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sleuth:基于TPM值的差异分析
kallisto/control-2 3 control-3 control kallisto/control-3 4 case-1 case kallisto/case-1 5 case -2 case kallisto/case-2 6 case-3 case kallisto/case-3 第一列为样本名称，第二列为样本对应的分组信息，第三列为每个样本kallisto ,case 两组， 每组3个生物学重复，可以通过以下代码构建上述的数据框 samples = c( "control-1", "control-2", "control-3", "case-1", "case 上述代码要求将所有样本的定量结果放在同一个文件夹下，目录结构如下 kallisto/ ├── control-1 ├── control-2 ├── control-3 ├── case-1 ├── case
4.6K11发布于 2020-05-08 - 来自专栏生信修炼手册
使用edgeR进行两组间的差异分析
读取文件 需要读取基因在所有样本中的表达量文件，示例如下 gene_id ctrl-1 ctrl-2 ctrl-3 case-1 case-2 case-3 geneA 14 0 11 4 0
1.8K10发布于 2020-05-08 - 来自专栏生信修炼手册
使用DESeq2进行两组间的差异分析
读取数据 读取基因的表达量表格和样本的分组信息两个文件，其中表达量的文件示例如下 gene_id ctrl-1 ctrl-2 ctrl-3 case-1 case-2 case-3 geneA 14 分组信息的文件示例如下 sample condition ctrl-1 control ctrl-2 control ctrl-3 control case-1 case case
4.2K21发布于 2020-05-08 - 来自专栏生信修炼手册
使用limma进行两组间的差异分析
读取文件 读取基因在所有样本中的表达量文件，示例如下 gene_id ctrl-1 ctrl-2 ctrl-3 case-1 case-2 case-3 geneA 14 0 11 4 0 12
7.2K10发布于 2020-05-08 - 来自专栏kafka专栏
图解Kafka消费者客户端分区分配策略
consumer-1 consumer-2 选中策略 case-1 roundrobin,rang rang,roundrobin,strick roundrobin,rang roundrobin case -0投roundrobin, consumer-1投rang, consumer-3投roundrobin； 这样算下来 roundrobin是有2票的, 那么久选择roundrobin为分配策略； Case
2.1K30编辑于 2022-10-05 - 来自专栏小浩算法
漫画：常考的荷兰国旗问题你还不会吗？（初级）
(CASE-2) ? 但是这里要注意，C 交换完毕后，C 不能向前移。因为C指向的元素可能是属于前部的，若此时 C 前进则会导致该位置不能被交换到前部。继续向下遍历。 ?
5.6K42发布于 2020-05-08 - 来自专栏偏前端工程师的驿站
前端构建：Less入了个门
{case-1: darkred} .m(blue) {case {case-1: I am 'foo'} .m('bar') {case {.m(blue)} &-green {.m(green)} &-foo {.m('foo')} &-baz {.m('baz')} } // 最终输出 .x-blue { case
1.6K70发布于 2018-01-18 - 来自专栏偏前端工程师的驿站
前端构建：Less入了个门
{case-1: darkred} .m(blue) {case {case-1: I am 'foo'} .m('bar') {case {.m(blue)} &-green {.m(green)} &-foo {.m('foo')} &-baz {.m('baz')} } // 最终输出 .x-blue { case
2K70发布于 2018-01-18 - 来自专栏T客来了
打牢地基-拿下红黑树
_right_rotate(root) if self.is_red(root.left) and self.is_red(root.right): # case-2 节点的左右子树的根节点都为红色
50930发布于 2020-04-08 - 来自专栏小数志
PyTorch学习系列教程：卷积神经网络【CNN】
我们这里举两个特殊case研究一下： case-1：测试集样本0，对应手写数字7 1-a：原始图片： 1-b：经过第一层卷积，共提取6个通道的特征图 1-c：经过第二层卷积，提取16个通道的特征图 case
3K52编辑于 2022-09-19
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