Proprietary software AIMMS,目标-优化建模系统,包括GUI建设设施。 ALGLIB 具有c++和c#接口的双重许可(GPL/commercial)约束二次和非线性优化库。 AIMMS AMPL APMonitor -免费的学术和商业用途一样,与朱莉娅,Python和MATLAB集成。
A:可以根据ATOM name,进行坐标重排,BOND那边保持其中一个分子的bond即可,http://chemyang.ccnu.edu.cn/ccb/server/AIMMS/mol2.pdf q:
提供了方便轻巧的接口,支持 C++, Java, Python, .Net 开发,内存消耗少 (4)支持多种平台,包括 Windows, Linux, Mac OS X (5)支持 AMPL, GAMS, AIMMS links provided by the Optimization Services and GAMSlinks projects), MPL (through the CoinMP project), AIMMS
分子格式文件 分子储存文件最主要的是储存其三维坐标以及这些点之间的联系,这里以mol2文件为例 首先看官网介绍: MOL2格式:http://chemyang.ccnu.edu.cn/ccb/server/AIMMS
而一批开发规范分析解决方案的初创公司也有长足发展,包括AIMMS、 Ayata和Profitect。
代表企业:AIMMS; Angoss; Decision Lens; FICO;Gurobi Optimization; IBM; River Logic; SAS; Sparkling Logic;
也可通过建模系统(包括 AIMMS、AMPL、GAMS 和 MPL)访问。 AMPL 是数学规划的建模语言。文件 beer.mod 和 beer.dat 指定了酿酒厂问题的模型和数据。