二、Th1细胞的生物学特征Th1细胞是CD4+辅助性T细胞的重要功能亚群,以产生干扰素-γ(IFN-γ)为主要特征,同时分泌IL-2和淋巴毒素等效应分子。 Th1细胞也参与抗肿瘤免疫应答,通过活化CD8+细胞毒性T细胞和自然杀伤细胞,增强对肿瘤细胞的杀伤作用。三、T细胞发育与Th1分化调控(一)胸腺发育阶段T细胞发育的第一阶段发生于胸腺。 造血祖细胞在胸腺微环境中接受Notch信号和TCF1、GATA3、Bcl11b等转录因子的调控,向T细胞谱系定向分化。 其核心原理是在T细胞受体刺激的基础上,提供模拟体内Th1极化微环境的细胞因子组合,驱动初始T细胞向Th1谱系分化。 五、总结人Th1极化套装基于对Th1分化调控机制的深入理解,通过优化的细胞因子组合和激活条件,为人Th1细胞的体外定向分化提供高效、可控的标准化工具。
(二)CD4+效应T细胞与CTL相似,产生IFN-γ的Th1细胞在分化后下调IFNGR2表达,从而提高其在TME中的存活率,发挥抗肿瘤效应。 TCR刺激下,IFNGR1与STAT1共定位于免疫突触,形成"Th1细胞准备"状态,这一过程可被Th2细胞的IL-4R表达所抑制。 值得注意的是,肿瘤浸润效应T细胞上PD-1的表达可抑制Th1分化,形成负反馈回路限制IFN-γ产生。 其抗肿瘤效应主要体现为诱导MHCⅠ类表达及趋化因子CXCL9、CXCL10、CXCL11分泌,促进淋巴细胞迁移并抑制血管生成。 然而,CXCL11因与CXCR7结合而具有促血管生成活性;CXCL9及CXCL10促进Th1/Th17效应功能,而CXCL11则通过IL-10诱导Th2及Treg反应。
缺点:可能会错过那些在所有细胞中表达但在这种特定细胞类型中高度上调的细胞标记 min.pct:仅测试在两个群体中的任何一个中的最小部分细胞中检测到的基因。旨在通过不测试很少表达的基因来加速。 如果我们仔细查看标记基因列表,我们还会发现一些 T 细胞相关基因和激活标记。这些可能是激活的(细胞毒性)T细胞。有大量研究支持热休克蛋白与反应性 T 细胞在慢性炎症中诱导抗炎细胞因子的关联。 例如,我们可能对基因 TPSB2 感兴趣,它显示簇中的大部分细胞表达该基因,但其他簇中表达该基因的细胞很少。 因此簇20可能代表肥大细胞。肥大细胞是免疫系统的重要细胞,属于造血谱系。 我们将标记幼稚细胞并将剩余的簇标记为 CD4+ T 细胞。 现在获取所有这些信息,我们可以推测不同簇的细胞类型并绘制带有细胞类型标签的细胞。 + monocytes", "10" = "CD4+ T cells", "11
内容概要Elabscience 人Th1/Th2 流式细胞术染色试剂盒是一款专为辅助性 T 细胞亚群检测打造的四色荧光标记试剂盒,可一步法同时检测细胞表面与细胞内抗原,精准识别 Th1、Th2 细胞比例 人Th1/Th2 流式细胞术染色试剂盒介绍Th细胞,也称为辅助性T细胞,在静息状态下,Th0分化为Th1,Th2和Th17的能力非常弱,外周血中仅有极少量的Th1,Th2和Th17细胞,而当Th细胞受到外界因素刺激 ,Th0就会向Th1,Th2或Th17分化,具体分化趋向取决于微环境中细胞因子的种类,此时,通过检测样本中IFN-γ,IL-4或IL-17A的表达量,可知Th1,Th2或Th17细胞在活化的T淋巴细胞中的比例 ,将CD3+CD4+IFN-γ+ 细胞定义为 Th1 细胞,CD3+CD4+IL-4+ 细胞定义为 Th2 细胞,进而实现对两种细胞亚群的精准分选与比例定量,反映机体 Th1/Th2 细胞的分化与平衡状态 应用领域Elabscience 人Th1/Th2 流式细胞术染色试剂盒可用于体外淋巴细胞样本或实验模型培养细胞的检测,核心应用方向包括:免疫机制研究:探究 Th0 细胞向 Th1/Th2 定向分化的调控机制
内容概要Elbabscience 人 Th1/Th2 流式细胞术染色试剂盒是专为免疫检测设计的工具,采用四色荧光标记抗体混合物,可特异性结合目标抗原,实现对人 Th1、Th2 细胞的快速精准检测。 背景介绍辅助性 T 细胞(Th 细胞)是免疫系统的核心调控细胞,静息状态下的 Th0 细胞分化能力微弱,外周血中 Th1、Th2 等亚型细胞含量极低。 当受到外界刺激时,Th0 会在微环境细胞因子的调控下定向分化为 Th1 或 Th2 细胞,其分化平衡与免疫应答、疾病发生发展密切相关。 针对性应用场景基础免疫机制研究适用场景:探究 Th1/Th2 细胞分化的分子机制、微环境细胞因子对分化的调控作用等基础研究。 核心价值:支持新鲜全血、外周血单个核细胞等多种样本,可快速获取 Th1/Th2 细胞比例变化,为疾病发病机制研究提供关键数据。
辅助性T细胞:主要通过信号传导支持其他免疫细胞的功能。根据它们分泌的细胞因子不同,可以分为多个亚型(Th1,Th2,Th9,Th17,Th22,Tfh),每种亚型在免疫应答中发挥不同的作用。 (CCR7);中央记忆T细胞,Tcm(ANXA1,TCF7);效应记忆/效应T细胞,Temra/Teff(GNLY);Treg细胞(FOXP3, CTLA4);Th1细胞(IFNG,CXCL13);Tem /Th1细胞(IFNG,GZMK,BHLHE40);Th17细胞(IL23R);Tfh细胞(CXCR5);组织驻留记忆T细胞,Trm(CXCR6);固有层Trm细胞,P.Trm(CD6);CD4_markers_step3 簇进行注释,其中第7-9,12簇可能为Naive CD4+细胞,第0,1,2,4,5,11,14簇可能是记忆性T细胞(Tcm),第5簇可能是Th1细胞。 第1、2 簇可能为Th1细胞,因其特征性标志物包括TBX21(+)。第4、5、11簇可能为记忆性T细胞,因其表达ANXA1、GIMAP4、LEF1、TCF7。
内容概要Elabscience 人Th17 流式细胞术染色试剂盒,凭借三色荧光标记抗体混合物,可快速精准检测人 Th17 细胞,兼容细胞表面与细胞内抗原同步检测,适用于外周血单个核细胞、新鲜全血等样本, Th细胞,也称为辅助性T细胞,在静息状态下,Th0分化为Th1,Th2和Th17的能力非常弱,外周血中仅有极少量的Th1,Th2和Th17细胞,而当Th细胞受到外界因素刺激,Th0就会向Th1,Th2或 Th17分化,具体分化趋向取决于微环境中细胞因子的种类,此时,通过检测样本中IFN-γ,IL-4或IL-17A的表达量,可知Th1,Th2或Th17细胞在活化的T淋巴细胞中的比例。 背景介绍辅助性 T 细胞(Th 细胞)在免疫调节中发挥关键作用,静息状态下的 Th0 细胞分化为 Th1、Th2、Th17 细胞的能力极弱,外周血中这类细胞数量极少。 本试剂盒通过特异性结合这三种标志物的三色荧光标记抗体,与样本细胞反应后,借助多色流式细胞仪检测 CD3+CD4+IL-17A + 细胞群体,从而确定 Th17 细胞在活化 T 淋巴细胞中的比例。
激素受体阳性或三阴性乳腺癌患者在手术前接受了抗 PD1 治疗,作者对接受抗 PD1 治疗的初治患者(n = 29)或抗 PD1 治疗前接受新辅助化疗的患者(n = 11)的治疗前与治疗中活检样本进行单细胞转录组 样本信息 第一组(初治早期BC)的 29 名患者和第二组(接受新辅助化疗的 BC)的 11 名患者。 经验丰富的TEX细胞分裂为1型辅助细胞(TH1)和滤泡辅助细胞(TFH) T细胞扩增过程中基因表达的变化 作者沿着 CD8+ TEX 轨迹确定了五组差异表达基因 (DEG)。 沿着 CD4+ TH1 轨迹,作者在比较 Es 与 NE时类似地确定了五个基因集(图e)和 499 个 DEG,包括潜在的 TH1 标记,如 ZEB2(图f)。 分析的是来自配对的治疗前(接受抗PD1治疗的29名初诊患者)和治疗期间(抗PD1治疗前接受新辅助化疗的11名患者)的单细胞转录组、T细胞受体和蛋白质组数据。
激素受体阳性或三阴性乳腺癌患者在手术前接受了抗 PD1 治疗,作者对接受抗 PD1 治疗的初治患者(n = 29)或抗 PD1 治疗前接受新辅助化疗的患者(n = 11)的治疗前与治疗中活检样本进行单细胞转录组 样本信息 第一组(初治早期BC)的 29 名患者和第二组(接受新辅助化疗的 BC)的 11 名患者。 经验丰富的TEX细胞分裂为1型辅助细胞(TH1)和滤泡辅助细胞(TFH) T细胞扩增过程中基因表达的变化 作者沿着 CD8+ TEX 轨迹确定了五组差异表达基因 (DEG)。 沿着 CD4+ TH1 轨迹,作者在比较 Es 与 NE时类似地确定了五个基因集(图e)和 499 个 DEG,包括潜在的 TH1 标记,如 ZEB2(图f)。 分析的是来自配对的治疗前(接受抗PD1治疗的29名初诊患者)和治疗期间(抗PD1治疗前接受新辅助化疗的11名患者)的单细胞转录组、T细胞受体和蛋白质组数据。
细胞 1)诱导Th1细胞分化;2)抑制Th2细胞合成IL-4、IL-5、IL-10;3)促进NK细胞、T细胞产生IFN-r,增强其细胞毒活性;4)选择性抑制IL-4诱导IgE合成; IL-15 巨噬细胞 1)诱导Th1细胞分化;2)抑制Th17细胞;3)抑制外周血T细胞转变为Treg;4)限制中枢神经系统、眼睛、胎盘等部位炎症反应; 趋化因子 巨噬细胞、内皮细胞、T细胞、成纤维细胞、血小板 趋化白细胞进入组织局部 细胞,促进其细胞毒活性; 适应性免疫应答中的重要细胞因子 细胞因子 细胞来源 主要生物学效应 IL-2 CD4+T细胞、CD8+T细胞、NK细胞 1)促进T细胞增殖及细胞因子分泌、诱导Fas介导的细胞凋亡 MHC II类分子;2)诱导B细胞抗体类别转换,产生IgE;3)促进Th2细胞分化,抑制Th1细胞分化;4)抑制IFN-r介导的巨噬细胞活化;5)促进肥大细胞增殖(体外);6)联合IL-13诱导M2型巨噬细胞分化 ; IFN-r T细胞(Th1、CD8+T)、NK细胞 1)促进巨噬细胞活化及杀菌功能;2)诱导B细胞抗体类别转换,产生IgG,抑制IgE产生;3)诱导Th1细胞分化,抑制Th2,Th17细胞分化;4)
在末端Tex细胞和其他元簇之间具有强TCR共享的12种癌症类型中的11种中,末端Tex细胞与GZMK+Tex细胞、ZNF683+Trm细胞或P1或P2中的其他元簇表现出高pTrans值(图2D),暗示P1 全局扩散图和RNA速度分析表明,CD4+T细胞可以从幼稚T细胞分别发育为Temra细胞、TFH/TH1细胞或TNFRSF9+Treg细胞(图3A)。 两个与TFH细胞相关的元簇显示出从经典IL21+TFH细胞到IFNG+TFH/TH1细胞的逐渐转变过程(图3A和B)。 通过将肿瘤分为TMB高组和TMB低组,作者发现只有CD4+TFH/TH1细胞的频率与TMB显示出强相关性(FDR26.3%)。 一个模块由三个ISG+元簇组成,而四个CD8+Tex细胞群、TFH/TH1细胞和TNFRSF9+Treg细胞形成另一个模块。
在这项研究中,作者开发了一种光诱导的纳米银核酸递送系统,它具有精确的时空调控、高细胞摄取、低细胞毒性、内涵体逃逸功能并可将治疗性miRNA释放到胞浆中。 本文将外源性miR-148B导入Ras表达的角质形成细胞和小鼠鳞状细胞癌细胞中诱导凋亡,避免了对未表达的角质形成细胞的细胞毒性。 Th1细胞,起到强大的免疫调节作用。 此外,该递送系统对辅助性T细胞具有特异性的免疫调节作用,导致SNP-DAmiR148b处理的小鼠肿瘤抑制和脾脏中Th1细胞的增加。 这一策略为肿瘤治疗提供了一种有效的方法,具有特异性,对健康组织的副作用最小,增强Th1为主的细胞免疫。
单点检测三大误区误区一:免疫方向只看一个标志容易“看走眼”检测到 IFN-γ 升高,就是Th1免疫激活了?但需要考虑:有没有IL-12配合,微环境支不支持? 误区二:看到细胞趋化信号就稳了检测到CCL2 升高,说明它在召唤单核细胞。但需要考虑:这些细胞是来修复组织的,还是促进肿瘤生长的?检测到CXCL10 升高,代表它在吸引T细胞。 接下来,跟着小E一起看看多指标联检,能为你的研究带来哪些实实在在的不同:解析免疫应答主导类型,不再只是Th1/Th2二选一Ÿ Th1型:IFN-γ、IL-2、IL-12p70,主导抗病毒、抗肿瘤的细胞免疫 追踪免疫细胞迁移Ÿ CCL2:趋化单核/巨噬细胞,其在肿瘤中常促进展,在组织修复中可发挥有益作用。Ÿ CXCL10:趋化效应T细胞与NK细胞,其水平与肿瘤免疫治疗响应潜力相关。 Ÿ IL-8:主要趋化中性粒细胞,参与急性防御,也可介导慢性组织损伤。全景监测细胞因子风暴Ÿ 初始应答:IL-1β、TNF-α。Ÿ 级联放大:IL-6、G-CSF、GM-CSF。
然而,小鼠巨噬细胞簇(mM11-mM14)与人类的C1QC+TAMs的相似性最高,与人类的SPP1+TAMs具有最小化的重叠的基因表达最高。 与这些发现相一致的是,对来自Renca肿瘤的scRNA-seq数据的分析显示了在抗csf1r治疗后,细胞群体mM12和mM14几乎完全丧失,但TAM种群mM11、mM13和mM15的减少极少(图4C和4D 与耐药群体(mM11、mM13、mM15)相比,抗csf1敏感群体(mM12、mM14) mki67表达升高,增殖评分也更高(图4e和4G)。 进一步分析人类CRC患者中ofifng表达bhlhe40 + th1样细胞与cDC细胞的相关性,发现th1样细胞的基因标记与成熟和未成熟cDC1细胞优先呈正相关。 + th1样CD4+T细胞快速扩增。
但在实体瘤的治疗中依然存在着抗原异质性、免疫抑制微环境、细胞衰竭等障碍。当前CAR-T细胞的种子来源主要有初始T细胞与总T细胞两类,二者在组学分析、细胞模型构建及细胞增殖能力三大核心维度存在显著差异。 ,模型效果更优且稳定性更强,总T细胞因包含已分化的效应T细胞会干扰模型稳定性,例如样本中Th1细胞占比过高时,其对Th2细胞的抑制作用会导致Th2细胞模型构建效果不稳定;细胞增殖能力方面,初始T细胞在细胞疗法研究场景中的增殖能力显著优于总 Anti-Human CD8a Antibody[OKT-8](E-AB-F1110H)、FITC Anti-Human CD56/NCAM Antibody[5.1H11](E-AB-F1239C)、 人外周血使用人单个核细胞分离液(P 1.077)(E-CK-A103)分离PBMC细胞后,经刺激阻断剂激活后检测Th1/Th2细胞分泌细胞因子的功能和比例。 MagnetEC001Foxp3/Transcription Factor Staining KitE-CK-A108Human PBMC Separation Solution(P 1.077)E-CK-A103Human Th1
降维聚类分析后得到16种细胞类型,分别为淋巴系细胞包括T细胞、B细胞、NK细胞和浆细胞。髓系细胞包括单核细胞、巨噬细胞、树突细胞(cDC)、中性粒细胞和肥大细胞。 结果发现单核细胞和中性粒细胞在COVID-19患者中比非COVID-19患者更常见,特别在危重患者中更突出,巨噬细胞和上皮细胞也表现相似的情况。相反,CD8+ T细胞和NK细胞在轻度疾病中轻度富集。 与非COVID-19相比,观察到COVID-19患者的CD4+ TH17细胞略少,但TH1样细胞更多。比较轻度和重度COVID-19,发现后者的TH1样细胞显著增加(图2d, e)。 COVID-19的TH1样细胞系中TCR的丰度和均匀度均降低,而非COVID-19的TH1样细胞系中TCR的丰度和均匀度均降低(图4h)。同时这种减少在关键的COVID-19病例中最为显著(图4i)。 相比之下,TH17细胞和TSCM细胞的特征是仅在其运动轨迹的末端TCR丰度略有下降,这表明主要是TH1样细胞被特异性选择为SARS-CoV-2 抗原。
Genomics Proteomics Bioinformatics的一篇名为Single-cell Analysis of CAR-T Cell Activation Reveals A Mixed TH1 CD4+和 CD8+可以同时在杀死肿瘤细胞中起作用,细胞毒性活性与表达上调的一系列细胞因子有关系。 一些转录因子基因TBX21(T-bet)和GATA3及细胞因子基因IFNG(IFNc),TNF (TNFa),IL5 (IL5),和IL13(IL13)等,说明TH1/TH2响应在其中发生。 通过TGFB1和IL10的表达,可以推测CAR-T细胞具有Treg细胞活性,这部分细胞占比很低,另外大多数的CAR-T细胞还可以产生粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF),且细胞因子的响应依赖于分化状态 Single-cell Analysis of CAR-T Cell Activation Reveals A Mixed TH1/TH2 Response Independent of Differentiation
往期相关 单细胞初级8讲和高级分析8讲 单细胞分析十八般武艺1:harmony 单细胞分析十八般武艺2:LIGER 单细胞分析十八般武艺3:fastMNN 单细胞分析十八般武艺4:velocyto 单细胞分析十八般武艺 5:monocle3 单细胞分析十八般武艺6:NicheNet 单细胞分析十八般武艺7:CellChat 单细胞分析十八般武艺8:Garnett 单细胞分析十八般武艺9:DoubletFinder 单细胞分析十八般武艺 xCell的工作原理是用机器学习算法提取了64种免疫细胞和基质细胞的signature,待检测bulkRNA数据先用ssGSEA算法计算样本在每个细胞类型signature的富集分数,然后用特别设计的算法将样本中各种细胞类型的富集分数转换为细胞类型分数 xCell评分用于下游分析时,可以在不同样本之间对比同一细胞类型的得分,但是不要在同一样本内比较不同细胞类型的得分。 不要把xCell用于单细胞数据的细胞类型鉴定。 关于介绍 xCell 的说明 xCell并不是一款分析单细胞数据的工具,我向大家介绍它并收录在《单细胞分析十八般武艺》专题中,是因为它与单细胞的分析密切相关。
在这些方法中,签名列表中的每个基因都被同等对待,但实际上,这些基因在区分细胞类型时的作用可能大不相同。如果忽视了这些基因重要性的差异,那么分析结果很难达到最佳效果。 所谓锚点,是指参考数据集中的一个细胞和查询数据集中的一个细胞,它们在经过降维变换后的数据中互为最近邻。这些锚点还会经过进一步筛选,要求它们在原始基因表达空间中具有一定相似性。 之后,会构建一个权重矩阵,用来定义每个查询细胞与每个锚点之间的关系。最后,通过这个权重矩阵,将锚点细胞的标签或值传递给查询细胞。 对于需要转移的分类信息(比如细胞类型标签),输出数据框中还记录了每个细胞对不同参考细胞类型的预测分数。这些分数可以理解为每个查询细胞属于不同细胞类型的估计概率。 因此,我们可以通过汇总这些分数到查询细胞簇中,来进行进一步的比较分析。
今天和大家分享的是19年11月发表在Annals of Translational Medicine (IF:3.297)杂志上的一篇文章,“DNA methylation-based prognostic 高甲基化低表达基因在Th1和Th2细胞分化,胞吞作用,Th17细胞分化等途径显著富集。而低甲基化高表达基因在产热,卵母细胞减数分裂,癌症中的转录失调等途径显著富集。 KEGG和GO 分析中许多富集结果对分析有提示的作用,如Th1和Th2细胞分化,染色质沉默,髓样白细胞介导的免疫的正调控等等均与AML的发生发展有密切的关系。 ? 作者发现高甲基化/低表达的ATP11A中有73个对AML预后有统计学意义的CpG位点(表3展示了前10个),高甲基化/低表达基因的TGAM具有两个(p<0.05),低甲基化/高表达基因的ZNRF2有三个 最后作者发现,ATP11A的cg00990020, ITGAM的cg05625471和ZNRF2的cg07510230之间的DNA甲基化差异最为显著(图9A, B, C)。 ?