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告别杂细胞干扰！Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒，精准富集人初始 T 细胞
内容概要Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒凭借阴性分选技术，可从新鲜或冻存的人 PBMC 样本中快速分离高纯度人初始 T 细胞。 产品介绍Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒是一款操作快速简便的细胞分离产品，核心用于分离人初始 T 细胞。 检测原理Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性去除样本中 CD3⁻非 T 细胞、CD45RO⁺记忆 T 细胞等非目标细胞，实现人初始 T 细胞（CD3⁺CD45RA 应用领域免疫机制研究：探究初始 T 细胞的活化、分化及功能调控机制。肿瘤免疫治疗：用于 CAR-T 细胞疗法等研发中，提供高活性初始 T 细胞原料。 自身免疫病研究：分析初始 T 细胞在自身免疫病发生发展中的作用。疫苗研发：评估疫苗对初始 T 细胞的激活效果及免疫应答强度。再生医学：探索初始 T 细胞在组织修复与免疫重建中的应用。
15710编辑于 2025-11-13 - 来自专栏单细胞天地
干细胞样CD4+ T细胞判定及分析
T细胞提取：基于CD3和CD4的表达，提取出T细胞，并使用Seurat进行下游再分析。 + T细胞(簇0)、tfh样T细胞(簇1)、cycling(簇2和4)和细胞毒性CD4+ T细胞(簇3)。 细胞轨迹从TCF1hi CD4+ T细胞开始，随后分为三个分支，其中两个分支发展为两种不同的效应细胞群——tfh样细胞和细胞毒性CD4+ T细胞，第三个分支产生cycling CD4+ T细胞 scTCR-seq TCF1hi CD4+ T细胞与所有其他CD4+ T细胞簇共享TCR克隆型 这些结果支持CD4+ TCF1hi T细胞具有高可塑性和自我更新能力，并产生更多分化的效应T细胞的概念 文章小结 血管动脉免疫细胞群的单细胞和全组织转录组学研究发现 提供组织浸润和组织损伤效应T细胞的CD4+ T细胞存活于外血管血管周围的三级淋巴样结构中，表达转录因子T细胞因子1 (TCF1)，具有高增殖潜能，并产生eomesdermin (EOMES)+细胞毒性T
55710编辑于 2024-05-20 - 来自专栏芒果先生聊生信
再谈T细胞：起源、分化和分群
T细胞发育 T细胞来源于骨髓中的淋巴样祖细胞，在胸腺中分化、发育、成熟。在胚胎发育早期，T细胞的前体干细胞经血流输送到胸腺，从胸腺的浅皮质向深皮质、髓质移行，并发育为成熟的T细胞。 T细胞的准确定位与其表达的归巢受体有关，如L-选择素。但是，这个问题不是该总结的重点。T细胞从浅皮质→深皮质→髓质的时序移行才是T细胞发育的关键之所在！ 在T细胞发育早期，敲除 Notch1基因后, 胸腺细胞呈现出B细胞谱系的表型，而Notch1基因存在时，胸腺细胞呈现为T细胞谱系的表型。上述研究说明，Notch信号通路是T细胞活下来的必要条件。 在与抗原接触后，初始T细胞分化发育为不同功能的T细胞亚群，并表达新的归巢受体，从而“归巢”到新的部位。 T细胞分群 细胞表面的分子是T细胞分群的依据，是方便研究和交流而进行的人为标志。 下面就按照T细胞的部分表面分子对其进行分群以及功能总结。 1. TCR-CD3复合物（所有T细胞） 该复合物是T细胞特有的分子标志，在所有T细胞表面均有表达。
7.6K31发布于 2020-08-05 - 来自专栏用户7627119的专栏
R批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件
前面我们简单的介绍过免疫组库以及单细胞免疫组库的应用。今天给大家介绍一个做免疫组库数据分析很实用的数据库IMGT，以及如何使用R从IMGT批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件。 一、IMGT简介 IMGT （http://www.imgt.org/）是免疫遗传学（ImMunoGeneTics）的缩写，专注于所有脊椎动物物种的免疫球蛋白、T细胞受体（T-cell Receptors B细胞受体VDJ序列文件的下载链接如下，留给大家自己练习吧！
90550编辑于 2022-09-21 - 来自专栏JavaScript全栈
每日两题 T9
算法 LeetCode T1162. 地图分析[1] 描述 你现在手里有一份大小为 N x N 的『地图』（网格） grid，上面的每个『区域』（单元格）都用 0 和 1 标记好了。
69310发布于 2020-07-17 - 来自专栏生信技能树
超详细T细胞亚群标记基因列表
看到了一个超详细的对T细胞亚群进行分析的文献，分享给大家！ ### # 创建一个空的list对象 cell_markers <- list() # CD4+ T细胞亚群 cell_markers$`Naive T cells` <- c("CCR7", "SELL ", "IL2RA", "CTLA4", "TIGIT", "TNFRSF18", "MAGEH1", "SAT1", "CCR8", "KZF2", "IL10", "BATF") # CD8+ T细胞亚群 <- c("CXCL13", "TIGIT", "CTLA4", "PDCD1", "LAG3", "HAVCR2", "ENTPD1", "TOX", "TOX2", "LAYN", "TNFRSF9" $`Proliferation` <- c("MKI67", "TK1", "STMN1") # 细胞毒性 (Cytotoxicity) t_cell_states$`Cytotoxicity` <-
2.1K10编辑于 2025-05-25 探索ImmGen:2-T细胞综合图谱
基本介绍 immgen T 开源项目”联合41个实验室，绘制了包含62万余个细胞的小鼠T细胞综合图谱，整合多组学数据揭示了8大类及114个亚群，旨在全面解析T细胞在不同组织和免疫亚群的多样性。 小鼠T细胞综合图谱包括在单细胞水平上进行分析，整合mRNA测序、表面蛋白表达（CITE-seq/TotalSeq）和TCR-V测序（配对α/β链）。 样本信息：包含多个Cluster（如Cluster 1, 2, 3, 4, 5, 7, 9, 10, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 20, 21, 22, 23, 25, 28 分析特定数据集的单细胞基因表达分布： 如下图所示，通过交互式 UMAP 图表探索特定基因（如 Satb1）在调节性 T 细胞数据集中的表达分布。页面提供了细胞类型筛选、亚群选择及绘图模式切换工具。 总结：ImmgenT 模块，是研究T细胞相关基因在不同组织与不同细胞亚群重要资料，是研究基因在发育过程中组织与细胞特异性的百科全书。
18010编辑于 2026-01-27人T细胞激活试剂盒在细胞疗法中的应用
体内T细胞的活化需要双信号刺激：第一信号由T细胞受体（TCR）识别抗原呈递细胞（APC）表面的MHC-肽复合物提供；第二信号则由CD28等共刺激分子与相应配体相互作用提供。 二、T细胞活化的双信号机制T细胞的完全活化依赖于两个独立但协同的信号传导通路。第一信号由TCR/CD3复合物识别APC表面的抗原肽-MHC分子复合物所触发，决定了T细胞应答的特异性。 这一机制是机体维持外周免疫耐受的重要方式，也为体外T细胞激活策略的设计提供了理论基础。三、人T细胞激活试剂盒的核心组分人T细胞激活试剂盒的核心功能是模拟体内APC提供的双信号刺激。 四、激活试剂在不同细胞疗法中的应用（一）CAR-T细胞制备在CAR-T细胞生产流程中，T细胞的离体激活是基因修饰前的关键步骤。 五、激活条件对T细胞质量的影响激活策略不仅影响T细胞的扩增效率，还深刻影响其功能表型和临床应用效果。
8710编辑于 2026-03-16- 来自专栏DrugOne
Science | 肿瘤浸润性T细胞的泛癌单细胞图谱
肿瘤中的CD8+细胞以出现耗竭T细胞为特征(图1D)，而在CD4+T细胞群中，丰度最高的是TNFRSF9+ Treg细胞群，其在血液和正常组织中的频率均显着降低(图1E)。 总之，出现了潜在的肿瘤反应性T细胞-TFH/TH1细胞、TNFRSF9+ Treg细胞、CD8+ISG+T细胞和四种Tex细胞群，代表了局部抗肿瘤免疫反应-而扩增的CD8+Temra细胞也可能含有肿瘤特异性 图2 CD8+耗竭T细胞的异质性和动力学 CD4+区室中潜在肿瘤反应性T细胞的特性 在CD4+区室中，主要的潜在肿瘤反应性元簇是IFNG+TFH/TH1和TNFRSF9+Treg细胞。 全局扩散图和RNA速度分析表明，CD4+T细胞可以从幼稚T细胞分别发育为Temra细胞、TFH/TH1细胞或TNFRSF9+Treg细胞(图3A)。 对于Treg细胞，出现了从TNFRSF9-Treg细胞到TNFRSF9+Treg细胞的轨迹(图3A)，表明从静息状态(TNFRSF9-)逐渐过渡到激活状态(TNFRSF9+)。
93620编辑于 2022-03-25 - 来自专栏天意生信俱乐部
单细胞互作新思路！NicheNet实战：单核细胞如何调控T细胞？附代码
这里我们选择单核细胞作为发送者，记忆型CD4+ T细胞作为接收者。 receiver_cells <- WhichCells(seuratObj, expression = seurat_annotations == "Memory CD4 <em>T</em>") # 确认细胞数量 cat("发送细胞(CD14+ Mono)数量:", length(sender_cells), "\n") cat("接收细胞(Memory CD4 T)数量:", length(receiver_cells 这里我们比较记忆CD4+ T细胞和初始CD4+ T细胞的差异基因。 通过本教程的分析流程，我们确定了PBMC中单核细胞可能向记忆CD4+ T细胞发送的关键信号分子，以及这些信号可能影响的下游靶基因。
1.1K00编辑于 2025-05-14 - 来自专栏学习有记
T-SQL进阶：超越基础 Level 9：动态T-SQL代码
By Gregory Larsen, 2016/07/29 (首次发表于: 2014/07/23) 关于系列 本文属于进阶系列：Stairway to T-SQL: Beyond The Basics 跟随Gregory Larsen的T-SQL DML进阶系列，其涵盖了更多的高级方面的T-SQL语言，如子查询。 创建简单的T SQL 对于如何创建动态TSQL的第一个例子，我们来考虑以下情况。 假设您有一个应用程序，用户界面允许用户从下拉列表中选择要读取的表。 在Listing 9中，我提供了一个如何修改我的GetUserName存储过程以使用参数化的TSQL的例子。 为此，首先我需要运行Listing 9中的代码。
2.8K20发布于 2018-07-18 - 来自专栏流式抗体推文
Elabscience 小鼠CD3CD28 T细胞活化珠：小鼠 T 细胞体外扩增的 “黄金工具”
T 细胞的体外激活与扩增。 检测原理Mouse CD3/CD28 T 细胞激活磁珠的作用原理基于对体内 T 细胞活化机制的精准模拟：信号 1（特异性抗原信号）：磁珠表面偶联的 CD3 单克隆抗体可与 T 细胞表面的 TCR/CD3 肿瘤免疫研究：激活小鼠肿瘤模型来源的 T 细胞，研究肿瘤微环境对 T 细胞功能的抑制作用，或筛选增强 T 细胞抗肿瘤活性的药物。 细胞治疗研发：体外扩增小鼠抗原特异性 T 细胞，为过继性 T 细胞治疗等细胞疗法的临床前研究提供细胞来源。 产品优势信号模拟精准高效：同时提供 T 细胞活化所需的主要信号和协同刺激信号，激活效率远超单一信号刺激，可有效诱导 T 细胞增殖。
26710编辑于 2025-09-18 【免疫笔记】αβ T 细胞谱系的时间追踪系统
1.追踪系统的基因构建原理 通过基因编辑实现 T 细胞发育阶段的特异性标记： 基因插入策略：在 TCRδ 基因（T 细胞受体 δ 链）的恒定区下游插入Cre-ER基因片段。 因此，Cre-ER片段会仅在 DP 阶段的 T 细胞中存在，SP 及后续阶段的 T 细胞中则消失。 T 细胞中生效）； 追踪过程：标记胸腺中的 DP T 细胞后，观察这些细胞在衰老过程中向胸腺 SP 阶段、外周脾脏 CD4+ T 细胞的迁移 / 留存情况。 ）：胸腺 DP 细胞的标记率下降（8.2%），但胸腺 CD4SP、脾脏 CD4 细胞的标记率上升（24%、3.2%）——说明标记的 DP T 细胞向后续阶段 / 外周组织迁移。 意义：这个系统实现了对 αβ T 细胞发育特定阶段（DP 阶段）的 “时间特异性标记”，可以精准追踪这些细胞在体内的分化、迁移和衰老命运，为研究 T 细胞发育、免疫记忆维持等提供了工具
17710编辑于 2025-11-30一文讲清T细胞命名及marker
T细胞属于淋巴系，T细胞根据CD4或CD8共受体（TCR）的表达，分为CD4和CD8两种类型。然而，按照不同的命名方式，我们将T细胞分为不同的类别。 Memory T cell：“记忆细胞”指的是经历激活和分化的幼稚T细胞后代。Anergic T cell：先前被激活但持续处于低反应状态的T细胞。 TH9 cell：致病性TH2 (pTH2) 细胞、人类中的TH2A（过敏性）细胞或小鼠中的TH9RM (T_H9组织驻留记忆）细胞。 cell)：在有利于T_reg细胞分化的细胞因子存在下，在体外被分化成T_reg细胞的CD4+ T细胞。 T_PEX细胞能够响应持续存在的抗原进行自我更新，并分化为更效应细胞样的耗竭CD8+ T细胞和终末分化耗竭CD8+ T细胞。
52710编辑于 2025-12-16- 来自专栏单细胞天地
人类胸腺发育的细胞图谱揭示了T细胞组库的形成
作者总共采集了 15 个胎儿胸腺（从 7 - 17 孕周）和 9 个出生后至成人期的胸腺样本，同时采用了不同的细胞分选策略保证细胞亚群的覆盖率。 作者进一步推断了 T 细胞后续分化的轨迹：始于 CD4-CD8- DN，逐渐变为 CD4+CD8+ DP，经过 CCR9 high 的 αβ(entry) 阶段，分化为成熟的 CD4+ 或 CD8+ SP CD8αα+ T(I) 和 Treg 都表达表面蛋白 marker CD137（TNFRSF9），于是作者通过流式分选和 Smart-seq2 建库测序，验证了 CD3+CD137+CD4- 可以作为 、NR4A3、PDCD1 和 TNFRSF9，但同时也存在物种间差异基因（人类 GNG4 和 XCL1，小鼠 ZEB2 和 CLDN10），并且人类 CD8αα+ T(I) 最终成为 CD8AhighCD8Blow aDC 还可能通过 CXCL9/10:CXCR3 募集其他 DC 和成熟 Treg，并在 Treg 成熟过程中提供共刺激信号。
4.4K51发布于 2021-04-16 - 来自专栏生信技能树
为什么一个单细胞亚群既有T细胞也有B细胞的标记基因呢
b站免费视频课程 地址：https://www.bilibili.com/video/BV19Q4y1R7cu 很多小伙伴在实践我们的教程的时候，会注意到一个很有意思的现象，就是某个单细胞亚群既有T细胞也有 B细胞的标记基因，如下所示，其实很简单： 某个单细胞亚群既有T细胞也有B细胞的标记基因 可以看到， 这个cycling 亚群就是 既有T细胞也有B细胞的标记基因，实际上是因为它们这群细胞高表达 TOP2A 和MKI67基因，处于比较活跃的细胞增殖状态，这样无论它本身是 T细胞还是B细胞，它们的这个状态使得它们在普通的降维聚类分群的流程里面就会被混合在一起。 breast cancer》，也提到了这样的现象： 这个文章的研究者们的解决方案是单独拿出来这个 cycling 亚群 进行继续细分，所以就有了如下所示： . d, UMAP depicting the T-cell phenotypes detected in the proliferative T-cell subcluster.
1.5K20发布于 2021-11-23 - 来自专栏作图丫
【单细胞文献解读】溃疡性结肠炎CD8+T细胞的单细胞图谱
获得如下细胞类型：初始T细胞、记忆T细胞、组织驻留的记忆T细胞(TRM)、效应T细胞、双阳性(DP)T细胞、MAITs 、上皮内淋巴细胞(IELs) 和IL26+CD8+T细胞(图1C,D)。 非经典MHC分子HLA-E9在溃疡性结肠炎的多种上皮亚群中被诱导，而其相应的配体在CD8+T细胞中被诱导。 通过伪时间分析绘制线性进化轨迹: 从初始T细胞 到记忆T细胞、组织驻留的T细胞(TRM)、GZMK+效应T细胞，最后到IL26+细胞(图3B，C)。 同时随着BATF、CTLA4、HAVCR2、LAYN和TNFRSF9的表达增加，而与效应T细胞功能相关的分子(如GZMK)，则稳步丢失(图3C-E)。 04 结肠CD8+T细胞的多组学分析证实了UC的异质性和重塑性 为了在蛋白质水平上验证单细胞特征，作者接下来通过测序(CITE-seq)结合cell hashing技术，整合了另外9,062个细胞的转录和蛋白质组数据
1.2K20编辑于 2022-03-29 - 来自专栏单细胞天地
单细胞揭示B-ALL患者耗竭性T细胞亚群异质性
方法：从健康个体和急性B淋巴细胞白血病 (B-ALL) 患者的外周血中分选出 T 细胞，进行单细胞转录组测序。根据基因表达，无监督聚类将细胞分为13 个 T 细胞亚群。 在 B-ALL 患者中发现了健康个体的所有 11 个主要 T 细胞亚群，B-ALL中T细胞显示出更多的免疫通路活化特征。 GZMK− γδ T 细胞具有与 GZMK+ γδ T 细胞相似的转录组，它们与2个效应亚群（CD4_TE 和 CD8_TE）聚集在一起。此外，MAIT 细胞与 GZMK+ γδ T 细胞聚集在一起。 总的来说，耗竭性T 细胞应被视为一个具有异质性质的“细胞室”，里面由处于不同状态的 T 细胞组成，可能具有不同的生物学功能。 每个患者都受到少量 T 细胞克隆的强烈支配，表明某些 T 细胞克隆扩增很高。
1.3K30编辑于 2022-03-14 - 来自专栏顶刊美图
跟着顶刊学习单细胞CD4T细胞功能基因集评分！
to immunotherapy resistance文献中的CD8T细胞功能基因集评分，今天卡卡继续带大家学习这篇推文中的CD4T细胞功能基因集评分。 往期推文如下：跟着顶刊学习单细胞CD8T细功能基因集评分！回复20250411获取本期数据的CD4T细胞功能基因集评分！ rescale函数##这里加载自己的CD8T细胞处理好的Seurat对象即可load("CD4_Obj.Rdata")CD4_Obj$seurat_clusters=as.factor(CD4_Obj$ seurat_clusters)加载CD4T细胞功能基因集library(scales)# 设置输出路径figurePath <- ". 后台回复20250411获取本期数据的CD4T细胞功能基因集评分！
34410编辑于 2025-04-11 - 来自专栏生信技能树
T细胞状态打分R包应用于单细胞转录组数据
T细胞状态的新工具，TCellSI (T Cell State Identifier)。 系统地评估T细胞状态的新工具 目前准确评估T细胞的八种不同状态，这些状态包括： ● 静止（Quiescence） ● 调节（Regulating） ● 增殖（Proliferation） ● 辅助（Helper T细胞状态评分（TCSS, T Cell State Score）。 通过这些评分，研究人员可以深入了解T细胞在免疫反应中的具体功能和角色。 TCellSI借助Mann-Whitney U统计量，通过特定的标记基因集和参考谱为样本进行T细胞状态的评估。 TCellSI不仅能准确描述T细胞状态，而且在免疫环境中显现出高度的预测价值。
98411编辑于 2024-07-26
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