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【单细胞文献解读】溃疡性结肠炎CD8+T细胞的单细胞图谱
这项工作基于单细胞转录组学及质谱流式细胞技术，对健康人及溃疡性结肠炎（UC）患者的结肠CD8+ T细胞进行了分析，对比了患者与健康人结肠中各CD8+ T细胞亚群在比例及功能上的差异。 小结：描绘了结肠CD8+T细胞的异质性，包括具有固有性和适应性特征的IL26+细胞和DP调节性CD8+T细胞。 02 溃疡性结肠炎结肠CD8+T细胞的动态重构 作者观察到溃疡性结肠炎患者CD8+T细胞亚群变化较大，例如，组织驻留的记忆T细胞（TRM）平均占健康恢复细胞总数的45%，但仅占CD8+细胞总数的约10% 在健康结肠的CD8+细胞中，组织驻留的T细胞（TRM）富集了最高的T细胞克隆(图3G)。 揭示了CD8+T细胞组成中广泛的异质性，包括扩增的效应子和效应子后分化的CD8+T细胞。
1.2K20编辑于 2022-03-29 - 来自专栏流式抗体推文
Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒，快速分离CD8+T 细胞，直接用于下游实验
内容概要Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是一款专为生命科学与医学研究打造的高效细胞分离工具。 产品介绍人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是 Elabscience 品牌推出的核心产品，专注于人初始 CD8+T 细胞的精准分离。 检测原理人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性结合非目标细胞的抗体与磁珠复合物，在磁场作用下将 CD8+T 细胞以外的杂细胞（如 CD56+、CD57+、CD45RO + 细胞等 目标细胞（人初始 CD8+T 细胞）因不与磁珠结合而留在上清液中，最终实现快速、高效的分离。 肿瘤免疫治疗：为 CAR-T 细胞疗法、肿瘤疫苗研发等提供高质量初始细胞原料。感染病学研究：分析初始 CD8+T 细胞在病毒、细菌感染中的免疫应答过程。
14810编辑于 2025-11-14 - 来自专栏作图丫
8+！免疫相关：肝细胞癌中 T 细胞介导的肿瘤杀伤的分子特征
导语 尽管检查点阻断是治疗肝细胞癌 (HCC) 的一种有前途的方法，但尚未确定预期会出现反应的患者亚群。T 细胞介导的肿瘤杀伤 (TTK) 是免疫检查点抑制剂治疗的基本原理。 背景介绍 免疫相关分析一直是生信分析经久不衰的热点，今天小编为大家带来的这篇文章，作者通过高通量筛选试验鉴定了调节肿瘤细胞对 T 细胞介导的杀伤（GSTTKs）敏感的基因，应用无监督聚类根据 GSTTK 结合生存分析结果（图 2E），与有利生存结果相对应的簇 2 中的样本显示，效应记忆 CD8+ T 细胞、Th1 细胞、CD56 自然杀伤细胞、嗜酸性粒细胞、自然杀伤 T 细胞、中性粒细胞和浆细胞样树突状细胞大量浸润 基于 RNA 测序数据的 TIDE 分析显示，Cluster 2 中的样本在 T 细胞功能障碍、微卫星不稳定性和肿瘤相关成纤维细胞方面的得分高于 Cluster 1 中的样本，而 Cluster 1 中的样本在 T 细胞排斥、骨髓细胞方面的得分更高；这些发现与 ssGSEA 结果大体一致（图 3C）。
61120编辑于 2022-12-14 - 来自专栏专业duilib使用+业余界面开发
关于uint8_t、uint_least8_t、uiuint_fast8_t等说明
t、int16_t、int32_t、int64_t、uint8_t、uint16_t、uint32_t、uint64_t int_least8_t、int_least16_t、int_least32_t 、int_least64_t、uint_least8_t、uint_least16_t、uint_least32_t、uint_least64_t int_fast8_t、int_fast16_t、int_fast32 _t、int_fast64_t、uint_fast8_t、uint_fast16_t、uint_fast32_t、uint_fast64_t; intmax_t、uintmax_t等。 uint8_t; typedef unsigned short uint16_t; typedef unsigned int uint32_t; typedef unsigned long long uint64_t; typedef signed char int_least8_t; typedef short int_least16
2.1K20发布于 2019-07-02 - 来自专栏流式抗体推文
告别杂细胞干扰！Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒，精准富集人初始 T 细胞
产品介绍Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒是一款操作快速简便的细胞分离产品，核心用于分离人初始 T 细胞。 检测原理Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性去除样本中 CD3⁻非 T 细胞、CD45RO⁺记忆 T 细胞等非目标细胞，实现人初始 T 细胞（CD3⁺CD45RA 应用领域免疫机制研究：探究初始 T 细胞的活化、分化及功能调控机制。肿瘤免疫治疗：用于 CAR-T 细胞疗法等研发中，提供高活性初始 T 细胞原料。 自身免疫病研究：分析初始 T 细胞在自身免疫病发生发展中的作用。疫苗研发：评估疫苗对初始 T 细胞的激活效果及免疫应答强度。再生医学：探索初始 T 细胞在组织修复与免疫重建中的应用。 品质稳定：2-8°C 保存期长达 12 个月，冰袋运输保障品质，批次间一致性高。
15710编辑于 2025-11-13 - 来自专栏单细胞天地
单细胞水平揭示CD8⁺ T-LGLL的免疫组特征
文章信息 题目：Single-cell characterization of leukemic and non-leukemic immune repertoires in CD8+ T-cell large 发现与正常样本相比，T-LGLL患者中异常克隆扩增的T细胞具有更复杂的异质性，包括显著上调的细胞毒性、抗细胞凋亡和T细胞耗竭。 、scTCRαβ-seq、Vβ流式细胞术得到CD8⁺T细胞的克隆型信息，得到11种T-LGLL克隆型 之后对T-LGLL克隆型的细胞进行重新聚类，得到7个亚群，其中最大的群上调了T-LGLL markers 之后为了验证突变型和野生型STAT3 T-LGLL 之间的差异，分析了普通转录组数据，与突变型STAT3患者相比，野生型 STAT3 患者的 CD8+ T 细胞具有更高的细胞毒性评分。 T-LGLL患者的细胞通讯增强 作者为了解释T-LGLL患者中细胞因子介导的白血病细胞和非白血病细胞间的细胞互作关系，分析了9 名 T-LGLL 患者和 8 名健康对照的血浆细胞因子表达。
60210编辑于 2023-02-16 uint8_t crc8_data(const uint8_t dat8)
// CRC8生成多项式#define POLYNOMIAL 0x07// 计算CRC8校验值uint8_t crc8_data(const uint8_t dat8) { uint8_t crc laipuhuo.com POLYNOMIAL 0x07// 初始化CRC8查找表void init_crc8_table(void) { uint8_t i, j; for (i = 0 = crc; }}// 计算CRC8校验值uint8_t crc8(const void *data, size_t len) { const uint8_t *byte = data; & 0xFF]; } return crc;}int main(int argc, char *argv[]) { int fd; uint8_t buffer; size_t bytes_read; uint8_t crc; if (argc !
45410编辑于 2024-08-19- 来自专栏生信技能树
纯粹靠单细胞转录组数据是很难区分CD4和CD8阳性T细胞
然后发现CD4和CD8的T细胞在单细胞转录组水平本来就很难确定亚群和名字 虽然说CD8 T和CD4 T细胞亚群 是一种分类方法，但是各自内部又是可以按照功能进行划分，naive, memory ，effector 那么是否有可能让CD8 T和CD4 T细胞亚群在umap上面就是截然不同的呢 其实是因为单纯的转录组水平的差异不足以区分CD8 T和CD4 T细胞亚群，不妨加入蛋白质表达量水平信息。 ，其它主要是CD8的T细胞。 如果你询问chatGPT单细胞水平CD8的T细胞可以细分哪些： 在单细胞水平上，CD8+ T细胞也可以被进一步细分为多种亚型，这些亚型主要根据它们的功能特性、细胞因子产生情况和表面标志物进行分类。 那么，CD4和CD8两个不同T细胞亚群需要各自内部独立做拟时序分析吗？
3K12编辑于 2023-11-23 - 来自专栏顶刊美图
跟着顶刊学习单细胞CD8T细功能基因集评分！
点击这里，后台回复20250410获取示例示例数据和学习资料前言卡卡继续带着大家在顶刊挖图，今天学习的仍然是这篇泛癌T细胞的文章。 先上图:对CD8T细胞进行功能评分并且绘制热图e, Heat map illustrating expression of 19 curated gene signaturesacross CD8+ T 函数##这里加载自己的CD8T细胞处理好的Seurat对象即可load("CD8_Obj.Rdata")读取CD8T细胞功能基因集# 设置输出路径figurePath <- ". (CD8_Obj$seurat_clusters)[ci]]) FunctionScoreMatrix[ri, ci] <- fv }}FunctionScoreMatrix <- t(apply ")))后续可以进行AI修整图片，即可得到原文效果结束语这篇推文就到此结束，用这篇顶刊收集到的基因集对CD8T细胞功能进行评分，可以用到自己的分析当中去。
47910编辑于 2025-04-10 - 来自专栏单细胞天地
干细胞样CD4+ T细胞判定及分析
B细胞依赖性免疫反应: T细胞(CD3E、CD4、CD8A、GZMB和LTB) B细胞(CD19、CD38、SDC1、FCRL3、FCRL5、CR2、LTB、JCHAIN、IGLL5和CD79B) 抗原呈递 簇1的基因转录本包括tf BCL6、MAF和TOX2，以及与B细胞辅助功能相关的基因，如IL21、CXCL13和TNFSF8，将它们鉴定为tfh样细胞 簇3的基因包括EOMES和SLAMF7，以及参与细胞毒性的基因如 PRF1、NKG7、GZMB和GZMK，表达趋化因子CCL4和CCL5 簇2和簇4的基因图谱包含细胞周期基因ME2F8、MKI67、PCNA和MCM2 基于这些发现，将这些细胞簇注释为TCF1hi CD4 + T细胞(簇0)、tfh样T细胞(簇1)、cycling(簇2和4)和细胞毒性CD4+ T细胞(簇3)。 TCF1hi CD4+ T细胞与所有其他CD4+ T细胞簇共享TCR克隆型 这些结果支持CD4+ TCF1hi T细胞具有高可塑性和自我更新能力，并产生更多分化的效应T细胞的概念 文章小结 血管动脉免疫细胞群的单细胞和全组织转录组学研究发现
55710编辑于 2024-05-20 - 来自专栏芒果先生聊生信
再谈T细胞：起源、分化和分群
c) 阳性选择 表达功能性TCRαβ的CD4+CD8+双阳性（DP）T细胞仍属于未成熟细胞。 若DP细胞的TCRαβ与胸腺上皮细胞表面的MHC-I类分子中等亲和力结合，则DP细胞表面CD8分子表达上调，CD4分子表达下调直至丢失，转变成CD8+单阳性T细胞； 若DP细胞的TCRαβ与胸腺上皮细胞表面的 CD4或CD8（成熟T细胞） 成熟的T细胞一般只表达CD4或CD8。CD4和CD8分子是跨膜糖蛋白分子，都不具有多样性。 CD152（CTLA-4） CD152（CTLA-4）组成性表达于调节性T细胞或诱导性表达于CD4+、CD8+T细胞表面，是B7家族分子的第二个受体。 初始T细胞：CD45、TCR-CD3、CD28、CD4/CD8 活化T细胞：CD152（CTLA4）、CD279（PD-1） 全活化T细胞：CD134（OX40） ? ?
7.6K31发布于 2020-08-05 - 来自专栏用户7627119的专栏
R批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件
前面我们简单的介绍过免疫组库以及单细胞免疫组库的应用。今天给大家介绍一个做免疫组库数据分析很实用的数据库IMGT，以及如何使用R从IMGT批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件。 一、IMGT简介 IMGT （http://www.imgt.org/）是免疫遗传学（ImMunoGeneTics）的缩写，专注于所有脊椎动物物种的免疫球蛋白、T细胞受体（T-cell Receptors B细胞受体VDJ序列文件的下载链接如下，留给大家自己练习吧！
90550编辑于 2022-09-21 - 来自专栏生信技能树
超详细T细胞亚群标记基因列表
看到了一个超详细的对T细胞亚群进行分析的文献，分享给大家！ 下面几张图来自文献： 整理后的： note：下面这两张图来自小红书 按照CD4/CD8/其他T分别分类： R代码版：用的时候可能需要稍微修改一下 ############################ ### # 创建一个空的list对象 cell_markers <- list() # CD4+ T细胞亚群 cell_markers$`Naive T cells` <- c("CCR7", "SELL , "KZF2", "IL10", "BATF") # CD8+ T细胞亚群 cell_markers$`Naive T cells` <- c("CCR7", "SELL", "S100A8", " $`Proliferation` <- c("MKI67", "TK1", "STMN1") # 细胞毒性 (Cytotoxicity) t_cell_states$`Cytotoxicity` <-
2.1K10编辑于 2025-05-25 - 来自专栏全栈程序员必看
int8_t、int16_t、int32_t转换
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君 文件中有四个字符 abcd 以int32_t读入只有1个数： 1684234849 转为二进制：1100100011000110110001001100001 每8位分隔（最前面补了个0）：01100100、01100011、01100010、01100001 转十进制：100、99、98、97，即 dcba 可以看到第一个字符在最低位 int8_t(1684234849 ) 截取最低8位，得到97，即 a int8_t(1684234849>>8) 向右移动8位后截取最低8位，得到98，即 b 转int16_t 同理。 反之，如果将int32_t数字写入文件：1684234849 以int8_t读出，会依次读到97、98、99、100，即abcd int8_t 还原为int32_t： int32_t(int32_t(100 ) << 24 | int32_t(99) << 16 | int32_t(98) << 8 | int32_t(97)) 结果为1684234849 发布者：全栈程序员栈长，转载请注明出处：https
3.5K20编辑于 2022-09-21 探索ImmGen:2-T细胞综合图谱
基本介绍 immgen T 开源项目”联合41个实验室，绘制了包含62万余个细胞的小鼠T细胞综合图谱，整合多组学数据揭示了8大类及114个亚群，旨在全面解析T细胞在不同组织和免疫亚群的多样性。 小鼠T细胞综合图谱包括在单细胞水平上进行分析，整合mRNA测序、表面蛋白表达（CITE-seq/TotalSeq）和TCR-V测序（配对α/β链）。 AllResting（相对于所有静息状态细胞） 该网页通过交互式地图与统计图表，直观揭示了CD4+ T细胞亚群在不同生理病理状态下的转录组特征，特别是Cluster 1表现出的激活或效应记忆样表型（如Ly6c1 分析特定数据集的单细胞基因表达分布： 如下图所示，通过交互式 UMAP 图表探索特定基因（如 Satb1）在调节性 T 细胞数据集中的表达分布。页面提供了细胞类型筛选、亚群选择及绘图模式切换工具。 总结：ImmgenT 模块，是研究T细胞相关基因在不同组织与不同细胞亚群重要资料，是研究基因在发育过程中组织与细胞特异性的百科全书。
18010编辑于 2026-01-27人T细胞激活试剂盒在细胞疗法中的应用
二、T细胞活化的双信号机制T细胞的完全活化依赖于两个独立但协同的信号传导通路。第一信号由TCR/CD3复合物识别APC表面的抗原肽-MHC分子复合物所触发，决定了T细胞应答的特异性。 这一机制是机体维持外周免疫耐受的重要方式，也为体外T细胞激活策略的设计提供了理论基础。三、人T细胞激活试剂盒的核心组分人T细胞激活试剂盒的核心功能是模拟体内APC提供的双信号刺激。 四、激活试剂在不同细胞疗法中的应用（一）CAR-T细胞制备在CAR-T细胞生产流程中，T细胞的离体激活是基因修饰前的关键步骤。 研究人员通过优化细胞因子组合，在培养基中添加IL-7、IL-15等，可将诱导周期缩短至7天左右，25-30天扩增至临床所需细胞量，同时提高CD8+杀伤性T细胞的比例，改善临床疗效。 五、激活条件对T细胞质量的影响激活策略不仅影响T细胞的扩增效率，还深刻影响其功能表型和临床应用效果。
8710编辑于 2026-03-16- 来自专栏DrugOne
Science | 肿瘤浸润性T细胞的泛癌单细胞图谱
(ISG)-阳性T细胞；杀伤细胞免疫球蛋白-如受体(KIR)-阳性自然杀伤(NK)-如T细胞、ZNF683+CXCR6+组织驻留记忆T细胞(Trm细胞)和CD8+区室中的四个耗竭CD8+T细胞(Tex细胞 从优势比(OR)分析来看，幼稚T细胞和Temra细胞(CD4+和CD8+)在血液中表现出强烈的分布偏好，而TNFRSF9+ Treg细胞、TFH/TH1细胞、CD8+ISG+T细胞和四个CD8+Tex细胞群似乎在肿瘤上富集 总之，出现了潜在的肿瘤反应性T细胞-TFH/TH1细胞、TNFRSF9+ Treg细胞、CD8+ISG+T细胞和四种Tex细胞群，代表了局部抗肿瘤免疫反应-而扩增的CD8+Temra细胞也可能含有肿瘤特异性 由于FOXP3对Treg细胞功能很重要，因此CD8+FOXP3+T细胞(CD8+Treg细胞)与耗竭之间的联系值得进一步研究。 C3至C8的肿瘤具有低频率的终末Tex细胞和高频率的CD8+ZNF683+CXCR6+Trm细胞，可进一步分为以幼稚T细胞(C7)、富集幼稚T细胞(C8)、富集Temra 细胞(C6)、富集Tc17或TH17
93620编辑于 2022-03-25 - 来自专栏天意生信俱乐部
单细胞互作新思路！NicheNet实战：单核细胞如何调控T细胞？附代码
这里我们选择单核细胞作为发送者，记忆型CD4+ T细胞作为接收者。 receiver_cells <- WhichCells(seuratObj, expression = seurat_annotations == "Memory CD4 <em>T</em>") # 确认细胞数量 cat("发送细胞(CD14+ Mono)数量:", length(sender_cells), "\n") cat("接收细胞(Memory CD4 T)数量:", length(receiver_cells 这里我们比较记忆CD4+ T细胞和初始CD4+ T细胞的差异基因。 通过本教程的分析流程，我们确定了PBMC中单核细胞可能向记忆CD4+ T细胞发送的关键信号分子，以及这些信号可能影响的下游靶基因。
1.1K00编辑于 2025-05-14 多组学文献分享---T-bet+CD8+ T细胞在微卫星稳定型胃癌中控制抗PD-1应答
结果6、T-bet+CD8+ T细胞在ICI敏感性癌症的肿瘤区室中高度浸润T-bet+ CD 8 + T细胞与肿瘤细胞更接近。 在胃癌队列中，MSI-H胃癌细胞有T-bet+ CD 8 + T细胞浸润增加的趋势，14.16%（16/113）的MSS胃癌细胞的T-bet+ CD 8 + T细胞浸润较大多数MSI-H胃癌细胞多。 结果8、T-bet+ T细胞和PD-L1+肿瘤细胞之间的正反馈回路驱动ICI敏感性T-bet+ CD 8 + T细胞是MSI-H和MSS GC中最重要的整体传入信号接收者（单细胞通讯分析）。 然而，仅在MSI-H GC中，T-bet+ CD 8 + T细胞与广泛的其他细胞类型（如巨噬细胞、树突状细胞、癌性上皮细胞、CD 8 + T细胞和Treg）相互作用，而在MSS GC中，通信限于成纤维细胞和血管内皮细胞内 MSI-H GCs中的T-bet+ CD 8 + T细胞也显示出比MSS GCs中更高的细胞毒性分子和HLA分子的表达，暗示T-bet+ CD 8 + T细胞的更强的细胞毒性表型也可能由肿瘤先天特性驱动
25710编辑于 2025-05-22- 来自专栏流式抗体推文
Elabscience 小鼠CD3CD28 T细胞活化珠：小鼠 T 细胞体外扩增的 “黄金工具”
T 细胞的体外激活与扩增。 产品支持磁吸分离，适配多种样本类型，且在 2-8℃条件下可稳定保存一年，为免疫机制研究、细胞治疗研发等领域提供可靠工具，目前售价 6280 元，提供多规格选择。 肿瘤免疫研究：激活小鼠肿瘤模型来源的 T 细胞，研究肿瘤微环境对 T 细胞功能的抑制作用，或筛选增强 T 细胞抗肿瘤活性的药物。 细胞治疗研发：体外扩增小鼠抗原特异性 T 细胞，为过继性 T 细胞治疗等细胞疗法的临床前研究提供细胞来源。 稳定性强易储存：产品在 2-8℃条件下可稳定保存 12 个月，且明确要求切勿冷冻，储存条件宽松，便于实验室长期储备使用。
26710编辑于 2025-09-18
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