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探索ImmGen:2-T细胞综合图谱
基本介绍 immgen T 开源项目”联合41个实验室，绘制了包含62万余个细胞的小鼠T细胞综合图谱，整合多组学数据揭示了8大类及114个亚群，旨在全面解析T细胞在不同组织和免疫亚群的多样性。 小鼠T细胞综合图谱包括在单细胞水平上进行分析，整合mRNA测序、表面蛋白表达（CITE-seq/TotalSeq）和TCR-V测序（配对α/β链）。 All（相对于所有细胞） 2. Cluster 1 vs. 单细胞Treg细胞亚群交互模块 Rosetta2浏览器浏览单细胞数 1.在这个界面，选择不同细胞亚群或者不同数据集中单细胞数据，可以在2处进行搜索，3处进行单个数据集的进一步分析。 2. 总结：ImmgenT 模块，是研究T细胞相关基因在不同组织与不同细胞亚群重要资料，是研究基因在发育过程中组织与细胞特异性的百科全书。
18010编辑于 2026-01-27- 来自专栏流式抗体推文
告别杂细胞干扰！Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒，精准富集人初始 T 细胞
产品介绍Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒是一款操作快速简便的细胞分离产品，核心用于分离人初始 T 细胞。 检测原理Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性去除样本中 CD3⁻非 T 细胞、CD45RO⁺记忆 T 细胞等非目标细胞，实现人初始 T 细胞（CD3⁺CD45RA 应用领域免疫机制研究：探究初始 T 细胞的活化、分化及功能调控机制。肿瘤免疫治疗：用于 CAR-T 细胞疗法等研发中，提供高活性初始 T 细胞原料。 自身免疫病研究：分析初始 T 细胞在自身免疫病发生发展中的作用。疫苗研发：评估疫苗对初始 T 细胞的激活效果及免疫应答强度。再生医学：探索初始 T 细胞在组织修复与免疫重建中的应用。 品质稳定：2-8°C 保存期长达 12 个月，冰袋运输保障品质，批次间一致性高。
15710编辑于 2025-11-13 - 来自专栏单细胞
单细胞实战之亚细胞分群之CD4+T细胞分群——从入门到进阶(中级篇2）
该推文首发于公众号：单细胞天地上一讲在完成了从T/NK至CD4+T细胞流程实践后，在这一讲内容中我们将对CD4+T细胞进行亚群的细分。 差异基因结果；首先需要对常规的CD4+T细胞亚群具有一定了解，这些细胞亚群包括了：幼稚性T细胞，辅助性T细胞(THs)，记忆性T细胞和调节性T细胞(Treg)等细胞。 辅助性T细胞：主要通过信号传导支持其他免疫细胞的功能。根据它们分泌的细胞因子不同，可以分为多个亚型(Th1，Th2，Th9，Th17，Th22，Tfh)，每种亚型在免疫应答中发挥不同的作用。 2.2 区分其他T细胞亚群理论上也应该层层递进下去，但实操中发现还是有点难度,不同细胞亚群的标志物界限比较模糊# 进一步区分其他亚群CD4_markers_step2 =list( T_check=c 第1、2 簇可能为Th1细胞，因其特征性标志物包括TBX21(+)。第4、5、11簇可能为记忆性T细胞，因其表达ANXA1、GIMAP4、LEF1、TCF7。
1.9K00编辑于 2025-03-23 - 来自专栏全栈程序员必看
A2W W2A A2T T2A _T() 含义以及用法
A2W、W2A、A2T、T2A _T() 的含义及使用方法 1、A2W和W2A 在《Window核心编程》，多字节和宽字节之间转换比较麻烦的，MultiByteToWideChar函数和WideCharToMultiByte WCHAR* wchar = _T("qwer"); const char* achar = W2A(wchar); cstring = wchar; （3）A2T的用法：char* ——> CString USES_CONVERSION; char* achar = "qwer"; CString cstring = A2T(achar); （4）W2A的用法：CString ——> char* USES_CONVERSION; CString cstring = _T("qwer"); char* achar = T2A(cstring); （5）_T(“”)是一个宏，定义于tchar.h 下 #define _T(x) __T(x) #ifdef _UNICODE #define __T(x) L ## x #else #define __T(x) x 发布者：全栈程序员栈长，转载请注明出处
96010编辑于 2022-09-23 - 来自专栏单细胞天地
TREM2(high)巨噬细胞和γδT细胞的基因表达特征预测免疫治疗反应
方法：分析了接受ICT治疗的黑色素瘤样本的单细胞RNA测序公共数据集和4个转录组数据集。 结果：确定了在ICT无应答反应的样本中，有高表达TREM2的巨噬细胞亚群和gammadelta T细胞亚群。 : CD8+ T cells (CD3+CD8A+CD4−); CD4+ T cells (CD3+CD8A−CD4+); Regulatory T cells (Tregs) (FOXP3+); MKI67hi Supplementary Figure 7 5.γδT细胞和B细胞亚群与ICT反应的关系 他们还鉴定了两组γδT细胞（n=927；clusters8)。 这表明，cluster21γδT细胞（命为Tgd_c21）可能导致ICT耐药。对Tgd_c21和Tgd_c8进行差异分析，差异最明显基因为RRM2，BIRC5、SPC24、UBE2C和CDCA5。 Figure3 6.在其他scRNA数据集验证 下载重新分析了黑色素瘤接受免疫治疗的单细胞数据。该数据集没有γδT细胞数据。
1.8K40编辑于 2022-06-13 - 来自专栏单细胞天地
干细胞样CD4+ T细胞判定及分析
B细胞依赖性免疫反应: T细胞(CD3E、CD4、CD8A、GZMB和LTB) B细胞(CD19、CD38、SDC1、FCRL3、FCRL5、CR2、LTB、JCHAIN、IGLL5和CD79B) 抗原呈递 簇1的基因转录本包括tf BCL6、MAF和TOX2，以及与B细胞辅助功能相关的基因，如IL21、CXCL13和TNFSF8，将它们鉴定为tfh样细胞 簇3的基因包括EOMES和SLAMF7，以及参与细胞毒性的基因如 PRF1、NKG7、GZMB和GZMK，表达趋化因子CCL4和CCL5 簇2和簇4的基因图谱包含细胞周期基因ME2F8、MKI67、PCNA和MCM2 基于这些发现，将这些细胞簇注释为TCF1hi CD4 + T细胞(簇0)、tfh样T细胞(簇1)、cycling(簇2和4)和细胞毒性CD4+ T细胞(簇3)。 基因特征分析显示，cycling2表现出更强的T细胞受体(TCR)信号特征，表明cycling1和cycling2的激活状态不同 CD4+ T细胞亚群之间潜在的谱系关系 使用Monocle3进行了伪时间分析
55710编辑于 2024-05-20 - 来自专栏芒果先生聊生信
再谈T细胞：起源、分化和分群
2. CD4或CD8（成熟T细胞） 成熟的T细胞一般只表达CD4或CD8。CD4和CD8分子是跨膜糖蛋白分子，都不具有多样性。 初始T细胞——CD45RA、CD62Lhigh 效应T细胞——CD45RO、IL2Rhigh 效应型记忆T细胞——CD45RO、CCR7- 中央型记忆T细胞——CD45RO、CCR7+或CD44、CD62Lhigh CD28识别专职性抗原呈递细胞（APC）表面的B7-1（CD80，诱导性表达）和B7-2（CD86，组成性表达），提供T细胞活化的第二信号。 PD-1有两个配体：PD-L1和PD-L2（PD-L1、PD-L2与B7-1、B7-2结构高度同源，在活化的APC表面表达）。 5. 体内检测CTL功能的方法： 1）体内细胞毒性杀伤实验； 2）抗原肽-MHC分子四聚体技术； 3）ELISPOT； 4）LDH释放法。 ?
7.6K31发布于 2020-08-05 - 来自专栏用户7627119的专栏
R批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件
前面我们简单的介绍过免疫组库以及单细胞免疫组库的应用。今天给大家介绍一个做免疫组库数据分析很实用的数据库IMGT，以及如何使用R从IMGT批量下载B细胞和T细胞受体VDJ序列文件。 一、IMGT简介 IMGT （http://www.imgt.org/）是免疫遗传学（ImMunoGeneTics）的缩写，专注于所有脊椎动物物种的免疫球蛋白、T细胞受体（T-cell Receptors 我们把这10个文件的名字读到file变量中 2.下载TCR VDJ序列文件 #创建文件夹 dir.create("TCR_seq") #循环下载10个文件 for(TCR in file){ out B细胞受体VDJ序列文件的下载链接如下，留给大家自己练习吧！
90550编辑于 2022-09-21 - 来自专栏生信技能树
超详细T细胞亚群标记基因列表
看到了一个超详细的对T细胞亚群进行分析的文献，分享给大家！ ### # 创建一个空的list对象 cell_markers <- list() # CD4+ T细胞亚群 cell_markers$`Naive T cells` <- c("CCR7", "SELL ", "CTLA4", "TIGIT", "TNFRSF18", "MAGEH1", "SAT1", "CCR8", "KZF2", "IL10", "BATF") # CD8+ T细胞亚群 cell_markers cell_markers$`TSEN` <- c("低表达CD27") cell_markers$`p-TEX` <- c("TCF7", "CD27", "CD28", "EOMES") # 非常规T细胞亚群 (Proliferation) t_cell_states$`Proliferation` <- c("MKI67", "TK1", "STMN1") # 细胞毒性 (Cytotoxicity) t_cell_states
2.1K10编辑于 2025-05-25 人T细胞激活试剂盒在细胞疗法中的应用
二、T细胞活化的双信号机制T细胞的完全活化依赖于两个独立但协同的信号传导通路。第一信号由TCR/CD3复合物识别APC表面的抗原肽-MHC分子复合物所触发，决定了T细胞应答的特异性。 四、激活试剂在不同细胞疗法中的应用（一）CAR-T细胞制备在CAR-T细胞生产流程中，T细胞的离体激活是基因修饰前的关键步骤。 经典方法先用高浓度IL-2诱导TIL初步扩增，随后使用含抗CD3和抗CD28抗体的培养基进行大规模扩增。 （三）Treg细胞培养调节性T细胞（Treg）在外周血中比例极低，仅占单个核细胞的1-2%，而临床治疗单次需输注1×10⁹个细胞，体外扩增需求高达50-100倍。 Treg细胞的激活同样依赖CD3/CD28双信号刺激，常用方法为抗CD3/CD28抗体偶联磁珠联合IL-2和TGF-β等生长因子，实现Treg细胞的特异性扩增，用于自身免疫性疾病治疗和器官移植排斥预防的研究
8710编辑于 2026-03-16- 来自专栏CSDNToQQCode
JavaScript-T2
JavaScript-T2 前言 本次主要讲解的知识点是： JavaScript自定义函数 JavaScript系统函数 JavaScript 事件 JavaScript 的常用事件 JavaScript button>
<button onclick="console.log(maxValue(5,6))">最大数值</button> </body> </html> 状态1 状态249030编辑于 2022-12-05 - 来自专栏DrugOne
Science | 肿瘤浸润性T细胞的泛癌单细胞图谱
2 结果 T细胞泛癌单细胞转录组图谱的构建 作者编译了21种癌症类型的T细胞单细胞转录组图谱(图1A)。 和P2作为T细胞耗竭的通用路径。 卵巢癌的一个末端Tex细胞子集表达了Treg细胞主导的TF FOXP3(图2E)，这些CD8+FOXP3+T细胞倾向于与表达CXCL13的细胞共享TCR，这意味着CD8+FOXP3+T细胞和CXCL13 同样，卵巢癌末端Tex细胞的一个子集表达KIR2DL3和TXK，它们是KIR+TXK+T细胞的标志基因(图2E)，并且这些细胞与表达CXCL13细胞共享TCR。 图2 CD8+耗竭T细胞的异质性和动力学 CD4+区室中潜在肿瘤反应性T细胞的特性 在CD4+区室中，主要的潜在肿瘤反应性元簇是IFNG+TFH/TH1和TNFRSF9+Treg细胞。
93620编辑于 2022-03-25 - 来自专栏天意生信俱乐部
单细胞互作新思路！NicheNet实战：单核细胞如何调控T细胞？附代码
这里我们选择单核细胞作为发送者，记忆型CD4+ T细胞作为接收者。 这里我们比较记忆CD4+ T细胞和初始CD4+ T细胞的差异基因。 ident.1 = "Memory CD4 T", ident.2 = "Naive CD4 T", > 0] cat("记忆CD4+ T细胞上调的差异基因数量:", length(geneset_oi), "\n") # 定义背景基因(在任一CD4 T细胞亚群中有表达的基因) cd4_cells 通过本教程的分析流程，我们确定了PBMC中单核细胞可能向记忆CD4+ T细胞发送的关键信号分子，以及这些信号可能影响的下游靶基因。
1.1K00编辑于 2025-05-14 - 来自专栏流式抗体推文
Elabscience 小鼠CD3CD28 T细胞活化珠：小鼠 T 细胞体外扩增的 “黄金工具”
产品支持磁吸分离，适配多种样本类型，且在 2-8℃条件下可稳定保存一年，为免疫机制研究、细胞治疗研发等领域提供可靠工具，目前售价 6280 元，提供多规格选择。 信号 2（协同刺激信号）：磁珠表面同时偶联的 CD28 单克隆抗体与 T 细胞表面的 CD28 分子结合，提供关键的协同刺激信号，弥补单一抗原信号的不足，确保 T 细胞从初始状态向活化状态转变并启动增殖程序 肿瘤免疫研究：激活小鼠肿瘤模型来源的 T 细胞，研究肿瘤微环境对 T 细胞功能的抑制作用，或筛选增强 T 细胞抗肿瘤活性的药物。 细胞治疗研发：体外扩增小鼠抗原特异性 T 细胞，为过继性 T 细胞治疗等细胞疗法的临床前研究提供细胞来源。 稳定性强易储存：产品在 2-8℃条件下可稳定保存 12 个月，且明确要求切勿冷冻，储存条件宽松，便于实验室长期储备使用。
26710编辑于 2025-09-18 【免疫笔记】αβ T 细胞谱系的时间追踪系统
1.追踪系统的基因构建原理 通过基因编辑实现 T 细胞发育阶段的特异性标记： 基因插入策略：在 TCRδ 基因（T 细胞受体 δ 链）的恒定区下游插入Cre-ER基因片段。 因此，Cre-ER片段会仅在 DP 阶段的 T 细胞中存在，SP 及后续阶段的 T 细胞中则消失。 T 细胞中生效）； 追踪过程：标记胸腺中的 DP T 细胞后，观察这些细胞在衰老过程中向胸腺 SP 阶段、外周脾脏 CD4+ T 细胞的迁移 / 留存情况。 ）：胸腺 DP 细胞的标记率下降（8.2%），但胸腺 CD4SP、脾脏 CD4 细胞的标记率上升（24%、3.2%）——说明标记的 DP T 细胞向后续阶段 / 外周组织迁移。 意义：这个系统实现了对 αβ T 细胞发育特定阶段（DP 阶段）的 “时间特异性标记”，可以精准追踪这些细胞在体内的分化、迁移和衰老命运，为研究 T 细胞发育、免疫记忆维持等提供了工具
17710编辑于 2025-11-30一文讲清T细胞命名及marker
三、CD4 T细胞亚组TH1 cell：T_H1细胞促进针对那些能够逃避巨噬细胞内杀伤的病原体的免疫应答TH2 cell：T_H2细胞促进对蠕虫寄生虫的免疫应答，并可导致过敏性炎症。 TH9 cell：致病性TH2 (pTH2) 细胞、人类中的TH2A（过敏性）细胞或小鼠中的TH9RM (T_H9组织驻留记忆）细胞。 cell)：在有利于T_reg细胞分化的细胞因子存在下，在体外被分化成T_reg细胞的CD4+ T细胞。 四、记忆T细胞亚群TCM (T central memory) cell：能够穿越静息状态的高内皮微静脉，通常在抗原刺激下表达IL-2，并通常保持增殖和分化为效应T细胞、T_EM细胞和T_RM细胞的能力 Nat Rev Immunol (2025). https://doi.org/10.1038/s41577-025-01238-2Andrew O. Cole, Rachel W.
52710编辑于 2025-12-16- 来自专栏单细胞天地
人类胸腺发育的细胞图谱揭示了T细胞组库的形成
CD45 分别富集免疫细胞和非免疫细胞 CD3 分别富集 T 细胞和非 T 细胞 EPCAM 富集上皮细胞 建库方法： 10x Genomics Single Cell 3' v2 and 5’ Reagent VDJ 重排基因（RAG1, RAG2）从增殖晚期开始增加，于静息态达到高峰，提示了 T 细胞分化中增殖和重排的关系 通过整合 TCR 数据，作者发现，在增殖晚期 DN 中检测到重排的 TCRβ 链，与重排事件和 基因，例如early DN（ST18）、DP （AQP3）和 DP-to-SP 过渡态（TOX2），并且构建了 T 细胞谱系定向相关的转录因子调控网络 ? 此外，作者注意到另一群由非编码 RNA（MIR155HG）定义的不同于终末分化 Treg 及 Treg(diff) 的细胞，注释为 T(agonist) ，其表达 IL2RA 但低表达 FOXP3，与小鼠胸腺中 TRDV1 和 TRDV2 两个常见的 TCRδ V 基因，发现 TRDV2 主要用于 DN 阶段，而 TRDV2 主要用于 DP(Q) 和 αβT entry 阶段。
4.4K51发布于 2021-04-16 - 来自专栏全栈程序员必看
NOIPD2T2 – 宝藏 题解
考场上没有想清楚就草草码了一个Prim然后交了，但是因为你代价和深度有关，所以贪心地Prim是错误的。
27330编辑于 2022-07-21 - 来自专栏生信技能树
为什么一个单细胞亚群既有T细胞也有B细胞的标记基因呢
b站免费视频课程 地址：https://www.bilibili.com/video/BV19Q4y1R7cu 很多小伙伴在实践我们的教程的时候，会注意到一个很有意思的现象，就是某个单细胞亚群既有T细胞也有 B细胞的标记基因，如下所示，其实很简单： 某个单细胞亚群既有T细胞也有B细胞的标记基因 可以看到， 这个cycling 亚群就是 既有T细胞也有B细胞的标记基因，实际上是因为它们这群细胞高表达 TOP2A 和MKI67基因，处于比较活跃的细胞增殖状态，这样无论它本身是 T细胞还是B细胞，它们的这个状态使得它们在普通的降维聚类分群的流程里面就会被混合在一起。 breast cancer》，也提到了这样的现象： 这个文章的研究者们的解决方案是单独拿出来这个 cycling 亚群 进行继续细分，所以就有了如下所示： . d, UMAP depicting the T-cell phenotypes detected in the proliferative T-cell subcluster.
1.5K20发布于 2021-11-23 - 来自专栏作图丫
【单细胞文献解读】溃疡性结肠炎CD8+T细胞的单细胞图谱
还观察到双阳性(DP) CD4+ CD8+ FOXP3+T细胞数量在UC中增加，natural TYROBP+在UC中减少，TYROBP-IEL在UC中增加(图2A)。 在上皮内淋巴细胞(IEL)和IL26+T细胞中发现了整体的信号水平较高，这是由包括KIR3DL2(Rs17771967)在内的基因的特异性高表达所驱动的(图2C，D)。 在CD8+T细胞中，发现了谱系特异性细胞的相互作用，如IL18-IL18R1/IL18RAP和TNF-TNFRSF1A，只在吸收细胞和多个CD8+亚群之间互作，而在分泌型的细胞则不出现(图2D，E)。 在初始T细胞和早期的中枢记忆T细胞中CCR7表达较高，而共抑制受体(HAVCR2，CTLA4)在晚期表达较高(图3D，E)。并且发现，随着共抑制分子的逐渐增加，T细胞激活标志物有很强的信号。 同时随着BATF、CTLA4、HAVCR2、LAYN和TNFRSF9的表达增加，而与效应T细胞功能相关的分子(如GZMK)，则稳步丢失(图3C-E)。
1.2K20编辑于 2022-03-29
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