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Seurat, SeuratObject and Matrix version issue
如果你在安装和使用Seurat (v5) and SeuratObject (v5) 过程中，出现了一些关于Matrix package的问题，可以看看本文。 ).library(Seurat)library(SeuratObject)Error: package or namespace load failed for ‘SeuratObject’ in dyn.load 我发现1.6-2版本可以正常安装。 所以事情又回到了起点，还是需要安装Matrix 1.6-1. 4). 而Matrix package就需要Fortran compiler，我电脑没有安装，所以我需要安装fortran编译器。5).
4.7K61编辑于 2023-11-21 - 来自专栏生信技能树
假如你不喜欢最新版的Seurat包的单细胞理念
我们依赖于这个V4的版本的Seurat流程做出来了大量的公共数据集的单细胞转录组降维聚类分群流程，100多个公共单细胞数据集全部的处理，链接：https://pan.baidu.com/s/1MzfqW07P9ZqEA_URQ6rLbA 也是V5了，这样的话如果新人开始学单细胞转录组技术分析流程，使用默认的安装代码，就默认安装了V5版本的SeuratObject 和Seurat，非常可怕！！！ _4.1.3.tar.gz 2022-11-07 19:50 185K [ ] SeuratObject_4.1.4.tar.gz 2023-09-27 00:30 186K 首先卸载你默认安装的 然后就可以简单的使用代码去卸载你默认安装的V5版本的SeuratObject 和Seurat： remove.packages(“SeuratObject”) remove.packages(“Seurat 然后安装旧版本的SeuratObject 和Seurat 安装旧版本的SeuratObject 和Seurat需要首先拿到网页链接地址，然后从网页安装 # 4 download from URL packageurl
3.9K21编辑于 2023-11-14 - 来自专栏ops技术分享
openstack安装（9）
[root@controller ~]# yum install -y rabbitmq-serve
41720发布于 2021-05-06 - 来自专栏CSDN技术博客
WebSphere9（was9）静默安装
was9安装与was8.5区别在于：was9安装时需要和JDK一起装，不能单独安装； 之前写过was8.5的静默安装博客https://blog.csdn.net/mfanoffice2012/article IBM SDK Java Technology Edition for Installation Manager consult the product documentation 8.5 与 9主要区别之处 /eclipse/tools/imcl install \ com.ibm.websphere.ND.v85_8.5.5000.20130514_1044 \ #was程序包小版本，此处注意与was9对比
2K20发布于 2021-08-10 - 来自专栏云同步
Docker 安装 Elasticsearch 9
Run Elasticsearch locally | Elastic Docs 环境 操作系统：Ubuntu 24.04 LTS 容器：Docker 28.2.2 ES 版本：最新版（9.0.3） 安装 1）安装 docker【已安装可跳过】 参考：Ubuntu 安装 docker-CSDN博客 2）启动 elasticsearch 若是出现报错请往 Q&A 看 # 通过 curl 下载启动脚本 并进行执行
61110编辑于 2025-08-01 - 来自专栏学习java的小白
安装tomcat9
一、下载 官网 下载地址： https://tomcat.apache.org/download-90.cgi 二、解压安装 1、首先进入你上传的压缩文件所在目录
66520发布于 2020-12-07 - 来自专栏云计算教程系列
如何在Debian 9上安装Apache Tomcat 9
本教程介绍Debian 9服务器上Tomcat 9的最新版本的基本安装和一些配置。 准备 在开始本教程之前，您应该拥有一个在您的服务器上设置了sudo权限的非root用户。 您可以通过完成我们的Debian 9初始服务器设置教程来了解如何执行此操作。 没有服务器的同学可以在这里购买，不过我个人更推荐您使用免费的腾讯云开发者实验室进行试验，学会安装后再购买服务器。 第3步 - 安装Tomcat 安装Tomcat 9的最佳方法是下载最新的二进制版本，然后手动配置它。 在Tomcat 9下载页面上找到最新版本的Tomcat 9 。 /tomcat-9/v9.0.11/bin/apache-tomcat-9.0.11.tar.gz 我们将Tomcat安装到/opt/tomcat目录中。 想要了解更多关于安装Apache Tomcat 9的相关教程，请前往腾讯云+社区学习更多知识。
3.8K63发布于 2018-11-05 - 来自专栏全栈程序员必看
Linux安装Tomcat9
Linux安装Tomcat9 1：下载安装包 安装完jdk，我们需要下载tomcat了，点我跳转，这样子我们找到Binary Distributions，下载链接.tar.gz（http://mirrors.cnnic.cn /apache/tomcat/tomcat-9/v9.0.0.M9/bin/apache-tomcat-9.0.0.M9.tar.gz）下载 可以用wget （先用命令行cd到所在目录运行wget http://mirrors.cnnic.cn/apache/tomcat/tomcat-9/v9.0.0.M9/bin/apache-tomcat-9.0.0.M9.tar.gz）或者浏览器下载 : /usr/soft/apache-tomcat-9.0.0.M9 Using CATALINA_TMPDIR: /usr/soft/apache-tomcat-9.0.0.M9/temp 在浏览器输入http://127.0.0.1:8080 ,或者使用命令w3m http://127.0.0.1:8080(w3m命令没有的话，请使用apt-get或者yum安装，具体请百度)
2K20编辑于 2022-09-01 - 来自专栏m0w3n
Debian9安装Metasploit
参考博文：https://www.jianshu.com/p/ea0629b9e367 0x0 添加Kali源 deb http://http.kali.org/kali kali-rolling main non-free contrib 添加数字证书 $wget archive.kali.org/archive-key.asc //下载签名 $apt-key add archive-key.asc //安装签名 更新包列表 $apt-get update 0x1 安装postgresql 添加postgresql源 deb http://apt.postgresql.org/pub/repos/apt/ stretch-pgdg main 安装postgresql $wget --quiet -O - https://www.postgresql.org/media/keys/ACCC4CF8.asc | apt-key add #so easy 0x3 初始化metasploit-framework $msfdb init 0x4 完成安装，检查 msf启动 $msfconsole 检测数据库连接 msf>db_status
2.5K10发布于 2020-02-28 - 来自专栏Tacc
Debian9安装openssl
使用源代码安装一些程序，比如Zabbix及BIND9都需要openssl服务器组件的支持，另外在安装过程中还有可能会需要zlib的支持。 对于服务器安装系统及使用apt源的方式进行安装服务一般都是比较旧的，可以使用源码进行安装较新版本的服务。 /下面，安装位置为/usr/local/openssl/目录下。 cd /home/debian tar -zxvf openssl-1.0.2m.tar.gz 3、对于已经解压缩的文件进行安装编译。使用./config或者. /configure进行编译,然后使用make及make install进行编译安装。
2.2K10编辑于 2022-05-05 - 来自专栏爱游博客
安卓9安装Xposed框架
前两天把自己手机升级到了Android P也就是安卓9.0升级后才发现无法安装Xposed框架，Xposed框架真的是个神器，模块各种各样的都有，搞机必备，所以有了这篇文章，纯记录下 Android P Edxposed及太极得安装使用方法，前提是你有安装Magisk框架。 Edxposed安装 先下载Magisk框架模块，在Magisk框架里面刷入即可。 注意：如果启动模块导致无法开机先不要急着重置手机，进入rec到文件管理器进入data>app文件夹，删除刚刚安装的模块即可开机。 Edxposed后启用微X模块会卡死在开机第二屏 太极·magisk 太极和上面一样的安装方法 太极·阴是APP安装版，太极·阳是magisk安装版 当然你也可以不安装magisk版本，直接下载太极安装
18.2K20发布于 2019-08-07 将SeuratV5降为V4：目前试过最简便的方法，复制黏贴可用
先正常下载SeuratBiocManager::install("Seurat")BiocManager::install("SeuratObject")#此时的版本> packageVersion(" Seurat")[1] ‘5.1.0’> packageVersion("SeuratObject")[1] ‘5.0.2’> packageVersion("Matrix")[1] ‘1.6.1.1’ 然后单独卸载Seurat和SeuratObjectremove.packages("SeuratObject")remove.packages("Seurat")#detach(package:Seurat 'spatstat.core' are not available for package 'Seurat'此处的E:/develop/handmake_install_packages请更改为你本人安装这几个软件包的路径 ，但因为安装SeuratObject需要的Matrix软件包的版本为1.5-4，而下载Matrix过程中又要依赖spatstat.core软件包，因此在本地或者github下载这几个包。
4.3K00编辑于 2024-07-19- 来自专栏Y5neKO博客
Debian 9 安装和配置VNC
以上是 VNC 的介绍（复制的） 因为今天刚在阿里云花两百多大洋买了个服务器，思考了许久决定用 Debian9，为了方便桌面化管理，所以准备配置一下 VNC 服务 准备：Debian 服务器一台 下面开始教程 第一步：安装桌面环境 Debian9 默认情况下是没有桌面环境的，所以我们先来准备好桌面环境 这里我准备安装 GNOME 桌面环境 首先 SSH 连接上服务器 更新你的软件包列表 apt-get update 然后在你的服务器上安装 GNOME 环境 apt-get install x-window-system-core -y apt-get install task-gnome-desktop 安装完成后使用 = root quiet_success 保存退出 重启即可自动启动桌面环境，如果没启动输入 startx GNOME 环境就搭建好了 第二步：安装 VNC 服务器 我这里用的是 TightVNC 服务器 首先安装 TightVNC apt-get install tightvncserver 安装完成后使用 vncserver 命令进行 vnc 服务器的初始配置，设置安全密码并创建初始配置文件
2.7K20编辑于 2022-01-13 - 来自专栏生信菜鸟团
玩转服务器-配置SeuratV4环境
Seurat V4 先正常安装Seurat，会默认安装V5版本及Seurat相关依赖包 #配置Seurat V4 #检查路径设置 .libPaths() #正常安装 install.packages ("SeuratObject") install.packages("Seurat") ##安装后检查 library(Seurat) installed.packages()["Seurat", c "SeuratObject")) #安装Seurat V4 install.packages('SeuratObject',repos=c('https://satijalab.r-universe.dev ()["SeuratObject", c("Package", "Version", "LibPath")] 成功安装SeuratObject 安装 Seurat V4 可能会遇到报错。 ，再次执行安装命令，即可成功安装。
82810编辑于 2025-04-02 - 来自专栏分析工具
Seurat4/Seurat5共存技巧学习
::install_version("SeuratObject", "4.1.4") remotes::install_version("Seurat", "4.4.0")# 重启设定V4路径.libPaths (c("/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.4-arm64/Resources/seurat4"))packageVersion("SeuratObject 第一次安装先安装SeuratV5，再安装SeuratV4# 确定路径，安装V5.libPaths()rm(list = ls()) install.packages('Seurat')library(Seurat )packageVersion("Seurat")packageVersion("SeuratObject")# 流程同上# 安装V4.libPaths()# 创建文件夹，放V4dir.create(" ("SeuratObject", "4.1.4") remotes::install_version("Seurat", "4.4.0")# 重启确认packageVersion("SeuratObject
69700编辑于 2024-08-24 - 来自专栏生信技能树
从零开始配置R编程语言软件环境
一直提示我要更新 而且很多人遇到了seurat版本问题 ： seurat版本问题 因为新手第一次安装，默认安装最新版，r语言软件，rstudio这个ide软件，里面的各个包！ AppData/Local/R/win-library/4.3" [2] "C:/Program Files/R/R-4.3.1/library" 我的seurat是v4，但是初学者现在开始默认安装的都是 now running under evolution status 2 (status 2 uses the sf package in place of rgdal) Attaching SeuratObject > detach("package:Seurat", unload = TRUE) > detach("package:SeuratObject", unload = TRUE) 一个简单的快捷方式 AppData/Local/R/win-library/4.3 $ ls -d *eurat* Seurat/ mousecortexref.SeuratData/ SeuratObject
68410编辑于 2023-12-28 单细胞分析一 下载数据，加载Seurat 包
Matrix 包版本更高的版本 尝试先卸载再重新安装： remove.packages("Matrix") install.packages("Matrix") 安装完成后，再次尝试加载 Seurat = 1.6.1 最后发现，Matrix没有删除干净，之前下载过其他版本R包，仍有Matrix 移除旧版本的包： remove.packages('Matrix') remove.packages('SeuratObject " %in% installed.packages()) { stop("SeuratObject package was not successfully removed.") } if ("Seurat /src/contrib/Archive/SeuratObject/SeuratObject_4.1.4.tar.gz https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive /Seurat/Seurat_4.4.0.tar.gz 下载后放在Rpackages常用目录下 安装 Seurat 包 install.packages("D:/packages/SeuratObject
1.8K00编辑于 2024-06-24- 来自专栏Windows技术交流
centos9rocky linux 9almalinux 9 安装xfce图形界面和xrdp
可参考https://www.linuxcapable.com/how-to-install-xfce-desktop-on-centos-9-stream/https://access.redhat.com /discussions/6964666先说结论，centos9安装完，rdp远程时很卡，但rocky linux 9/almalinux 9很流畅，参考https://cloud.tencent.com /developer/article/1627252给centos8.x安装xfce图形界面(适用opencloudos8.x)，rdp远程时也很流畅。 9 / rocky linux 9dnf config-manager --set-enabled crbdnf install epel-releaseyum install epel-release filezilla客户端走sftp协议先上传到服务器 然后执行下面2句chmod -R 755 /usr/share/fonts/chinesefc-cache -fv然后就可以用fc-list命令查看已经安装的字体了然后
5.7K51编辑于 2022-12-01 - 来自专栏Debian中国
Debian 9 安装配置 Caddy Server
下载安装 Caddy 首先去 Download Caddy 选择你需要的插件，然后复制下方的 One-step installer script (bash)，例如我的是 $ curl https:// http.filemanager,http.git,http.ipfilter,http.minify,http.nobots,http.ratelimit,http.realip,tls.dns.cloudflare 安装完后输入 which caddy，不出意外的话会输出 /usr/local/bin/caddy 至此，安装完毕，但是目前它不会开机自启，只是简单地把二进制文件下载下来，所以下一步要注册服务。
4K20发布于 2018-12-20 - 来自专栏老司机的技术博客
docker实战(9)docker快速安装hbase
下载镜像 docker pull harisekhon/hbase 运行容器 docker run -ti harisekhon/hbase当你执行成功之后直接进入hbase shell，慢慢享用吧 使用hbase 退出容器后，下次再进入可以使用 docker exec -ti hbase1 /hbase/bin/hbase shell 创建表,第一个参数是表名，第二个参数是列簇名 create 'table1' , 'cf1' 1）查看有哪些表 hbase(main)> list 2）创建表 # 语法
1.3K70发布于 2018-04-16
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