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使用宏基因组的方法快速鉴定新冠病毒SARS-CoV2
使用宏基因组的方法快速鉴定新冠病毒SARS-CoV2一、如果不考虑成本，可以使用宏基因组测序的方法来快速鉴定新冠病毒SARS-CoV2，这种方法无需扩增、分析简单、准确度高。
1.7K00编辑于 2022-12-13 - 来自专栏DrugOne
Nat. Commun. | ClickGen: 一种基于模块化反应和强化学习对可合成化学空间定向探索的生成式AI模型
为评估ClickGen在DNDD任务中的表现，该文首先考虑三种不同类型的靶标：ROCK1，SARS-Cov2 Mpro（以下简称SARS-Cov2或Mpro）以及AA2AR，对模型效果进行测试。 生成案例 主要研究结果与讨论 ClickGen模型在实际药物设计中的可行性分析 为了评估ClickGen模型在针对SARS-Cov2的全新药物设计任务中的可行性，该文将生成分子的结构、对接构象和结合构象与非共价抑制剂进行了比较 这两种氨基酸残基在SARS-Cov2抑制剂的设计中至关重要，ClickGen模型中也观察到了这一结果。
83210编辑于 2024-11-26 - 来自专栏机器之心
探索「老药新用」最短路径：亚马逊AI Lab开源大规模药物重定位知识图谱DRKG
# 目标新冠病毒相关实体 COV_disease_list = ['Disease::SARS-CoV2 E','Disease::SARS-CoV2 M', ...
1.2K21发布于 2020-06-16 - 来自专栏生信菜鸟团
一起来学习新冠病毒的基因分析（1）：背景与数据介绍
为了使我们的意图更具可读性，国际上的研究者将使用以下命名约定： nCov:新型冠状病毒又被称为SARS-Cov2，2019-nCov，COVID-19 SARS：非典型肺炎病毒 batSARS：表示在蝙蝠中观察到的
4.4K40发布于 2020-04-28 - 来自专栏量子位
什么，PyTorch还能开发新药？哈佛推出这款工具包，10行代码训练“药神”模型
不仅如此，这个AI模型还包含另外几种案例，例如SARS-CoV2 3CLPro的旧药新用方法、预训练模型等。
63550发布于 2020-09-04 - 来自专栏DrugOne
EBioMedicine | SARS-CoV-2抗体发现流程中整合基于人工智能的表位预测
在HEK293T细胞中进行克隆和小规模重组生产后，从398种克隆的抗体中，有249种抗体通过ELISA显示能够与SARS-CoV2 S1蛋白结合，188种抗体能够中和带有源自武汉SARS-CoV-2的刺突蛋白的囊泡病毒性疱疹病毒基因报告病毒
30910编辑于 2024-06-04 - 来自专栏用户7627119的专栏
纳米孔RNA直接测序技术揭示了新冠病毒的转录组和表观转录组信息
研究方法 1.实验材料： 感染SARS-CoV2（BetaCoV / Korea / KCDC03 / 2020）的Vero细胞 2.实验方法： Direct RNA seq和DNB-seq 研究结果
1.1K20发布于 2020-08-07 - 来自专栏DrugOne
Science | EVOLVEpro：结合蛋白质语言模型与少样本主动学习的高效 in silico 定向进化框架
利用EVOLVEPro进行抗体优化 作者使用EVOLVEpro优化了两种具有治疗相关性的单克隆抗体：C143，这是一种针对SARS-CoV2刺突蛋白的抗体，和aCD71，这是一种针对人转铁蛋白受体的抗体
1.7K10编辑于 2024-12-23 - 来自专栏DrugOne
Nat. Commun.| 通过将异质数据集投射到一个共同的细胞嵌入空间进行在线单细胞数据整合
其次，根据在SCALEX COVID-19 PBMC Atlas中的细胞计算相同的细胞因子评分和炎症评分（在SC4研究中定义），作者证实单核细胞亚群与SARS-Cov2感染引发的细胞因子风暴有关，并且在严重患者中进一步升高
1.1K20编辑于 2022-11-28 - 来自专栏图形化开放式生信分析系统开发
新冠病毒分型和突变分析（SARS-CoV2_ARTIC_Illumina）
备注：docker运行的操作系统，推荐为Linux，windows，macOS系统改下docker可能部分功能（网络）不能正常运行
1.5K20编辑于 2023-02-03 - 来自专栏智药邦
JCIM｜药物发现的超大型化合物数据集概述
来自阿根廷和布鲁克海文国家实验室、芝加哥大学和Rutgers大学的研究小组从23个来源聚集了大量的小分子，利用高性能计算计算这些小分子的性质，利用计算的性质训练机器学习模型，并将得到的模型用于SARS-CoV2
1.7K20编辑于 2022-06-08 - 来自专栏图形化开放式生信分析系统开发
新冠病毒分型和突变分析（SARS-CoV2_ARTIC_Nanopore）
备注：docker运行的操作系统，推荐为Linux，windows，macOS系统下docker可能部分功能（网络）不能正常运行
1.2K00编辑于 2022-12-13
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