> is.na(x) [1] FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE
2-6 链表逆序 我只介绍两种常用方法吧,非递归方法 和 递归 方法 我觉得够用就行 1、非递归方法: 将第二个元素后面的元素依次插入到头结点后面, 最后再把原始第一个元素放到原始第二个元素后面,整个链表就能够反转了 = nullptr) { //由于p2一直固定在原始的第2个元素 //所以r一直都是取紧接着原始的第2个元素右侧的那个元素地址 r = p2->next; p2->next = r->next; //将r插入到第1个元素后面,这里因为第1个元素的位置P1也不变,所以也很简单 r->next = p1->next; p1->next = r; } // = nullptr) { //由于p2一直固定在原始的第2个元素 //所以r一直都是取紧接着原始的第2个元素右侧的那个元素地址 r = p2->next; p2->next = r->next; //将r插入到头结点后面 r->next = h->next; h->next = r; } //最后与不带头结点的单链表的区别就是,不用修改头指针了
安装完成之后,你将会看到一个朴实无华的图标,没错,这就是 R 语言本尊了。 ? R 语言简单实例 主要工作已经完成,让我们动动小手,优雅的单击(或双击)R Studio 图标,来感受一下R 语言的魅力。 小结 到此为止,R 语言就已经顺利的收入囊中了,恭喜你,又掌握了一门语言(的 Hello world)了。 【此处应有掌声】 接下来,会继续介绍 R 语言的基本用法和其中比较重要的函数使用方法,目标是能使用 R 语言对数据进行初步分析,以便能在生活和工作之中有所应用。 加之在大学时就对数据分析感兴趣,也曾经学过 R 语言,现在算是重温和复习吧。
过去一个月实验比较忙,很久没有写点东西了,今天要给amina画图,因此学习了一下R语言的基础画图。
一、R语言安装 首先进入官网:https://cran.r-project.org 下载相应版本的安装包 点击base 点击Download R4.1.2 for Windows,即可开始下载
学习生信时,最常用的可视化软件就是R,可大家在使用的时候又好像用的是Rstudio,究竟什么是R和Rstudio? R是一种编程语言,也是统计计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,能够提供强大的功能。 RStudio提供了一个具有很多功能的环境,使R更容易使用,是在终端中使用R的绝佳选择。 01 安装R 进入R的官网https://www.r-project.org/ 第一步 点击红框中的download R 第二步 在镜像这里中选择第一个 第三步 接下来按照红框点点点就能完成R的安装 第四步 第五步 R语言软件界面简陋,通常不直接使用,而是用图形界面的Rstudio。 1.显示文件列表 dir() #查看工作路径下文件,类似于Linux系统下的ls list.files() #同上 示例 2.加减乘除 和其他编程语言相同,直接输入即可 示例 3.赋值 赋值符号
今天继续学习R语言基础的R包使用,以R包:dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”) #务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号 部分人可能会因为镜像的问题失败,解决方法https://mp.weixin.qq.com /s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw 03 R包及数据准备 install.packages("dplyr") library(dplyr) test <- iris[c(1:2,51:52,101 经过这几期的R语言基础,你应该能够入门R了,渐渐的也要自己去学会看帮助文档,去搜报错,还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗? ? +命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档 如果你能独立处理这些问题,那么恭喜你,你的R应该没问题啦! 应该没问题了!!!!吧?
___________________________________________________________________________________ 二、R语言中的线性混合模型 来自博客 R中的线性混合模型介绍(翻译博客)(来自科学网邓飞博客)原来来自:http://www.r-bloggers.com/linear-mixed-models-in-r/ 1、nlme lme4 Asreml 几个包的介绍: 包 优点 缺点 nlme 这是一个比较成熟的R包,是R语言安装时默认的包,它除了可以分析分层的线性混合模型,也可以处理非线性模型。 2、R语言案例 数据来源:一个传统的裂区数据来说明不同软件包的用法,这个数据oats是在MASS包中,是研究大麦品种和N肥处理的裂区试验,其中品种为主区,肥料为裂区。 在R语言中我们使用mgcv包中的lmer函数来完成这项工作。首先载入faraway包以便读取psid数据集,然后加载mgcv包,再将年份数据中心化以方便解释模型,最后用lmer函数进行建模。
() #列出当前工作空间中的对象 rm(list=ls()) dir() #列出当前目录 dir.create(“c:/myproject”) options() #查看R软件默认选项的设置 "mylife") #保存工作空间到mylife文件中 load("mylife") #载入工作空间 #输入与输出 #重定向至文本文件和图像文件 source("inputFile.R" class mode names c(obj1,obj2) cbind(obj1,obj2) rbind(obj1,obj2) head tail ls() rm(obj1,obj2) #批处理 R CMD BATCH options infile outfile #linux "c:\program\r\r.exe" CMD BATCH --vanilla --slave "c:\myscript.R #R函数调用 sum.of.squares <- function(x,y) { x^2 + y^2 } sum.of.squares(3, 4)
R基础概念及数据类型重要提示1.Tab键可以补全函数、变量名、指定数据框的行名列名等,能够有效避免错误输入与提高效率2.只有赋值才会使变量发生变化,没有赋值R只是单纯展示出数据3.在R中,Error是唯一代表错误的 ,大部分Warning可以忽略,但并不是出现了Error才是错误,一定要反复检查代码是否完成了目的,小心暗流4.R中“=”与“<-”均可表示赋值,但是在函数的形式参数=实际参数中,仅可用"="<em>R</em>中数据类型分为字符 is.numeric(a)> a<-1> class(a)[1] "numeric"> a<-as.character(a) #仅当赋值了a才会改变> is.numeric(a)[1] FALSE向量向量将R中不同元素组合生成
student12" "student14"#paste0就是默认没有间隔的paste,paste0与paste(,sep = ""),paste(,sep="")可以自定义需要组合的字符间的间隔符号#在使用R语言处理了向量是
R的使用 在Rstudioy中新建项目(R project) File-New Project-New Directory-New Project-Directory name-Creat 文件中不要有中文和字符) 新建脚本 (Ctr+shift+N) 更改字号 (Tools-Global options-Apearance-Editor font size) 重启 session-restart R shift+F10) 工作目录(working directory)默认在 .Rproject文件夹下 打开文件时,双击打开 .Rproject 即可打开RStudio,打开后工作目录自动设置好了 R界面文字放大 “control” + “shift” + “+” R界面文字缩小 “control” + “-” 二.报错 报错: Error 。
画图的目的是为了展示数据常用可视化R包和函数作图的三类1.基础包-绘图函数实例plot(iris ,1 ,iris,3,col = iris,5) text(6.5,4, labels = 'hello p + stat_compare_means(comparisons = my_comparisons,aes(label = after_stat(p.signif)))4.save_export.R图片保存
这里介绍五种R语言的循环语法,分别是: for if repeat which while for samples<- c(rep(1:10)) samples ## [1] 1 2 3
一、入门认知· 命令提示符号 >· 括号前是一个函数· win系统中,快捷ctr+enter 运行· 函数aqrt-开方· 新建project,一步一步规范建立,需要的文件放入建立的文件夹里,R才能识别二 、读懂反馈· R语言,warning 99%废话,1%会恶化,产生意外的结果· 重启分3等级:1.重启电脑;2.重启R语言;3.重启session(严重性减退)· 出现+,提示命令不完整,补全或按ESC (“”''单引双引可,中文不行);逻辑型(TRUE—T;FALSE—F;NA缺失值)· 判断数据类型的函数:class(),将要判断的内容卸载括号里· 常见报错:引号、拼写错误、大小写(小写的逻辑值,R语言不认 · is 族函数,判断,返回值为TRUE or FALSE· is . character("4") 是否是字符型 TRUE、FALSE _R语言里,格式大于内容· as族函数,实现数据类型之间的转换 数据类型、结构· 数据结构:向量、数据框、矩阵、列表· 数据框约等于“表格”:1.表格是一个实际存在的文件,而数据框是R的一个内部数据;2.它比常规表格多一个要求,每一列只能有一种数据类型· 数据框单独拿出的一列是向量
2.2对单个向量进行操作(1)赋值( <- alt+—,在R里操作)赋值,=随意的写法,是OK的=可以代替赋值号 <- ,反过来不行赋值+输出一起实现图片可用名,不建议使用已经占用的格式,如c,limma duplicated(x)此为常用使用形式table(X)#重复值统计,看重复几次,没有重复,返回为1,可以统计出现的次数sort(x)排序,默认从小到大,sort(x,decreasing=T),排序则可改成从大到小R语言的默认思想英文 +函数名帮助文档paste0(rep("student",times=length(a)),seq(2,15,by=2))R语言函数思想:能用函数代替,就不要手动去数,除非代码只用一次2.3对两个向量的操作
dev.off() #关闭画板,报错也没问题,如果多次运行也不出图就dev.new()
一、R 语言简介 1.1 R 语言历史 R 语言是一款统计软件,R 语言也是一门编程语言,R 语言也是一个数据分析平台。 ➢ 一种相当完善、简洁和高效的程序设计语言。 ➢ R 语言是彻底面向对象的统计编程语言。 ➢ R 语言和其它编程语言、数据库之间有很好的接口。 ➢ R 语言是自由软件,可以放心大胆地使用,但其功能却不比任何其它同类软件差。 ➢ R 语言具有丰富的网上资源。 2.3 R 语言与 Excel 对比 1、R 语言开源免费,Excel 收费; 2、R 语言支持 Linux 版本,Excel 只支持 windows,macos,ios,Android 2.4 R 语言与 Python 对比 1、R 语言具有更强大的统计学功能; 2、R 语言的 Bioconductor 项目可以处理生物数据,例如基因表达数据,单细胞测序等;
工欲善其事必先利其器,学习R语言数据分析,第一步自然是R安转。 单细胞数据分析相关R包安装 一、R的使用 R是一种区分大小写的解释型语言。你可以在命令提示符(>)后每次输入并执行一条命令,或者一次性执行写在脚本文件中的一组命令 。 R语句由函数和赋值构成。 R使用<-,而不是传统的=作为赋值符号。 学习一门语言,一定要学会查看帮助文档。R提供了大量的帮助功能,学会如何使用这些帮助文档可以在相当程度上助力编程工作 。 R语言中的基本数据类型(模式)包括数值型、字符型、逻辑型(TRUE/FALSE)、复数型(虚数)和原生型(字节)。 R拥有许多用于存储数据的对象类型,包括标量、向量、矩阵、数组、数据框和列表。 类别(名义型)变量和有序类别(有序型)变量在R中称为因子(factor)。类似于编程语言中的枚举类型。
project,自选路径 2、显示路径 dir() getwd() 3、列出工作目录里的文件 list.files() 4、创建脚本 左上角轴承图标 — script — 复制下来 — 保存到一个新的R中或者 .txt文件 注意:一般把后缀改为.R,以方便下次直接导入使用 二、 1、加减乘除 > 3+5 [1] 8 > 3-5 [1] -2 > 3*5 [1] 15 > 3/5 [1] 0.6 > 3^5 [