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R语言从入门到精通：Day11
方差分析在各种实验和准实验设计的分析中都有广泛应用，接下来将要介绍用于常见研究设计分析的 R函数。 此外，以表达式y~A+B+A:B为例，R会默认这样理解它（序贯型）：（1）A对y的影响；（2）控制A时，B对y的影响;（3）控制A和B的主效应时，A与B的交互效应。 其中R默认调用序贯型，而有些统计软件（如SPSS）默认调用边界型。也不用担心必须应用其它两种理解方式的情形，R中提供了很多函数包来应对（如包car中的函数Anova()）。） ?
2K21发布于 2019-09-24 - 来自专栏生信小驿站
R语言之生信（11）五分钟学会用R语言构建ceRNA网络
我们想要的结果大致如下： （1）寻找miRNA-mRNA调节关系对 （2）寻找miRNA-lncRNA调节关系对 （3）合并miRNA-mRNA、miRNA-lncRNA调节关系对，构建ceRNA网络 R语言运行的调控关系对如下所示
5.2K32发布于 2019-05-07 - 来自专栏Java爬坑系列
【R语言入门】R语言环境搭建
安装完成之后，你将会看到一个朴实无华的图标，没错，这就是 R 语言本尊了。 ? R 语言简单实例 主要工作已经完成，让我们动动小手，优雅的单击（或双击）R Studio 图标，来感受一下R 语言的魅力。 小结 到此为止，R 语言就已经顺利的收入囊中了，恭喜你，又掌握了一门语言（的 Hello world）了。 【此处应有掌声】 接下来，会继续介绍 R 语言的基本用法和其中比较重要的函数使用方法，目标是能使用 R 语言对数据进行初步分析，以便能在生活和工作之中有所应用。 加之在大学时就对数据分析感兴趣，也曾经学过 R 语言，现在算是重温和复习吧。
3.1K22发布于 2020-12-01 - 来自专栏全栈程序员必看
r语言绘图参数(R语言plot画图)
过去一个月实验比较忙，很久没有写点东西了，今天要给amina画图，因此学习了一下R语言的基础画图。
4.2K10编辑于 2022-07-25 - 来自专栏小汪Waud
R||R语言基础（三）_R包
今天继续学习R语言基础的R包使用，以R包：dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”) #务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号 部分人可能会因为镜像的问题失败，解决方法https://mp.weixin.qq.com /s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw 03 R包及数据准备 install.packages("dplyr") library(dplyr) test <- iris[c(1:2,51:52,101 经过这几期的R语言基础，你应该能够入门R了，渐渐的也要自己去学会看帮助文档，去搜报错，还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗？ ? +命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档 如果你能独立处理这些问题，那么恭喜你，你的R应该没问题啦！ 应该没问题了！！！！吧？
4.4K50编辑于 2023-02-16 - 来自专栏小汪Waud
R||R语言基础（一）
学习生信时，最常用的可视化软件就是R，可大家在使用的时候又好像用的是Rstudio，究竟什么是R和Rstudio？ R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。 RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。 01 安装R 进入R的官网https://www.r-project.org/ 第一步 点击红框中的download R 第二步 在镜像这里中选择第一个 第三步 接下来按照红框点点点就能完成R的安装 第四步 第五步 R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。 1.显示文件列表 dir() #查看工作路径下文件，类似于Linux系统下的ls list.files() #同上 示例 2.加减乘除 和其他编程语言相同，直接输入即可 示例 3.赋值 赋值符号
2.7K20编辑于 2023-02-16 - 来自专栏全栈程序员必看
R语言安装~R，Rstudio
一、R语言安装 首先进入官网：https://cran.r-project.org 下载相应版本的安装包 点击base 点击Download R4.1.2 for Windows，即可开始下载
3.6K20编辑于 2022-09-14 - 来自专栏优雅R
R 语言中 X11 相关的一些问题
参考 Anaconda 官方文档《Using R language with Anaconda》安装 R-4.0.2： conda create -n r-4.0.2 r-essentials r-base ==4.0.2 1. unable to open connection to X11 display > plot(1:10) Error in .External2(C_X11, d$display 命令行下 R 画图无法弹出图形界面结果 正常情况下，capabilities()如果现实 X11 为 TRUE，执行plot(1:10)时会在 windows 下弹出一个绘图的结果图形界面。 ? 首先，使用 root 安装下面一些 X11 依赖： yum install xorg-x11-* libX11-* libXt-* 其次，在你的 XShell 中配置 X11 转发功能。 最后，用你的 XShell 重新登录服务器，打开 R 执行plot(1:10)即可出现你想要的绘图结果界面。
4.3K40发布于 2020-11-13 - 来自专栏BioIT爱好者
R 语言中 X11 相关的一些问题
参考 Anaconda 官方文档《Using R language with Anaconda》安装 R-4.0.2： conda create -n r-4.0.2 r-essentials r-base ==4.0.2 1. unable to open connection to X11 display > plot(1:10) Error in .External2(C_X11, d$display 命令行下 R 画图无法弹出图形界面结果 正常情况下，capabilities()如果现实 X11 为 TRUE，执行plot(1:10)时会在 windows 下弹出一个绘图的结果图形界面。 首先，使用 root 安装下面一些 X11 依赖： yum install xorg-x11-* libX11-* libXt-* 其次，在你的 XShell 中配置 X11 转发功能。 最后，用你的 XShell 重新登录服务器，打开 R 执行plot(1:10)即可出现你想要的绘图结果界面。 猜您喜欢
1.6K10发布于 2021-10-15 - 来自专栏全栈程序员必看
r语言 固定效应模型_r语言coef函数
___________________________________________________________________________________ 二、R语言中的线性混合模型 来自博客 R中的线性混合模型介绍（翻译博客）（来自科学网邓飞博客）原来来自：http://www.r-bloggers.com/linear-mixed-models-in-r/ 1、nlme lme4 Asreml 几个包的介绍： 包 优点 缺点 nlme 这是一个比较成熟的R包，是R语言安装时默认的包，它除了可以分析分层的线性混合模型，也可以处理非线性模型。 2、R语言案例 数据来源：一个传统的裂区数据来说明不同软件包的用法，这个数据oats是在MASS包中，是研究大麦品种和N肥处理的裂区试验，其中品种为主区，肥料为裂区。 在R语言中我们使用mgcv包中的lmer函数来完成这项工作。首先载入faraway包以便读取psid数据集，然后加载mgcv包，再将年份数据中心化以方便解释模型，最后用lmer函数进行建模。
6.4K30编辑于 2022-11-17 - 来自专栏R语言系列
R06-R语言作图
画图的目的是为了展示数据常用可视化R包和函数作图的三类1.基础包-绘图函数实例plot(iris ,1 ,iris,3,col = iris,5) text(6.5,4, labels = 'hello p + stat_compare_means(comparisons = my_comparisons,aes(label = after_stat(p.signif)))4.save_export.R图片保存
43910编辑于 2024-06-15 - 来自专栏生信小驿站
R语言for循环①
matrix(c(1:50),nrow=5) > a [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10] [1,] 1 6 11 45 50 > for (i in c(1:nrow(a))) + for (j in c(1:ncol(a))) + {print(a[i,j])} [1] 1 [1] 6 [1] 11
1.7K40发布于 2018-08-27 - 来自专栏祥子的故事
R语言：图形
counts = table(cyl) counts cyl 4 6 8 11 7 14 lbls = paste(names(counts),"\n",counts,sep="") lbls [1] "4\n11" "6\n7" "8\n14" pie(counts,labels=lbls) par(opar) ?
3.4K30发布于 2019-02-18 - 来自专栏我的作业
R语言基础
1.设置字体大小 tools→Global Options→Appearence→Editor font size 2.R语言基本操作 2.1用Rproject管理工作目录 每项工作任务要单独新建一个project
42250编辑于 2023-11-20 - 来自专栏生信学习
R语言画图
两种方式一、R自带的plot函数画图二、ggplot2函数plot函数R自带的画图工具，R绘图基础图形系统的核心，plot（）函数是一个泛型函数，使用plot时真正被调用的时函数依赖于对象所属的类。 一般情况下，R绘图区域没有out margin区域；标签、轴名称和标题在figure region区域；画的线条之类的都在plot region区域which，在当前图形上绘制边框，参数可以选择plot 副标题颜色fg，图形的前景色bg，图形的背景色> a <- c(10,15,20,25,30,35)> b <- c(12,23,34,45,56,67)> par(mfrow= c(3,2))> plot11 <- plot(a,b,type = "b",pch = "$",col.axis = 2,main = "坐标轴刻度颜色为红",sub = "plot<em>11</em>")> plot12 <- plot(a,b pch = "*",family ="mono",xlab ="横坐标a2",ylab = "纵坐标b2",col.main = "green",main = "等宽",sub = "plot28")11
88310编辑于 2024-07-21 - 来自专栏R语言&linux
R语言-专题
1.字符串图片1.str_length图片x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."x### 1.检测字符串长度str_length(x)length(x) #返回字符串的个数2.str_splitsplit返回列表，但是列表不能进行计算，对列表进行取子集### 2.字符串拆分str_split(x," ")x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")st
2.1K00编辑于 2023-02-07 - 来自专栏友弟技术工作室
R语言入门
R语言简介 四十多年前， R 语言的始祖诞生了 ， John Chambers 在贝尔实验室中开发出S语言 ，用于快速地进行数据探索， 统计分析和可视化 。 R语言及其生态作为连接现实世界中的数据和数学模型的桥梁，正在社群的努力下一步一步地把这些想法具体化。 让我们进入 R 语言的世界！ R语言基本数据结构 下面用 R 的解释器来熟悉一下 R 语言的基本数据结构。 首先让我们先进入 R 环境下 我是在mac操作环境下的，ubuntu的是一样的。 统计之都 : 国内质量最高的统计网站，有一些关于统计和R语言的优秀博客以及与R有关的会议通知。 肖凯博客(需访问外国网站): 很有质感的博客，有大量 R 语言应用的案例。 R 语言实战 ： 一本从统计角度介绍 R 语言的书籍 ，较为简单 ， 适合快速翻阅。
2.7K110发布于 2018-04-25 - 来自专栏R语言交流中心
R语言升级
因为一个R包让我不得不对电脑的R进行升级，正好整理下整个升级的过程。我们是在Rstudio中进行的升级操作。用到了包installr。 install.MikTeX, install.git,install.git, install.GraphicsMagick,install.ImageMagick, check.for.updates.R, 我们不在此一一介绍，今天主要介绍updateR这个函数： updateR()主要要来升级R软件，升级过程中会遇到下面的一些选项： 会提示当前版本已经后面最新的升级版本： ? 我们设置好后关闭Rstudio，再次打开Rstudio新版本的R就可以用了。 ? 当然，我们如果需要安装github的包的时候，Rtools软件老版本也不再适用，需要下载新版本的Rtools。 下载链接：https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/。 ? 当然这个包有一个缺陷，暂时还不能完成Linux系统下的R升级。
3.1K40发布于 2020-06-16 - 来自专栏素质云笔记
R语言︱画图
,draw.segments = T,key.loc =c(5,0.5) , mar =c(2,0,0,0) ) #full=F，代表半圆 #segments代表一段一段画 #注释图标位置 #图边距 11
1.7K31发布于 2019-05-26 - 来自专栏学习记录
R语言基础
3.在“管理本地用户和组”中找到当前用户的用户名，就可以看到用户名是英文还是中文了下载R和Rstudiob站有教程，暂时不需要装R包什么是RR是一种编程语言，也可以统计计算、绘图，它汇集了很多函数RStudio 是免费提供的开源集成开发环境（IDE），RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，方便用户在终端中使用R页面如下各窗口的功能如下：1.控制台（左下窗口）脚本运行和结果展示2.脚本编辑器 （左上窗口）在处理数据时，通常会编写一份脚本文件，即一组命令的集合来表示整个操作过程的逻辑流，该脚本文件可以直接读取并由R引擎执行。 boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))iris是一个R语言自带的数据框 面板显示调节设置字体大小tools->global options->apperanceR语言基本操作用Rproject管理工作目录设置工作目录：setwd()查看工作目录：getwd()这样的话，只设置了一个工作目录
57610编辑于 2024-06-10
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