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R语言基础| 下载、安装
编程语言R拥有丰富的统计学函数和数据可视化包，适用于高维生物学数据。基于此，本系列文章开展R语言基础教程，帮助更多学习生信的小伙伴打好编程基础。 R下载与安装 下载链接：https://mirrors.dftianyi.com/CRAN/ 根据电脑系统选择相应的R版本 mac系统的根据macOS版本号选择合适的安装包，下载并安装即可。 windows系统的按以下步骤下载并安装即可 Linux系统安装R 使用Linux安装R，建议配置好conda环境之后，用conda命令安装R，之后有需要安装的R包，conda会解决大部分的包依赖问题。 下载链接：https://posit.co/download/rstudio-desktop/ Linux安装Rstudio-sever： 安装Rstudio-sever： VlnPlot(pbmc, features = c("nFeature_RNA", "nCount_RNA", "percent.mt"), ncol = 3) 结果图： 下期内容 下一节我们将详细介绍"R语言管理数据集
93610编辑于 2025-01-22 - 来自专栏单细胞生信分析
R语言的下载与安装
本文主要结构： 一、下载最新版本的R 二、最新版本R的下载与安装步骤 三、下载指定版本的R 一、通过清华镜像网址下载：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN 二、R语言下载与安装的步骤： 1.进入官方网址：https://www.r-project.org,点击download R ? 2.点击任一中国镜像网址均可 ? 5.点击Download R-4.3.1 for Windows 下载R安装文件 ? 下载完R安装文件后，运行安装文件并按照提示进行安装，安装完成后，可以点击R图标启动R软件。 安装时建议安装在有一定闲置空间的硬盘中，后续安装R包后，R的安装文件夹会占据数G硬盘空间。 安装方法： Windows系统：下载后运行下载的安装包，按照安装向导进行安装。 三、下载指定版本的R 选择旧版本的R进行下载并安装 ? 四、R下载及安装动画教程 ?
2.8K40编辑于 2023-07-27 - 来自专栏天意生信俱乐部
R语言TCGA数据下载与整理
这篇推文将帮助你了解如何从GDC（Genomic Data Commons）下载TCGA（The Cancer Genome Atlas）数据，并在R中进行数据整理和处理。 通过Linux下载TCGA数据 在Linux系统上，可以使用gdc-client工具从GDC下载TCGA数据。 在R中读取下载的TCGA数据 下载完成后，可以使用R加载这些数据，并进行整理。 TCGA数据到R的全程数据处理。 具体操作包括： 下载数据：使用gdc-client工具从GDC下载TCGA数据。 读取数据：在R中读取下载的.tsv文件。 整理表达矩阵：将数据提取并合并成一个统一的表达矩阵。
1.5K10编辑于 2025-01-22 - 来自专栏全栈程序员必看
r软件的下载与安装_R语言怎么安装
一、R软件下载 下载地址：https://cran.r-project.org/ 图 1 R软件下载页面 下载之后是.exe执行文件，不是zip压缩格式文件，可以直接点击安装。 最后一步是设置系统环境变量： 三、Rstudio下载及安装过程 下载地址：https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/#download 下载的文件一个exe文件，一个是zip文件。 RStudio一些其它小技巧： 切换不同R版本 R允许多个版本共存，比如我在电脑上同时安装了3个版本（如下图）。通过RStudio可以很方便在各个R版本间进行切换。 老版本的R安装包下载链接，Windows：https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/，Mac： https://cran.r-project.org
8.4K21编辑于 2022-08-03 - 来自专栏电脑专业软件
R语言软件下载和安装教程
R语言软件简介：R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。 QR语言软件下载：[软件全称]：R语言 3.6.2[软件大小]：82MB[软件语言]：中文[安装环境]：Win7/Win8/Win10/Win11[下载地址①]：百度网盘：https://pan.baidu.com pwd=mph7R语言安装教程：1.打开安装包，运行R-3.5.2安装包2.选择中文，点击确定3.点击下一步4.点击浏览，更改安装位置5.我这里选择D盘，点击下一步6.下拉箭头，根据自己的电脑选择32位或者 64位7.选择后，点击下一步8.选择no，点击下一步9.点击下一步10.选择创建桌面快捷方式，点击下一步11.耐心等待安装完成12.点击结束RStudio安装1.运行RStudio.exe安装2.点击下一步 3.点击浏览可更改安装位置4.我这里也选择安装在D盘下，点击下一步5.点击安装6.耐心等待安装完成7.点击完成8.打开软件，安装完成
1.7K20编辑于 2022-11-28 - 来自专栏PPV课数据科学社区
R语言 | 2018年RStudio大会资料下载
随着R语言用户逐年增加，RStudio也开始网罗世界上各位大牛，大家聚在一起，彼此交流分享使用R语言的一些成果和心得。 本次会议举办了60多场会议，分别为R的初级用户、高级用户以及寻求R行业应用解决方案的人士而设。
1.2K50发布于 2018-04-20 - 来自专栏生信学习笔记01
R语言基础-02（数据框、下载包）
","r2","r3","r4")#只修改某一行/列的名colnames(df1)[2] <- "CHANGE"数据框取子集取子集的本质还是按位置或者按逻辑值#筛选数值型df1[df1$score > Species=="c",]test[test$Species %in% c("a","c"),]矩阵不支持$删除#删除 rm(l)#删除一个rm(df1,df2)#删除多个rm(list = ls()) #清空下载包 require(string))install.packages("stringr")包是否下载成功的唯一标准是library()没有error，当提示package not available时，原因可能为 ：1.名字写错；2.安装命令错误；3.包与R语言版本不符合（极少数）；4.包过时。 row.names = 1,sep = ",")Tips：输出文件时不要覆盖原文件需要用非proj的文件夹内的文件时，写全路径多用tabfread函数读取快且遇空行不易出错引用自生信技能树马拉松课程小洁老师R语言基础
95430编辑于 2023-03-12 - 来自专栏菜鸟学数据分析之R语言
R语言下载安装-Mac版本
应后台有人询问Mac苹果版本的安装和更新，故写写mac版本R语言的安装。因用苹果版本的R语言已经有三个月，总体感觉非常NICE，相比于Windows版本，更喜欢MAC，运行速度较快。 有苹果版本R语言安装 R语言的安装： 登陆官网https://www.r-project.org，找到右侧Download R ? 点击链接进入后，点击Download R for (Mac) OS X ? 点击“R-3.3.4.pkg“安装包，支持最新版本的MacOS（Sierra），若点击右侧“XQuartz”，一般是使用机器学习、3D制图等需要的下载安装。 下载完成后按照软件安装提示一步一步操作即可在Mac成功安装运行。 ? 安装成功后： ? R语言更新：点击Check For R Updates ?
6.6K40发布于 2020-08-06 - 来自专栏软件激活安装
R语言4.0.4 软件下载及安装教程
R语言是一种为数学研究者设计的数学程序设计语言，主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。 如果你是一个计算机编程的初学者，渴望学习一般的计算机编程，R语言不是一个理想的选择，你可以选择Python、C或Java。R语言和C语言都是贝尔实验室的研究成果，但它们的侧重点不同。 R语言是为数学理论研究者设计的解释型语言，而C语言是为计算机软件工程师设计的。。R语言是一种解释型语言（不同于C语言的编译和操作），其执行速度比C语言慢得多，不利于优化。 下载：资源库 (imeetyou.store)安装教程：1. 选择下载的安装包，右击即可解压缩。2.打开解压后的文件夹，点击右键，以管理员身份运行安装程序。3.单击“确定”。4.单击下一步。 8.单击下一步。9.检查桌面快捷方式，然后单击“下一步”。10.软件安装中……11.单击结束。12.打开解压后的文件夹，右键单击，以管理员身份运行rtools安装程序。13. 单击next。14.
1.6K40编辑于 2023-04-14 - 来自专栏科技记者
《高效R语言编程》8--高效硬件
粗略经验，RAM应该是所分析数据集的3倍benchmarkme::get_ram() #查看你有多少RAM，当然我的电脑--属性也行Ps.我的windows系统中没有结果NA B 3、确认你用的是64位的R ·.Machine$sizeof.pointer #[1] 8·这样的结果就代表64位啦，这个应该是有原理的，感兴趣的可以查下。 4、云计算也是一个成本低的获得强大算力的一个选择 5、固态硬盘通常对代码执行影响不大，但是可以提升整体工作效率 R语言跑个分玩玩 library(benchmarkme) res=benchmark_std 1,600 x 1,600 random matrix: 2.75 (sec). plot(res) # You are ranked 310 out of 749 machines. # AMD R7 4700 8核心8线程，还凑活 # 上传你的结果 upload_results(res) Creating temporary file Getting system specs.
1.1K30发布于 2021-07-27 - 来自专栏技术一点点成长
R语言之RCurl实现文件批量下载
使用者通过RCurl可以轻易访问网页，进行相关数据的抓取以及下载，为数据分析提供原始素材。近年RCurl在数据分析业界中使用也越来越流行。 Step1:安装RCurl install.packages('RCurl') Step2:代码实现 =========================== 1 #利用RCurl包批量下载（抓取）文件 library('RCurl') 4 5 html=getURL("http://rfunction.com/code/1202/") 6 7 #查看网页源码，之后确定抓取信息的“代码字串”特征 8 ，循环遍历 30 31 setwd('G:\\R_Project\\RCurl抓取的文件') #注意‘\\’转义 32 33 dir() 34 35 i=1 36 37 base="http 具体实现方式仅需要在上述代码最后的循环内部加入如下一行代码： Sys.sleep(2) 结语： 爬虫其实也就这么回事儿~本文利用R语言的RCurl工具包成功抓取到数据，在此也仅仅是给对数据相关分析感兴趣的朋友提供一丝参考而已
2.2K10编辑于 2022-08-09 - 来自专栏R语言的基本操作
GEO芯片数据下载和在R语言的准备
样本里看一下数据范围是否正常ID_REF与VALUE value在0-24范围内正常（取过log）芯片数据在Series Matrix Files里面转录组和单细胞数据在Supplementary file在R语言中的操作准备工作
48912编辑于 2024-03-15 - 来自专栏生物信息云
R语言TCGA-Assembler包下载TCGA数据
1.下载TCGA-Assembler 通过官网下载（需要注册），或者百度一下也有资源。 1处，点击下载即可。 我们目前只关注Module_A.R和Module_B.R这2个R文件。 将其中的Module_A.R和Module_B.R拷贝到这个文件夹TCGA_Assembler中，这个Module_A主要是用来下载数据的，而Module_B主要用来分析数据； ? 和Module_B.R)时，如果提示错误，一般是缺少包，提示缺什么安装什么就行了： source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("httr
5.3K30发布于 2019-08-07 - 来自专栏机器学习与统计学
【R语言经典实例8】如何定义一个R函数。
函数的一个参数，而若使用匿名函数直接作为lapply函数的参数，则能将原先的命令简化至同一行中： > lapply(lst, function(x) sd(x)/mean(x)) 由于本书重点不在于介绍R的编程语言 ，这里不对R函数编程的细微之处进行解释。 另请参阅 有关如何定义函数，参见《An Introduction to R》（http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-intro.pdf）和《R in a Nutshell 函数的一个参数，而若使用匿名函数直接作为lapply函数的参数，则能将原先的命令简化至同一行中： > lapply(lst, function(x) sd(x)/mean(x)) 由于本书重点不在于介绍R的编程语言 ，这里不对R函数编程的细微之处进行解释。
3.2K40发布于 2019-04-10 - 来自专栏sci666
R语言系列第一期：R语言背景、下载安装及功能介绍
R的历史背景 R语言是从S统计绘图语言演变而来，可看作S的“方言”。 R语言。 在使用之前，我们肯定要下载和安装软件：（以windows X64为例） STEP1:下载 R官网：https://www.r-project.org/ CRAN: 同大多数编程软件相似，数学运算的符号: + – * / ^ 等等，同时也服从运算顺序的规则，例如： > (7-5)*3+4/2 [1] 8 R可将运算结果保存在用户命名的变量中 （这里”=”和”<-”都能够将符号右侧的表达式的值赋给左侧的变量 《R语言统计入门（第二版）》人民邮电出版社 Peter Dalgaard著 2. 《R语言初学者指南》人民邮电出版社 Brian Dennis著 3.
1.1K10发布于 2019-05-11 - 来自专栏Hank’s Blog
2-8 R语言基础 日期与时间
> x2 <- Sys.Date() > class(x2) [1] "Date"
50410发布于 2020-09-16 - 来自专栏科研猫
R语言从入门到精通：Day8
是时候 关注 我们一波了 在上一次教程中，我们讲解了R语言绘图的诸多函数，想必看到自己做出的图形，肯定小有成就感吧。 在R中，一般使用函数 par() 或者 layout() 组合多幅图形。 条形图 条形图通过垂直的或水平的条形展示了类别型变量的分布(频数)，在R中对应函数 barplot()。下面是几个简单的例子。 ? 图6:简单条形图 ? 图8:条形图的微调。 还有一种特殊但常见的条形图：棘状图。棘状图对堆砌条形图进行了重缩放，这样每个条形的高度均为1，每一段的高度即表示比例，可以通过vcd包中的函数spine()绘制。例子如下： ? 最后，为了方便大家学习，本次推文中所有图形的数据都来自R自带或者R中函数包自带，图形及相关代码都可以通过客服小姐姐获得。 本期干货 · ！R语言图形day8图形绘制 ！ 原文详情：“科研猫”公众号
1.9K22发布于 2019-09-24 - 来自专栏R语言交流中心
R语言之GEO基因表达数据的下载整合
代码如下： source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("GEOquery") ? 代码解释：获取数据编码：GSE2669；数据下载存储地方：F:/geo/ 然后获取矩阵数据： myMatrix <- Data@GSE2669_series_matrix.txt.gz@assayData series_matrix.txt.gz)) Meta(GSE2669)：查看这个数据集的情况 GSMList(GSE2669)：查看每个GSM具体 GPLList(GSE2669)：查看GPL平台，常用来作为芯片注释 如果数据下载完成后出现错误 ： 那么可以用下面的代码载入已经下载好的数据： Data <- getGEO(filename="F:/geo/GSE2669_series_matrix.txt.gz") myMatrix <-Data
10.5K30发布于 2019-07-31 - 来自专栏小徐学爬虫
R语言爬虫程序自动爬取图片并下载
R语言本身并不适合用来爬取数据，它更适合进行统计分析和数据可视化。而Python的requests，BeautifulSoup，Scrapy等库则更适合用来爬取网页数据。 如果你想要在R中获取网页内容，你可以使用rvest包。 在R中，我不清楚是否可以直接设置爬虫ip，但你可以在requests库的文档中查找相关信息。
46310编辑于 2023-11-14 - 来自专栏爬虫0126
使用crul库和R语言的下载器程序
以下是一个使用crul库和R语言的下载器程序，用于从下载音频。此程序使用了jshk.com.cn/get_proxy的代码。 537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/58.0.3029.110 Safari/537.36") // 添加一个处理函数 c.AddHandler(func(r fmt.Printf("Error closing file: %v\n", err) return } // 打印下载完成的消息 fmt.Printf("Error fetching URL: %v\n", err) }}```请将`https://www.tiktok.com/your-audio-url`替换为你想要下载的 这个程序将使用crul库和R语言从TikTok下载音频文件，并将其保存为`tiktok_audio.mp3`。
32630编辑于 2023-10-19
腾讯云开发者
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