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  • 来自专栏科研猫

    Hiplot Pro,凤凰涅槃,全新上线,更懂你的科研绘图平台

    平台开放以来,累积服务450万人次,相关成果于2022年5月发表于《Briefings in Bioinformatics》杂志。 个月潜心研发,于2022年11月2日正式更新上线Hiplot Pro平台。 “美”应该是它给你的第二感觉,没有杂乱的排版和复杂的跳转,Hiplot Pro深度优化了UI界面,用极简的外观承载了极繁的功能,简约而不简单;“全”应该是它给你的第三感觉,涵盖工具、流程、课堂、市场四大模块 为了提升绘图速度,避免单一参数修改后要需要重新提交任务的耗时耗力操作,Hiplot Pro中所有的原生应用均使用了全新的自研加速框架,参数改修不再需要重头计算,使得图形修改速度极大提升,实现极速响应。 在Hiplot Pro,每一个用户都可以申请成为开发者。入驻Hiplot平台,拥有自己的workbench,随心所欲地发布自己专属的分析工具,然后通过Hiplot平台部署开放给全世界的用户使用。

    1.2K30编辑于 2022-11-04
  • 来自专栏科研猫

    绘制热图,无需代码,快速完成发表级别科研绘图

    2022年11月2日,我们科研猫正式发布了Hiplot Pro(https://hiplot.com.cn),一个全新界面,功能强大,全系免费的科研绘图和数据分析平台。 在整个Hiplot Pro的研发中,我们始终把用户体验放在第一位,为了搭建最便捷最优化的使用体验,开发团队在试用了目前市面上十余种计算/绘图平台后,结合数十位一线科研人员的使用反馈后,设计了现有的绘图页面 下面我们以最常用的热图绘制工具给大家进行演示一下如何在Hiplot Pro平台快速绘制热图。 Step1:上传数据点击右侧“上传按钮”,可以选择上传本地文件,或者你存在Hiplot盘中的文件(对的,没错,我们还提供了存储功能)。 在这里给大家做个一简单的介绍,Hiplot Pro中参数通常分为三大类:数据参数通常用以指明用作绘图的数据列特殊参数是指对于该绘图/分析工具特定的参数,比如热图中聚类的参数,高低数值对应颜色的参数等。

    1.8K21编辑于 2022-11-04
  • 来自专栏科研猫

    Hiplot Pro |工具系列--在线绘制优雅的箱线图

    具体如下: 绘图操作:直接登录 Hiplot Pro(https://hiplot.com.cn),读取数据,设置几个参数即可。

    4.6K20编辑于 2023-01-06
  • 来自专栏生信技能树

    Hiplot绘图项目(无需R语言就可以上车高颜值图表)

    看完这5个资源 但不可能人人都有时间和精力系统性学习咱们生物信息学,Hiplot项目为这些无法抽空学习R语言的小伙伴提供了一个解决方案! 目前,该平台提供基于 R 语言的 60 余种基础可视化和 50 余种进阶绘图的功能(可能已经是市面上相对比较全的平台之一),同时还部署了多个 openbiox 社区项目(如 bget 下载文献附录、UCSCXenaShiny 组合热图(基因表达、基因突变、元信息) 两个月前的 Hiplot :基础插件大概 40 个,进阶插件 10 几个,开源书籍 4-5 个。只支持 PNG/PDF 格式导出。 By Chris Lou 随着注册用户人数不断增长,平台操作指南和绘图教学视频的需求日益迫切。 By YTDai 很荣幸能加入到这样优秀的团队进行平台的开发,看到平台注册使用用户的不断增长和大家的肯定,是对我们莫大的鼓励,平台的功能和性能也在不断的增加和完善,极大地满足了人们对科研绘图的需求,真正实现了零基础绘图

    4.1K41发布于 2020-09-22
  • 来自专栏优雅R

    好用的免费科研绘图神器,推荐试试

    涉及到文章的门面,科研绘图,很多伙伴又需要在纷繁的软件大海、眼花缭乱的公司之间进行选择。Hiplot的出现为大家解决了这些问题。 免费的科研绘图神器—Hiplot,是2020年7月推出的全网首个开源绘图平台,目前提供基于R语言的70余种基础可视化和60余种进阶绘图的功能,同时还部署了多个 openbiox社区项目(如bget下载文献附录 https://hiplot.com.cn 所有功能免费! Hiplot简介 Hiplot 致力于建立一个快速迭代、支持中英文环境的科研数据可视化平台。 目前该平台建设已初具规模,已提供基于 R 语言的 70 余种基础可视化的功能: area,面积图 barplot,柱状图 barplot-3d,三维柱状图 beeswarm,蜜蜂群图 boxplot,箱线图 用户 交互界面 登录 注册 基础绘图卡片浏览与检索 绘图示例 | 相关性热图 绘图示例 | 免疫浸润分析 文件上传窗口 文件浏览与管理 文件在线查看和编辑 (支持文本文件、XLSX、CSV、TXT 等)

    3.5K40发布于 2021-04-25
  • 来自专栏科研猫

    高维数据可视化必备图形-平行坐标图

    介绍完平行坐标图,给大家隆重介绍一下全网首个开源绘图平台-HiplotHiplot是openbiox联合科研猫郑重推出的,免费注册,无需安装,一站式绘图的开源绘图平台,你还在等什么? 近年来,随着各类计算平台(如生物医学领域的 Galaxy 和 DNAnexus)、相关 IT 软硬件基础设施的发展(如分布式计算、容器技术、软件包管理器、数据分析流程构建框架等),初级科研工作者已经可以相对比较轻松地获取相关数据的上游分析结果 ;中英文支持的屈指可数;上手仍然有一定难度;部分平台的文件管理不太方便;用户能够主动参与平台建设的少之又少。 Hiplot简介 Hiplot 是由 openbiox 社区于 2019 年 10 月发起,并在新冠疫情爆发后快速发展的一个社区开发项目:致力于建立一个快速迭代、支持中英文环境的科研数据可视化平台和协作社区 基础绘图卡片浏览与检索 ? 绘图示例 | 相关性热图 绘图示例 | 免疫浸润分析 文件上传窗口 ? 文件浏览与管理 文件在线查看和编辑 (支持文本文件、XLSX、CSV、TXT 等) ?

    3K10发布于 2020-08-17
  • 来自专栏优雅R

    Hiplot 在线绘图工具的本地运行开发库开源

    Hiplot 简介 Hiplot 项目发起于 2019 年,是由国内生物信息学开源社区 Openbiox 和多家单位和机构共同建设的一个免费、易用、部分开源的综合在线绘图系统(生物医学为主)。 截至目前,该网站已提供超过 230+余个在线可视化分析功能,涵盖了基础科研绘图、组学可视化和部分临床模型可视化功能。 总的注册用户已超过 2 万 5 千人,总访问量超过 300 万次,每日任务数已超 4000 余次。 基础模块卡片视图 Hiplot 本地运行/开发库可以用来做什么? Hiplot 网站应用的本地运行和开发库:https://github.com/hiplot/hiplotlib。 基于我们提供的基础库,绘图插件的核心功能均可以在本地完成独立开发和调试。

    1K30编辑于 2022-06-27
  • 科研绘图工具分级指南:从新手到顶刊,这7款神器如何搭配?

    BioGDP——全学科覆盖的国产绘图平台定位:生物医学绘图的“全能型选手”。 Hiplot——国产免费数据可视化平台定位:生物医学数据的“快速可视化工具”。 GraphPad Prism——生物医学统计绘图“黄金标准”定位:实验数据分析与绘图的“一体化工具”。 5. Origin——多学科硬核数据处理平台定位:跨学科复杂数据的“分析利器”。 推荐 BioGDP 免费版 + Hiplot+SciDraw,三者覆盖素材获取、数据可视化、快速出图,版权合规且支持高清导出,完全满足基础科研绘图与普通期刊投稿。

    49210编辑于 2026-04-02
  • 来自专栏生信技能树

    Hiplot 在线绘图工具的本地运行开发库开源啦!

    Hiplot 简介 Hiplot 项目发起于 2019 年,是由国内生物信息学开源社区 Openbiox 和多家单位和机构共同建设的一个免费、易用、部分开源的综合在线绘图系统(生物医学为主)。 截至目前,该网站已提供超过 230+余个在线可视化分析功能,涵盖了基础科研绘图、组学可视化和部分临床模型可视化功能。 总的注册用户已超过 2 万 5 千人,总访问量超过 300 万次,每日任务数已超 4000 余次。 基础模块卡片视图 Hiplot 本地运行/开发库可以用来做什么? Hiplot 网站应用的本地运行和开发库:https://github.com/hiplot/hiplotlib。 基于我们提供的基础库,绘图插件的核心功能均可以在本地完成独立开发和调试。

    2.6K10编辑于 2022-06-27
  • 6 款工具覆盖从素材到顶刊,免费 + 专业全适配

    01 BioGDP——国产原创绘图平台,版权无忧BioGDP是一款国产生物医学绘图平台,拥有10000+原创手绘素材,覆盖分子、细胞、动物模型全学科方向。 它最大的亮点是所有素材均为平台原创,可提供官方版权授权文件,彻底解决科研发表的版权隐患。 ——免费生信可视化神器Hiplot是一个国产免费在线科研数据可视化平台,专为生物医学领域设计。 按需组合可高效解决科研绘图的素材、数据、设计三大核心问题。FAQ 1. 生物医学科研绘图,优先选哪款工具? 免费科研绘图工具能满足 SCI 投稿吗?可以!BioGDP+ Hiplot+SciDraw 的组合,支持高清导出与矢量格式,版权合规,完全适配普通 SCI 期刊要求。 3.

    42010编辑于 2026-03-25
  • 来自专栏科研猫

    实现矢量图的编辑和拼图,不用安装AI软件,也能快速出图!这个拼图工具快快用起来~·

    科研绘图中有两种图像类型,矢量图(通常是PDF和AI格式)和位图(通常是JPG、TIF、PNG格式)。 矢量图在科研绘图中的地位可谓举足轻重,很多期刊在最后校稿proof完成,要发表的时候,都会要求作者上传矢量图文件。那么就给我们带来一个困扰已久的问题: 矢量图如何拼图? 2022年12月15日,Hiplot平台(https://hiplot.com.cn)上线了全新的拼图工具,登录网页以后,点击工具模块,第一个就是。 工具使用地址: https://hiplot.com.cn/cloud-tool/drawing-tool/link/635 温馨提示 建议大家在使用的时候,先点击工具右上角的“全屏”,再去上传文件,全屏使用效果更加哦

    3K20编辑于 2023-01-06
  • 来自专栏生信技能树

    Hiplot 预印本发布:辅助生物医学数据可视化

    Hiplot 绘图网站预印本文章近期已作为预印本在 bioRxiv 发布,欢迎大家进行引用。 Hiplot 网站 2021.3-2022.3 访问省份 TOP 10 Openbiox 社区新一轮项目将在 5 月下旬发起,感兴趣的朋友可以投递简历至 admin@openbiox.org。 Hiplot: a comprehensive and easy-to-use web service boosting publication-ready biomedical data visualization Here, we propose an easy-to-use web service, Hiplot (https://hiplot.com.cn), equipping with comprehensive We used the demo and real datasets to demonstrate the usage workflow and the core functions of Hiplot

    44610编辑于 2022-07-26
  • 科研绘图全流程实战:从实验数据到期刊封面,8款工具这样搭

    科研绘图不是孤立的“画图”,而是贯穿从数据处理到最终发表的全流程。本文模拟一篇典型生物医学论文的配图制作过程,为你呈现8款工具如何各司其职、无缝协作,最终产出符合顶刊要求的全套配图。 操作:打开 BioGDP 官网,无需安装在“模板库”中搜索“信号通路”,选择一个顶刊级模板拖拽替换素材:用平台自带的细胞膜、受体蛋白、信号分子素材添加文字标注,调整配色导出为300DPI高清PNG等格式这一步的成果 第三步:生信数据可视化——用Hiplot快速出图场景:你做了RNA-seq,需要绘制火山图展示差异表达基因。 总结生物医学科研绘图可按全流程搭配工具:实验数据统计用 GraphPad Prism/Origin,机制图快速绘制选 BioGDP,生信图表用 Hiplot,免费素材可选用 SciDraw、Bioicons 2.实验数据统计与绘图用哪款工具?常规数据选 GraphPad Prism,复杂数据拟合与批量处理选 Origin。3.生信数据可视化(火山图 / 热图)用什么工具?

    42810编辑于 2026-04-02
  • 来自专栏优雅R

    生信爱好者周刊(第 29 期):Hiplot开发库开源

    封面图 Hiplot Gallery。 via 本周话题:Hiplot开发库开源 Hiplot 项目发起于 2019 年,是由国内生物信息学开源社区 Openbiox 和多家单位和机构共同建设的一个免费、易用、部分开源的综合在线绘图系统(生物医学为主 截至目前,该网站已提供超过 230+余个在线可视化分析功能,涵盖了基础科研绘图、组学可视化和部分临床模型可视化功能。 总的注册用户已超过 2 万 5 千人,总访问量超过 300 万次,每日任务数已超 4000 余次。 3、ask - Friendly CLI interaction in R[5] 4、cmd - Code generator to produce CLI from R packages[6] 5

    76920编辑于 2022-06-27
  • 科研绘图分级指南!7 款工具从零基础到顶刊全覆盖

    BioGDP特点:一个拥有10000+原创手绘素材、200+顶刊模板、支持高清多格式导出的全学科覆盖型国产生物医学在线绘图平台。 优势:所有素材均为平台原创并官方提供版权授权文件,消除发表版权风险,同时凭借顶刊级审美与极简中文界面,大幅缩短绘图时间、提升科研产出效率。 Hiplot特点:一个支持超过200种可视化图表并内置医学统计学分析模块的国产免费在线科研数据可视化平台。 MATLAB特点:一个在工程生物学领域具备高级建模与仿真能力、可生成高精度三维心脏模型及脑电信号动态模拟图等专业可视化成果的综合性平台。 总结科研绘图工具可按 “基础 - 进阶 - 高阶” 分级选择:基础友好型的 BioGDP、Hiplot、SciDraw,零门槛适配新手快速出图与素材补充;进阶专业型的 GraphPad Prism、Origin

    1K20编辑于 2026-03-25
  • 来自专栏Chris生命科学小站五年归档

    Hiplot 预印本发布:生物医学数据可视化辅助工具

    Hiplot 绘图网站预印本文章近期已作为预印本在 bioRxiv 发布,欢迎大家进行引用。 Hiplot 网站 2021.3-2022.3 访问省份 TOP 10 Openbiox 社区新一轮项目将在 5 月下旬发起,感兴趣的朋友可以投递简历至 admin@openbiox.org。 Hiplot: a comprehensive and easy-to-use web service boosting publication-ready biomedical data visualization Here, we propose an easy-to-use web service, Hiplot (https://hiplot.com.cn), equipping with comprehensive We used the demo and real datasets to demonstrate the usage workflow and the core functions of Hiplot

    27420编辑于 2023-02-28
  • 来自专栏BioIT爱好者

    Galaxy Project | 一些尝试与思考

    一些思考 生物信息有很多小而实用的小工具,像序列处理、统计、绘图等等,这些工具在命令行下可以信手拈来,但基于 web 集成的平台却极少(可能个人孤陋寡闻)。 在绘图领域,个人接触过感觉比较好用的有 Hiplot、ImageGP,或者是更大一点的 omicshare tools,以及其他的一些平台。 这样的情况在国内的生物类公司尤为明显,几乎每一个大一点的生物公司都有一个自己所谓的"平台",而用户每接触一个这样的平台都要先花一段时间去熟悉这些平台的操作使用逻辑,然后再去上传自己的数据和分析。 而且大部分的这些平台都是闭源的(所以轮子也只有它自己才能造)。 对于一些逻辑比较简单的平台还好,对那些大而臃肿,逻辑极其复杂的平台而言,虽然提供了使用教程,但是用起来非常耗时,费心费力。 国内为什么没有人考虑过开源的生物信息平台,集中力量办大事?可能有利益或者其他原因,但个人感觉如果有,会更香。

    76020发布于 2021-10-15
  • 来自专栏科研猫

    哈佛最新研究发现,打的是孩子屁股,伤害的是孩子脑子

    Child Development, 2021; DOI: 10.1111/cdev.13565 免费的科研绘图神器—hiplot,是2020年7月推出的全网首个开源绘图平台,目前提供基于R语言的70余种基础可视化和 60余种进阶绘图的功能,同时还部署了多个 openbiox社区项目(如bget下载文献附录、UCSCXenaShiny 等)。 https://hiplot.com.cn 所有功能免费!

    87030发布于 2021-04-25
  • 来自专栏机器学习与统计学

    谁是2020年最强Python库?年度Top10出炉,看你用过几个!

    Dear PyGui还可以绘图、创建主题、创建2D游戏,还拥有一些小工具,比如说内置文档、日志记录、源代码查看器之类的,这些小工具可以协助App的开发。 开源地址: https://github.com/onelivesleft/PrettyErrors 5、Diagrams 程序员在编程的时候,有时候需要跟同事解释他设计的程序代码之间复杂的结构关系,然而这不是一两句话能说清楚的 它们的图标来自多家服务商,包括AWS, Azure, GCP等。 仅需几行代码,就可以简单地创造出箭头符号和结构图。 ? 由于它使用Graphviz来渲染图,所以还需要先安装好Graphviz。 HiPlot是今年3月Facebook发行的一个库,主要用于处理高维数据。 Facebook AI通过几十个超参数和10万多个实验,利用HiPlot,来分析深度神经网络。 默认情况下,HiPlot的Web服务可以解析CSV或JSON文件,还可以为其提供自定义Python解析器,将实验转换为HiPlot实验。

    1.1K20发布于 2021-01-06
  • 来自专栏优雅R

    使用 Openbiox Hiplot (ORG) 在线开源绘图工具绘制发表级网络图

    Openbiox Hiplot (ORG) 开源绘图工具在基础模块中提供了基于 igraph 的发表级网络图绘制功能 Network (igraph)。 在线工具地址: https://hiplot.cn/basic/network-igraph 源代码下载: https://github.com/hiplot/plugins-open/tree/master Lou J, Bao Z, Zeng H, Yang Z, Cheng W, Zhao F, Zeng J, Liu XS, Wu R, Shen Y, Chen Z, Chen S, Wang M; Hiplot Hiplot: a comprehensive and easy-to-use web service for boosting publication-ready biomedical data visualization 图4 Demo 1 输出 示例 2 图5 Demo 2 示例输入 如 图5 所示,Demo 2 指定了节点大小列和标记组列,颜色画板 1 使用了 nejm 画板,颜色画板 2 使用了自定义画板,并设置为均一灰色

    1.4K10编辑于 2023-02-28
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