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靶向免疫细胞活化的关键调控组件：CD3E&CD3D异二聚体Fc融合蛋白的构建与应用
二、工程化策略：构建CD3E&CD3D异二聚体Fc融合蛋白为获得结构稳定、功能明确的CD3E/CD3D异二聚体研究工具，采用重组蛋白工程技术进行体外构建成为一种高效策略。 在本构建策略中，采用两种不同亚型的羊驼源Fc片段分别与CD3ε和CD3δ的胞外域融合。 其二，Fc标签的存在可显著延长重组蛋白在体外的半衰期，并可能通过其效应功能（如与Fcγ受体结合）赋予融合蛋白额外的生物学特性，为特定研究目的提供便利。 三、CD3E&CD3D异二聚体Fc融合蛋白的主要应用方向此工程化蛋白为T细胞免疫学研究及药物开发提供了多功能的工具分子。 四、总结与展望CD3E&CD3D异二聚体Fc融合蛋白的成功构建，为T细胞生物学研究领域提供了一个结构明确、功能可靠的重要工具。
13710编辑于 2026-02-11- 来自专栏生命科学
MCE丨重组蛋白常见的融合标签
Q：什么是融合标签？A：融合标签是指利用 DNA 体外重组技术，在目的蛋白 N 端或 C 端进行融合表达的特定蛋白、多肽或寡肽标签。Q：融合标签有什么作用？ Q：融合标签的分子量和功能有关吗？A：蛋白融合标签的分子量越大，对蛋白质本身的功能影响越大，所以大分子融合标签一般只用于检测或蛋白纯化等。 常见的小分子量的融合标签，因其具有很多商品化的标签抗体，可以节省使用者制备目的蛋白的单克隆抗体的时间与成本。Q：是否所有的融合标签都需要切除？ 为了便于将重组蛋白的融合标签去除，在设计构建载体时需要在标签蛋白和目的蛋白之间加上蛋白酶识别位点，常用的蛋白酶位点有：HRV 3C 蛋白酶切位点、TEV 蛋白酶切位点、肠激酶切位点、SUMO 蛋白酶切位点等 Q：融合标签加在 N 端或 C 端，有什么区别？A：蛋白融合标签对于 N 端或 C 端的选择性对重组蛋白的结构与特性会造成一定的影响。
50310编辑于 2023-03-22 ESM3蛋白质语言模型cookbook（3）
前两章我们介绍了ESM3和ESM-C模型 ESM3蛋白质语言模型cookbook（1） ESM3蛋白质语言模型cookbook（2） ·Hayes论文图 ESM3 能够在蛋白质的序列、结构和功能之间进行联合推理，因此我们可以构建新的提示方式，以比许多其他生物语言模型更高的控制水平引导模型生成蛋白质。 序列、结构和功能这三种模态在模型中被表示为离散 token 的轨道，既出现在模型的输入中，也出现在输出中，并在模型内部融合为一个统一的潜在空间。 gfp蛋白质结构 接下来我们再去看看pdb id为1qy3 的蛋白质结构是什么样子的呢？ ，其中背后的引擎则是esm3蛋白质多模态模型，并且也用到了自然语言中的很多概念，如mask和token的表示。
3700编辑于 2026-04-17- 来自专栏实验盒
ProtChat：融合大语言模型与蛋白质语言模型的自动化蛋白质分析工具
通过这种整合，ProtChat 能够自动化执行复杂的蛋白质分析任务，如蛋白质属性预测、蛋白质-药物相互作用预测等。 1. ProtChat的应用场景 ProtChat 的应用场景涵盖了蛋白质科学的多个关键领域： 蛋白质属性预测：如蛋白质稳定性、荧光强度、远程同源性等。 蛋白质-药物相互作用预测：预测蛋白质与药物之间的相互作用，助力药物筛选和设计。 蛋白质-蛋白质相互作用预测：预测蛋白质之间的相互作用，揭示复杂的生物网络。 通过与PLLMs（如ESM和MASSA）的集成，ProtChat 在多个下游任务中表现良好，尤其是在蛋白质-药物相互作用和蛋白质-蛋白质相互作用预测方面。 总结 ProtChat 通过整合GPT-4和蛋白质大语言模型，成功地将自然语言处理能力与蛋白质领域的专业知识相结合，提供了一个高效的自动化蛋白质分析工具。
52510编辑于 2025-01-22 【辰辉创聚生物】重组蛋白：从基因序列到药物设计的核心引擎
活性中心与结合界面对于酶类药物，其活性中心是催化生化反应的关键区域；对于受体-Fc融合蛋白，其与配体结合的界面是发挥功能的核心。 通过X射线晶体学、冷冻电镜等技术解析重组蛋白的三维结构，可以直观地“看到”这些关键区域，为药物优化提供蓝图。3. Fc融合蛋白这是一种巧妙的蛋白工程设计。将某个具有治疗潜力的蛋白（如受体胞外区、细胞因子）与免疫球蛋白G的Fc片段通过基因工程融合。 Fc片段不仅延长了融合蛋白在血液中的半衰期，还可能赋予其抗体般的效应功能。 例如：肿瘤坏死因子受体-Fc融合蛋白，通过利用其受体部分“中和”过量的TNF-α，同时利用Fc片段延长药效，从而治疗类风湿关节炎等自身免疫性疾病。3.
25600编辑于 2025-12-04- 来自专栏大数据和云计算技术
超融合方案分析系列（3）深信服超融合方案分析
前言 作者是国内研究超融合相当早的专家，有非常强的理论基础和实战经验，以下是超融合分析系列前面几篇，已经阅读过的同学可以跳过。 超融合分析系列： 超融合概述 超融合产品分析系列（1）：nutanix方案 超融合方案分析系列（2）：VSAN的超融合方案分析 非常深入的超融合分析系列，希望大家会喜欢，另外文章最后附有作者的微信，有兴趣的同学可以加作者做更深入的交流 下面是本系列第4篇正文： 整体方案 深信服的超融合一体机以及超融合方案目前在各个地方都推的比较猛，从官网看，他们的客户也有不少了。 今天我们一起来分析一下深信服超融合方案： 深信服超融合的整个方案中包含了aSV、aNET、aSAN三个核心组成部分。当然，既然是超融合方案，虚拟化是基础，而分布式存储则是超融合的核心。 3 第三个是网络需求： 在深信服官网http://wiki.sangfor.com.cn/index.php/超融合:最佳实践，我找到了对网络的一个要求： ?
8.6K70发布于 2018-03-08 - 来自专栏MixLab科技+设计实验室
VGUI融合的3种实现方式
最后，应用级语音交互只是通过GUI把VUI的内容可视化，但同时降低了GUI的阅读效率，算不上真正的VGUI融合。 最后，可见即可说只是通过VUI操作GUI，但能力非常有限，仍然算不上真正的VGUI融合。 3.系统级语音交互拥有意图识别和业务逻辑理解能力，因此系统可以理解用户的意图，也可以依据特定场景主动发起语音交互。 4.基于1、2、3点，系统级语音交互具有信息汇集和理解的能力，它是信息的中枢但服务于系统和各个应用，所以它应该把收集到的信息重新分发给各个应用。 最后，系统级语音交互能兼顾GUI和VUI的优点，提升VGUI的工作效率，是真正的VGUI融合。
1.6K40发布于 2020-03-12 - 来自专栏Y大宽
1️⃣序列获取(3)：蛋白质序列获取
EXProt :database for EXPerimentally verified Protein functions ps，写到这里，安利一个航母网址https://www.expasy.org/ 3 UniProtKB：不能再详细 Swiss-Prot 数据来源 核酸数据库翻译推导 蛋白质数据库PIR挑选 科学文献摘录 研究人员直接提交的蛋白序列 特点 每一条序列包括核心数据和注释两类, 其中 核心数据包括序列，参考文献，分类信息等 注释数据包括功能描述，翻译后修饰，结构域和功能位点，四级结构，相关疾病，PPI等 融合多个数据库，降低冗余 与其它数据库交叉引用 4 PIR The
68510发布于 2019-01-28 - 来自专栏大数据和云计算技术
超融合方案分析系列（4）H3C超融合方案分析
超融合概述 超融合产品分析系列（1）：nutanix方案 超融合方案分析系列（2）：VSAN的超融合方案分析 超融合方案分析系列（3）深信服超融合方案分析 非常深入的超融合分析系列，希望大家会喜欢，另外文章最后附有作者的微信 下面是本系列的第5篇，对H3C的深入分析。 整体方案 H3C UIS 统一基础架构系统就是H3C的超融合。 下面我们来分析一下UIS的方案，在UIS超融合一体机介绍中有一段描述： H3C UIS-Cell超融合一体机产品是H3C面向IaaS（基础架构即服务）推出的新一代解决方案，包含有UIS-Cell 3000 超融合一体机（4U4节点硬件方案，支持3节点的4030起步） ? H3C UIS R690 G2机架式超融合系统（4U4路机架服务器，只支持E7-4800v3） H3C UIS R590 G2机架式超融合系统（2U4路机架服务器，只支持E5-4600v3） H3C
6.1K60发布于 2018-03-08 呼吸道合胞病毒（HRSVBRSV）核心抗原深度解析：Fusion蛋白、G蛋白及PreF3蛋白的科研试剂应用
一、 融合糖蛋白F0：病毒入侵的核心引擎融合糖蛋白F0是HRSV/BRSV最具特征性的抗原之一，介导病毒包膜与宿主细胞膜的融合，是病毒进入细胞的关键第一步。 三、 PreF3蛋白：稳定融合前构象的抗原设计突破PreF3蛋白并非病毒基因组直接编码的天然蛋白，而是基于F蛋白结构生物学研究而精心设计的重组蛋白工程产物，特指稳定在融合前构象（Prefusion conformation 背景与设计理念：天然的F蛋白在激活前处于亚稳态的融合前构象（PreF），在被蛋白酶切割或某些条件下，会不可逆地转变为更稳定的融合后构象（PostF）。 通过引入特定的点突变（如去除切割位点、引入二硫键“DS-Cav1”或“SC-TM”设计），可以“锁定”F蛋白在PreF状态，此即PreF3蛋白（第三代预融合稳定设计代表）。 虽然F蛋白相对保守，但G蛋白差异显著，而PreF3蛋白的设计也需针对不同亚型进行序列优化。
23110编辑于 2025-12-15【辰辉创聚生物】呼吸道合胞病毒（HRSV）重组蛋白概述：F、G、N 等关键结构蛋白的类型与形式解析
病毒表面分布有多种跨膜糖蛋白，内部由核衣壳蛋白包裹基因组 RNA，并通过基质蛋白维持病毒整体结构。 二、HRSV 主要重组蛋白类型介绍1. F 蛋白（Fusion Protein）F 蛋白是 HRSV 包膜上的关键融合蛋白，介导病毒包膜与宿主细胞膜之间的融合过程。 该蛋白在结构上具有显著的构象变化特征，主要包括前融合构象（prefusion）和后融合构象（postfusion）两种状态。 由于糖基化对其结构与功能具有重要影响，G 蛋白在不同表达系统中可能呈现差异化的分子特征。3. ：用于表位定位与片段级别的功能分析标签融合形式：如 His、Fc 等融合结构，便于检测、固定或偶联实验不同形式的选择，通常取决于研究目标对构象完整性、分子大小及检测方式的要求。
18300编辑于 2025-12-19- 来自专栏python3
h3c和思科融合Vxlan
2.2.2.1/32 ip router ospf 1 area 0.0.0.0 line console line vty router ospf 1 router-id 2.2.2.1 H3C srv1000] xconnect vsi ***a [SwitchC-HundredGigE1/0/1-srv1000] quit [SwitchC-HundredGigE1/0/1] quit H3C time=52.298 ms 84 bytes from 11.1.1.1 icmp_seq=2 ttl=64 time=43.287 ms 84 bytes from 11.1.1.1 icmp_seq=3 42.977 ms 84 bytes from 11.1.1.252 icmp_seq=2 ttl=255 time=128.824 ms 84 bytes from 11.1.1.252 icmp_seq=3
93910发布于 2020-01-15 【辰辉创聚生物】抗体定制服务｜单克隆抗体｜多克隆抗体｜重组抗体开发解决方案
常见形式包括多肽抗原、重组蛋白、融合蛋白或细胞裂解物等。设计中需考虑抗原位点的表面暴露性、保守性与免疫原性，同时避免与非特异性区域发生交叉反应。2. 3. 抗体筛选与鉴定多克隆抗体（pAb）：从动物血清中纯化特异性IgG，适合快速开发与信号增强实验。单克隆抗体（mAb）：通过杂交瘤技术或单B细胞克隆，从单一B细胞获取抗体，具有高度一致性与特异性。 四、抗体定制的应用实例生物标志物研究：开发针对特定蛋白的IHC抗体、WB抗体，用于表达水平分析；信号通路研究：特异性抗体用于调控蛋白检测、磷酸化状态分析；细胞表面分型：开发用于流式细胞术（FC）的抗体； Q2：没有蛋白，能开发抗体吗？A：当没有蛋白时，可以考虑使用多肽抗原或通过结构预测设计免疫原性区域合成肽段，并结合KLH/BSA偶联增强免疫效果。Q3：抗体表达后如何验证其有效性？ A：常用方法包括ELISA、WB、IHC、FC、IP等。建议根据应用场景制定验证策略，并提供相应实验图谱。Q4：如何选择合适的表达系统？
19610编辑于 2025-07-21- 来自专栏DrugAI
. | 融合蛋白语言与几何深度学习的疫苗抗原精准预测
研究人员提出 PLGDL 框架，联合利用蛋白语言模型与几何深度学习模型，同时整合蛋白序列与三维结构信息，用于保护性疫苗抗原预测。 方法 PLGDL 框架通过蛋白语言模型从氨基酸序列中提取上下文嵌入特征，并利用几何深度学习模型 NEGCN 从蛋白三维结构中学习空间与拓扑信息。 序列–结构特征融合显著提升预测性能 在多种评估指标上，融合序列与结构信息的 PLGDL 明显优于仅使用序列特征的传统方法，在不同病原体类别中均保持稳定表现。 图 3｜在构建数据集上多种分类算法的预测性能比较。 讨论 PLGDL 展示了一种融合蛋白序列语义与三维结构几何信息的通用抗原预测框架。通过避免人工特征工程，并在多病原体数据上联合训练，该方法实现了良好的泛化能力。
18620编辑于 2026-01-06 CKS1 GST Tag融合蛋白：细胞周期调控机制研究的核心工具
二、CKS1GSTTag融合蛋白的表达与纯化策略为获得高纯度、高活性的CKS1重组蛋白用于体外研究，常采用融合蛋白表达系统。 将CKS1蛋白编码基因与谷胱甘肽S-转移酶标签进行融合表达，是一种成熟且高效的策略。1.表达系统选择：该融合蛋白通常在原核表达系统（如大肠杆菌）中进行异源表达。 3.标签切除灵活性：在GST标签与CKS1之间设计特异的蛋白酶切割位点（如凝血酶、PreScission蛋白酶位点），可在纯化后选择性地切除GST标签，从而获得无标签的、接近天然构象的CKS1蛋白，以满足某些需要排除标签干扰的精细功能研究 三、CKS1GSTTag融合蛋白在分子机制研究中的应用纯化获得的CKS1GSTTag融合蛋白为细胞周期调控的体外研究提供了强有力的分子工具，其主要应用方向如下：1.蛋白质-蛋白质相互作用验证：-Pull-down 3.功能抗体开发与筛选：高纯度的CKS1GSTTag蛋白可作为优质的免疫原，用于制备高特异性的多克隆或单克隆抗体。
8710编辑于 2026-02-13- 来自专栏R语言可视化
两蛋白间的分子对接3—使用AlphaFold进行
两蛋白间的分子对接3—使用AlphaFold进行据说AlphaFold进行分子对接比传统的蛋白分子工具如zdock、hdock的对接效果更好。 输出PDB格式文件3.pymol中进行可视化操作安装ppi.py脚本文件，Choose file选择ppi.py这个脚本，安装脚本ppi.py这段 Python 脚本是专门在 PyMOL 中执行的，用来分析和可视化蛋白质 -蛋白质相互作用（PPI），重点包括：π-π stacking（芳香环之间的堆叠）Salt bridge（盐桥）Hydrogen bonds（氢键）同时，脚本还设置了可视化参数，便于展示结果。 [1] - y3[1], y1[2] - y3[2]] n2 = [D2 * E3 - E2 * D3, D3 * E1 - E3 * D1, D1 * E2 - E1 * D2] dot_product share_source=copy_web&spm_id_from=333.788.videopod.sections&vd_source=b6fa58fce4b5e0fc33b25e14b4f5774
3.4K11编辑于 2025-04-08 - 来自专栏纳米药物前沿
Biomaterials：新型双特异性融合蛋白增强胰腺癌成像的靶向性
中国医学科学院肿瘤医院影像诊断科赵心明/中国科学院自动化研究所田捷、王坤合作报道了通过对抗体的不同结合结构域进行基因融合而构建的小尺寸，双特异性融合蛋白Bi50，其对胰腺癌具有增强的靶向作用。 作者成功构建了针对胰腺癌VEGF和EGFR的新型双特异性融合蛋白Bi50。 基因融合使合成的Bi50具有较小的分子量（尺寸），同时确保了两个scFvs的双特异性，这有助于融合蛋白在致密胰腺癌组织中的渗透。 因此，融合蛋白Bi50在体内比对照蛋白F（ab′）2具有更高的瘤内渗透性和富集性。此外，Bi50不仅在体内和体外对胰腺癌细胞保持了非常突出的双特异性，而且还获得了“多级”靶向作用。 增加了肿瘤内渗透和蓄积，双特异性和“多水平”靶向增加了融合蛋白Bi50对胰腺癌的靶向。新型融合蛋白Bi50在胰腺癌的早期诊断和精准手术成像中显示出广阔的前景。
40550发布于 2021-02-04 - 来自专栏DrugOne
复旦大学王满宁团队提出ProteinF3S模型，通过融合蛋白序列、结构和表面信息进行酶分类预测
作者提出了一个新的框架ProteinF3S，该框架融合了蛋白质序列、结构和表面（fusion of sequence, structure and surface）的互补信息。 作者将ProteinF3S与一些具有代表性的方法进行了比较，如表1所示，在基于不同酶反应类型的蛋白质分类任务上，ProteinF3S的准确度超越了现有方法。 然而，多尺度双向融合取得了积极的效果，证明了融合策略的重要性。此外，表3底部的两行也说明了融合过程中残差设计的必要性。残差的设计实现了选择性融合，使模型在合理的尺度和方向上传输互补信息。 表3 不同融合策略对比 在这项研究中，作者提出了融合蛋白质序列、结构和表面之间存在的互补信息的框架ProteinF3S。 未来，ProteinF3S有望扩展到更多的蛋白质任务，相关的融合策略也可以推广到更多类型的分子表征学习任务中。 参考文献 Yuan et al.
27510编辑于 2025-03-20 ESM3蛋白质语言模型cookbook（1）
一.背景介绍 对于蛋白质序列的研究和结构的研究现在变得越来越热门，所谓工欲善其事，必先利其器，所以今天我们就来介绍一下ESM3, 使用ESM3可以对蛋白质进行特征提取，无论是之后再接入各种各样的神经网络 5 亿年进化并实测设计出全新的绿色荧光蛋白，帮助科学家按需创造酶、抗体及碳捕获蛋白等功能分子，标志着蛋白质语言模型从“预测”迈向“可控生成”时代。 ESM-3更是一个多模态的蛋白质语言模型，结合了蛋白质的结构和功能等特征。 因为蛋白质由氨基酸组成，而每一种氨基酸又由不同的原子组成，所以这里是原子坐标，如果没有这个原子，那么其坐标则为nan 3: 每个原子的(x,y,z)坐标 打印一下看看咯： print(protein.coordinates protein.sasa = protein_chain.sasa() plt.plot(protein.sasa) 我们还可以将这些SASA值映射到结构的3D可视化上，利用我们拥有这种蛋白质的3D坐标这一事实
2900编辑于 2026-04-17IL-21IL-21R信号通路：从生物学功能到抗体-细胞因子融合蛋白的精准治疗策略
二、抗体-IL-21融合蛋白的设计原理与进展为克服IL-21的临床应用瓶颈，研究者提出了“抗体-细胞因子融合蛋白”的策略，旨在通过抗体部分实现肿瘤微环境的靶向递送，并延长IL-21的半衰期。 2.延长体内半衰期：利用抗体的Fc片段或抗体本身的较长半衰期特性，可显著改善IL-21的药代动力学特性，使其在体内维持更长的有效浓度。近期，该领域取得了显著进展。 三、IL21/IL21R研究试剂盒在融合蛋白开发中的关键应用在抗体-IL-21融合蛋白的理性设计、筛选与功能评价过程中，精确解析IL-21与受体（IL-21R）的相互作用及下游信号传导至关重要。 2.信号通路激活评估：•通过检测IL-21刺激下游关键信号分子（如STAT3、STAT1）的磷酸化水平，或使用报告基因细胞系（如STAT报告基因），试剂盒能够定量评估不同IL-21变体或其融合蛋白激活IL 3.细胞水平功能验证：•试剂盒提供标准化的细胞功能检测方案，可用于评估IL-21融合蛋白对特定靶细胞（如PD-1阳性的T细胞系、原代NK细胞或肿瘤特异性T细胞）的功能影响。
15810编辑于 2026-01-20
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