;DMSO;meets analytical specification of Ch.P.体外研究二甲基亚砜 (DMSO) 是一种无色液体。 Help & FAQs二甲基亚砜 (DMSO) 可以用于细胞冻存吗? 可以的,但是 DMSO 是有毒性的,在做细胞实验的时候建议 DMSO 占比不超过 1/1000,动物实验的时候建议不超过 1/10。 新买的 DMSO 为什么放 4℃ 冰箱 (冰上) 冻住了,这是正常的吗? DMSO 的熔点是 18 ℃,在低于 18 ℃ 下 DMSO 会凝固,所以在 4℃ 冰箱 (冰上) 冻住是正常的,如果冻住的话可以放室温或者 37℃ 水浴来解冻。
(11)加DMSO前要把液体小心吸掉。 或者将96孔板倒扣于滤纸上来吸取孔内的培养液); c) 每孔加入150μL DMSO,置摇床上低速振荡10min,使结晶物充分溶解(加入 DMSO 溶解后,将加入DMSO的96孔板放入37℃ 孵箱内孵育 需要注意的是,以DMSO 作为溶剂溶解的药物至少需要进行100倍以上稀释才能使用,因为作用于细胞DMSO的含量高于1%时,DMSO会杀死细胞从而影响判断。) 或者将96孔板倒扣于滤纸上来吸取孔内的培养液); c) 每孔加入150μL DMSO,置摇床上低速振荡10min,使结晶物充分溶解(加入 DMSO 溶解后,将加入DMSO的96孔板放入37℃ 孵箱内孵育 或者将96孔板倒扣于滤纸上来吸取孔内的培养液); c) 每孔加入150μL DMSO,使结晶物充分溶解(加入 DMSO 溶解后,将加入DMSO的96孔板放入37℃ 孵箱内孵育 10~20 min,这样有助于
■ 忍辱负重的有机溶剂们 1、DMSO 实际上,我们实验中会碰到很多水不溶的产品,这时候 DMSO 该登场了。 我们知道,一般细胞实验中 DMSO 含量终浓度尽量在 0.1% 以下,而在动物实验中,对于正常鼠,建议 DMSO 的终浓度不大于 10%;对于裸鼠或体弱鼠,建议 DMSO 的终浓度尽量不要超过 2% 。 通常,DMSO 配制的母液如果直接用生理盐或 PBS 稀释成工作液,有可能出现析出的情况,这时就需要助溶剂的鼎力相助啦。 萌 Cece:只要溶解度允许,可以降低 DMSO 含量,建议取少量尝试,因为水溶性如果很差的话,可能会有析出。 作为 DMSO 和乙醇的好兄弟,DMF,是一种挥发速度低的极性溶剂,在生物领域常用来溶解一系类对 DMSO 敏感的产品,比如铂类化合物,动物中使用也与 DMSO 类似。
或者将96孔板倒扣于滤纸上来吸取孔内的培养液); c) 每孔加入150μL DMSO,置摇床上低速振荡10min,使结晶物充分溶解(加入 DMSO 溶解后,将加入DMSO的96孔板放入37℃ 孵箱内孵育 需要注意的是,以DMSO 作为溶剂溶解的药物至少需要进行100倍以上稀释才能使用,因为作用于细胞DMSO的含量高于1%时,DMSO会杀死细胞从而影响判断。) 或者将96孔板倒扣于滤纸上来吸取孔内的培养液); c) 每孔加入150μL DMSO,置摇床上低速振荡10min,使结晶物充分溶解(加入 DMSO 溶解后,将加入DMSO的96孔板放入37℃ 孵箱内孵育 或者将96孔板倒扣于滤纸上来吸取孔内的培养液); c) 每孔加入150μL DMSO,使结晶物充分溶解(加入 DMSO 溶解后,将加入DMSO的96孔板放入37℃ 孵箱内孵育 10~20 min,这样有助于 DMSO对紫色结晶物的溶解(尤其在冬天)); d) 加DMSO后10min内,用酶标仪检测各孔波长490nm的吸光值。
■ 不提比例就判定有毒,实在是不负责任的耍流氓行为 以 DMSO 为例,一般建议其终浓度在 0.1% 以下,这个浓度是非常保守的建议了,有一些细胞本身并不敏感,可以承受 0.5% 的 DMSO,甚至 1% 的 DMSO 对细胞活力也没有明显影响。 ■ 凡事都有例外 正如前面所提到的,DMSO 固然可用于诸多化合物的溶解,但是面对含铂化合物的时候,也是无能为力呢,这个时候,就需要 DMF 等辅助出场了。 ■ 溶解药物,既要讲“法理”,也要通“人情” 比如,GW4869微溶于 DMSO,难溶于水,除了借力甲磺酸,也可用 DMSO 配置成均匀的混悬液作为储备液,最后用培养基稀释可达到澄清状态;比如,天气冷的时候 ■ 不要随便拒绝没听过的溶剂 THF、丙酮、乙腈、乙酸乙酯,这些溶剂不常见,却是友好的存在,比如丙酮,在 MCF-7、RAW-264.7 以及 HUVEC 细胞系中,比 DMSO、乙醇和 DMF 都更加友好
分子量远低于肾阈值(<30 kDa),可通过肾脏快速排泄,无蓄积风险物理参数速查:外观:无色至淡黄色透明液体密度:约 1.127 g/mL(25°C)溶解度:H₂O ≥ 100 mg/mL(≈333 mM),DMSO ≥ 100 mg/mL(建议使用新开封DMSO,避免吸湿影响溶解)二、体外研究应用:溶解性与实验操作指南DA 已批准聚乙二醇 (PEG) 在食品、化妆品和药物中用作载体或基质,包括可注射、局部、直肠和鼻腔制剂 细胞实验:H2O 中的溶解度 : ≥ 100 mg/mL (333.33 mM)DMSO 中的溶解度 : 100 mg/mL (333.33 mM; 超声助溶; 吸湿的 DMSO 对产品的溶解度有显著影响 ,请使用新开封的 DMSO)* "≥" means soluble, but saturation unknown.三、体内研究应用:安全剂量与给药途径PEG300 被广泛用于动物实验中的药物溶媒,其安全性已通过多项药理和毒理研究验证 四、使用建议与注意事项密封保存:PEG300具强吸湿性,使用后请立即拧紧瓶盖,避免水分进入影响实验准确性;DMSO配套使用:若用于化合物储备液,建议使用新开封DMSO,防止因DMSO吸水导致析出;超声助溶
■ 胚胎实验研究显示,像 DMSO、DMF、乙醇、丙酮这些常见的小分子药物溶剂,斑马鱼胚胎和幼体的耐受度在 0.5-2.5% (孵育时间 24 小时)。 以 DMSO 为例,细胞实验中一般不超过 0.1%,而斑马鱼胚胎和幼体通常暴露于高达 1% DMSO 环境中,斑马鱼毒性实验中,胚胎对 2.5% DMSO 耐受性都很好。 友情提示,大多数胚胎孵育,DMSO 终浓度还是控制在 0.1% 以下的哟。不要轻易在危险的边缘试探哟! 2016 年,发表在Dis Model Mech期刊上的一篇研究,斑马鱼口服给药,DMSO 浓度达到了 10%。 ■ 药浴Terfenadine诱导斑马鱼 QTc 延长的实验中,使用药浴的方式进行处理,DMSO 终浓度达到了 1%,孵育时间为 10 分钟。
,很多时候,这些液体里还有很大比例的 DMSO 等毒性溶剂,是药三分毒,况且它还只是个和 (huo) 药的。 萌 Cece 建议:小鼠单次腹腔给药最佳体积 5 mL-10 mL/kg,在溶解度允许情况下适当减少给药体积,用 DMSO 配制的母液时,对于正常小鼠或大鼠,建议 DMSO 的终浓度不要大于 10%;对于裸鼠或体弱小鼠或大鼠 ,建议 DMSO 的终浓度尽量不要超过 2%;对于正常小鼠,如果给药频率超过一天三次,建议 DMSO 的终浓度尽量不要超过 5%。 ■ 第四宗罪:每天给药多次,有机溶剂总比例高 小白:腹腔给药用 5% DMSO 配置,就打 100 μL,咋就快瘫痪了呢,主人很困惑。本小白也很困惑,主人,您一天打 6 次咋不说? 雨蛙素用于急性胰腺炎模型是需要隔一小时给一次药,一天给药 5-7 次,如果用 DMSO 配置,需要将 DMSO 终浓度降到很低很低,重要的是,雨蛙素本身水溶性非常好,这种情况首先建议用生理盐水/PBS
取细胞完全培养基、 DMSO、胰蛋白酶等,放于水浴箱中预热。首先消毒双手和超净台。取约 10 毫升细胞完全培养基放于 15 毫升离心管中。 配置细胞冻存液:冻存液应该提前配制,置于室温备用,防止临时配制产生的热量损伤细胞,按无血清培养基 比 血清 比 DMSO=7:2:1 的比例配置细胞冻存液,其中加大冻存液中血清的比例对于保存某些脆弱的干细胞以及一些比较珍贵的细胞很有好处的 2、注意冷冻保护剂之品质 DMSO 应为试剂级等级,无菌且无色, 可以用 0.22 微米滤膜过滤,或者直接购买无菌产品。以 5-10 ml 小体积分装, 4℃避光保存,勿作多次解冻。 使用 DMSO 前,不需要进行高压灭菌,它本身就有灭菌的作用。高压灭菌反而会破坏它的分子结构,以至于降低冷冻保存效果。在常温下, DMSO 对人体有害,故在配制时最好带上手套。 混匀 DMSO 要快,因为 DMSO 对细胞有毒性,混合后应尽快冻存。尤为值得注意的是细胞中加入冻存液后,一定要混匀,防止 DMSO 沉淀。
J Leukoc Biol. 1996;59(4):555-561.02 溶解性数据细胞实验:DMSO 中的溶解度 : 100 mg/mL (162.12 mM; 超声助溶)Ethanol 中的溶解度 方案 二请依序添加每种溶剂: 10% DMSO 90% (20% SBE-β-CD in Saline)Solubility: 2.5 mg/mL (4.05 mM); 悬浊液; 超声助溶此方案可获得 以 1 mL 工作液为例,取 100 μL 25.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL 20% 的 SBE-β-CD 生理盐水水溶液 中,混合均匀。 方案 三请依序添加每种溶剂: 10% DMSO 90% Corn OilSolubility: ≥ 2.5 mg/mL (4.05 mM); 澄清溶液此方案可获得 ≥ 2.5 mg/mL(饱和度未知)的澄清溶液 以 1 mL 工作液为例,取 100 μL 25.0 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL玉米油中,混合均匀。
示例:雷帕霉素动物实验溶解方案之玉米油依序添加每种溶剂:10% DMSO 90% Corn OilSolubility: ≥ 2.08 mg/mL (2.28 mM); 澄清溶液。 以 1 mL 工作液为例,取 100 μL 20.8 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 900 μL 玉米油中,混合均匀。 03溶剂类DMSO(HY-Y0320)是一种极性非质子溶剂,由于助溶效果显著和对实验动物低毒性得以广泛应用。可单独使用制得药物原液[6],但在动物给药实验中,一般与不同类别的助溶剂进行配比使用[7]。 小彩蛋:DMSO 是细胞实验的常客,自然也经常用于细胞冻存。 比如 Tween 80 (HY-Y1891) 可与 DMSO、PEG300、生理盐水混合配比用于小鼠腹腔注射[7],还可以减少细菌附着并抑制生物膜的形成[10]。
■ 溶解界老大哥:万能溶剂 DMSO 很多产品并不溶于水,这时候,我们的万能溶剂 DMSO 就闪亮登场了。 细胞实验可以根据您的最大使用浓度,配置 1000X 的储液,使用时培养基稀释到工作液浓度。 Tips: 有时候可能会遇到产品本身溶解度不高的情况,无法配置 1000X 的储备液;要做好溶剂对照,排除下 DMSO 对实验结果的影响。 此外,其他有机溶剂 DMF (铂类物质的好朋友),丙酮等,虽相对 DMSO 使用较少,但它们还是药物溶解的好溶剂! ■ 对于有机溶剂溶解的产品(如 DMSO) 正常小鼠可用 DMSO 配置至少 10 倍的储液,使用时加助溶剂稀释 10 倍,做好溶剂对照就可以了。 在这里给大家安利一个小工具! 我们最终的工作液浓度是 0.8 mg/mL,50X,就是配置 40 mg/mL 的储液 (此产品在 DMSO 中的溶解度为 125 mg/mL,可以满足),使用时按照 2% DMSO+40% PEG300
_24h_wt_rep1<-read.csv("SRR12692092_summits_filt_blacklist.csv") DMSO_24h_wt_rep1<-DMSO_24h_wt_rep1[, -4] DMSO_24h_wt_rep2<-read.csv("SRR12692093_summits_filt_blacklist.csv") DMSO_24h_wt_rep2<-DMSO_24h_wt_rep2 3、拿到每个样本中peaks对应得基因名 这一步非常重要,拿到基因名就可以根据课题需要进行差异分析等 #以DMSO_24h_wt样本为例 #replicate 1 peakAnno_DMSO_24h_wt_rep1 "]])) colnames(genelist_DMSO_24h_wt_rep2_uniqe)<-"symbol" #重复样本间共同的开放基因 venn.diagram( x=list( DMSO _24h_wt_rep1=genelist_DMSO_24h_wt_rep1_uniqe$symbol, DMSO_24h_wt_rep2=genelist_DMSO_24h_wt_rep2_uniqe
可溶于多种有机溶剂,如二甲基亚砜(DMSO)、乙醇、甲醇和氯仿。在实验中最常使用DMSO配制高浓度的储存液(例如,10-100 mM)。稳定性: 固体粉末在-20°C干燥、避光条件下稳定。 DMSO储存液也应分装后于-20°C或更低温度保存,并避免反复冻融和光照,以防止降解。 溶解性与溶剂对照: 由于其水溶性差,必须使用DMSO等有机溶剂配制。在细胞实验中,必须设置含有相同浓度DMSO的溶剂对照组,以排除DMSO本身对细胞的潜在影响。
需先溶于极性有机溶剂(如二甲基亚砜,DMSO)中配制成高浓度的储存液(例如,20-100 mM),使用时再稀释到培养液或缓冲液中。DMSO储存液应置于-20°C或更低温度保存。 DMSO储存液应避免反复冻融,并需严格避光保存,以维持其活性。在水溶液或细胞培养液中稳定性相对较差,会随时间推移而降解。 溶剂对照: 由于需要溶解在DMSO中使用,实验中必须设置含有相同浓度DMSO的溶剂对照组,以排除DMSO本身对细胞的潜在毒性影响。
","3_DMSO_Ova", "4_IBET_Ova","5_IBET_Ova","6_IBET_Ova")#检查行名、列名#rownames(dat)colnames (dat)#> [1] "2_DMSO_Ova" "3_DMSO_Ova" "4_IBET_Ova" "5_IBET_Ova" "6_IBET_Ova"# 转换为整数矩阵exp <-as.matrix( #分组信息的获取library(stringr)k = str_detect(colnames(exp),"DMSO");table(k) Group = ifelse(k,"DMSO","IBET") Group = factor(Group,levels = c("DMSO","IBET"));Groupdata.frame(colnames(exp),Group)#保存数据save(exp,Group paste0(proj,".Rdata"))2 差异基因三大R包的差异基因分析rm(list = ls())load("GSE200033.Rdata")table(Group)#> Group#> DMSO
易溶于DMSO(可达100 mg/mL)、乙醇和甲醇。稳定性与保存: 固体粉末应在-20°C、避光、干燥条件下保存。 配制的溶液(例如用DMSO配制10 mg/mL的储存液)也建议在-20°C避光保存,并避免反复冻融。作用原理与机制Brefeldin A 最主要的作用是可逆地抑制蛋白质从内质网向高尔基体的转运。 溶剂对照: 由于BFA常用DMSO溶解,实验中必须设置含有相同终浓度DMSO的溶剂对照组,以排除DMSO本身对细胞的影响。毒性警示: BFA对细胞有显著毒性,特别是在较高浓度和较长处理时间下。
/data/GSM4462450_Nalm6_DMSO_matrix.mtx.gz') mtx dim(mtx) cl=fread('.. /data/GSM4462450_Nalm6_DMSO_barcodes.tsv.gz', header = T,data.table = F ) head(cl) rl=fread /data/GSM4462450_Nalm6_DMSO_features.tsv.gz', header = T,data.table = F ) head(cl) head(rl) pro='DMSO') head(DMSO@meta.data) mtx=readMM('.. =DMSO, RUNX1=RUNX1 ) save(sceList,file = 'sceList.Rdata') Setp2:数据质控过滤 这个地方没什么好说的,就 是标准的代码,复制粘贴即可:
小鼠 (n = 5/6) 在感染后 1、2、3、4、6、10、21 和 24 小时用 ~10-20 μl 带有 abaucin 的 Glaxal Base (实验组) 或 DMSO (对照组) 治疗。 感染 1 小时后,用 DMSO(红色;n = 6)或 4% abaucin(蓝色;n = 6)治疗小鼠 24 小时以上。纵轴是感染后 25 小时伤口组织的细菌负荷。 0.0034;DMSO 与 4% abaucin 相比,P= 0.0039)。 感染前 (t = 0)、用 DMSO 处理 24 小时后以及用 abaucin 处理 24 小时后的小鼠背表面图像。在 DMSO 中观察到的炎症 (箭头) 在用 abaucin 处理的小鼠中不存在。 图 3 显示,使用 abaucin 进行治疗后的伤口细菌负荷明显低于 DMSO 组,且在用 DMSO 处理 24 小时后仍存在的伤口炎症在 abaucin 中消失了,abaucin 能够有效地控制鲍曼不动杆菌的感染
超声助溶 (<60°C); DMSO can inactivate Cisplatin's activity动物实验溶解方案:以下溶解方案,请直接配制工作液。建议现用现配,在短期内尽快用完。 方案 三请依序添加每种溶剂: 0.5% CMC-Na/saline waterSolubility: 20 mg/mL (66.66 mM); 悬浊液; 超声助溶Help & FAQs为什么不建议用 DMSO DMSO 会使顺铂失活,参考文献 PMID: 24812268。必须避光吗?实验室没有避光 EP 管,影响使用吗?是的,需要避光保存,也可以用铝箔包一下。