这个就是在快速乘的基础上改一下 sum=0--->sum=1 x+=x--->x*=x //快速幂模板 public double quickPow(double x,long y){ double sum=1; while(y>0){ if((y&1)==1){ sum*=x; } x*=x; y=y>>1; }
感知机非常简单同时又很容易理解,但是相对应的,缺点也很多。感知机最大的缺点就是它只能解决线性可分的问题。
Hash:本次打包的一个标识。 Version:使用的webpack版本 Time:本次打包耗时 Built at: 生成时间
#因子:分类数据 #有序和无序 #整数向量+标签label #Male/Female #常用于lm(),glm()
现在已经习惯了容器化了,不仅可以很快的配合CICD来实现部署,同时主要是也能解决一些疑难杂症,比如在Linux中经常会有各种图形图像的依赖包问题。特别是内网环境。
2-5 线性表之循环链表 循环链表就是链表首尾相接连成一个环,可以用单链表 和 循环链表来实现。
本文链接:https://blog.csdn.net/shiliang97/article/details/101173005 2-5 Two Stacks In One Array (20 分) Write
2-5 修理牧场 (35 分) 农夫要修理牧场的一段栅栏,他测量了栅栏,发现需要N块木头,每块木头长度为整数Li个长度单位,于是他购买了一条很长的、能锯成N块的木头,即该木头的长度是Li的总和
一般自然群体,基因型个体的杂合度过高或者过低,都不正常,我们需要根据杂合度进行过滤。偏差可能表明样品受到污染,近亲繁殖。我们建议删除样品杂合率平均值中偏离±3 SD的个体。
了解什么叫响应式。 了解CSS3 Media Queries 了解Bootstrap 了解Bootstrap的全局 CSS 样式。特别是其中的栅格系统。 作业 用Bootstrap做页面 http://www.bootcss.com/ 。交互不需要实现
前面章节介绍了小程序的文件构成,那么这些文件在微信客户端是怎么协同工作的呢?在本章中将会介绍微信客户端给小程序所提供的宿主环境,下文把这个概念简称为宿主或者宿主环境。
代码清单2-5 /* 预定义的结果表 */ int countTable[256] = { 0, 1, 1, 2, 1, 2, 2, 3, 1, 2, 2, 3, 2, 3, 3, 4, 1
pbmc500_assay <- CreateChromatinAssay(pbmc500.counts, fragments = frags.500) pbmc500 <- CreateSeuratObject meta.data=md.500) pbmc1k_assay <- CreateChromatinAssay(pbmc1k.counts, fragments = frags.1k) pbmc1k <- CreateSeuratObject meta.data=md.1k) pbmc5k_assay <- CreateChromatinAssay(pbmc5k.counts, fragments = frags.5k) pbmc5k <- CreateSeuratObject meta.data=md.5k) pbmc10k_assay <- CreateChromatinAssay(pbmc10k.counts, fragments = frags.10k) pbmc10k <- CreateSeuratObject assay <- CreateChromatinAssay(counts = counts.500, sep = c(":", "-"), min.features = 500) pbmc500 <- CreateSeuratObject
1.2 创建seurat对象 依然使用CreateSeuratObject 函数,此处count 为读取的矩阵文件。 sce0 <- CreateSeuratObject(counts = data) sce0 head(sce0@meta.data) An object of class Seurat 19790 1,CreateSeuratObject中的meta.data参数 CreateSeuratObject函数除了简单的过滤条件外 ,还有一个重要的meta.data参数,可以输入提供的meta信息。 检索之后https://github.com/satijalab/seurat/issues/2715 发现 ,是因为CreateSeuratObject要求meta文件中rownames是count文件的 CreateSeuratObject函数的帮助文档中也很明确的提到了该点要求。 发现问题后,只需要将meta文件的cellid列转为rownames即可。
Read10X(data.dir = paste(dataset_loc, ids[1],"filtered_feature_bc_matrix", sep="/")) seurat_obj <- CreateSeuratObject Read10X_h5(file.path(dataset_loc, ids[1], "filtered_feature_bc_matrix.h5"), use.names = T) seurat_obj <- CreateSeuratObject row names as the gene IDs rownames(counts) <- gene_ids colnames(counts) <- cell_ids seurat_obj <- CreateSeuratObject 1L),sep="_") d10x }) seurat_merge <- do.call("cbind", d10x.data) # for "dgCMatrix" seurat_data <- CreateSeuratObject Read10X(data.dir = paste(dataset_loc, file,"filtered_feature_bc_matrix", sep="/")) seurat_obj <- CreateSeuratObject
dgCMatrix" # attr(,"package") # [1] "Matrix" # 构建 Seurat 对象 # 初步过滤一般不需要修改参数,除非数据实在太难看 Seurat_object <- CreateSeuratObject ScRNAdata <- Read10X_h5(filename = "GSM3489182_Donor_01_raw_gene_bc_matrices_h5.h5") Seurat_object <- CreateSeuratObject read.table( "data/GSM2829942/GSM2829942_HE6W_LA.TPM.txt", row.names = 1, header = T) Seurat_object <- CreateSeuratObject CreateSeuratObject( counts, project = "CreateSeuratObject", assay = "RNA", names.field = 1,
习题2-5 求平方根序列前N项和 本题要求编写程序,计算平方根序列 1\sqrt{1}1 + 2\sqrt{2}2 + 3\sqrt{3}3 +⋯的前N项之和。
这两天分析一个单细胞数据发现一个奇怪的问题,就是创建 seurat 对象的时候,我明明设置了参数 CreateSeuratObject 函数的project 参数,但是最后merge 不同的样本后发现 > gsub(".txt","", pro) [1] "IRI1d_1" CreateSeuratObject 这个函数做了什么? 赶紧查看 CreateSeuratObject 的帮助文档: Create a Seurat object Description Create a Seurat object from raw data = NULL, project = "CreateSeuratObject", ... ) Arguments counts Either a matrix-like object with # 创建Seurat对象 sce <- CreateSeuratObject(counts = counts, min.cells=3, project = gsub(".txt","", pro),
MACS <- CreateSeuratObject(counts = MACS, project = "H14_MACS", min.cells = 3, min.features = 100) MACS H21 <- CreateSeuratObject(counts = H21, project = "H21", min.cells = 3, min.features = 100) H21 H23 <- CreateSeuratObject(counts = H23, project = "H23", min.cells = 3, min.features = 100) H23 H24 <- CreateSeuratObject = H32, project = "H32", min.cells = 3, min.features = 100) H32 H33 <- CreateSeuratObject(counts = H33 = 3, min.features = 100) H36 H38 <- CreateSeuratObject(counts = H38, project = "H38", min.cells = 3,
如果是单个样品,直接读取进来然后创建seurat对象即可:初试Seurat的V5版本 主要区别在于,V4版本中一般是循环读取样品,使用CreateSeuratObject创建seurat对象,然后使用merge 那我们可以先把多个样品合并成为了一个超级大的表达量矩阵,并使其行名为基因名,列名为barcodes信息,后面直接针对它来使用CreateSeuratObject函数去构建Seurat对象,就是完美的下游分析的输入数据啦 GSE212975/',samples) names(dir) <- samples #读取数据创建Seurat对象 counts <- Read10X(data.dir = dir) sce.all = CreateSeuratObject sceList[[i]])<-paste0(samples[i],"_",col) } #数据整合后创建seurat对象 merge <- do.call(cbind,sceList) sce =CreateSeuratObject F,data.table = F ) head(rl) #整合矩阵信息 colnames(mtx)=cl$V1 rownames(mtx)=rl$V1 #创建seurat对象 sce.all=CreateSeuratObject