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来自专栏三代测序-说
全长转录组 | 三代全长转录之circRNA（ONT ）-- CIRI-long
从源代码安装 $ git clone https://github.com/bioinfo-biols/CIRI-long.git CIRI-long $ cd CIRI-long # Create $ pip install CIRI-long 三、CIRI-long的使用方法软件主页：https://github.com/bioinfo-biols/CIRI-long 1. 基本用法 CIRI-long两个命令: CIRI-long call 和 CIRI-long collapse，因此整个流程分为两步。 usage: CIRI-long [-h] [-v] {call,collapse} ... /test_call/test.cand_circ.fa 运行CIRI-long collapse合并一个或多个样本结果。 $ CIRI-long collapse -i .
75020编辑于 2024-04-07
来自专栏生信技能树
刷了一下历年的中国生物信息学十大进展
via%3Dihub 长按阅读原文图：CGGA数据库开发结构示意图及功能实现 • 基于纳米孔测序的环形RNA识别和全长重建方法—CIRI-long 环形RNA是一类在真核生物中广泛存在的环状转录本中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队通过结合滚环反转录扩增和三代纳米孔测序技术，开发了高效测定环形RNA全长转录本的实验与计算方法CIRI-long，解决了目前研究方法中难以区分环形RNA与线性mRNA 工具链接： https://github.com/bioinfo-biols/CIRI-long 原文信息： Zhang J, Hou L, Zuo Z, Ji P, Zhang X, Xue Y, et
2.1K40编辑于 2023-09-04