首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
    • 综合排序
    • 最热优先
    • 最新优先
    时间不限
  • 来自专栏流式抗体推文

    Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒,快速分离CD8+T 细胞,直接用于下游实验

    内容概要Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是一款专为生命科学与医学研究打造的高效细胞分离工具。 产品介绍人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是 Elabscience 品牌推出的核心产品,专注于人初始 CD8+T 细胞的精准分离。 检测原理人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术,通过特异性结合非目标细胞的抗体与磁珠复合物,在磁场作用下将 CD8+T 细胞以外的杂细胞(如 CD56+、CD57+、CD45RO + 细胞等 目标细胞(人初始 CD8+T 细胞)因不与磁珠结合而留在上清液中,最终实现快速、高效的分离。 肿瘤免疫治疗:为 CAR-T 细胞疗法、肿瘤疫苗研发等提供高质量初始细胞原料。感染病学研究:分析初始 CD8+T 细胞在病毒、细菌感染中的免疫应答过程。

    15710编辑于 2025-11-14
  • 来自专栏作图丫

    【单细胞文献解读】溃疡性结肠炎CD8+T细胞的单细胞图谱

    小结:描绘了结肠CD8+T细胞的异质性,包括具有固有性和适应性特征的IL26+细胞和DP调节性CD8+T细胞。 将hIL-26Tg小鼠和对照B6小鼠的饮用水中加入2.5%的葡聚糖硫酸钠(DSS),并在第0天和第3天分别用抗IL-26单克隆抗体(MAb)或对照mAb处理hIL-26Tg小鼠(图6A,B)。 主成分分析(PCA)表示DSS与对照(图6E)的RNA-seq图谱之间存在明显差异。在WT和hIL-26Tg小鼠之间确定了295个显著(<5%FDR)的差异表达基因(图6F)。 接下来,比较了WT和TG小鼠在DSS条件下的RNA-seq数据,确定了473个差异表达基因(图6G)。在hIL-26小鼠中,观察到免疫反应相关转录本的表达明显减少(图6G-I)。 揭示了CD8+T细胞组成中广泛的异质性,包括扩增的效应子和效应子后分化的CD8+T细胞

    1.2K20编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏DrugOne

    Brief. Bioinform. | 基于肿瘤免疫微环境数学建模和强化学习的免疫检查点抑制剂(ICI)联合化疗决策优化

    总结来说,ICC疗程决策主要和在图6(a)中显示的三个维度变量相关,化疗敏感性癌细胞数量、耐药性癌细胞数量和CD8+T细胞与癌细胞数量的比值。 图6(a)中的填充颜色代表的是推荐的化疗剂量,而绿色平面代表的是ICI是否使用的决策边界。 为了可视化病人TIME在四个疗程的ICC干预下的接续动态演进,作者固定了化疗耐药性癌细胞数量为均值并展示了病人的TIME在化疗敏感性癌细胞数量和CD8+T细胞与癌细胞比值两个维度的演进(图6(b))。 DRL智能体推荐低剂量的化疗联合ICI,这样的ICC治疗策略促进CD8+T细胞增殖,其与癌细胞比值迅速增加,如图6(b)中向右下角指的玫红色箭头所示。 而剩下7个“冷”肿瘤病人ICC疗程失效,原因是化疗耐药性细胞的自然增长速率过快,而使得最终CD8+T 细胞比癌细胞比例下降,深粉红色箭头在第三或第四个周期向左指。 图 6.

    40610编辑于 2024-11-23
  • 来自专栏单细胞天地

    细胞测序鉴定银屑病的致病细胞亚群

    结果 细胞聚类 质控后的细胞: 银屑病:2919个CD8+T细胞, 正常皮肤:1656个CD8+T细胞。 分11个亚群。 银屑病皮肤中的炎性CD8+T 细胞亚群 接着研究银屑病皮肤中的CD8+T 细胞。看了已知的T细胞marker在各群的表达。如下图A。健康皮肤多的亚群,如cluster1,2,3,5,炎性子表达的少。 图D,银屑病cluster6和10,细胞毒性T细胞通路变道上调,而exhausted 肿瘤浸润的淋巴细胞里没有。 直觉上,cluster 0、4、6 和 10 之间共享的 TCR 序列和克隆型将与由cluster 4 代表的激活的皮肤归巢 CD8+T 细胞分化为任一细胞毒性效应物(由簇0代表)的模型一致。) 或 Tc17 细胞效应器(由cluster6表示),根据先前的观察,产生 IL-17 的 CD8+T 细胞可以产生体外产生IL-22 的亚群。 小结 本文内容不多,杂志期刊影响因子较高。

    1.6K10发布于 2021-09-15
  • 来自专栏作图丫

    【单细胞文献解读】早期复发性肝癌的肿瘤微环境

    数据介绍 Discovery cohort: 12例初治的肝细胞癌(HCC)患者的癌组织以及癌旁组织,6例早期复发HCC患者的癌组织以及癌旁组织,进行单细胞测序。 TregLAYN),CD8+ T细胞可细分为7个亚群(CD8 CCR6, CD8 NR4A1, CD8 GZMK, CD8 XCL1, CD8 CTLA4, and CD8 LAG3)(图A)。 03 HCC的CD8+T细胞发育轨迹 利用Monocle绘制HCC原发灶和复发灶的CD8+T细胞进化轨迹。 1)CD8 CCR6和CD8 NR4A1位于进化的早期,细胞会经历以CD8 GZMH和CD8 GZMK为特征的中间细胞毒性状态,最终达到以CD8 CLTA4和CD8 XCL1为特征的耗竭状态(图A)。 HCC的CD8+T细胞进化状态可总结为4个阶段: Phase 1:即进化的初始阶段,伴随着CCR6,CCR7,NCR3,KLRB1基因表达上调,而杀伤性功能的基因GZMA,GZMB,GZMH表达下调(图

    1.6K10编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏作图丫

    干湿结合让你的biomarker筛选更上一层!

    导语 GUIDE ╲ 鉴定CD8+T细胞相关因子和黑色素瘤的共表达网络,阐明黑色素瘤CD8+T细胞相关基因在微环境中之间的相互作用。 GSEA分析显示,T细胞受体信号通路、抗原加工和呈递、趋化因子信号通路和自然杀伤细胞介导的细胞毒性与高表达组相关(图6C)。作者发现这些生物学途径与免疫相关有关,都参与了肿瘤免疫。 在皮肤黑色素瘤、甲状腺癌、头颈部细胞癌、肝细胞癌和肺鳞腺癌中,CCL5、GBP5、GZMA、GZMH、IRF1、LAG3、NKG7、PRF1、PSMB10与CD8+T淋巴细胞浸润比例相关(图6D)。 图6 04 单细胞分析 为了确定这些基因来自哪个细胞,进行了单细胞分析。 CD8+T淋巴细胞水平高和PSMB10水平高的患者预后最好,而CD8+T淋巴细胞水平低和PSMB10水平低的患者预后最差(图10F)。

    60130编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏科研猫

    7分+纯生信思路,看到后我又跃跃欲试了

    前面一期我们讲了一篇非肿瘤相关的数据挖掘,研究了3种m6A调节因子介导的RNA甲基化修饰模式与牙周炎免疫微环境调控之间的关系,拯救非肿瘤:m6A+免疫微环境+5分+纯生信思路,你确定不来看看? 6.分子亚型的预后价值 COX回归分析和ROC分析评估TCGA队列中分子亚型的预后价值. 7.体细胞突变和拷贝数改变(CNA)数据获取 cBioportal 网站:下载体细胞突变和 CNA 数据. 8 WNT信号通路和TGF-β信号通路有关 图A:CD8+T细胞相关基因的功能富集分析结果; 图B:高CD8+T细胞浸润组和低CD8+T细胞浸润组之间的基因集变异分析(GSVA)。 图C-D:高CD8+T细胞浸润组和低CD8+T细胞浸润组之间免疫相关特征的差异。 其中高CD8+T细胞浸润组的关键免疫检查点基因的表达水平升高; 图E:高CD8+T细胞浸润组和低CD8+T细胞浸润组中免疫抑制细胞的丰度。

    89820编辑于 2022-04-09
  • 来自专栏优雅R

    多组学文献精读07 | TGF-β以耗竭T细胞削弱PD-L1抑制剂疗效(视频)

    Figure 1b-c 高CD8+T细胞Score具有更好的临床反应 高CD8+T细胞Score具有显著延长的OS ? Figure 2a-c a:IHC;棕色:CD8+T细胞;此图肿瘤内少CD8+T;而基质内富含CD8+T。 b:病人泌尿系统肿瘤的免疫表型可分为三种:耗竭+豁免+炎症 c:炎症型中具有良好应答者具有更高的CD8+T细胞Score f:具体展示下三种免疫表型的IHC,棕色:CD8+T细胞; ? Figure S5i EMT6小鼠模型中应用PD-L1和TGFβ联合抑制的反应效果很大程度上取决于CD8+T细胞是否耗竭 ? Figure S5i-n 重复验证上述结果:MC38小鼠模型 ? Figure 4c-d EMT6小鼠模型:FCM检测:应用PD-L1和TGFβ联合抑制-->CD8+T细胞及颗粒酶B数量显著增加 ?

    1.9K61发布于 2020-07-03
  • 来自专栏凋亡检测试剂盒推文

    Elabscience 小鼠CD8 T细胞阴性分选试剂盒,助力成果突破

    内容概要Elabscience 推出的 EasySort™小鼠 CD8+T 细胞阴性分选试剂盒(货号:MIM003N),凭借阴性分选技术实现小鼠脾脏和淋巴结中 CD8+T 细胞的快速高效分离,分选后细胞纯度高达 本试剂盒适用于分离小鼠脾脏和淋巴结的 CD8+T 细胞,分离出的细胞可直接进行下游应用。 检测原理本试剂盒采用阴性分选技术实现 CD8+T 细胞的高效分离。 )将这些非目标细胞吸附去除,从而留下未被标记的纯净 CD8+T 细胞。 抗病毒免疫研究:针对病毒感染模型,分离 CD8+T 细胞以分析其在病毒清除、免疫记忆形成中的作用。细胞治疗研发:为 CD8+T 细胞过继性免疫治疗研究提供高纯度起始细胞,助力细胞改造与治疗效能评估。

    29910编辑于 2025-09-22
  • 来自专栏单细胞天地

    揭示胶质母细胞瘤中T细胞功能障碍的免疫调节机制:髓系细胞与IL-10的关键作用

    (b) 利用加权相邻邻居(WNN)数据整合和参考UMAP的降维处理,进行细胞类型注释。 (c) 对CD8+T 和CD4+T细胞进行降维聚类。 (d) CD8+T细胞的top30基因,展示重要的经典markers (e) CD4+T细胞的top30基因,展示重要的经典markers。 (b) CD8+T细胞中PRDM1基因的表达量。 (c) PRDM1扰动假设的插图。 (d) CD8+T细胞的RNA速率(RNA-速度)(左)和扰动轨迹(右)的矢量图。 (e) CD8+T细胞:推断的扰动(PRDM1)的矢量场投影,颜色表示发展和扰动轨迹的内积。 (f) 与(e)类似的CD4+T细胞的展示。 图6 人脑切片中T细胞的功能建模 (a, b) 使用新皮质切片培养的工作流程示意图。 (c) 密度图用于量化HMOX+和HMOX- IBA1+髓样细胞与肿瘤(上图)和T细胞(下图)之间的空间距离。

    74910编辑于 2024-02-23
  • 来自专栏生信菜鸟团

    竟然还能发:scRNA+bulk RNAseq筛选CD8+T细胞相关特征预测胃癌预后

    方法:①从TISCH2数据库中检索到的scRNA-seq图谱来筛选出CD8+T细胞特征基因;②利用Cox和LASSO回归构建基于这些CD8+T细胞特征基因的TCGA队列预后模型;③进行生存分析以研究特征对 在GSE134520注释到9个细胞亚群。将两个数据集的CD8T细胞取交集后得到703个候选CD8+T细胞特征基因进行后续分析。 KEGG富集分析发现,CD8+T细胞特征基因主要富集于神经退行性变(hsa05022)和帕金森病(hsa05012)等通路。 3.2 筛选CD8+T细胞相关风险特征基因 从上述703个交叉基因中通过单因素Cox回归分析鉴定出35个与GC患者临床结局明显相关的CD8+T细胞标志基因。 CD8+T细胞特征在预测GC临床结局方面具有显著性能。 3.3 风险特征与临床特征之间的关系 高危评分与晚期肿瘤分期呈显著正相关。

    54510编辑于 2024-03-06
  • 来自专栏科研猫

    文献解读 | 8分+,单细胞基因组学+肿瘤微环境+预后

    细胞类型相对丰度的计算表明,在 274 名 nccRCC 患者队列中,耗竭的CD8+T细胞、TAMs和sarRCC衍生细胞的比例较大,与nccRCC的预后不佳相关。 图 2:nccRCC 发生异常的生物学过程 3.耗竭的CD8+T在nccRCC的TME中富集 图A:CD8+T细胞被分为三个亚组; 图B:气泡图中显示三个亚组细胞最重要的10个标志物; 图C:检测到的免疫检查点涉及 图 5:nccRCC TME 中成纤维细胞和内皮细胞的特征 6.在274例NCCRCC患者中,TME中的sarRCC细胞或渗透性免疫细胞与不良后果相关 图A:CIBERSORTx计算每个亚组的相对丰都, ; 这些数据指出了衰竭的CD8+T细胞、TAMs和肉瘤性RCC在nccRCC进展中的关键意义。 图 6:scRNA-seq 分析识别的 TME 细胞簇在 TCGA nccRCC 队列患者中的临床价值 小结 该研究以来自原发性肿瘤和转移部位的样本作为探索 nccRCC 的 TME 和异质性的基础。

    85030编辑于 2022-04-09
  • 来自专栏单细胞天地

    细胞meta分析揭示肿瘤反应性CXCL13+T细胞对免疫检查点阻断的反应

    Fig4 外周血T细胞动态变化与clone revival Fig5 作者通过分析多部位取样单细胞测序发现基底细胞癌中治疗后增加的肿瘤反应性CD8+T细胞主要是新的clone,而对于非小细胞肺癌和鳞状细胞癌则是旧 +T细胞来自于外周血,作者利用scTCR-seq数据,发现新,旧clone的肿瘤反应性CD8+T细胞都有部分来源于外周血,且外周血中的肿瘤反应性CD8+ T细胞比例与肿瘤内的正相关。 细胞中分出CXCL13+ CD4+,其高表达耗竭表型相关基因如PDCD1(Fig6a,b)。 进一步分析发现其在疗效好的患者的治疗后样本中丰度较高,体现了其在免疫治疗中的作用(Fig6c)。且还发现其治疗前丰度能很好预测治疗效果(Fig6d)。 Fig6 当与CD8+ CXCL13+治疗前丰度结合后对治疗疗效预测效果更好。 Fig6 最后一张图,展现了经典的CD8分化轨迹以及肿瘤反应性CD8+T细胞的分化轨迹。

    1.1K20编辑于 2023-02-10
  • 来自专栏作图丫

    Nature Communication| DNA甲基化评估细胞浸润

    一些具有抗肿瘤作用的免疫细胞均在免疫Hot组浸润(如CD8+T细胞,CD4+T细胞,CD19+B细胞以及NK细胞)【图a】。 各个细胞的浸润组分与溶细胞活性(Cytolytic activity)相关,尤其是CD8+T细胞与溶细胞活性最相关,说明这些细胞的浸润可以反映抗肿瘤的免疫作用【图b】。 免疫Hot组有更高的溶细胞活性【图c】,且CD8+T细胞与Treg的比值也增加【图d】。 CASP8,PIK3CA,CREBBP,EP300, HLA-A突变主要出现在免疫Hot组,而TP53,KDM6A的突变主要富集在免疫Cold组。 同样发现在免疫Hot组中富集了CD8+T细胞,Treg细胞以及B淋巴细胞,而在免疫Cold组中富集了CD4细胞、NK细胞、嗜酸粒细胞以及成纤维细胞【图b】。

    1.1K21编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏百味科研芝士

    多数据库联合分析肾透明细胞癌免疫浸润轻松发3分+

    图1.比较ccRCC和正常匹配组织中22种TIICs 与正常匹配肿瘤组织相比,ccRCC中CD8+T细胞,滤泡辅助T细胞(Tfh),调节T细胞(Treg),巨噬细胞M0,M1和中性粒细胞更多;而初始B细胞 用Pearson相关系数分析TIICs间的相关性,其中CD8+T细胞与Tfh呈强正相关,与静息记忆性CD4+T细胞呈强负相关,与巨噬细胞M2中等负相关。(图2) ? 图4.预后相关TIICs的的生存曲线 研究不同免疫细胞和ccRCC病理分级的关系:静息DC,静息肥大细胞,单核细胞和静息CD4+记忆性T细胞随肾癌Fuhrman分级增加而减少;而CD8+T细胞,Tfh, 以往研究表明,当肿瘤组织中存在功能成熟的DC时,CD8+T细胞与良好预后相关。本文中,ccRCC中CD8+T细胞浸润与不良预后相关,静息和激活DC与良好预后相关。 研究表明Treg和M2有促肿瘤作用,而本文中ccRCC CD8+T细胞,Treg,Tfh随着Fuhrman分级增加而增加,且CD8+T与M2间存在负相关,说明M2,Treg,Tfh可能在T细胞耗竭中起“

    1.4K10发布于 2020-06-04
  • 来自专栏纳米药物前沿

    Nature:IL-18bp是IL-18免疫治疗的分泌性免疫检查点和屏障

    与野生型IL-18不同,DR-18通过促进多功能效应CD8+T细胞的发展,降低表达耗竭TOX转录调节因子的耗竭CD8+T细胞的患病率,以及扩大干细胞样TCF1+前体CD8+T细胞的量,在小鼠肿瘤模型中发挥了强大的抗肿瘤作用 DR-18扩增干细胞样的TCF1+前体CD8+T细胞,并使其向多功能Teff细胞分化,远离TOX+Tex细胞。 这一机制似乎与阻断PD-1的作用不同,PD-1增强了Tex细胞的功能,但不影响干细胞CD8+T细胞的数量。 例如,低剂量的IL-2可用于治疗性地扩大免疫抑制的Treg细胞,但高剂量可刺激CD8+T细胞用于肿瘤免疫治疗。 DR-18作用于CD8+Teff细胞、干细胞样TCF1+CD8+T细胞和NK细胞的能力为DR-18和其他IL-18受体激动剂的临床开发提供了强有力的理论基础。

    1.3K30发布于 2021-02-04
  • 来自专栏科研菌

    这篇3+分文章带你学会多数据库分析免疫浸润

    图1.比较ccRCC和正常匹配组织中22种TIICs 与正常匹配肿瘤组织相比,ccRCC中CD8+T细胞,滤泡辅助T细胞(Tfh),调节T细胞(Treg),巨噬细胞M0,M1和中性粒细胞更多;而初始B细胞 用Pearson相关系数分析TIICs间的相关性,其中CD8+T细胞与Tfh呈强正相关,与静息记忆性CD4+T细胞呈强负相关,与巨噬细胞M2中等负相关。(图2) ? 图4.预后相关TIICs的的生存曲线 研究不同免疫细胞和ccRCC病理分级的关系:静息DC,静息肥大细胞,单核细胞和静息CD4+记忆性T细胞随肾癌Fuhrman分级增加而减少;而CD8+T细胞,Tfh, 以往研究表明,当肿瘤组织中存在功能成熟的DC时,CD8+T细胞与良好预后相关。本文中,ccRCC中CD8+T细胞浸润与不良预后相关,静息和激活DC与良好预后相关。 研究表明Treg和M2有促肿瘤作用,而本文中ccRCC CD8+T细胞,Treg,Tfh随着Fuhrman分级增加而增加,且CD8+T与M2间存在负相关,说明M2,Treg,Tfh可能在T细胞耗竭中起“

    1.3K21发布于 2020-06-28
  • 来自专栏纳米药物前沿

    Nat Nanotechnol:选择性抑制肿瘤相关巨噬细胞溶酶体内的半胱氨酸蛋白酶以提高其交叉呈递抗原的能力

    通过抗原交叉呈递激活CD8+T细胞在消除肿瘤方面非常有效。尽管该功能传统上归因于树突状细胞,但肿瘤相关巨噬细胞(TAM)也可以交叉呈递抗原。同时,TAM也是最丰富的肿瘤浸润白细胞。 然而,由于TAM调节其交叉呈递抗原能力的机制尚不完全清楚,导致TAM尚未被用于激活CD8+T细胞。 近日,Nature Nanotechnology报道了TAM在其溶酶体中含有过度活跃的半胱氨酸蛋白酶,阻碍了抗原交叉呈递,从而阻止了CD8+T细胞活化。 E64-DNA能够特异性抑制TAM溶酶体内的半胱氨酸蛋白酶群体,通过提高其交叉呈递抗原的能力激活CD8+T细胞来抑制肿瘤生长。 通过抑制半胱氨酸蛋白酶的活性,E64-DNA改善了TAM中的抗原交叉提呈,从而激活CD8+T细胞以对抗肿瘤的发生。

    52720编辑于 2022-08-15
  • 来自专栏生信技能树

    轻松一挖就节约10万经费

    label=T,group.by = "sample") ggsave(filename="3-cluster/harmony_DimPlot.pdf") ###设置分辨率 #分辨率分类 #文中是分了6群 群,就是复现的0群.也就是功能失调的CD8+T细胞 原文 image.png image.png image.png image.png image.png 复现 image.png image.png 都是DLBCL008这个样本的功能失调的CD8+T细胞 占的比例最高 原文 image.png 复现 image.png ⑤、PD-1、A2aR 的表达情况 也是和原文趋势一致。 结论就是: DLBCL002在功能失调型的CD8+T细胞不表达PD-1和A2aR, DLBCL007和DLBCL111仅表达PD-1, DLBCL008同时表达PD-1和A2aR,其含有大量的功能失调的 CD8+T细胞 原文 image.png 复现 image.png 写在文末 本文关心的是功能失调的CD8+T细胞,其实T细胞耗竭也是有多个阶段,比如文章:《Developmental Relationships

    64810编辑于 2022-06-08
  • 来自专栏用户7627119的专栏

    Nature Medicine|乳腺癌抗PD1治疗过程中肿瘤细胞变化图谱

    图1 乳腺癌PD1治疗前后细胞图谱变化 ▎T细胞沿着CD8+TEX细胞克隆增殖 对T细胞进行发育轨迹分析,发现存在3个不同的分化方向,TEX2细胞、驻留记忆CD8+T细胞(TRM)和激活效应/记忆T细胞 然而,预处理后的T细胞中PD1的表达和增殖T细胞的数量在TNBC中更高。在TNBC中,Es也表现出CD8+T细胞效应功能基因表达增加、CD4+TH1活性和免疫检查点基因预处理增加。 图4 在BC和BC亚型中,增殖T细胞和非增殖T细胞特征 ▎树突状细胞与T细胞扩增关系 树突状细胞(dc)在调节CD8+T细胞免疫和肿瘤抗原耐受之间的平衡中起着核心作用。 对来自仅接受抗PD1(n=29)治疗的患者的2410个DC进行了亚聚,发现6种表型,与NEs相比,Es致DC中PD-L1 (CD274)和PD-L2 (PDCD1LG2)升高。 图6 交互免疫环境与T细胞扩增正相关 结 论 文章通过对比治疗前后出现T细胞克隆增殖与未出现克隆增殖病人的免疫微环境改变,揭示了多种免疫细胞在免疫治疗中的分化规律, 以及可能的作用机制。

    1K20编辑于 2022-09-21
领券