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  • 来自专栏流式抗体推文

    Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒,快速分离CD8+T 细胞,直接用于下游实验

    内容概要Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是一款专为生命科学与医学研究打造的高效细胞分离工具。 产品介绍人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是 Elabscience 品牌推出的核心产品,专注于人初始 CD8+T 细胞的精准分离。 检测原理人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术,通过特异性结合非目标细胞的抗体与磁珠复合物,在磁场作用下将 CD8+T 细胞以外的杂细胞(如 CD56+、CD57+、CD45RO + 细胞等 目标细胞(人初始 CD8+T 细胞)因不与磁珠结合而留在上清液中,最终实现快速、高效的分离。 肿瘤免疫治疗:为 CAR-T 细胞疗法、肿瘤疫苗研发等提供高质量初始细胞原料。感染病学研究:分析初始 CD8+T 细胞在病毒、细菌感染中的免疫应答过程。

    22610编辑于 2025-11-14
  • 来自专栏作图丫

    【单细胞文献解读】溃疡性结肠炎CD8+T细胞的单细胞图谱

    小结:描绘了结肠CD8+T细胞的异质性,包括具有固有性和适应性特征的IL26+细胞和DP调节性CD8+T细胞。 (图4A,B),制备了另外7个UC和5个健康样本。 以CyTOF数据为参考,接下来进行了多模态单细胞数据整合,以推断两种表达模式之间最可能的对应细胞(图5A,B)。许多关键标记在蛋白质和mRNA水平上共表达(图5C,D)。 相反,来自UC患者的重新激活的细胞也富集了GZMK+效应标志物(图5E-G)。 揭示了CD8+T细胞组成中广泛的异质性,包括扩增的效应子和效应子后分化的CD8+T细胞

    1.3K20编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏凋亡检测试剂盒推文

    Elabscience 小鼠CD8 T细胞阴性分选试剂盒,助力成果突破

    内容概要Elabscience 推出的 EasySort™小鼠 CD8+T 细胞阴性分选试剂盒(货号:MIM003N),凭借阴性分选技术实现小鼠脾脏和淋巴结中 CD8+T 细胞的快速高效分离,分选后细胞纯度高达 本试剂盒适用于分离小鼠脾脏和淋巴结的 CD8+T 细胞,分离出的细胞可直接进行下游应用。 其核心原理是利用特异性抗体与样本中除 CD8+T 细胞外的其他细胞(如 CD4+T 细胞、B 细胞、单核细胞等)表面的标志分子结合,再通过磁珠(需搭配专用磁分离设备,如 EasySort™-5 Magnet )将这些非目标细胞吸附去除,从而留下未被标记的纯净 CD8+T 细胞。 抗病毒免疫研究:针对病毒感染模型,分离 CD8+T 细胞以分析其在病毒清除、免疫记忆形成中的作用。细胞治疗研发:为 CD8+T 细胞过继性免疫治疗研究提供高纯度起始细胞,助力细胞改造与治疗效能评估。

    34510编辑于 2025-09-22
  • 来自专栏作图丫

    【单细胞文献解读】早期复发性肝癌的肿瘤微环境

    导语 GUIDE ╲ 肝癌是世界上致死性排名第四的癌症,肝细胞癌(HCC)是肝癌中最常见的亚型。HCC患者在手术切除后5年复发率可达50%-70%,其中有70%的患者在2年内复发,即早期复发。 02 早期复发性HCC呈现独特的免疫微环境 对髓系细胞进一步细分亚群,可将巨噬细胞细分为5个簇,单核细胞细分为2个簇,树突状细胞细分为3个簇,以及一个周期性细胞簇(图A-C)。 03 HCC的CD8+T细胞发育轨迹 利用Monocle绘制HCC原发灶和复发灶的CD8+T细胞进化轨迹。 复发HCC中CD161+CD8+ T细胞的富集与较高的二次复发率显著相关(图5H)。 比较HCC原发灶vs癌旁的clonal CD8+T细胞比例,发现HCC原发灶中有更多的clonal CD8+T

    1.7K10编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏单细胞天地

    细胞测序鉴定银屑病的致病细胞亚群

    将银屑病Tc17细胞亚群与黑色素瘤浸润的 CD8+T 细胞进行比较,发现这些细胞细胞因子、溶细胞和代谢转录活性的上调,这与衰竭程序不同。 结果 细胞聚类 质控后的细胞: 银屑病:2919个CD8+T细胞, 正常皮肤:1656个CD8+T细胞。 分11个亚群。 银屑病皮肤中的炎性CD8+T 细胞亚群 接着研究银屑病皮肤中的CD8+T 细胞。看了已知的T细胞marker在各群的表达。如下图A。健康皮肤多的亚群,如cluster1,2,3,5,炎性子表达的少。 比较银屑病人Tc17 亚群和黑色素病人浸润的CD8+T细胞 之前的文献中有对黑色素瘤浸润的T细胞失能打分。 从每个 CD8+T 细胞群中,细胞群之间共享 43 到263个TCR(即,可以在同一受试者的不同细胞群中发现的TCR序列)。

    1.6K10发布于 2021-09-15
  • 来自专栏作图丫

    干湿结合让你的biomarker筛选更上一层!

    导语 GUIDE ╲ 鉴定CD8+T细胞相关因子和黑色素瘤的共表达网络,阐明黑色素瘤CD8+T细胞相关基因在微环境中之间的相互作用。 发现在TCGA-SKCM队列中,黄色模块与CD8+T细胞的相关性最强(Cor=0.69;P=1e-26)。黄色模块与CD8+T细胞之间的相关性图如图2C所示。 在皮肤黑色素瘤、甲状腺癌、头颈部细胞癌、肝细胞癌和肺鳞腺癌中,CCL5、GBP5、GZMA、GZMH、IRF1、LAG3、NKG7、PRF1、PSMB10与CD8+T淋巴细胞浸润比例相关(图6D)。 用SingleR对这些子集进行注释,比较结果发现PSMB10、GZMA、GZMH、PRF1、CCL5CD8+T细胞亚群中的表达含量相对较高,证实了之前在TCGA-SKCM中的发现(图7)。 CD8+T淋巴细胞水平高和PSMB10水平高的患者预后最好,而CD8+T淋巴细胞水平低和PSMB10水平低的患者预后最差(图10F)。

    65330编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏DrugOne

    Brief. Bioinform. | 基于肿瘤免疫微环境数学建模和强化学习的免疫检查点抑制剂(ICI)联合化疗决策优化

    图2展示了模型描述的癌细胞、免疫细胞和药物之间的交互机制: 化疗耐药性癌细胞和敏感性癌细胞之间的竞争; CD8+T 细胞在抗原呈现时增殖,抗原来自癌细胞表面、由CD8+T细胞和化疗药物引起的癌细胞产生抗原性细胞凋亡 ; 癌细胞、调节性T细胞(Tregs)对CD8+T细胞的抑制; 免疫检查点蛋白(PD-L1)减弱CD8+T 细胞杀伤癌细胞,而免疫检查点抑制剂恢复CD8+T 细胞对癌细胞的杀伤能力; 化疗对免疫系统的协同作用和破坏作用 :杀伤癌细胞,减少癌细胞CD8+T细胞的抑制并释放抗原;同时也杀伤CD8+T细胞。 总结来说,作者发现“热”肿瘤中CD8+T细胞增长很快;“冷”肿瘤中的CD8+T细胞刚开始增长快,但后续和癌细胞持平;而“极端冷”肿瘤中CD8+T细胞增长比癌细胞慢。 图5. 固定的ICC疗程和DRL智能体推荐ICC疗程表现对比 图5中的结果显示固定的ICC疗程并不能应对减少肿瘤数量和增强CD8+T细胞数量两者之间的权衡。

    46310编辑于 2024-11-23
  • 来自专栏科研猫

    7分+纯生信思路,看到后我又跃跃欲试了

    TME中 CD8+T 细胞的异质表型和临床意义尚未完全阐明。 在这项研究中,作者基于多组学数据对免疫基因组进行分析,探讨了CD8+T细胞相关分子亚型的临床价值和肿瘤异质性。 颜色强度与CD8+T细胞的丰度呈正相关。 WNT信号通路和TGF-β信号通路有关 图A:CD8+T细胞相关基因的功能富集分析结果; 图B:高CD8+T细胞浸润组和低CD8+T细胞浸润组之间的基因集变异分析(GSVA)。 图C-D:高CD8+T细胞浸润组和低CD8+T细胞浸润组之间免疫相关特征的差异。 其中高CD8+T细胞浸润组的关键免疫检查点基因的表达水平升高; 图E:高CD8+T细胞浸润组和低CD8+T细胞浸润组中免疫抑制细胞的丰度。

    95520编辑于 2022-04-09
  • 来自专栏生信菜鸟团

    竟然还能发:scRNA+bulk RNAseq筛选CD8+T细胞相关特征预测胃癌预后

    方法:①从TISCH2数据库中检索到的scRNA-seq图谱来筛选出CD8+T细胞特征基因;②利用Cox和LASSO回归构建基于这些CD8+T细胞特征基因的TCGA队列预后模型;③进行生存分析以研究特征对 在GSE134520注释到9个细胞亚群。将两个数据集的CD8T细胞取交集后得到703个候选CD8+T细胞特征基因进行后续分析。 KEGG富集分析发现,CD8+T细胞特征基因主要富集于神经退行性变(hsa05022)和帕金森病(hsa05012)等通路。 3.2 筛选CD8+T细胞相关风险特征基因 从上述703个交叉基因中通过单因素Cox回归分析鉴定出35个与GC患者临床结局明显相关的CD8+T细胞标志基因。 CD8+T细胞特征在预测GC临床结局方面具有显著性能。 3.3 风险特征与临床特征之间的关系 高危评分与晚期肿瘤分期呈显著正相关。

    61010编辑于 2024-03-06
  • 来自专栏百味科研芝士

    多数据库联合分析肾透明细胞癌免疫浸润轻松发3分+

    用Pearson相关系数分析TIICs间的相关性,其中CD8+T细胞与Tfh呈强正相关,与静息记忆性CD4+T细胞呈强负相关,与巨噬细胞M2中等负相关。(图2) ? (图5) ? 图5.免疫细胞与ccRCC Fuhrman分级的关系 小结 本篇文章中,作者利用CIBERSORT网页工具从ccRCC肿瘤转录组推测22种TIICs亚群的浸润比例,并结合预后结果来推测其临床意义。 以往研究表明,当肿瘤组织中存在功能成熟的DC时,CD8+T细胞与良好预后相关。本文中,ccRCC中CD8+T细胞浸润与不良预后相关,静息和激活DC与良好预后相关。 研究表明Treg和M2有促肿瘤作用,而本文中ccRCC CD8+T细胞,Treg,Tfh随着Fuhrman分级增加而增加,且CD8+T与M2间存在负相关,说明M2,Treg,Tfh可能在T细胞耗竭中起“

    1.5K10发布于 2020-06-04
  • 来自专栏单细胞天地

    揭示胶质母细胞瘤中T细胞功能障碍的免疫调节机制:髓系细胞与IL-10的关键作用

    (d) CD8+T细胞的top30基因,展示重要的经典markers (e) CD4+T细胞的top30基因,展示重要的经典markers。 (b) CD8+T细胞中PRDM1基因的表达量。 (c) PRDM1扰动假设的插图。 (d) CD8+T细胞的RNA速率(RNA-速度)(左)和扰动轨迹(右)的矢量图。 (e) CD8+T细胞:推断的扰动(PRDM1)的矢量场投影,颜色表示发展和扰动轨迹的内积。 (f) 与(e)类似的CD4+T细胞的展示。 图5 髓样细胞和淋巴细胞互作分析 (a) 使用两种方法探索细胞-细胞相作:(1)基于配体-受体相互作用预测; (2)在ST数据集中进行验证。 (f) 高度连接的髓样细胞中top5富集的代谢通路。 (g) UMAP图展示基因表达量。 (h) 混合的CD3+/IBA1+阳性双峰的双峰分析。突出的双峰群体展示了CD3+/IBA1+阳性双峰。

    82010编辑于 2024-02-23
  • 来自专栏科研菌

    这篇3+分文章带你学会多数据库分析免疫浸润

    用Pearson相关系数分析TIICs间的相关性,其中CD8+T细胞与Tfh呈强正相关,与静息记忆性CD4+T细胞呈强负相关,与巨噬细胞M2中等负相关。(图2) ? (图5) ? 图5.免疫细胞与ccRCC Fuhrman分级的关系 小结 本篇文章中,作者利用CIBERSORT网页工具从ccRCC肿瘤转录组推测22种TIICs亚群的浸润比例,并结合预后结果来推测其临床意义 以往研究表明,当肿瘤组织中存在功能成熟的DC时,CD8+T细胞与良好预后相关。本文中,ccRCC中CD8+T细胞浸润与不良预后相关,静息和激活DC与良好预后相关。 研究表明Treg和M2有促肿瘤作用,而本文中ccRCC CD8+T细胞,Treg,Tfh随着Fuhrman分级增加而增加,且CD8+T与M2间存在负相关,说明M2,Treg,Tfh可能在T细胞耗竭中起“

    1.3K21发布于 2020-06-28
  • 来自专栏科研猫

    文献解读 | 8分+,单细胞基因组学+肿瘤微环境+预后

    细胞类型相对丰度的计算表明,在 274 名 nccRCC 患者队列中,耗竭的CD8+T细胞、TAMs和sarRCC衍生细胞的比例较大,与nccRCC的预后不佳相关。 4.研究结果 1.nccRCC单细胞测序的细胞聚类 图A-C,E:来自 5 名 nccRCC 患者的 14 个组织。 图F:气泡图显示每个细胞类型的top5主要基因标记物。 图1.来自 nccRCC 和正常组织的单细胞景观 2.与正常来源细胞相比,nccRCC 癌细胞在代谢和基因表达方面存在多样性和异常性。 图 2:nccRCC 发生异常的生物学过程 3.耗竭的CD8+T在nccRCC的TME中富集 图A:CD8+T细胞被分为三个亚组; 图B:气泡图中显示三个亚组细胞最重要的10个标志物; 图C:检测到的免疫检查点涉及 ; 这些数据指出了衰竭的CD8+T细胞、TAMs和肉瘤性RCC在nccRCC进展中的关键意义。

    90030编辑于 2022-04-09
  • 来自专栏优雅R

    多组学文献精读07 | TGF-β以耗竭T细胞削弱PD-L1抑制剂疗效(视频)

    基本概念: IC:SP142对免疫细胞(IC)染色的评分-->检测PD-L1表达;分为: IC0 (<1%), IC1 (≥1% and <5%), IC2+ (≥5%). Figure 1b-c 高CD8+T细胞Score具有更好的临床反应 高CD8+T细胞Score具有显著延长的OS ? Figure 2a-c a:IHC;棕色:CD8+T细胞;此图肿瘤内少CD8+T;而基质内富含CD8+T。 b:病人泌尿系统肿瘤的免疫表型可分为三种:耗竭+豁免+炎症 c:炎症型中具有良好应答者具有更高的CD8+T细胞Score f:具体展示下三种免疫表型的IHC,棕色:CD8+T细胞; ? Figure S5i EMT6小鼠模型中应用PD-L1和TGFβ联合抑制的反应效果很大程度上取决于CD8+T细胞是否耗竭 ? Figure S5i-n 重复验证上述结果:MC38小鼠模型 ?

    2K61发布于 2020-07-03
  • 来自专栏生信技能树

    SARS-CoV-2感染的雪貂支气管肺泡灌洗液单细胞转录组数据挖掘(2) 细分NK和CD8的T单细胞亚群

    (全部的代码复制粘贴即可运行,欢迎尝试以及批评指正) 现在是雪貂支气管肺泡灌洗液单细胞转录组显示SARS-CoV-2感染期间巨噬细胞的顺序变化专辑第2讲:主要是对 NK cells and CD8+T = "seurat_clusters", label=T) dev.off() 1643460147179 #未感染对照组(n=3)、2 dpi (n=3)和5 dpi (n=4)各细胞类型在NK细胞群中的比例 +T细胞的表达水平 pdf("Fig2f.vln_plot_activation_CD8.pdf",3.8,5) VlnPlot(cov.CD8, features = "OAS1", pt.size +T细胞在阴性对照,2 dpi和5 dpi处的分布 pdf("Fig2g.condition_umap_CD8.pdf",9,15) par(mfrow=c(1,3), mar = c(1,1,3,1) ="dpi 5")[gr]) } dev.off() 1643464265434 #CD8+T细胞中OAS1和ISG15的表达 pdf("Fig2h.featureplot.pdf",12,8*0.8

    61620编辑于 2022-03-03
  • 来自专栏用户7627119的专栏

    Cell Reports | 靶向单细胞多组学方法,可在低深度下同时检测蛋白表达和低丰度转录组

    来自三个健康供体的PBMCs(外周血单核细胞),经过样本预处理后,获得单细胞样本(CD45+live PBMCs 和 EBV-tetramer+ CD8+T细胞)。 对T细胞亚群的转录组学和蛋白质表达进行联合分析,才能真实的研究T细胞生物机制。(上图C) 结合蛋白表达和mRNA表达分析,可以观察到5个经典的naïve和memory T细胞亚群。 (图D\E\F) 该方法可以从所有CD8+T细胞中鉴别出EBV-specific CD8+T细胞亚群,该亚群的两个特征性差异化表达基因为:Granulysin基因表达下调,YBX3基因表达上调。 CD8蛋白+T细胞聚类图显示5个亚群,结合CD45RO和CD45RA表达,可判别出naïve、effector、memory T细胞(下图C)。 热图显示这5细胞亚群内关键效应转录本的表达(下图D)。 ? 5. 单细胞Target mRNA +AbSeq在其他免疫细胞类型中的应用 ?

    1.1K40发布于 2020-08-05
  • 来自专栏纳米药物前沿

    Nature:IL-18bp是IL-18免疫治疗的分泌性免疫检查点和屏障

    与野生型IL-18不同,DR-18通过促进多功能效应CD8+T细胞的发展,降低表达耗竭TOX转录调节因子的耗竭CD8+T细胞的患病率,以及扩大干细胞样TCF1+前体CD8+T细胞的量,在小鼠肿瘤模型中发挥了强大的抗肿瘤作用 DR-18扩增干细胞样的TCF1+前体CD8+T细胞,并使其向多功能Teff细胞分化,远离TOX+Tex细胞。 这一机制似乎与阻断PD-1的作用不同,PD-1增强了Tex细胞的功能,但不影响干细胞CD8+T细胞的数量。 例如,低剂量的IL-2可用于治疗性地扩大免疫抑制的Treg细胞,但高剂量可刺激CD8+T细胞用于肿瘤免疫治疗。 DR-18作用于CD8+Teff细胞、干细胞样TCF1+CD8+T细胞和NK细胞的能力为DR-18和其他IL-18受体激动剂的临床开发提供了强有力的理论基础。

    1.4K30发布于 2021-02-04
  • 来自专栏生信技能树

    轻松一挖就节约10万经费

    原文 image.png 复现 image.png ③、确定功能失调的CD8+细胞亚群 利用CD8A、GZMB、CTLA4、TIGIT、LAG3 这5个基因的表达情况来确定 可以确定的是:原文的1 群,就是复现的0群.也就是功能失调的CD8+T细胞 原文 image.png image.png image.png image.png image.png 复现 image.png image.png 都是DLBCL008这个样本的功能失调的CD8+T细胞 占的比例最高 原文 image.png 复现 image.png ⑤、PD-1、A2aR 的表达情况 也是和原文趋势一致。 结论就是: DLBCL002在功能失调型的CD8+T细胞不表达PD-1和A2aR, DLBCL007和DLBCL111仅表达PD-1, DLBCL008同时表达PD-1和A2aR,其含有大量的功能失调的 CD8+T细胞 原文 image.png 复现 image.png 写在文末 本文关心的是功能失调的CD8+T细胞,其实T细胞耗竭也是有多个阶段,比如文章:《Developmental Relationships

    70410编辑于 2022-06-08
  • 来自专栏单细胞天地

    细胞meta分析揭示肿瘤反应性CXCL13+T细胞对免疫检查点阻断的反应

    作者整合了5个癌种7个队列的免疫治疗单细胞数据,探究治疗前后CXCL13+ 肿瘤反应性CD8 T细胞丰度与免疫治疗疗效的关系。 Fig4 外周血T细胞动态变化与clone revival Fig5 作者通过分析多部位取样单细胞测序发现基底细胞癌中治疗后增加的肿瘤反应性CD8+T细胞主要是新的clone,而对于非小细胞肺癌和鳞状细胞癌则是旧 +T细胞来自于外周血,作者利用scTCR-seq数据,发现新,旧clone的肿瘤反应性CD8+T细胞都有部分来源于外周血,且外周血中的肿瘤反应性CD8+ T细胞比例与肿瘤内的正相关。 (Fig5d-e) 外周血肿瘤反应性CD8+ T细胞随时间的动态变化是什么样的呢?作者发现在疗效好的患者中外周血肿瘤反应性CD8+ T细胞在治疗后随时间不断增加。 Fig6 最后一张图,展现了经典的CD8分化轨迹以及肿瘤反应性CD8+T细胞的分化轨迹。经典的分化轨迹来自于2021年张泽民刚刚在Science上发表的泛癌T细胞分群文章。

    1.2K20编辑于 2023-02-10
  • IL-10信号在肿瘤免疫治疗中的双重角色及精准研究策略

    然而,近年研究表明,在特定时空背景下,IL-10也能直接作用于CD8+T细胞,增强其细胞毒性功能、维持记忆表型,并促进抗肿瘤免疫应答。 研究发现,肿瘤浸润免疫细胞(如CD8+T细胞、巨噬细胞)的IL-10R表达呈现“滞后性非线性”特征。 3.临床相关性验证:通过对涵盖27种人类肿瘤类型的组织芯片进行分析,研究证实肿瘤浸润的CD8+T细胞和巨噬细胞普遍存在IL-10R高表达状态,提示该机制可能具有广泛的临床意义。 2.IL-10RA表达水平与细胞分型分析:•利用优化的细胞表面染色与流式细胞术方案,试剂盒可精确检测并量化特定免疫细胞亚群(如CD8+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞)上IL-10RA的表达水平,识别IL- 例如,在验证IL-10R高表达的基础上,进一步评估IL-10对CD8+T细胞增殖(通过CFSE或Ki67检测)、细胞因子(如IFN-γ)分泌或细胞毒功能的影响。

    23810编辑于 2026-01-19
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