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  • 来自专栏流式抗体推文

    Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒,快速分离CD8+T 细胞,直接用于下游实验

    内容概要Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是一款专为生命科学与医学研究打造的高效细胞分离工具。 产品介绍人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是 Elabscience 品牌推出的核心产品,专注于人初始 CD8+T 细胞的精准分离。 检测原理人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术,通过特异性结合非目标细胞的抗体与磁珠复合物,在磁场作用下将 CD8+T 细胞以外的杂细胞(如 CD56+、CD57+、CD45RO + 细胞等 目标细胞(人初始 CD8+T 细胞)因不与磁珠结合而留在上清液中,最终实现快速、高效的分离。 肿瘤免疫治疗:为 CAR-T 细胞疗法、肿瘤疫苗研发等提供高质量初始细胞原料。感染病学研究:分析初始 CD8+T 细胞在病毒、细菌感染中的免疫应答过程。

    15710编辑于 2025-11-14
  • 来自专栏作图丫

    【单细胞文献解读】溃疡性结肠炎CD8+T细胞的单细胞图谱

    数据介绍 对3名健康人与3名UC患者的结肠CD8+T细胞进行单细胞转录组测序,共获得8,581 个细胞。 测序平台:10x Genomics。 小结:描绘了结肠CD8+T细胞的异质性,包括具有固有性和适应性特征的IL26+细胞和DP调节性CD8+T细胞。 初始T细胞、MAIT和双阳性(DP) T细胞群体表现较高的克隆多样性,大多数细胞表达独特的TCR CDR3序列(图3F)。 小结:共抑制分子PD1、TIM3和LAG3主要标记CD103+细胞等,少数CD103-细胞在蛋白水平上表现出慢性T细胞刺激的特征(图4E,F)。 揭示了CD8+T细胞组成中广泛的异质性,包括扩增的效应子和效应子后分化的CD8+T细胞

    1.2K20编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏作图丫

    【单细胞文献解读】早期复发性肝癌的肿瘤微环境

    NK CD16(FCGR3A+)亚群在HCC原发灶中富集,且高表达了很多细胞毒性细胞、以及抑制功能的基因(HAVCR2,KIR2DL-1,KIR2DL-3)(图D)。 Treg FOXP3+细胞在HCC原发灶中富集,伴随着CD27, FOXP3, LAIR3的高表达。 HCC的CD8+T细胞进化状态可总结为4个阶段: Phase 1:即进化的初始阶段,伴随着CCR6,CCR7,NCR3,KLRB1基因表达上调,而杀伤性功能的基因GZMA,GZMB,GZMH表达下调(图 Phase 2:表现出肝脏驻留记忆T细胞的特征,高表达JUN、FOS、NR4A1、NR4A3基因(图F)。 Phase 3:表现出效应T细胞的特征,高表达细胞毒性相关基因,而耗竭性基因表达较低。 随着CD8+T细胞进化的过程,HCC原发灶中只有BTLA表达升高,而LAG3和TIGIT的表达只在状态转换时有短暂的提升。

    1.6K10编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏DrugOne

    Brief. Bioinform. | 基于肿瘤免疫微环境数学建模和强化学习的免疫检查点抑制剂(ICI)联合化疗决策优化

    研究流程 图3描述了这篇论文的研究框架。首先,作者基于最新的肿瘤免疫微环境生物和临床知识构建了描述其演进的常微分方程——TIME动态演进模型。 ; 癌细胞、调节性T细胞(Tregs)对CD8+T细胞的抑制; 免疫检查点蛋白(PD-L1)减弱CD8+T 细胞杀伤癌细胞,而免疫检查点抑制剂恢复CD8+T 细胞对癌细胞的杀伤能力; 化疗对免疫系统的协同作用和破坏作用 :杀伤癌细胞,减少癌细胞CD8+T细胞的抑制并释放抗原;同时也杀伤CD8+T细胞。 图3. 论文研究框架 结果与分析 TIME动态演进模型 作者的模型中,病人肿瘤微环境的演进取决于CD8+T细胞和癌细胞数量的比值。根据这一比值,作者将肿瘤分成“热”肿瘤,“冷”肿瘤和“极端冷”肿瘤。 总结来说,作者发现“热”肿瘤中CD8+T细胞增长很快;“冷”肿瘤中的CD8+T细胞刚开始增长快,但后续和癌细胞持平;而“极端冷”肿瘤中CD8+T细胞增长比癌细胞慢。

    40610编辑于 2024-11-23
  • 来自专栏单细胞天地

    细胞测序鉴定银屑病的致病细胞亚群

    将银屑病Tc17细胞亚群与黑色素瘤浸润的 CD8+T 细胞进行比较,发现这些细胞细胞因子、溶细胞和代谢转录活性的上调,这与衰竭程序不同。 结果 细胞聚类 质控后的细胞: 银屑病:2919个CD8+T细胞, 正常皮肤:1656个CD8+T细胞。 分11个亚群。 银屑病皮肤中的炎性CD8+T 细胞亚群 接着研究银屑病皮肤中的CD8+T 细胞。看了已知的T细胞marker在各群的表达。如下图A。健康皮肤多的亚群,如cluster1,2,3,5,炎性子表达的少。 cluster4高表达CCR7, KLRG1,CXCR3.cluster 6和10高表达IL17A. Tc17细胞亚群表达CXCL13 对银屑病人中富集的cluster6,10格外感兴趣。 在每个受试者中,这些细胞代表平均 224 个独特的“克隆型”,此处将其定义为具有完全匹配的 TCR 序列集的细胞组推断的 CDR3 区域的比较。

    1.6K10发布于 2021-09-15
  • 来自专栏凋亡检测试剂盒推文

    Elabscience 小鼠CD8 T细胞阴性分选试剂盒,助力成果突破

    内容概要Elabscience 推出的 EasySort™小鼠 CD8+T 细胞阴性分选试剂盒(货号:MIM003N),凭借阴性分选技术实现小鼠脾脏和淋巴结中 CD8+T 细胞的快速高效分离,分选后细胞纯度高达 本试剂盒适用于分离小鼠脾脏和淋巴结的 CD8+T 细胞,分离出的细胞可直接进行下游应用。 检测原理本试剂盒采用阴性分选技术实现 CD8+T 细胞的高效分离。 )将这些非目标细胞吸附去除,从而留下未被标记的纯净 CD8+T 细胞。 抗病毒免疫研究:针对病毒感染模型,分离 CD8+T 细胞以分析其在病毒清除、免疫记忆形成中的作用。细胞治疗研发:为 CD8+T 细胞过继性免疫治疗研究提供高纯度起始细胞,助力细胞改造与治疗效能评估。

    29910编辑于 2025-09-22
  • 来自专栏作图丫

    干湿结合让你的biomarker筛选更上一层!

    导语 GUIDE ╲ 鉴定CD8+T细胞相关因子和黑色素瘤的共表达网络,阐明黑色素瘤CD8+T细胞相关基因在微环境中之间的相互作用。 绿黄模块与CD8+T细胞之间的相关性图如图2F所示。 图2 接下来,作者根据模块相关性大于0.7和CD8相关性大于0.4来筛选两个模块之间的交叉因素。得到了22个基因(图3A)。 为了计算这些基因与CD8+T细胞浸润比例之间的相关性,作者根据TCGA-SKCM(图3D)和GSE65904(图3E)队列中9个基因表达值的中位数建立亚群。 在皮肤黑色素瘤、甲状腺癌、头颈部细胞癌、肝细胞癌和肺鳞腺癌中,CCL5、GBP5、GZMA、GZMH、IRF1、LAG3、NKG7、PRF1、PSMB10与CD8+T淋巴细胞浸润比例相关(图6D)。 CD8+T淋巴细胞水平高和PSMB10水平高的患者预后最好,而CD8+T淋巴细胞水平低和PSMB10水平低的患者预后最差(图10F)。

    60130编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏生信菜鸟团

    竟然还能发:scRNA+bulk RNAseq筛选CD8+T细胞相关特征预测胃癌预后

    方法:①从TISCH2数据库中检索到的scRNA-seq图谱来筛选出CD8+T细胞特征基因;②利用Cox和LASSO回归构建基于这些CD8+T细胞特征基因的TCGA队列预后模型;③进行生存分析以研究特征对 3. 在GSE134520注释到9个细胞亚群。将两个数据集的CD8T细胞取交集后得到703个候选CD8+T细胞特征基因进行后续分析。 KEGG富集分析发现,CD8+T细胞特征基因主要富集于神经退行性变(hsa05022)和帕金森病(hsa05012)等通路。 3.2 筛选CD8+T细胞相关风险特征基因 从上述703个交叉基因中通过单因素Cox回归分析鉴定出35个与GC患者临床结局明显相关的CD8+T细胞标志基因。

    54510编辑于 2024-03-06
  • 来自专栏科研猫

    7分+纯生信思路,看到后我又跃跃欲试了

    3、TME中免疫/非免疫细胞的收集和生存分析 xCell网站:下载TME 中64种免疫和非免疫细胞类型; Cox回归和Kaplan-Meier分析识别与预后相关的免疫和基质细胞类型。 CD8 + T 细胞的 Kaplan-Meier 分析 3.IRDEGs的加权基因相关网络分析 CD8+T细胞相关基因模块的鉴定 图B:IRDEG的聚类树状图。 图C-D:高CD8+T细胞浸润组和低CD8+T细胞浸润组之间免疫相关特征的差异。 其中高CD8+T细胞浸润组的关键免疫检查点基因的表达水平升高; 图E:高CD8+T细胞浸润组和低CD8+T细胞浸润组中免疫抑制细胞的丰度。 CD8+T细胞衰竭标志物的表达水平升高,包括 CTLA4、TIGIT、PDCD1 和 LAG3,并且脱粒标志物 (CD107a) 的水平受到抑制。 分子亚型间内在免疫逃逸机制探索。

    89820编辑于 2022-04-09
  • 来自专栏单细胞天地

    揭示胶质母细胞瘤中T细胞功能障碍的免疫调节机制:髓系细胞与IL-10的关键作用

    研究者对8例患者进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq),并对3例患者进行了空间转录组测序(ST)。 右侧框中显示了top3的基因。 (b) CD8+T细胞中PRDM1基因的表达量。 (c) PRDM1扰动假设的插图。 (d) CD8+T细胞的RNA速率(RNA-速度)(左)和扰动轨迹(右)的矢量图。 (e) CD8+T细胞:推断的扰动(PRDM1)的矢量场投影,颜色表示发展和扰动轨迹的内积。 (d) GBM亚型和CD4+T细胞(d)之间的空间相关性分析,使用Moran统计(R2值)。 (e) 线图描绘了CD8+T的TRM-CD3与肿瘤亚型之间的距离。 (f) 高度连接的髓样细胞中top5富集的代谢通路。 (g) UMAP图展示基因表达量。 (h) 混合的CD3+/IBA1+阳性双峰的双峰分析。突出的双峰群体展示了CD3+/IBA1+阳性双峰。

    74910编辑于 2024-02-23
  • 来自专栏百味科研芝士

    多数据库联合分析肾透明细胞癌免疫浸润轻松发3分+

    今天和大家分享的是2020年3月发表在Journal of Cancer(IF:3.182)上的一篇文章,“The immune infiltration in clear cell Renal Cell 用Pearson相关系数分析TIICs间的相关性,其中CD8+T细胞与Tfh呈强正相关,与静息记忆性CD4+T细胞呈强负相关,与巨噬细胞M2中等负相关。(图2) ? (CIBERSORT筛选p<0.05的数据,得到418个包含总体生存率的病人数据,并且计算了中位TIICs亚群风险比HR和95%置信区间)(图3) 8个预后相关TIICs:静息和激活的树突状细胞,静息和激活的肥大细胞 以往研究表明,当肿瘤组织中存在功能成熟的DC时,CD8+T细胞与良好预后相关。本文中,ccRCC中CD8+T细胞浸润与不良预后相关,静息和激活DC与良好预后相关。 研究表明Treg和M2有促肿瘤作用,而本文中ccRCC CD8+T细胞,Treg,Tfh随着Fuhrman分级增加而增加,且CD8+T与M2间存在负相关,说明M2,Treg,Tfh可能在T细胞耗竭中起“

    1.4K10发布于 2020-06-04
  • 来自专栏科研菌

    这篇3+分文章带你学会多数据库分析免疫浸润

    今天和大家分享的是2020年3月发表在Journal of Cancer(IF:3.182)上的一篇文章,“The immune infiltration in clear cell Renal 用Pearson相关系数分析TIICs间的相关性,其中CD8+T细胞与Tfh呈强正相关,与静息记忆性CD4+T细胞呈强负相关,与巨噬细胞M2中等负相关。(图2) ? (CIBERSORT筛选p<0.05的数据,得到418个包含总体生存率的病人数据,并且计算了中位TIICs亚群风险比HR和95%置信区间)(图3) 8个预后相关TIICs:静息和激活的树突状细胞,静息和激活的肥大细胞 以往研究表明,当肿瘤组织中存在功能成熟的DC时,CD8+T细胞与良好预后相关。本文中,ccRCC中CD8+T细胞浸润与不良预后相关,静息和激活DC与良好预后相关。 研究表明Treg和M2有促肿瘤作用,而本文中ccRCC CD8+T细胞,Treg,Tfh随着Fuhrman分级增加而增加,且CD8+T与M2间存在负相关,说明M2,Treg,Tfh可能在T细胞耗竭中起“

    1.3K21发布于 2020-06-28
  • IL-10信号在肿瘤免疫治疗中的双重角色及精准研究策略

    然而,近年研究表明,在特定时空背景下,IL-10也能直接作用于CD8+T细胞,增强其细胞毒性功能、维持记忆表型,并促进抗肿瘤免疫应答。 研究发现,肿瘤浸润免疫细胞(如CD8+T细胞、巨噬细胞)的IL-10R表达呈现“滞后性非线性”特征。 1.滞后性的分子基础:细胞在经历一次高浓度IL-10刺激后,通过IL-10/STAT3信号通路形成正反馈环路,可导致IL-10R的转录持续激活。 3.临床相关性验证:通过对涵盖27种人类肿瘤类型的组织芯片进行分析,研究证实肿瘤浸润的CD8+T细胞和巨噬细胞普遍存在IL-10R高表达状态,提示该机制可能具有广泛的临床意义。 例如,在验证IL-10R高表达的基础上,进一步评估IL-10对CD8+T细胞增殖(通过CFSE或Ki67检测)、细胞因子(如IFN-γ)分泌或细胞毒功能的影响。

    16210编辑于 2026-01-19
  • 来自专栏优雅R

    多组学文献精读07 | TGF-β以耗竭T细胞削弱PD-L1抑制剂疗效(视频)

    Figure S1c-d PD-L1在免疫细胞上的表达与免疫相关转录组特征有关,例如高CD8+T细胞Score和免疫相关基因的表达量(火山图) ? Figure 1b-c 高CD8+T细胞Score具有更好的临床反应 高CD8+T细胞Score具有显著延长的OS ? Figure 2a-c a:IHC;棕色:CD8+T细胞;此图肿瘤内少CD8+T;而基质内富含CD8+T。 b:病人泌尿系统肿瘤的免疫表型可分为三种:耗竭+豁免+炎症 c:炎症型中具有良好应答者具有更高的CD8+T细胞Score f:具体展示下三种免疫表型的IHC,棕色:CD8+T细胞; ? Figure 4c-d EMT6小鼠模型:FCM检测:应用PD-L1和TGFβ联合抑制-->CD8+T细胞及颗粒酶B数量显著增加 ?

    1.9K61发布于 2020-07-03
  • 来自专栏科研猫

    文献解读 | 8分+,单细胞基因组学+肿瘤微环境+预后

    细胞类型相对丰度的计算表明,在 274 名 nccRCC 患者队列中,耗竭的CD8+T细胞、TAMs和sarRCC衍生细胞的比例较大,与nccRCC的预后不佳相关。 图 2:nccRCC 发生异常的生物学过程 3.耗竭的CD8+T在nccRCC的TME中富集 图A:CD8+T细胞被分为三个亚组; 图B:气泡图中显示三个亚组细胞最重要的10个标志物; 图C:检测到的免疫检查点涉及 LAG3、HAVCR2、PDCD1、CTLA4、TNFRSF9; 图D:CD8+T细胞的分化轨迹:非恶性组织衍生的CD8+ T细胞(亚组1)可分化为亚组2和亚组3。 亚组3表达更多与配体-受体对相关的免疫检查点,而亚组2具有更多的免疫的正常配体-受体对CD8+ T细胞; 图E:CD8+T细胞中:HAVCR2、LAG3、PDCD1、TNFRSF9高表达; 在nccRCC 耗竭的CD8+T细胞亚群中,靶点HAVCR2/LAG3可能优于PD-1/PD-L1和CTLA4作为nccRCC的免疫治疗靶点。

    85030编辑于 2022-04-09
  • 来自专栏纳米药物前沿

    Nature:IL-18bp是IL-18免疫治疗的分泌性免疫检查点和屏障

    与野生型IL-18不同,DR-18通过促进多功能效应CD8+T细胞的发展,降低表达耗竭TOX转录调节因子的耗竭CD8+T细胞的患病率,以及扩大干细胞样TCF1+前体CD8+T细胞的量,在小鼠肿瘤模型中发挥了强大的抗肿瘤作用 DR-18扩增干细胞样的TCF1+前体CD8+T细胞,并使其向多功能Teff细胞分化,远离TOX+Tex细胞。 这一机制似乎与阻断PD-1的作用不同,PD-1增强了Tex细胞的功能,但不影响干细胞CD8+T细胞的数量。 例如,低剂量的IL-2可用于治疗性地扩大免疫抑制的Treg细胞,但高剂量可刺激CD8+T细胞用于肿瘤免疫治疗。 DR-18作用于CD8+Teff细胞、干细胞样TCF1+CD8+T细胞和NK细胞的能力为DR-18和其他IL-18受体激动剂的临床开发提供了强有力的理论基础。

    1.3K30发布于 2021-02-04
  • 来自专栏纳米药物前沿

    Nat Nanotechnol:选择性抑制肿瘤相关巨噬细胞溶酶体内的半胱氨酸蛋白酶以提高其交叉呈递抗原的能力

    通过抗原交叉呈递激活CD8+T细胞在消除肿瘤方面非常有效。尽管该功能传统上归因于树突状细胞,但肿瘤相关巨噬细胞(TAM)也可以交叉呈递抗原。同时,TAM也是最丰富的肿瘤浸润白细胞。 然而,由于TAM调节其交叉呈递抗原能力的机制尚不完全清楚,导致TAM尚未被用于激活CD8+T细胞。 近日,Nature Nanotechnology报道了TAM在其溶酶体中含有过度活跃的半胱氨酸蛋白酶,阻碍了抗原交叉呈递,从而阻止了CD8+T细胞活化。 E64-DNA能够特异性抑制TAM溶酶体内的半胱氨酸蛋白酶群体,通过提高其交叉呈递抗原的能力激活CD8+T细胞来抑制肿瘤生长。 通过抑制半胱氨酸蛋白酶的活性,E64-DNA改善了TAM中的抗原交叉提呈,从而激活CD8+T细胞以对抗肿瘤的发生。

    52720编辑于 2022-08-15
  • 来自专栏数据科学(冷冻工厂)

    细胞Seurat - 细胞聚类(3)

    本系列持续更新Seurat单细胞分析教程,欢迎关注! 我们在这里选择了 10 个,但鼓励用户考虑以下事项: 树突状细胞和 NK 与 PC 12 和 13 密切相关的基因定义了罕见的免疫子集(即 MZB1 是浆细胞样 DC 的标记)。 我们发现,将此参数设置在 0.4-1.2 之间通常会为大约 3K 细胞的单细胞数据集带来良好的结果。对于较大的数据集,最佳分辨率通常会增加。可以使用 Idents() 函数找到簇。 AAACATACAACCAC-1 AAACATTGAGCTAC-1 AAACATTGATCAGC-1 AAACCGTGCTTCCG-1 ## 2 3 2 1 ## AAACCGTGTATGCG-1 ## 6 ## Levels: 0 1 2 3 4 5 6 7 8 未完待续,持续更新

    62310编辑于 2024-03-02
  • 来自专栏生信技能树

    SARS-CoV-2感染的雪貂支气管肺泡灌洗液单细胞转录组数据挖掘(2) 细分NK和CD8的T单细胞亚群

    (全部的代码复制粘贴即可运行,欢迎尝试以及批评指正) 现在是雪貂支气管肺泡灌洗液单细胞转录组显示SARS-CoV-2感染期间巨噬细胞的顺序变化专辑第2讲:主要是对 NK cells and CD8+T /72*0.8) DimPlot(cov.NK,group.by = "seurat_clusters", label=T) dev.off() 1643460147179 #未感染对照组(n=3) 、2 dpi (n=3)和5 dpi (n=4)各细胞类型在NK细胞群中的比例 pdf("Fig2b.NK_stacked_bar_composition_celltype.pdf",3.8,5) x +T细胞在阴性对照,2 dpi和5 dpi处的分布 pdf("Fig2g.condition_umap_CD8.pdf",9,15) par(mfrow=c(1,3), mar = c(1,1,3,1) 去除细胞效应和基因效应 06.单细胞转录组数据的降维聚类分群 07.单细胞转录组数据处理之细胞亚群注释 08.把拿到的亚群进行更细致的分群 09.单细胞转录组数据处理之细胞亚群比例比较

    55220编辑于 2022-03-03
  • 顶刊分享----空间免疫评分系统预测肝癌复发

    与REC HCC相比,非REC HCC的IF中显著富集三种不同的NK细胞群:CD3-CD56+ ordinary NK(P = 3.5 × 10-2)、CD3-CD16+CD56+细胞毒性NK(P SPON2+NK和CD8+T细胞相互作用为了研究SPON2+NK细胞是否在抗肿瘤免疫应答中与CD8+T细胞相互作用,使用mIHC和单细胞RNA-seq数据进行了进一步分析。 空间相关性表明SPON2+NK细胞CD8+T细胞之间可能存在相互作用,这可能有助于抗肿瘤免疫。 为了确定CD8+T细胞和SPON2+NK细胞之间的直接接触是否是CD8+T细胞抗肿瘤活性所必需的,使用HepG 2细胞、SPON2敲除的NK细胞和未敲除的NK细胞进行共培养实验。 研究表明,SPON2+NK细胞CD8+T细胞之间的直接接触对于它们的抗肿瘤活性是必需的,由IFNγ信号传导介导。NK细胞中的SPON2缺失增加HCC复发小鼠模型。

    25120编辑于 2025-03-17
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