- 综合排序
- 最热优先
- 最新优先
- 来自专栏生信菜鸟团
整合性地绘制人类炎症和癌症中的CD8+ T细胞图谱 | Nature Methods
TCR信息的CD8+ T细胞。 CD8+ T 细胞图谱的多功能性和适用性，使其能够自动将 CD8+ T 细胞注释转移到外部查询数据集。 我们对我们全面的人类CD8+ T细胞图谱进行了注释，包含18种不同的细胞亚型，并展示了scAtlasVAE揭示我们的CD8+ T细胞注释与先前建立的泛癌CD8+ T细胞图谱之间的一致性和差异的能力。 Annotation of CD8+ T cell subtype CD8+ T细胞亚型的注释 Para_01 我们对CD8+ T细胞图谱的十维潜在空间进行了无监督聚类。 簇11被注释为增殖T细胞（MKI67）。 由于S1PR1的低表达以及与先前报道的ITGB2+ Trm细胞相似的转录组图谱，簇10被注释为ITGB2+ Trm细胞。
1.1K10编辑于 2025-02-20 【免疫笔记】CD8+ T细胞的“多面人生”—从功能分化到调节性亚群的争议
上周听了一场免疫领域的学术报告，被CD8+ T细胞的“复杂人设”狠狠圈粉了——这货哪儿是单纯的“杀手细胞”啊，简直是免疫界的“多面手”（甚至有点“谜”）。 整理了PPT里的核心信息，分享给感兴趣的朋友~ 一、CD8+ T细胞的功能：抗原特异性说了算 报告开篇就点出：CD8+ T细胞的功能和“命运”，本质是由它的抗原特异性决定的（图1）。 这波“薛定谔的CD8+ T细胞”，直接打破了我对它“专职杀手”的刻板印象。 二、人类CD8+ T细胞图谱：TCR库的“花样”有多足？ 一个2025年人类CD8+ T细胞TCR库图谱。 这也解释了为啥不同疾病里CD8+ T细胞的功能天差地别：TCR库的“配置”从根上就不一样啊！ 最后报告做了个“三方对比”（图5），把CD8 Tregs、CD4+ Foxp3+ Treg、常规CD8+ T细胞放一起PK： 维度 CD4+ Foxp3+ Treg CD8 Tregs 常规CD8+ T
40610编辑于 2025-12-24Immunity | 单细胞+Xenium空间转录组揭示前列腺组织驻留记忆CD8+ T细胞的分化与异质性
然而，前列腺——作为男性生殖系统中重要的外分泌腺和屏障组织，同时也是恶性肿瘤的高发部位——其CD8+ T细胞群体的特征几乎完全未知。 Trm分化的关键细胞因子 瘤内异质性 scRNA-seq (小鼠+人前列腺CD8+ T细胞) 揭示Trm亚群的转录异质性 空间定位 10x Xenium (480基因panel, 亚细胞分辨率) 将T细胞表型映射到离散组织微环境 (A) 实验设计；(B) 前列腺P14 T细胞频率和数量的时间动态；(C-D) CD69/CD103表达谱；(E) CD69+CD103+亚群的绝对数量稳定性；(G-H) 小鼠和人前列腺CD8+ T细胞的组织定位 (A) 感染后7/30/250天的前列腺共聚焦显微镜；(B) Xenium数据概览——细胞类型定位和转录本检测；(C) 联合MDE降维和原位空间定位展示11种细胞类型的分布；(D) 上皮/基质区域的细胞类型组成 ： CD103+ CD8+ T细胞富集于上皮细胞附近 CD103+ T细胞表达更高水平的Granzyme B 这与小鼠的空间模式完全一致 临床转化的关键启示：前列腺癌中也存在相似的Trm亚群和人类前列腺中
12910编辑于 2026-04-13文献分享--髓系细胞网络调控复发性卵巢癌中原始免疫图谱的重建
结果2、OC免疫表型的特征在于不同的TIL和髓样细胞状态CD8+ T细胞亚群特征炎症型肿瘤：显著富集PD1+ CD8+ T细胞（提示耗竭状态），但CD103+（组织驻留）和GzB+（颗粒酶B+）亚群比例无差异排斥型 CD8+ T细胞空间分布的差异，更反映了TILs与髓系细胞的功能状态分化，这可能是导致患者预后差异的核心机制。 /荒漠型肿瘤：✓ CD11c+:CD68+髓系细胞同型互作增加✓ 形成CD8+:CD11c+:CD68+三重生态位，可能干扰CD8+ T细胞共刺激关键临床关联富含PD-L1+髓系生态位的患者无进展生存期 通过对TILs-髓系细胞空间邻域关系的分析，发现：复发性纯炎症型肿瘤保持最高频率的CD8+:CD11c+互作提示树突细胞（DC）持续参与抗肿瘤免疫应答混合炎症型肿瘤同时富集两种关键互作：✓ CD8+:CD11c +（T细胞-DC）✓ CD8+:CD68+（T细胞-TAM）反映免疫微环境处于动态平衡状态复发性排斥型肿瘤主要特征为：✓ CD8+:CD68+互作优势（与TAMs的免疫抑制性交互）✓ CD8+:CD11c
34620编辑于 2025-08-05- 来自专栏百味科研芝士
泛癌分析T细胞衰竭异质性发11分+SCI
TEX亚群与免疫溶细胞活性（CYT）的相关性分析表明，从C1-C5亚群CYT打分逐渐下降，CD8+ T细胞，Th1，Th2和CD4+ T细胞丰度同样逐渐下降（图1b）。 TEX亚群具有显著不同的免疫微环境 为研究衰竭过程中5个TEX亚群CD8+ T细胞的干细胞样特性，作者使用干细胞标记基因富集打分和CD69表达水平评估祖细胞样表型和个体患者的增殖能力。 ssGSEA分析表明从TEXprog到TEXterm，免疫细胞浸润水平逐渐下降（图3b），此外M2巨噬细胞，CD8+ T细胞和静息CD4+ 记忆T细胞浸润水平最高（图3c）。 TEXprog中CD8+ T细胞，活化CD4+记忆T细胞比例最高，M2巨噬细胞比例最低，TEXterm中促肿瘤M2巨噬细胞和肥大细胞比例最高（图3c和3d）。 对这40个基因构建PPI网络并鉴定到一个包括28个基因的子网络，包括TLL1, MYH11, P2RY8和PRKD2（图4e）。
59410编辑于 2022-12-12 文献分享--单细胞图谱描绘化疗后肝母细胞瘤的免疫细胞重塑与增强的肿瘤-成纤维细胞相互作用
免疫细胞重塑：化疗会富集CD69+ CD8+ T细胞，并使髓系细胞向免疫激活表型转变。 亚群分类：从57,739个T细胞中鉴定出11个集群，主要包括：CD4+ TregCD8+ T细胞（三个主要亚群）：CD8+_c1_CD69+：表达组织驻留标记CD69。 化疗后CD69+ CD8+ T细胞的富集与验证富集现象：CD69+ CD8+ T细胞在化疗后显著增加（5对配对样本中有4例比例升高）。 细胞功能实验验证实验设计：通过流式细胞分选技术从肿瘤样本中分选出CD69+ CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和PD-1+ CD8+ T细胞（Tex），分别与GFP+HepG2肝癌细胞共培养，监测肿瘤细胞存活率 髓系细胞与CD69+ CD8+ T细胞的相互作用相互作用增强：化疗后，多个髓系细胞亚群与CD69+ CD8+ T细胞之间的相互作用增强。
11420编辑于 2026-03-30- 来自专栏单细胞天地
解析食管鳞癌化疗病人的单细胞转录组
(CTHRC1 and MMP11), and vascular smooth muscle cells (DES and MYH11)【图B】 看内皮细胞 在图A发现：NACT-ESCC的tumor 细胞亚型相似性，发现它们的差异主要来自CD8+ T细胞（图D） 然后将 CD8+ T 继续细分（图E），得到10个cluster，整合成3个亚型：cytotoxic CD8+ T cells, exhausted CD8+ T cells, and naïve CD8+ T cells。 在NACT-ESCC中，exhausted CD8+ T cells and naïve CD8+ T占比明显升高，表示化疗改变了ESCC的免疫微环境 之后又对 CD8+ T cells进行了拟时序分析 ，轨迹从naïve CD8+ T & cytotoxic CD8+ T cell开始，分叉之一是cytotoxic CD8+ T cells，另一个分叉是exhausted CD8+ T cells；
1.1K51编辑于 2022-06-13 Nature Immunology | 老年癌症患者为何更难治愈？最新研究揭示关键机制！
本文表明，老化肿瘤微环境（TME）中有限的 CD8+ T 细胞激活，超出了细胞本身缺陷对肿瘤控制的限制。在老化过程中，肿瘤生长增加与 CD8+ T 细胞浸润和功能的减少有关。 + T 细胞以及四聚体特异性（Tet+）CD8+ T 细胞的百分比。 OT-1 CD8+ T 细胞，按簇着色。 广泛细胞类型的指定如下：巨噬细胞（Mac；簇（C）2、3 和 5）、NK 细胞（簇 4）、CD8+ T 细胞（簇 1、7 和 9）、树突状细胞（DCs；簇 6、8 和 10）、CD4+ T 细胞（簇 11 j, 随着衰老或在老年肿瘤微环境（TME）中潜在的 CD8+ T 细胞内在和 CD8+ T 细胞外在机制的示意图。
30400编辑于 2025-06-10- 来自专栏生信宝典
第一篇新冠单细胞文献！|解读
轻度患者中肺CD8+ T细胞数量的增加可能表明CD8+ T细胞在清除病毒中的作用，而重症患者中较高水平的T细胞增殖则值得探究。 发现轻度病例CD8+ T细胞中T细胞的活化、迁移、钙离子信号分子相关基因被上调，而重症患者CD8+ T细胞中的病毒反应、代谢产物和能量生成以及翻译起始分子相关基因被上调（图3E和3F）。 因此，这些数据证实了假设，即轻症患者中CD8+ T细胞更有助于清除病毒，而重度患者中的CD8+ T细胞正在准备增殖。 ? 图3. 不出所料，CCR7+ T细胞作为幼稚或中央记忆细胞，几乎没有克隆扩增，而CD8+效应T细胞在不同T细胞亚群中显示出最高的扩增水平（图4A）。 与轻症患者相比，重症患者CD8+T细胞比例较低，增殖细胞比例较高 ； （4）轻度疾病组的总T细胞和CD8+ T细胞的扩增水平均显着高于重症患者，表明克隆扩增的CD8+ T细胞的高效的效应分子水平； [1
2K20发布于 2020-04-23 - 来自专栏单细胞天地
单细胞水平分析红斑狼疮异质性
对33名儿童SLE患者（cSLE）和11名对照组进行了约276,000个外周血单个核细胞（PBMCs）的单细胞RNA测序，对系统性红斑狼疮（SLE）患者的血液转录组进行了分析，并揭示了其细胞来源的复杂性 cell clusters five CD8+ T cell clusters 通过BioinfoArk提供的中国区chatGPT查询到各个细分亚群的解释： 树突状细胞（Dendritic cells 五个CD4+ T细胞群集：CD4+ T细胞是免疫系统的重要组成部分，主要负责协调免疫反应。这里的五个群集可能代表了不同的CD4+ T细胞亚型。 五个CD8+ T细胞群集：CD8+ T细胞是免疫系统的重要组成部分，主要负责杀死病毒感染的细胞和癌细胞。这里的五个群集可能代表了不同的CD8+ T细胞亚型。 高ISG表达特征（ISGhi）来自于主要细胞类型中少数经转录学定义的亚群，包括单核细胞、CD4+和CD8+ T细胞、自然杀伤细胞、传统树突状细胞（cDCs）、浆细胞样树突状细胞（pDCs）、B细胞，尤其是浆细胞
46140编辑于 2023-10-06 顶刊分享--激活的ATF6α是限制免疫监视的肝脏肿瘤驱动因子
成像质谱流式揭示ATF6αhi肿瘤的免疫微环境特征免疫细胞浸润：ATF6αhi肿瘤区域CD8+ T细胞及CD11c+ 细胞浸润增加，但其中CD8+PD-1+ T细胞及CD8+PD-1+TIM3+终末耗竭 细胞邻域分析：ATF6αhi肿瘤中形成以CD11c+树突状细胞（DC）和CD4+ T细胞为中心的CD8+ T细胞聚集灶，同时CD11c+ DC与FOXP3+CD4+调节性T细胞（Treg）共定位增强，提示局部免疫抑制 免疫浸润：CD8+ T细胞及PD-1+细胞浸润减少（与ATF6α活化小鼠中增殖及免疫浸润增加的现象相反）。 ATF6α通过代谢竞争限制CD8+ T细胞功能scRNA-seq揭示：TGAlb-cre+肝脏CD8+ T细胞效应/耗竭亚群增加，但糖酵解及OXPHOS通路活性降低，提示葡萄糖缺乏微环境选择性抑制CD8 机制模型：ATF6α活化肝细胞通过增强糖酵解/乳酸产生，在细胞非自主层面上抑制CD8+ T细胞抗肿瘤免疫监视。
35520编辑于 2026-02-21- 来自专栏单细胞天地
小鼠同种异体胰岛移植和同源胰岛移植的单细胞景观
其中11,870个细胞为同源移植物，7,770个细胞为同种异体移植物）。 其中以T细胞浸润为主，包括传统CD4+ T细胞、调节性T细胞和CD8+ T细胞。健康C57BL/6小鼠和ICR小鼠胰腺中的免疫细胞数量有限，仅有小部分的巨噬细胞。 2. ) 图3.胰岛移植物中T细胞的定位(免疫荧光)：相较于同种异体移植物，同源移植物中的CD4+/CD8+ T细胞数量更多。 MHC I类分子高表达的这种转化特异性地促进CD8+ T细胞的相互作用。 5. 也将公共数据库中的健康胰腺组织单细胞数据与移植物进行对比分析。应用免疫荧光染色进一步说明相较于同种异体移植物，同源移植物中的CD4+/CD8+ T细胞数量更多。
82010编辑于 2023-02-10 - 来自专栏生信技能树
单细胞文献学习
Step 6、细胞聚类 参考前面的例子：人人都能学会的单细胞聚类分群注释 ，第一次分群就非常漂亮！我们就直奔主题，看T细胞的细分亚群！ Step 7、细胞注释 这个时候根据 CD8+ 的marker 基因，比如 "GZMK","CD8B","CD8A" ，确定了上面umap图中的 0,1,4,6,11 亚群就是 我们所需要的 CD8 + 的T细胞亚群： #手动注释 genes_to_check = c("GZMK","CD8B","CD8A") #CD8+的marker DotPlot(pbmc1, group.by = 'seurat_clusters Step 8、CD8+细胞亚群提取分析 #提取CD8T细胞 rm(list=ls()) load("marker_annotion.RData") levels(Idents(pbmc1)) pbmc< 4类，如下所示： naive T cells, memory T cells, CD8+ T cell/natural killer cell, CD8+ T cell 写在文末 咱们现在这个专栏《100
1K20发布于 2021-07-06 - 来自专栏生信技能树
乳腺癌患者抗PD1治疗期间肿瘤内变化的单细胞图谱
和耗竭标志物（HAVCR2、LAG3）的 CD8+ T 细胞，以及以 T-helper-1 表达为特征的 CD4+ T 细胞（IFNG)和滤泡辅助 (BCL6, CXCR5) 标志物。 作者将这种细胞称为经验T细胞（TEX细胞）。 拟时序分析结果 三种不同的CD8+ T细胞轨迹。 TN连接到TEM细胞，TEM细胞分叉成三种不同的轨迹，形成TEX1和TEX2细胞、滞留记忆CD8+ T细胞(TRM)和激活效应/记忆T细胞(TEMRA细胞)。 与 CD8+ T 细胞类似，NEs 中 RUNX3 和 CBFB 减少，而 Es 中 IFN-α/γ 反应增加（图 f-h）。 分析的是来自配对的治疗前（接受抗PD1治疗的29名初诊患者）和治疗期间（抗PD1治疗前接受新辅助化疗的11名患者）的单细胞转录组、T细胞受体和蛋白质组数据。
58820编辑于 2021-12-16 - 来自专栏单细胞天地
乳腺癌患者抗PD1治疗期间肿瘤内变化的单细胞图谱
和耗竭标志物（HAVCR2、LAG3）的 CD8+ T 细胞，以及以 T-helper-1 表达为特征的 CD4+ T 细胞（IFNG)和滤泡辅助 (BCL6, CXCR5) 标志物。 作者将这种细胞称为经验T细胞（TEX细胞）。 拟时序分析结果 三种不同的CD8+ T细胞轨迹。 TN连接到TEM细胞，TEM细胞分叉成三种不同的轨迹，形成TEX1和TEX2细胞、滞留记忆CD8+ T细胞(TRM)和激活效应/记忆T细胞(TEMRA细胞)。 与 CD8+ T 细胞类似，NEs 中 RUNX3 和 CBFB 减少，而 Es 中 IFN-α/γ 反应增加（图 f-h）。 分析的是来自配对的治疗前（接受抗PD1治疗的29名初诊患者）和治疗期间（抗PD1治疗前接受新辅助化疗的11名患者）的单细胞转录组、T细胞受体和蛋白质组数据。
83810发布于 2021-10-09 - 来自专栏流式抗体推文
告别杂细胞干扰！Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒，精准富集人初始 T 细胞
内容概要Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒凭借阴性分选技术，可从新鲜或冻存的人 PBMC 样本中快速分离高纯度人初始 T 细胞。 产品介绍Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒是一款操作快速简便的细胞分离产品，核心用于分离人初始 T 细胞。 检测原理Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性去除样本中 CD3⁻非 T 细胞、CD45RO⁺记忆 T 细胞等非目标细胞，实现人初始 T 细胞（CD3⁺CD45RA 应用领域免疫机制研究：探究初始 T 细胞的活化、分化及功能调控机制。肿瘤免疫治疗：用于 CAR-T 细胞疗法等研发中，提供高活性初始 T 细胞原料。 自身免疫病研究：分析初始 T 细胞在自身免疫病发生发展中的作用。疫苗研发：评估疫苗对初始 T 细胞的激活效果及免疫应答强度。再生医学：探索初始 T 细胞在组织修复与免疫重建中的应用。
15910编辑于 2025-11-13 - 来自专栏生信菜鸟团
【生信文献200篇】83 TNBC单细胞免疫图谱揭示了新的免疫细胞亚群
并通过免疫组织化学染色证实了CD8+ T细胞，CD4+调节T细胞，B细胞和巨噬细胞。 CD8+细胞细分： 通过已知T细胞功能标记基因的表达情况和簇间差异基因(DEGs)的表达，揭示了T细胞簇间的不同特征。 在naïve细胞群(T2和T4)中，只有大约10%的CD8+细胞具有克隆性TCR，而在衰竭CD8+ T细胞群(T1和T6)中超过30%。 总共有71对TCR与CD4+ T细胞共享，31对TCR与CD8+ T细胞共享，52对TCR发生在DN T细胞内。 并且研究人员鉴定的11种TCR对，不仅在巨噬细胞和T细胞中共存，而且还在患者TNBC010和TNBC012中共存，表明它们可能识别常见的抗原。 研究人员探索了TCR+巨噬细胞靶标的抗原。
1.9K20发布于 2021-12-01 - 来自专栏单细胞天地
OSCA单细胞数据分析笔记11—Cell type annotation
CD8+ T-cells 0.307063:0.19412309 CD8+ T-cells CD8+ T-cells # AAACCTGCAGGCGATA-1 0.323697:0.182205:0.483679 Monocytes 0.531659:0.46923231 Monocytes Monocytes table(pred$labels) # B-cells CD4+ T-cells CD8 观察具体每个位置细胞对所有参考细胞类型的评分。从图中可以看出B-cells、Monocytes的评分具有专一性，而CD4+与CD8+细胞可能会出现难以区分的情况。 从图中可以看出，多个cluster对应于一种细胞类型Monocytes，可能反应可不同的细胞亚类情况。而CD4+与CD8+细胞会出现对应于同一个cluster的情况。 =ref$label.main) # B-cells CD4+ T-cells CD8+ T-cells HSC Monocytes NK cells #
2.3K30发布于 2021-07-02 - 来自专栏生信探索
文献阅读001:由I类HLA转录缺失导致的联合免疫治疗的获得性癌症耐药性
病人一：HLA-B特异的CD8+ T细胞治疗、免疫检查点抑制剂等治疗 病人二：HLA-A2特异的CD8+ T细胞治疗、免疫检查点抑制剂等治疗 1. memory/effector，激活的CD8+ T细胞（红色） 图片 病人一在4个时间点的外周血scRNA-seq t-SNE图，激活的CD8+ T细胞主要在resp（免疫治疗相应阶段）。 激活的CD8+ T细胞浸润应答肿瘤 免疫组织染色表面，在免疫治疗相应阶段激活的CD8+ T细胞浸润肿瘤，但是在复发阶段CD8+ T细胞消失。 结合外周血单细胞测序结果（CD8+ T细胞）一直存在于外周血中，以上结果表明肿瘤特异性CD8+ T细胞不再识别抗原。 图片 总结 灌注的CD8+ T细胞能过缩小肿瘤大小，但是复发时肿瘤细胞的与灌注的CD8+ T细胞对应的HLA的转录水平会下调。
534100编辑于 2023-02-14 - 来自专栏生信技能树
人类衰老状态的血液免疫单细胞图谱
CD8+ T cells, Cluster 6 and 9 with mixed expression of CD4+ and CD8+ were named as ‘other T cells’ Clusters to varying levels of S100A9, LYZ, IL1B and FCGR3A expression. myeloid dendritic cells (mDCs; cluster 11 初步分成了 17 clusters 接下来就是对每个单细胞亚群进行细分了，比如T细胞，可以看到跟肿瘤微环境单细胞转录组的T细胞构成很不一样，没有大量的耗竭相关t细胞 ： T细胞细分亚群 因为有4个分组 Naïve T细胞的比例随着年龄的增长而呈现出减少的趋势，从青年组过渡至老年组时，Naïve T细胞的数量更是急剧下降 体弱老年组CD4+T CM细胞较多，健康老年组CD8+T CM和Treg细胞较多 这可能意味着CD8+和CD4+T CM细胞之间的平衡在维持老年人免疫系统的活力中起着重要作用 因为还有scTCR-seq，所以需要跟这个普通单细胞转录组表达量矩阵数据分析结合起来，也是同样的看不同分组样品的差异即可
78210编辑于 2022-06-08
腾讯云开发者
Copyright © 2013 - 2026 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有
深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 
粤公网安备44030502008569号
腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号