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《Cell》破解 PROTAC 透膜难题∶ CD36 蛋白介导的内吞机制_MedChemExpress(MCE中国)
该团队揭示了 CD36 是介导 PROTAC 及 bRO5 化合物透膜的关键蛋白，通过结构优化增加PROTAC 分子与 CD36 的亲和力，可以明显提高 PROTAC 透膜性，显著增强 PROTAC 的抗肿瘤功效 这类分子通过同时结合靶蛋白和 E3 泛素连接酶，诱导蛋白质降解，从而实现对疾病关键蛋白的精准清除。 CD36 缺失会大幅降低这些药物的细胞摄取效率及靶蛋白降解能力；CD36 表达恢复可显著提升 PROTAC 的疗效。CD36 介导的摄取依赖于经典的内吞通路 (Rab5/EEA1 早期内体途径) 。 这些结果证明：CD36 赖于经典的内吞通路 (Rab5/EEA1 内吞途径) 实现对大分子药物摄取。 此外，shCD36 显著降低 bRO5 分子的摄入和毒性，如下图所示：了代 增加 PROTAC 或 bRO5 分子对 CD36 的亲和力，显著提高药效为提高 PROTAC 药物对 CD36 的亲和力，研究者通过可裂解
46301编辑于 2025-07-03- 来自专栏单细胞天地
单细胞数据揭示两种巨噬细胞亚型及其预测胃腺癌免疫治疗和预后的相关预后因素
将WGCNA分析中获得的巨噬细胞亚群（670）和巨噬细胞模块基因（2,360）中特异性表达的基因取交集，在86个常见基因中，鉴定出7个预后因子（RGS2、GNAI2、ANXA5、MARCKS、CD36、 MKN7 和 MKN28（两种胃癌细胞系）中 7 个预后因子的表达趋势与 RNA-seq 数据中的表达趋势一致，也比较了公共 HPA（人类蛋白质图谱）数据库中的蛋白质表达水平。 RGS2、GNAI2、ANXA5、MARCKS、CD36、NRP1和PDE4A是STAD的预后指标，其中GNAI2和PDE4A是保护指标，RGS2、ANXA5、MARCKS、CD36和NRP1是危险指标 首先，在HPA数据库中查询RGS2、GNAI2、ANXA5、MARCKS、CD36、NRP1和PDE4A的蛋白产物表达水平。MARCKS基因编码的蛋白质在STAD组织中的表达低于正常胃组织（图4A）。 RGS2在胞质溶胶中特异性表达，ANXA5在核膜中特异性表达，CD36在高尔基体中特异性表达（图4C）。此外，发现 GNAI2 的显着拷贝数缺失（图 4D）。
1.1K10编辑于 2024-04-01 AbMole | Alirocumab助力揭秘HTR期间肝脏免疫调节新机制
A, 肝脏中SREBP2的mRNA和蛋白水平通过qPCR（n=4）和WB测量。B, 肝脏中SREBP2的mRNA水平通过qPCR测定，血清中PCSK9的水平通过ELISA测定（n=4）。 pcsk9的靶点，包括ldlr、lrp1、lrp5、lrp8、vldlr和cd36，被标记出来。b，散点图显示排斥组和非排斥组之间cd36的表达。 C，tSNE图描述了心脏浸润的CD45+免疫细胞被分成5组。D，热图显示每个簇中Cd36的表达情况。 通过比较用PCSK9处理的腹膜巨噬细胞和对照组，观察到MHCII和共刺激分子表达增加（图5A），以及CD36的表达和脂肪酸的吸收减少（图5B）。 B, 腹膜巨噬细胞中CD36表达（左侧，n=5）和BODIPY（右侧，n=5）的代表性FACS直方图和柱状图。
13210编辑于 2025-12-22AbMole小讲堂丨Concanamycin A (Con A)：V-ATP酶抑制剂在自噬、肿瘤和动物实验中的应用
Concanamycin A可诱导溶酶体、胞内体等酸性细胞器的pH值升高，进而影响蛋白质降解、自噬体成熟及离子稳态。 Concanamycin A还能以0.1 μM的浓度在小鼠成骨细胞中抑制溶酶体酸化，降低组织蛋白酶B的活性[3]。 Concanamycin A(Con A，Folimycin，刀豆素A，AbMole，M7737) 在大鼠模型中，静脉注射（剂量为1 mg/kg）可用于研究V-ATP酶对CD36蛋白亚细胞循环的调控，并揭示其在心肌脂质代谢紊乱中的作用 自噬缺陷突变体（atg5-1和atg7-2）积累更多的FREE1蛋白，并对缺铁表现出超敏反应，在缺铁条件下，自噬相关基因上调，促进FREE1的自噬降解，从而可能减轻FREE1对铁吸收的抑制作用。 Protein Synthesis IN-1作为蛋白质合成抑制剂，用于追踪FREE1蛋白的半衰期和降解过程。
15510编辑于 2026-02-03- 来自专栏无细胞蛋白表达
无细胞蛋白表达如何加速激酶药物研发：5天完成DNA到蛋白表征
技术案例：利用无细胞蛋白表达系统实现BTK蛋白5天快速表征在蛋白质研究和药物研发过程中，研究人员通常需要获得稳定且具有活性的蛋白样品，以开展结构研究、功能研究以及小分子结合分析。 本文介绍一个基于无细胞蛋白表达技术的研究案例，展示如何在约 5 天内完成从 DNA 到蛋白表征的研究流程。 无细胞蛋白表达undefined在无细胞蛋白表达体系中进行蛋白合成。蛋白筛选与纯化undefined对表达蛋白进行筛选和纯化，以获得可溶性蛋白样品。 相比传统蛋白表达方法，该流程具有以下优势：显著缩短实验周期 提高蛋白表达效率 支持多构建体并行筛选 在部分实验流程中，从 DNA 构建体到蛋白功能表征的整个过程可在约 5 天内完成。 FAQ什么是无细胞蛋白表达？无细胞蛋白表达是一种在体外体系中合成蛋白质的技术方法，通过利用细胞裂解液中的蛋白翻译体系，在试管中直接完成蛋白质合成。无细胞蛋白表达相比传统表达有什么优势？
17130编辑于 2026-03-09 - 来自专栏医学数据库百科
人类蛋白免疫组化表达数据库
写在前面 我们在进行基因的蛋白表达检测的时候，通常的方法是进行western blot以及免疫组化进行检测的。 对于某一个蛋白免疫组化的结果呈现，数据库是分成了四个分类来呈现的，分别是：没有检测到、低表达、中表达以及高表达。、 ? 数据库使用 数据库的使用和基因的检索数据库是一样的。 我们只需要输入我们想要检索的蛋白名即可。例如我们这里输入：CD36。 ? 对于每一个蛋白的数据结果，数据库提供了多个模块来展示结果。首先我们看到的是一个汇总的界面，这里我们能看到这个蛋白的基本信息。 组织表达情况 在组织表达情况当中，我们可以看到这个蛋白的不同在不同的正常组织当中mRNA和蛋白的表达情况。 蛋白表达定位情况 在 CELL部分，我们可以看到这个蛋白在细胞当中的什么部位表达，通过蛋白的表达位置来确定这个蛋白可能具有的功能。 ? 3.
3.7K40发布于 2020-07-16 - 来自专栏生信技能树
花十几万做四个样品的空间单细胞转录组就为了证明这么简单的事情？
里面的空间单细胞转录组数据文件，走空间单细胞流程，详见：10x的空间单细胞文件格式详解 需要完成上面的4个样品的空间切片的上皮细胞的打分以及可视化，然后随便也看看下面的基因列表的地方吧； Fibroblast: CD36 ,PDGFRB,C5AR2,S100A4,CD70,PDPN,VIM,ITGA5,MME,PDGFRA,FAP,ACTA2, Endothelial: PECAM1,VEGFA,KDR,CD34,ITGB1 蛋白质组学分析：通过蛋白质质谱分析样品中蛋白质的组成，寻找与乳腺癌相关的蛋白质标志物。
21110编辑于 2024-11-21 - 来自专栏火星娃统计
GEO数据挖掘5
GEO数据挖掘5 sunqi 2020/7/13 GEO数据挖掘5 概述 GO和KEGG富集分析 KEGG全称 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，由日本京都大学生物信息学中心的 数据库能够把基因及表达信息作为一个整体的网络进行研究，通俗点讲就是通过基因寻找通路 GO全称为gene ontology，由基因本体联合会（Gene Ontology Consortium）建立的数据库，数据库对基因和蛋白功能进行限定和描述 948 ## 2 DUSP6 1848 ## 3 DCT 1638 ## 4 SPRY2 10253 ## 5 MOXD1 26002 ## 6 DEG=deg head(DEG) ## logFC AveExpr t P.Value adj.P.Val B g ## CD36 CD36 ## DUSP6 DUSP6 ## DCT DCT ## SPRY2 SPRY2 ## MOXD1 MOXD1 ## ETV4 ETV4 # 通过基因名将转换后的
1.4K10发布于 2020-09-15 - 来自专栏单细胞天地
母乳细胞的单细胞测序揭示了哺乳期乳腺变化
在人类乳腺中，这种导管结构会嵌入富含胶原蛋白的特殊基质中，其中含有不同类型的间充质和免疫 (IM) 细胞。 然后进行聚类分群， NMC主要是5个群，其中有3个是完全属于NMC：a single MY cluster and two luminal clusters (LCs)。 CSN318) and other secretory genes integral to milk fat secretion such as xanthine hydrogenase (XDH), CD36 (CD36) and mucin-1 (MUC1) 然后对LC1和LC2进行差异分析， 其中1640 个基因在 LC1 中高表达，发现 1782 个基因在 LC2 中高表达；富集分析结果显示：LC1 LC2的top10 调控元件在LC1中也是高表达，例如STAT5A（essential for secretory LC differentiation and milk production）。
38610编辑于 2023-09-26 - 来自专栏Y大宽
5️⃣蛋白质的特征信息3:卷曲螺旋预测
序列比对和序列特征分析总目录 卷曲螺旋是蛋白质中的结构motif，其中2-7个α-螺旋像绳索一样缠绕在一起，其中最常见的类型是二聚体和三聚体。 许多卷曲螺旋型蛋白质参与重要的生物学功能，例如基因表达的调节的转录因子。 比如c-Fos和c-jun。
2.8K10发布于 2019-03-04 【辰辉创聚生物】重组蛋白表达纯化|蛋白表达定制|蛋白修饰|原核表达蛋白
原核蛋白表达宿主菌株与表达载体的选择1. C41、C43 等突变株：对有毒或难表达蛋白更为耐受，常用于膜蛋白或代谢负担较大的蛋白。2. 质粒拷贝数与选择标记：高拷贝质粒能提高表达量，但可能增加宿主负担；低拷贝质粒适合对宿主敏感或有毒的目标蛋白。重组蛋白表达纯化策略1. 例如使用携带冷激蛋白promoter的表达载体，在较低温度（如11℃）下诱导，可显著提高可溶表达几率。蛋白表达定制服务1. 小规模表达筛选：不同诱导温度、菌株、培养方式下检测表达产量与溶解性；5. 大规模表达与裂解；6. 蛋白纯化：亲和层析 → 可选凝胶过滤或离子交换等进一步纯化；7.
64110编辑于 2025-08-25- 来自专栏百味科研芝士
干湿结合7-mRNA预测模型轻松发5分+
cholangiocarcinoma 一种新的多mRNA标志物预测胆管癌复发的预后价值 术语 CCA：胆管癌 DEGs：差异表达基因 mRNA：由DNA的一条链作为模板转录而来的、携带遗传信息的能指导蛋白质合成的一类单链核糖核酸 在平均交叉验证误差最小的λ值下，选择了7个非零系数的mRNA，包括CD36、GGCX、UBASH3B、DBN1、PTTG1、CCNA2和SPATS2（图3B）。 根据这7个mRNA的表达情况，构建了RFS的风险评分公式：风险评分=（-0.96873×CD36表达状态）+-0.03944×GGCX表达状态）+（0.01064×UBASH3B表达状态）+（0.04955 7-mRNA与RFS的ROC曲线的AUC分别为1年1000、3年0.958、5年0.977和5年以上0.979（图5D）。 此外，7-mRNA风险评分模型的AUC显著高于任何单个mRNA或临床因素（图5E-F）。 ? 图5 5.
72730发布于 2020-04-30 - 来自专栏生信星球
meta分析整合多次差异分析结果
优点：容错率极高，能整合量纲完全不同的数据（如转录组+蛋白质组+甲基化）。 缺点：丢失了具体的“倍数变化”信息，无法量化差异幅度。 26.93697 4.073695e-12 2.764409e-08 ## Rps18 -2.921302 7.197548 -21.07808 7.337186e-11 1.492161e-07 ## Cd36 16.56112 DOWN H2-K1 ## Gm10260 16.45028 UP Gm10260 ## Rps18 15.48881 DOWN Rps18 ## Cd36 15.39094 UP Cd36 head(deg2) ## logFC AveExpr t P.Value Rps18 -2.921302 0.1385943 7.337186e-11 0.31219117 0.1859874 ## 6 Cd36 4.472500 0.2130533 7.696087e
17710编辑于 2026-01-27 【辰辉创聚生物】包涵体蛋白纯化|可溶性蛋白表达|大肠杆菌蛋白表达|原核蛋白表达
在生物技术与分子生物学中，原核蛋白表达体系（尤其是大肠杆菌蛋白表达）因操作简便、生长速度快、成本低廉，是获取重组蛋白的重要途径。 然而，在高水平表达时，目标蛋白往往以包涵体蛋白形式沉淀，形成不可溶的聚集物。这种现象虽影响生物活性蛋白得率，但其高表达量、易纯化等特性使得包涵体蛋白纯化成为不可忽视的技术路线。 因此，在工程过程中，提升可溶性蛋白表达与完善包涵体蛋白的纯化与复性策略，是实现高效、活性蛋白回收的关键。可溶性蛋白表达策略避免目标蛋白形成沉淀、提高可溶性表达是首选路径。 5、培养添加剂优化：如渗透保护剂（甘氨酸-甜菜碱、山梨醇）、乙醇、维生素（如硫胺素、核黄素）、辅因子等，有助于提高可溶性表达。 通过上述策略，可显著在原核蛋白表达 / 大肠杆菌蛋白表达系统中提升可溶性蛋白表达比率，从而降低进入包涵体途径的蛋白量。包涵体蛋白纯化流程当可溶性表达不足时，包涵体表达成为高产获取目标蛋白的重要替代。
36610编辑于 2025-09-02- 来自专栏医学数据库百科
蛋白功能预测
我们在遇到一些新的蛋白的时候，经常需要去了解这个蛋白的功能。如果是一个新的还没有功能注释的蛋白，一般数据库就用不了了。这个时候就可以使用 NetGo 来对蛋白的序列进行功能注释了。 ? NetGo基于三重信息来对蛋白序列进行功能预测： 基于已知的功能信息信息(GO数据库) 基于STRING蛋白相互作用数据库进行注释 如果没有互作蛋白的可以进行同源转换进行注释。 数据库评价 对于蛋白功能预测的话，已知的蛋白基本上都已经基于GO预测好了。如果我们研究的是已知常规蛋白的话，其实可以去类似Genecards或NCBI的gene数据库直接看的。 这个数据库更多的可以用于新发现的蛋白的预测，或者说一个基因不同转录本之间的研究，看有没有功能的区别。
92810发布于 2020-06-01 PCSK9抑制剂在缺血性卒中防治中的研究进展
一、引言前蛋白转化酶枯草溶菌素9（PCSK9）作为调节胆固醇代谢的关键分子，近年来受到广泛关注。随着PCSK9抑制剂的临床应用日益普及，其在动脉粥样硬化性心血管疾病防治中的价值已获得充分证实。 除LDLR外，PCSK9还可促进低密度脂蛋白受体相关蛋白1（LRP1）、极低密度脂蛋白受体（VLDLR）及载脂蛋白E受体2（ApoER2）的降解，并通过载脂蛋白E（ApoE）及相关通路影响肝脏脂质合成与分泌 其一，高水平的循环PCSK9通过降低脂质清除间接激活血小板；其二，PCSK9可直接与血小板表面的CD36受体结合，不依赖于LDLR通路触发血小板活化信号，增强血小板聚集功能，从而增加血栓形成风险。 （三）小干扰RNA药物的研究现状针对PCSK9的小干扰RNA（siRNA）药物（如英克司兰）通过抑制PCSK9蛋白合成实现长效降脂效果。 该试剂盒采用分别标记供体荧光基团和受体荧光基团的PCSK9与LDLR蛋白，当二者特异性结合时发生能量转移，产生可定量检测的荧光信号。
13910编辑于 2026-02-28- 来自专栏DrugOne
用蛋白语言模型改进蛋白复合物预测
AlphaFold-Multimer 就提升了蛋白质复合物结构的预测水平，但其准确性依然取决于多序列比对（MSA）结果。 同时，蛋白质语言模型也在不同的工作中被广泛应用，它可以捕捉到序列中的约束和共进化信息。 ）和 MSA 深度（MSA_Depth），结果如图 5 所示。 图 5：不同因素对结果的影响 作者使用预测结构的 DockQ 得分评估 ColAttn 构建的间相互作用质量，当层数为 6 或 7 时，效果是最好的。 图 6：不同层上 DockQ 得分 4 总结 本文基于预训练蛋白语言模型，探索了一些 MSA 配对算法构建有效间相互作用的效果，这篇文章也是首次将蛋白语言模型用来构造联合 MSA，实验结果证明本文提出的
73320编辑于 2022-11-28 文献分享--肝癌中代谢原型癌细胞通过氧化低密度脂蛋白介导的代谢互作诱导促肿瘤性TREM2+巨噬细胞
鉴定出HCC癌细胞的三种功能原型：代谢型表现为增强的脂质（胆固醇/脂肪酸）、脂蛋白和外源物代谢；干性型呈现更高的蛋白质翻译、上皮间质转化（EMT）和干细胞特征；炎症型则以急性期反应和补体应答为特征。 多重免疫荧光（mIF）进一步在蛋白水平证实APOE+PanCK+代谢型癌细胞与TREM2+CD68+ TAMs的共定位。代谢原型高表达区域中，巨噬细胞及TREM2+ TAMs特征基因表达也显著上调。 结果5、对野生型（WT）和Trem2敲除（Trem2−/−）肝癌的单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析显示，Trem2−/− TAMs中Spp1表达显著抑制，与此前在Trem2−/− HCC模型中的发现一致 调控oxLDL生成与TME重塑机制1：促进脂质过氧化✓ Sqle敲低降低NADP+/NADPH比值和ROS水平✓ 抑制脂质过氧化和oxLDL生成机制2：增强oxLDL摄取✓ shSqle癌细胞通过上调CD36 增加oxLDL内吞，该效应可被CD36抑制剂（SSO）逆转✓ 可能补偿SQLE缺失导致的脂质合成抑制体内实验验证SQLE的免疫调节作用原位肝癌模型中，shSqle肿瘤生长减缓，瘤内oxLDL水平降低TREM2
57910编辑于 2025-07-25【辰辉创聚生物】膜蛋白表达|无细胞蛋白表达|重组蛋白表达生产
高可控性无细胞系统可以精确控制反应条件，如温度、pH、离子强度和底物浓度等，从而优化蛋白质的表达和折叠过程。这种可控性对于膜蛋白等复杂蛋白的表达至关重要。3. 无细胞蛋白表达系统在膜蛋白研究中的应用1. 膜蛋白的表达和纯化膜蛋白由于其疏水性和结构复杂性，传统的细胞表达系统难以高效表达和纯化。 膜蛋白的功能研究无细胞系统能够在体外合成具有功能的膜蛋白，如离子通道、受体和转运蛋白等，为其功能研究提供了便利。通过与膜片钳技术、荧光标记和质谱分析等方法结合，可以深入探讨膜蛋白的功能机制。4. 膜蛋白的药物筛选膜蛋白是许多药物的靶点，如G蛋白偶联受体（GPCR）和离子通道等。无细胞系统能够在体外合成目标膜蛋白，并进行高通量药物筛选，为新药的开发提供了有效的平台。 此外，结合计算模拟和结构生物学技术，也有助于深入探讨膜蛋白的功能机制。无细胞蛋白表达系统作为一种高效、可控和灵活的蛋白合成方法，在膜蛋白研究中具有重要应用价值。
36610编辑于 2025-09-09【辰辉创聚生物】哺乳动物细胞蛋白表达|HEK293蛋白表达|CHO细胞蛋白表达|哺乳蛋白瞬时表达
哺乳动物蛋白表达是指将目标基因导入哺乳动物细胞（如CHO、HEK293等）后，利用其与人类高度相似的转录、翻译及翻译后修饰机制，在细胞内合成并加工目标蛋白的过程。 其优势在于适合快速验证蛋白功能、小规模制备和结构分析。例如，研究者常在 HEK293E 中快速获得融合蛋白或重组受体蛋白，用于体外功能实验。 蛋白表达培养悬浮培养配合优化培养基（如 Expi293 系统），可在一周内获得毫克至克级蛋白产量。4. 磷酸化、乙酰化、甲基化等修饰：调控蛋白功能和定位；4、内质网和高尔基体的质量控制：能降解错误折叠蛋白，保证产物一致性。 哺乳动物细胞蛋白表达系统因其天然的折叠与修饰能力，成为表达结构复杂、功能敏感蛋白的首选平台。
38310编辑于 2025-08-27
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