BSseeker2:BSseeker2是一个用于WGBS数据分析的比对工具。它可以处理单链和双链亚硫酸盐转化测序数据,并支持Bowtie, Bowtie2和SOAPaligner作为比对器。 BSseeker2提供了甲基化位点检测和甲基化水平计算等功能。BWA-Meth:BWA-Meth是一个基于BWA的比对工具,专门用于处理WGBS数据。 使用四种不同的分析流程进行比对,包括Bismark、BitmapperBS、BSseeker2和BWAMeth。