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Angew：靶向肿瘤和免疫细胞中GRPr的肽偶联的铱（III）复合物
胃泌素释放肽受体（GRPr）在生命系统中起着增生和炎性的作用。本文报道了一种高度选择性的GRPr拮抗剂（JMV594）-铱（III）络合物，用于探测活肿瘤细胞和免疫细胞中的GRPr。 这是第一个肽偶联的铱（III）复合物，被开发为GRPr生物成像探针和GRPr活性的调节剂。这种诊疗制剂在揭示GRPr在生命系统中的各种作用方面显示出巨大潜力。 总体而言，此工作为开发肽偶联的金属基探针提供了一种有效的方法，该探针不仅保留了金属化合物的优异光物理特性，而且还结合了肽的理想生化特性。
57310发布于 2021-02-04 - 来自专栏纳米药物前沿
氧化石墨烯-环R10肽核靶向纳米平台克服肿瘤多药耐药
在这项工作中，环状R10肽（cR10）与聚甘油覆盖的纳米氧化石墨烯缀合，该工程化纳米平台可克服肿瘤多药耐药性。 由cR10肽促进的纳米制剂的核靶向，以及随后的激光触发释放的阿霉素释放实现有效的抗癌活性，这在体外和体内实验中均得到证实。 合成的纳米平台具有多种不同特征的组合，包括主动核靶向，高负载能力，药物的受控释放和光热性质，为克服耐多药癌症提供了新的策略。 本文证明了通过聚甘油覆盖的石墨烯纳米片靶向细胞核可以在体内和体外成功克服肿瘤的多药耐药性。 这项工作介绍了一种新开发的环状肽的核靶向纳米药物，为克服肿瘤多药耐药打开了新的大门。
39620发布于 2021-02-04 - 来自专栏DrugOne
. | 跨物种线粒体靶向序列的生成式设计
因此，提升线粒体靶向能力对于核酸酶和药物分子的高效递送也具有重要意义。 要将蛋白质定向至线粒体，需在核编码蛋白的N端添加一段靶向肽。 然而，目前被系统表征的靶向肽数量有限，导致相关序列在工程应用中被反复使用。 结果 构建用于人工线粒体靶向序列设计的变分自编码器 线粒体靶向序列（MTSs）是一类带正电荷的肽段，具有形成两性α螺旋的倾向。 在9条AMTS中，AMTS 131、205、225和335成功靶向线粒体；AMTS 6、64和96部分定位于线粒体及其他胞器；AMTS 110与245则未显示线粒体靶向能力。 随后，研究人员在潜在空间中进行线性插值，生成了62条假设具有双靶向能力的肽段。通过分析插值路径中肽段的特征变化，研究人员揭示了这类双靶向序列可能源自线粒体靶向肽的进化轨迹。
66810编辑于 2025-05-08 - 来自专栏DrugOne
. | 通过模拟结合界面实现精准肽分子设计
DRUGONE 肽类在靶向治疗中具有口服生物利用度、细胞通透性和高特异性等优势，使其区别于传统的小分子和生物制剂。 研究人员开发了一种人工智能算法 PepMimic，能够将已知受体或抗体转化为短肽结合剂，通过模拟已知结合界面生成候选肽。 小鼠乳腺癌、骨髓瘤和肺癌模型中的注射实验验证了候选肽的膜结合效果，展示了其在临床诊断成像和靶向治疗中的潜力。 在 CD38 和 TROP2 上的实验表明，PepMimic 能提升结合效果，并在体外实验中获得了高亲和力的肽分子（图6）。 实验验证结果表明，该方法在多个肿瘤模型中展示了靶向成像和治疗的潜力。未来，PepMimic 不仅可用于药物开发，还可应用于基础研究中的蛋白互作机制解析和诊断工具开发。
40210编辑于 2025-10-14 - 来自专栏DrugOne
Briefings in Bioinformatics | 用于PPI抑制剂设计的深度分子生成模型
结果表明，生成的分子具有更好的PPI靶向药物相似性和药物相似性。生成的分子与 iPPI-DB 共享化学空间。探索了 PPI 抑制剂的基于肽和基于配体的分子生成。 基于肽的生成分子案例 为了评估基于肽生成的化合物是否可以成为有效的候选分子，研究人员选择了基于p53(肽)生成 MDM2-p53 靶标的潜在候选抑制剂。 为了进一步确定优先考虑用于生物测定的分子，研究人员使用DOCK6进行分子对接来预测结合亲和力。分子对接结果显示，研究人员找到了 10 种具有比参考化合物更高的对接分数和 QEPPI 值的化合物。 该方法依赖于分子或肽作为种子分子生成多样性的PPI类药性化合物库。目前是第一次将深度分子生成模型应用于 PPI 抑制剂的从头设计。 研究人员探索了基于肽的 PPI 抑制剂设计和基于配体的 PPI 抑制剂设计。结果表明，生成的分子具有更好的 PPI 靶向药物相似性和药物相似性。
77050编辑于 2022-11-28 - 来自专栏纳米药物前沿
上海大学王艳丽Small Methods：一种通过细胞核靶向和线粒体介导的凋亡途径治疗肿瘤的高效碳基药物递送系统
据报道，负载DOX的CBNs可用于靶向肿瘤细胞核，但为了提高药物靶向率，通常需要修饰活性靶向配体，如抗体、叶酸和肽（RGD和核靶向肽）等，这些活性靶向配体在提高药物靶向性的同时也存在潜在的缺点，如抗体成本高 、肿瘤穿透率低（因其体积大）、适体稳定性低（因血浆中的核酸酶）以及肽的循环半衰期低（因血浆中的肽酶）等问题。 此外，修饰的靶向配体也使得合成过程繁琐且难以操作。 上海大学王艳丽教授课题组在之前的工作中通过改进的碱基介导的水热分子融合合成了一种新型石墨烯基肿瘤细胞核靶向荧光纳米探针，该探针具有肿瘤细胞靶向性的特点，是一种CBN。 结果表明，CPD在肿瘤细胞核中的DOX靶向率高达36.78 %，在肿瘤组织中的ID/g百分比高达30.09 %，肿瘤生长抑制率高达79.42±2.83 %，大大降低了DOX的全身副作用。
1K00编辑于 2022-08-15 - 来自专栏DrugAI
Science | 靶向无序蛋白的新一代结合蛋白设计
DRUGONE 无结构蛋白质和肽在生物过程中发挥关键作用，但由于其缺乏明确定义的结构且具有高度可变的序列和构象特性，因此难以被传统方法靶向。 研究人员先在6条合成序列上进行了测试，在平均每个靶标8个设计中获得了高亲和力结合，且多为10~100纳摩尔范围。 疾病靶点识别：用于识别突变型肽段（如CTN4），在临床质谱检测中具有潜力。 肿瘤细胞标记：结合MSLN的设计子能特异性标记表达该受体的细胞，表现出良好的肿瘤靶向潜力。 讨论 研究人员提出，靶向无结构蛋白实际上比靶向折叠结构更具优势，因为其构象异质性使其能被诱导至有利的结合状态。 其框架还可推广至： 靶向多种肿瘤相关受体的无结构区域； 检测神经肽、非典型开放阅读框编码蛋白； 通过设计双特异性结合子，提高结合特异性与亲和力； 融入催化功能，实现结合与功能调控的一体化； 探索翻译后修饰靶标
21520编辑于 2026-01-06 - 来自专栏纳米药物前沿
中国药科大学周建平/丁杨团队AS：仿生脂质纳米复合物组装体实现“药物-载体”协同清除Aβ和抑制Tau蛋白磷酸化治疗
以天然高密度脂蛋白活性组分载脂蛋白A-I（ApoA-I）和磷脂仿生组装Aβ高亲和纳米复合物，并荷载Tau蛋白磷酸化抑制剂亚甲蓝（MB）；为高效渗透入脑，经apoA-I模拟肽仿生锚定并优化靶向配体Ang密度 通过修饰不同密度的脑靶向肽Ang，在细胞和动物水平进行靶向效果比较和优化：纳米复合物APLN/MB的脑靶向效果与靶向肽Ang的修饰密度并非正相关，过高的优势密度可能会因位阻作用降低纳米复合物与靶向配体的相互作用 图3 靶向肽Ang密度优化及APLN/MB靶向效果考察。 优化并评价纳米复合物体内靶向效果及体内致病毒蛋白Aβ清除和Tau蛋白磷酸化抑制效果和机制。 “药物-载体”协同治疗策略通过同时靶向AD双致病诱因，有望阻断甚至逆转AD病程，为AD药物研发提供新策略，极具应用前景。
1.3K50编辑于 2022-08-15 - 来自专栏生命科学
MCE | HIV 衣壳蛋白有望成为 HIV 治疗新靶标
例如衣壳不仅充当保护屏障使病毒基因组免于被识别和降解，而且还能促进逆转录，与核孔复合体接触，并直接整合位点靶向。 靶向CA 的抑制剂靶向 CA 可以干扰 HIV-1 复制周期的早期和晚期步骤。近年来，越来越多抑制 CA 功能的小分子和基于肽的化合物被发现或开发。 靶向HIV-1 GagGag 蛋白是逆转录病毒编码的三种基因产物之一，HIV-1 的组装主要由 Gag 蛋白控制。 出芽后，Gag 被病毒蛋白酶切割，从而产生一系列较小的蛋白质 (MA、CA 和 NC) 和肽 (SP1、SP2 和 p6)。除了已经介绍的 CA 之外，Gag 的其他组分也与其功能密不可分。 HIV-1 Gag 的 p6 区域具有所谓的晚期结构域，招募病毒释放所需的细胞机制。
56830编辑于 2023-03-15 - 来自专栏DrugOne
Bioact. Mater. | 基于集成计算策略开发新型抗胞内菌感染药物
经过模型预测及理化性质限制，研究者快速锁定6个兼具穿膜特性、抗菌活性和生物相容性的候选肽（图2）。 2、跨尺度分子动力学模拟解析肽-膜相互作用 通过人工智能模型初步得到6条候选肽序列之后，研究者借助分子动力学模拟对候选肽和磷脂膜之间的相互作用进行系统性研究。 通过比较肽在细菌细胞膜体系（POPE/POPG）和哺乳动物细胞膜体系（POPC）中的行为差异分析其靶向性和作用机制。 为了更加精确量化6条候选肽的穿膜效率，研究者借助伞形采样方法对候选肽穿过宿主细胞膜过程的自由能分布进行计算，结果表明Crot-1具有最低的能垒24.3 kcal/mol。 这些跨尺度的模拟结果表明6条候选肽都倾向于与细菌细胞膜结合而对哺乳动物细胞膜无明显相互作用，在抗胞内菌感染方面具有巨大的应用潜力。
37510编辑于 2025-05-12 STTT | 从胰岛素到司美格鲁肽，读懂百年明星分子的现在与未来
不过，作为基于天然氨基酸的药物，多肽也有两大天生短板： 膜通透性差：多肽很难穿过细胞膜，因此约 90% 以上处于临床开发的多肽靶向的是细胞外靶点（如 GPCR、GnRH 受体、GLP-1 受体）； 体内稳定性差 心血管疾病：靶向 RAAS 与利钠肽 合成血管紧张素 II 于 2017 年获批，用于脓毒症 / 感染性休克的升压治疗； 利钠肽（ANP / BNP / CNP）是心血管稳态的关键调节因子。 肿瘤：诊疗一体化的新希望 多肽在肿瘤领域有四大应用方向：显像探针、偶联纳米材料、肽疫苗、靶向药物。 例如镥[Lu-177]氧奥曲肽用于神经内分泌肿瘤的诊断与治疗，多种靶向 PD-1 / PD-L1 的多肽正在研发。 图 4｜多肽在肿瘤治疗中的四大应用：(a) 候选肽筛选；(b) 显像与诊断；(c) 肽偶联纳米材料；(d) 肿瘤免疫与靶向治疗。
6200编辑于 2026-06-02- 来自专栏DrugOne
. | 挑战难成药蛋白，PepPrCLIP设计精准结合肽
设计结合剂以靶向难成药蛋白在药物研发中是一项重大挑战。在本研究中，作者提供了一个算法框架，用于设计短小、能与靶点结合的线性肽，仅需靶蛋白的氨基酸序列。 靶向蛋白降解已成为治疗疾病的一种有前途的替代方法，但主要依赖于小分子弹头结合并招募内源性E3泛素连接酶到靶点，因此仍然需要存在可接触的表面结合位点。 由于UltraID是一种高度结构化的新型蛋白，不存在于两种模型的训练集中，作者评估了PepPrCLIP和RFDiffusion生成靶向UltraID催化口袋的IP（抑制性肽）序列的能力，该催化口袋基于AlphaFold2 仅提供UltraID的靶序列并通过AlphaFold-Multimer确认其催化口袋靶向，作者使用PepPrCLIP生成了20个候选IP（IP_PpC_1至IP_PpC_20）。 相比之下，PepPrCLIP优先考虑多样化的序列，这些序列促进了与UltraID的强抑制性结合相互作用，这在靶向不同蛋白构象时可能进一步带来优势。
35300编辑于 2025-03-03 - 来自专栏DrugOne
ACS Fall 2025 |12个最新公布的临床候选药物
5、IID432（Novartis） Ph-1 | 靶向克氏锥虫的拓扑异构酶 II 抑制剂 基于 氰基三唑骨架，对 T. cruzi 高选择性。 6、ETN029（Mariana Oncology / Novartis） Ph-1 | 宏环肽放射配体（DLL3 靶点） 应用于小细胞肺癌与神经内分泌型前列腺癌。 9、FOG-001（Parabilis Medicines） Ph-1/2 | 稳定化 α-螺旋肽（Helicon™ 技术） 抑制 β-catenin/TCF4 相互作用，靶向 Wnt 通路。 11、MOMA-341（MOMA Therapeutics） Ph-1 | 共价 WRN 抑制剂 靶向 Cys727，利用合成致死机制，适用于 MSI-H/dMMR 肿瘤。 肽类与宏环分子 在放射配体和 PPI 靶向中展现潜力。 耐药克服与新型作用机制 成为焦点（如 FGFR2、WRN、PIP4K2C）。 传染病与炎症疾病 领域同样迎来小分子突破。
32910编辑于 2025-09-02 - 来自专栏生命科学
科研助攻 | 一文讲清：如何破解 PPI 靶点成药难题 | MedChemExpress (MCE)
随着相关研究的深入，热点 (Hot Spots) 的发现使有效靶向 PPI 成为可能。 基于结构设计的 PPI 抑制剂策略分为两种，第一种是基于界面热点结构设计小分子药物，第二种是拟肽设计，依靠计算机建模模拟 PPI 中关键肽的二级结构，根据关键肽形成的 α 螺旋结构设计肽/拟肽类化合物。 Chemical Society reviews vol. 44,22 (2015): 8238-59. [6] Xie, Xin et al. Signal transduction and targeted therapy vol. 8,1 335. 6 Sep. 2023.[7] Wu, Defa et al. Trends in biochemical sciences vol. 48,6 (2023): 539-552. [9] Villoutreix, Bruno O. et al.
45910编辑于 2024-06-27 IL-6IL-6R信号通路与细胞因子风暴：病理机制与靶向干预
临床观察发现，在这些重症病例中，白细胞介素-6水平的显著且持续升高是一个共同且关键的特征，提示IL-6信号通路在细胞因子风暴的发生与发展中可能扮演着核心驱动者的角色。 二、IL-6/IL-6R信号通路的双重作用与病理转化白细胞介素-6是一种具有多重生物学功能的关键细胞因子，其在生理和病理状态下的功能差异，主要取决于其通过哪种受体复合物传递信号。 2.反式信号：更为关键的是，IL-6可以与体液中广泛存在的可溶性IL-6受体结合，所形成的复合物能作用于几乎所有表达gp130的细胞（包括内皮细胞、上皮细胞等），从而极大地扩展了IL-6的作用范围。 三、靶向IL-6/IL-6R通路的治疗策略：从机制到临床鉴于IL-6在细胞因子风暴中的核心地位，阻断其信号通路成为干预过度炎症反应的重要治疗策略。靶向IL-6受体的人源化单克隆抗体应运而生。 基于坚实的临床证据，该靶向疗法已被全球多个权威治疗指南推荐，用于治疗存在过度炎症反应证据的重症患者。
21110编辑于 2026-01-20- 来自专栏DrugOne
. | 机制驱动AI新策略：设计专门攻击MRSA持留细胞的抗菌肽
单细胞微流控实验显示，该肽能够杀死指数生长期的持留细菌，证明机制型人工智能可用于开发针对耐药和持留菌的新型抗菌肽。 为解决这一问题，研究人员提出一种机制型人工智能策略，将机器学习模型与生物物理约束评分结合，通过同时考虑统计预测和膜作用机制，从而优先筛选具有真实膜破坏能力的抗菌肽，并专门用于靶向持留细胞和生物膜。 通过这一双重筛选流程，研究人员能够在大规模候选肽库中优先选择具有膜靶向活性并可能对持留菌有效的序列，并进一步通过体外实验、单细胞分析和动物模型验证其抗菌效果。 图4：WP-CAMPER1靶向细菌膜的结构与生物物理机制解析。 研究人员认为，膜靶向抗菌肽是一种有前景的抗感染策略，而将机器学习与机制约束结合，可以显著提升新型抗菌分子的发现效率。
19810编辑于 2026-03-25 Cell | PocketXMol：原子级统一建模重塑AI药物研发范式，并发现强效小分子和多肽抑制剂！
AlphaFold 3（已知口袋）；PoseBusters v2（308个复合物）中表现与AlphaFold 3相当（84.4%），且79.4%的构象同时满足“RMSD<2Å+PB-valid”，结构有效性突出（图6A-G 多肽的精准对接（13个测试样本中13个DockQ≥0.49）； 酶-底物识别：在卤化酶、糖基转移酶等4类酶家族中，对接置信度得分的AUROC均值达0.68，显著高于AlphaFold 3（0.56）（图6J 、6K），结合神经网络隐藏表征训练的逻辑回归模型后，AUROC进一步提升5.9%-51.9%； 虚拟筛选：在DEKOIS 2.0基准中，ROC_AUC中位数达0.787，与当KarmaDock（0.786 PD-L1靶向肽：高亲和力与体内肿瘤靶向性验证 PD-L1是免疫治疗的核心靶点，PocketXMol设计的10残基肽展现出优异的靶向性能： 结合亲和力：382个合成肽中，15个Kd达10⁻⁸M，76个达 ：P282肽能剂量依赖性抑制PD-1/PD-L1相互作用，为免疫治疗提供了新的肽类候选分子。
53420编辑于 2026-03-03- 来自专栏纳米药物前沿
程坤Sci Adv：杂合纳米复合物共同递送IKBKE siRNA和卡巴他赛可抑制三阴性乳腺癌的侵袭性和生长
在这里，密苏里大学堪萨斯城分校药学院程坤教授团队报道了一种混合纳米复合物，可将IKBKE siRNA和卡巴他赛共同递送至TNBC，以实现最佳的抗肿瘤作用，并用透明质酸修饰纳米复合物以靶向TNBC细胞上的 本文开发了一种HA修饰的基于肽的纳米复合物，将IKBKE siRNA和卡巴他赛共同包载以达到最佳的抗肿瘤效果。纳米复合物显示出更高的细胞摄取率，并且包裹的siRNA和卡巴他赛的肿瘤穿透性更好。 以siRNA靶向IKBKE是TNBC的潜在治疗策略。卡巴他赛在混合纳米复合物中的包裹也增强了IKBKE siRNA的活性。 基于肽的杂合纳米复合物为使用siRNA和化学治疗剂的联合疗法提供了一种新颖而通用的平台。 原文链接： https://advances.sciencemag.org/content/6/29/eabb0616
61010发布于 2021-02-04 - 来自专栏DrugScience
榕树集--利用机器学习在全球微生物组中发掘新型抗菌肽
亮点 使用ML对全球基因组进行预测，预测出大概100万种新的抗生素 在100个测试多肽中，79个体外实验验证有活性，63种靶向病原体 一些肽可能通过基因组碎裂从较长的序列中产生。 抗菌肽（Antimicrobial peptides ，AMPs) 抗菌肽（AMPs），也称为宿主防御肽（host defence peptides，HDPs），是所有生物类群中先天免疫反应的一部分。 原核和真核细胞之间的基础差异，可能成为抗菌肽的发挥作用的靶标。这些肽是强效的广谱抗菌剂，有潜力成为新型治疗药物。抗菌肽能杀死革兰氏阴性和阳性细菌、包膜病毒、真菌，甚至转化或癌变的细胞。 这些肽具有多种抗菌活性，从膜渗透到作用于各种细胞质目标。 Macrel 预测候选抗菌肽 AMPSphere使用机器学习（ML）模型Macrel来预测候选抗菌肽（c_AMPs）。 6,499个高质量AMP家族，包括海洋和土壤环境以及人类肠道。
1.1K10编辑于 2024-06-18 多肽与多肽的固相合成技术_MedChemExpress(MCE 中国)
近年来，科研工作者成功打造了一款针对肥胖的“神级装备”——司美格鲁肽，使“减肥”成为科研圈的现象级词条。 Section.02多肽的功能及其应用作为搭建多肽的“分子积木”，氨基酸种类、序列组合及修饰的多样性共同决定了多肽结构和功能的多样性，使其能执行信号转导与调控、免疫防御、酶催化、靶向识别运输等多种生理功能 药物与疫苗开发多肽可直接作为治疗性药物 (如胰岛素用于治疗糖尿病，司美格鲁肽被批准用于治疗 2 型糖尿病和肥胖)；也可作为靶向载体，辅助药物递送，例如 177Lu-dotatate (Lutathera ®)，其载体肽 Tyr3-octreotate 可将核素 177Lu 递送至表达生长抑素受体的肿瘤部位，实现靶向治疗。 多肽还可作为底物用于酶活研究，例如，MOCAc-PLGL(Dpa)AR 可作为荧光底物肽研究 MMP 的活性。
86110编辑于 2025-06-10
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