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Angew：靶向肿瘤和免疫细胞中GRPr的肽偶联的铱（III）复合物
胃泌素释放肽受体（GRPr）在生命系统中起着增生和炎性的作用。本文报道了一种高度选择性的GRPr拮抗剂（JMV594）-铱（III）络合物，用于探测活肿瘤细胞和免疫细胞中的GRPr。 这是第一个肽偶联的铱（III）复合物，被开发为GRPr生物成像探针和GRPr活性的调节剂。这种诊疗制剂在揭示GRPr在生命系统中的各种作用方面显示出巨大潜力。 总体而言，此工作为开发肽偶联的金属基探针提供了一种有效的方法，该探针不仅保留了金属化合物的优异光物理特性，而且还结合了肽的理想生化特性。
57310发布于 2021-02-04 - 来自专栏纳米药物前沿
氧化石墨烯-环R10肽核靶向纳米平台克服肿瘤多药耐药
在这项工作中，环状R10肽（cR10）与聚甘油覆盖的纳米氧化石墨烯缀合，该工程化纳米平台可克服肿瘤多药耐药性。 由cR10肽促进的纳米制剂的核靶向，以及随后的激光触发释放的阿霉素释放实现有效的抗癌活性，这在体外和体内实验中均得到证实。 合成的纳米平台具有多种不同特征的组合，包括主动核靶向，高负载能力，药物的受控释放和光热性质，为克服耐多药癌症提供了新的策略。 本文证明了通过聚甘油覆盖的石墨烯纳米片靶向细胞核可以在体内和体外成功克服肿瘤的多药耐药性。 这项工作介绍了一种新开发的环状肽的核靶向纳米药物，为克服肿瘤多药耐药打开了新的大门。
39620发布于 2021-02-04 - 来自专栏DrugOne
. | 跨物种线粒体靶向序列的生成式设计
然而，目前被系统表征的靶向肽数量有限，导致相关序列在工程应用中被反复使用。 在肽段长度分布上，人工MTS亦覆盖了训练数据的范围。 在二级结构方面，研究人员借助S4PRED模型预测α螺旋、β折叠与coil（无序结构）的比例。 采用Gibson组装法将这些MTS连接于GFP N端，同时构建以COX4的内源MTS为阳性对照。 共聚焦显微镜显示，GFP自身无法定位至线粒体，而COX4-GFP则能与线粒体染料MitoTracker重合。 随后，研究人员在潜在空间中进行线性插值，生成了62条假设具有双靶向能力的肽段。通过分析插值路径中肽段的特征变化，研究人员揭示了这类双靶向序列可能源自线粒体靶向肽的进化轨迹。
66810编辑于 2025-05-08 - 来自专栏纳米药物前沿
中国药科大学周建平/丁杨团队AS：仿生脂质纳米复合物组装体实现“药物-载体”协同清除Aβ和抑制Tau蛋白磷酸化治疗
以天然高密度脂蛋白活性组分载脂蛋白A-I（ApoA-I）和磷脂仿生组装Aβ高亲和纳米复合物，并荷载Tau蛋白磷酸化抑制剂亚甲蓝（MB）；为高效渗透入脑，经apoA-I模拟肽仿生锚定并优化靶向配体Ang密度 通过修饰不同密度的脑靶向肽Ang，在细胞和动物水平进行靶向效果比较和优化：纳米复合物APLN/MB的脑靶向效果与靶向肽Ang的修饰密度并非正相关，过高的优势密度可能会因位阻作用降低纳米复合物与靶向配体的相互作用 图3 靶向肽Ang密度优化及APLN/MB靶向效果考察。 以上述双病理AD小鼠为动物模型，通过水迷宫和筑巢行为学实验证实APLN/MB静脉注射给药可以显著改善小鼠的学习记忆能力和空间记忆能力的效果（图4）。 图4 APLN/MB治疗后行为学评价。 图5 体内Aβ清除和Tau蛋白磷酸化抑制考察。
1.3K50编辑于 2022-08-15 - 来自专栏DrugOne
. | 通过模拟结合界面实现精准肽分子设计
DRUGONE 肽类在靶向治疗中具有口服生物利用度、细胞通透性和高特异性等优势，使其区别于传统的小分子和生物制剂。 PepMimic 被应用于 PD-L1、CD38、BCMA、HER2 和 CD4 等药物靶点。 小鼠乳腺癌、骨髓瘤和肺癌模型中的注射实验验证了候选肽的膜结合效果，展示了其在临床诊断成像和靶向治疗中的潜力。 已知结合物的模拟实验 在 SPRi 实验中，研究人员测试了五个靶点（PD-L1、CD38、BCMA、HER2、CD4）的 384 条候选肽。 实验验证结果表明，该方法在多个肿瘤模型中展示了靶向成像和治疗的潜力。未来，PepMimic 不仅可用于药物开发，还可应用于基础研究中的蛋白互作机制解析和诊断工具开发。
40210编辑于 2025-10-14 - 来自专栏DrugOne
Briefings in Bioinformatics | 用于PPI抑制剂设计的深度分子生成模型
结果表明，生成的分子具有更好的PPI靶向药物相似性和药物相似性。生成的分子与 iPPI-DB 共享化学空间。探索了 PPI 抑制剂的基于肽和基于配体的分子生成。 基于肽的生成分子案例 为了评估基于肽生成的化合物是否可以成为有效的候选分子，研究人员选择了基于p53(肽)生成 MDM2-p53 靶标的潜在候选抑制剂。 此外，通过 QEPPI 值 > 0.5 和 SA 得分值 <4 过滤化合物后，有 44 种化合物被命中。 4 结论和未来工作 这项工作中，研究人员构建了一个 PPI 靶向药物相似性数据集，并开发了一种新的基于形状的分子生成框架，用于生成针对 PPI 的新型有效药物相似性分子。 研究人员探索了基于肽的 PPI 抑制剂设计和基于配体的 PPI 抑制剂设计。结果表明，生成的分子具有更好的 PPI 靶向药物相似性和药物相似性。
77050编辑于 2022-11-28 STTT | 从胰岛素到司美格鲁肽，读懂百年明星分子的现在与未来
心血管疾病：靶向 RAAS 与利钠肽 合成血管紧张素 II 于 2017 年获批，用于脓毒症 / 感染性休克的升压治疗； 利钠肽（ANP / BNP / CNP）是心血管稳态的关键调节因子。 肿瘤：诊疗一体化的新希望 多肽在肿瘤领域有四大应用方向：显像探针、偶联纳米材料、肽疫苗、靶向药物。 例如镥[Lu-177]氧奥曲肽用于神经内分泌肿瘤的诊断与治疗，多种靶向 PD-1 / PD-L1 的多肽正在研发。 图 4｜多肽在肿瘤治疗中的四大应用：(a) 候选肽筛选；(b) 显像与诊断；(c) 肽偶联纳米材料；(d) 肿瘤免疫与靶向治疗。 生长抑素受体 镓[⁶⁸Ga]依度曲肽（Edotreotide gallium Ga-68） 2019 诊断生长抑素受体阳性神经内分泌肿瘤 黑皮质素-4 受体 司美诺肽（Setmelanotide） 2020
6200编辑于 2026-06-02- 来自专栏DrugOne
. | 挑战难成药蛋白，PepPrCLIP设计精准结合肽
设计结合剂以靶向难成药蛋白在药物研发中是一项重大挑战。在本研究中，作者提供了一个算法框架，用于设计短小、能与靶点结合的线性肽，仅需靶蛋白的氨基酸序列。 靶向蛋白降解已成为治疗疾病的一种有前途的替代方法，但主要依赖于小分子弹头结合并招募内源性E3泛素连接酶到靶点，因此仍然需要存在可接触的表面结合位点。 由于UltraID是一种高度结构化的新型蛋白，不存在于两种模型的训练集中，作者评估了PepPrCLIP和RFDiffusion生成靶向UltraID催化口袋的IP（抑制性肽）序列的能力，该催化口袋基于AlphaFold2 在20个PepPrCLIP生成的IP中，19个显示成功的UltraID抑制，其中4个（IP_PpC_2、IP_PpC_8、IP_PpC_18和IP_PpC_19）表现出超过75%的抑制效率（图3C）。 Science Advances, 11(4), eadr8638.
35300编辑于 2025-03-03 - 来自专栏纳米药物前沿
上海大学王艳丽Small Methods：一种通过细胞核靶向和线粒体介导的凋亡途径治疗肿瘤的高效碳基药物递送系统
据报道，负载DOX的CBNs可用于靶向肿瘤细胞核，但为了提高药物靶向率，通常需要修饰活性靶向配体，如抗体、叶酸和肽（RGD和核靶向肽）等，这些活性靶向配体在提高药物靶向性的同时也存在潜在的缺点，如抗体成本高 、肿瘤穿透率低（因其体积大）、适体稳定性低（因血浆中的核酸酶）以及肽的循环半衰期低（因血浆中的肽酶）等问题。 此外，修饰的靶向配体也使得合成过程繁琐且难以操作。 上海大学王艳丽教授课题组在之前的工作中通过改进的碱基介导的水热分子融合合成了一种新型石墨烯基肿瘤细胞核靶向荧光纳米探针，该探针具有肿瘤细胞靶向性的特点，是一种CBN。 结果表明，CPD在肿瘤细胞核中的DOX靶向率高达36.78 %，在肿瘤组织中的ID/g百分比高达30.09 %，肿瘤生长抑制率高达79.42±2.83 %，大大降低了DOX的全身副作用。
1K00编辑于 2022-08-15 - 来自专栏生命科学
靶向甲状腺癌治疗的4种小分子药物 | MedChemExpress
由于化疗对于甲状腺癌的治疗作用不佳，分子靶向治疗现已成为甲状腺癌治疗中最令人关注的领域。 目前 FDA 已经批注了四种用于甲状腺癌治疗的靶向治疗药物,包括卡博替尼，乐伐替尼，索拉非尼以及凡德替尼。 2017年，多激酶抑制剂索拉非尼（Sorafenib）成为被 CFDA 批准，也是截止目前，仅一个用于放射性碘难治性分化型甲状腺癌的靶向药物。 Inhibiting TRK Proteins in Clinical CancerTherapy.Cancers (Basel). 2018 Apr 4;10(4). pii: E105.MCE 新品推荐
34830编辑于 2023-02-07 - 来自专栏DrugAI
Science | 靶向无序蛋白的新一代结合蛋白设计
DRUGONE 无结构蛋白质和肽在生物过程中发挥关键作用，但由于其缺乏明确定义的结构且具有高度可变的序列和构象特性，因此难以被传统方法靶向。 X射线晶体学结果显示设计结构与实际结构高度一致，NMR实验也证实靶肽在游离状态下为无序状态，在结合后被诱导形成有序结构。这说明设计策略能将无序肽诱导至结合构象。 疾病靶点识别：用于识别突变型肽段（如CTN4），在临床质谱检测中具有潜力。 肿瘤细胞标记：结合MSLN的设计子能特异性标记表达该受体的细胞，表现出良好的肿瘤靶向潜力。 讨论 研究人员提出，靶向无结构蛋白实际上比靶向折叠结构更具优势，因为其构象异质性使其能被诱导至有利的结合状态。 其框架还可推广至： 靶向多种肿瘤相关受体的无结构区域； 检测神经肽、非典型开放阅读框编码蛋白； 通过设计双特异性结合子，提高结合特异性与亲和力； 融入催化功能，实现结合与功能调控的一体化； 探索翻译后修饰靶标
21520编辑于 2026-01-06 - 来自专栏DrugOne
. | 机制驱动AI新策略：设计专门攻击MRSA持留细胞的抗菌肽
单细胞微流控实验显示，该肽能够杀死指数生长期的持留细菌，证明机制型人工智能可用于开发针对耐药和持留菌的新型抗菌肽。 为解决这一问题，研究人员提出一种机制型人工智能策略，将机器学习模型与生物物理约束评分结合，通过同时考虑统计预测和膜作用机制，从而优先筛选具有真实膜破坏能力的抗菌肽，并专门用于靶向持留细胞和生物膜。 通过这一双重筛选流程，研究人员能够在大规模候选肽库中优先选择具有膜靶向活性并可能对持留菌有效的序列，并进一步通过体外实验、单细胞分析和动物模型验证其抗菌效果。 图4：WP-CAMPER1靶向细菌膜的结构与生物物理机制解析。 研究人员认为，膜靶向抗菌肽是一种有前景的抗感染策略，而将机器学习与机制约束结合，可以显著提升新型抗菌分子的发现效率。
19910编辑于 2026-03-25 多肽与多肽的固相合成技术_MedChemExpress(MCE 中国)
Section.02多肽的功能及其应用作为搭建多肽的“分子积木”，氨基酸种类、序列组合及修饰的多样性共同决定了多肽结构和功能的多样性，使其能执行信号转导与调控、免疫防御、酶催化、靶向识别运输等多种生理功能 药物与疫苗开发多肽可直接作为治疗性药物 (如胰岛素用于治疗糖尿病，司美格鲁肽被批准用于治疗 2 型糖尿病和肥胖)；也可作为靶向载体，辅助药物递送，例如 177Lu-dotatate (Lutathera ®)，其载体肽 Tyr3-octreotate 可将核素 177Lu 递送至表达生长抑素受体的肿瘤部位，实现靶向治疗。 典型的多肽固相合成一般包含以下步骤 (图 2)4：1）氨基酸耦合：选择合适的树脂，将被保护基团保护的氨基酸与树脂结合；2）脱保护：去除氨基酸的保护基团，暴露活性氨基；3）活化与缩合：活化下一个氨基酸的羧基 ，与已固定在树脂上的氨基酸的氨基偶联形成肽键，并用溶剂清洗新生的肽-树脂复合物，去除未反应的物质，在此过程中氨基酸的侧链应被保护；4）循环：重复进行脱保护、活化与缩合步骤，直至合成目标肽链；5）切割与去保护
86110编辑于 2025-06-10- 来自专栏DrugOne
ACS Fall 2025 |12个最新公布的临床候选药物
5、IID432（Novartis） Ph-1 | 靶向克氏锥虫的拓扑异构酶 II 抑制剂 基于 氰基三唑骨架，对 T. cruzi 高选择性。 7、GS-1427（Gilead Sciences） Ph-2 | 口服 α4β7 整合素抑制剂 高选择性，避免 α4β1 相关副作用。 在炎症性肠病模型中疗效可比肩抗体药物。 9、FOG-001（Parabilis Medicines） Ph-1/2 | 稳定化 α-螺旋肽（Helicon™ 技术） 抑制 β-catenin/TCF4 相互作用，靶向 Wnt 通路。 11、MOMA-341（MOMA Therapeutics） Ph-1 | 共价 WRN 抑制剂 靶向 Cys727，利用合成致死机制，适用于 MSI-H/dMMR 肿瘤。 肽类与宏环分子 在放射配体和 PPI 靶向中展现潜力。 耐药克服与新型作用机制 成为焦点（如 FGFR2、WRN、PIP4K2C）。 传染病与炎症疾病 领域同样迎来小分子突破。
32910编辑于 2025-09-02 靶向KRAS G12V突变的新型TCR疗法进展及蛋白降解策略展望
1.TCR发现与功能验证：研究人员利用HLA-A*11:01转基因小鼠进行免疫，鉴定出两种能够特异性识别由该HLA分子呈递的9氨基酸KRASG12V突变肽的TCR。 3.结构生物学洞察：通过解析TCR-肽段-HLA三元复合物的晶体结构，研究揭示了G12V突变肽段独特的呈递构象，并明确了TCR通过其互补决定区与突变残基（缬氨酸）形成特异性相互作用的结构基础，这为理解免疫系统精确识别 此项研究证实了针对共享KRASG12V突变开发"现成"TCR-T细胞疗法的潜在可行性，为克服该突变亚型的靶向治疗困境提供了新的免疫学方案。 1.作用机制：该试剂盒包含的双功能分子能够一端选择性结合KRASG12V突变蛋白，另一端高效招募E3泛素连接酶CRL4^CRBN。 通过该工具，可系统评估蛋白降解对下游信号通路、细胞功能及肿瘤生长的影响，加速下一代靶向药物的发现。四、结论与展望KRASG12V突变作为重要的致癌驱动因素，其靶向治疗正处于多技术路径并行的突破前夜。
40210编辑于 2026-01-23- 来自专栏生命科学
高通道筛选出的小分子 应用到伊蚊“控制”| MedChemExpress
为了验证人类 NPY Y2 靶向药物是否在蚊子中同样也靶向调节 NPY 受体，研究者克隆了 49 个埃及伊蚊神经肽受体，并通过细胞实验去探究上述药物对蚊子受体的调节作用。 实验结果发现，TM30335 可以激活蚊子受体NPYLR7，而 BIIE0246 也靶向调节该受体（Figure 4.）。 相关产品： BIIE-0246 BIIE-0246 是一种有效的、非肽神经肽 Y (NPY) Y2 受体的高度选择性拮抗剂，其 IC50 值为 15 nM。 Velneperit Velneperit (S-2367) 是一种新型神经肽Y (NPY) Y5 受体拮抗剂。 Pancreatic Polypeptide, human：是一种 C-末端酰胺化的含 36 个氨基酸的多肽，用作神经肽 Y (NPY) Y4/Y5 受体激动剂。
35720编辑于 2023-02-20 - 来自专栏生命科学
MCE | HIV 衣壳蛋白有望成为 HIV 治疗新靶标
例如衣壳不仅充当保护屏障使病毒基因组免于被识别和降解，而且还能促进逆转录，与核孔复合体接触，并直接整合位点靶向。 靶向CA 的抑制剂靶向 CA 可以干扰 HIV-1 复制周期的早期和晚期步骤。近年来，越来越多抑制 CA 功能的小分子和基于肽的化合物被发现或开发。 靶向HIV-1 GagGag 蛋白是逆转录病毒编码的三种基因产物之一，HIV-1 的组装主要由 Gag 蛋白控制。 出芽后，Gag 被病毒蛋白酶切割，从而产生一系列较小的蛋白质 (MA、CA 和 NC) 和肽 (SP1、SP2 和 p6)。除了已经介绍的 CA 之外，Gag 的其他组分也与其功能密不可分。 HIV 靶点抑制剂及其作用机制Peptide T源自 HIV-1 gp120 的 V2 区的八肽，是 CD4 受体的配体，可阻止 HIV 与 CD4 受体结合Plerixafor选择性的 CXCR4 拮抗剂
56830编辑于 2023-03-15 - 来自专栏DrugOne
Bioact. Mater. | 基于集成计算策略开发新型抗胞内菌感染药物
通过比较肽在细菌细胞膜体系（POPE/POPG）和哺乳动物细胞膜体系（POPC）中的行为差异分析其靶向性和作用机制。 靶向性是确保药物高效清除胞内菌而无细胞毒性的关键因素。 主要器官病理学分析和体重统计结果表明Crot-1具有良好的生物相容性（图4）。这些体内和体外实验结果表明，Crot-1可以有效地消除细胞内细菌，同时对宿主细胞无明显毒性。 基于跨尺度分子动力学模拟构建肽-膜相互作用综合评价体系，从原子层面解析候选分子的靶向性与作用机制。随后，制定系统的实验方案对于目标分子的生物活性进行全面验证。 图4. Crot-1抗菌活性和生物相容性的体内评估。（A）Crot-1清除小鼠皮下感染模型中细胞内MRSA的示意图。（B）感染部位记录。（C）感染部位分离菌落平板涂布结果。
37510编辑于 2025-05-12 - 来自专栏智能生信
BMC Bioinf｜基于双向LSTM和Multi-head Attention的HLA与肽的结合预测
在HLA分子与肽的结合预测任务中，基于深度学习的预测模型虽然表现出较好的性能，但许多依赖于特定类型的HLA分子或特定的肽表位长度，且对数据量依赖较大，这导致数据量较少的HLA-C类分子和长肽表位的预测性能相对不佳 一、研究背景 1.1 背景 近年来，基于特异性T细胞的免疫治疗不断发展，取得了较好的成果，而靶向识别是免疫治疗过程的重要一环。对于靶向识别而言，准确预测HLA与肽的结合是其中的关键。 然而，许多模型都依赖于特定类型的HLA分子或特定的肽表位长度，且深度模型对数据量依赖较大，这导致数据量较少的HLA-C类分子和长肽表位的预测性能相对不佳。 3.3 模型对HLA-C类分子的预测性能提升较大 实验表明，模型对HLA-C类分子的预测性能提升较大，如图4。 ? 图4. HLA分子结合的模式特征刻画 四、总结 本文基于双向LSTM和Multi-head Attention提出了MATHLA预测模型，在HLA分子与肽结合预测任务上表现出了很好的性能，并对HLA-C类分子和长肽表位有十分明显的性能提升
1K20发布于 2021-04-13 - 来自专栏生命科学
科研助攻 | 一文讲清：如何破解 PPI 靶点成药难题 | MedChemExpress (MCE)
随着相关研究的深入，热点 (Hot Spots) 的发现使有效靶向 PPI 成为可能。 这些热点有助于保持 PPI 的稳定性，是两个蛋白发生相互作用的关键[4]。因此，虽然 PPI 界面面积大，但小分子药物只需作用于热点，就能影响调控 PPI 的稳定性。 基于结构设计的 PPI 抑制剂策略分为两种，第一种是基于界面热点结构设计小分子药物，第二种是拟肽设计，依靠计算机建模模拟 PPI 中关键肽的二级结构，根据关键肽形成的 α 螺旋结构设计肽/拟肽类化合物。 图 4. 小分子 PPI 抑制剂的开发方法[5]。 Proteins vol. 68,4 (2007): 803-12. [4] Cukuroglu, Engin et al.
45910编辑于 2024-06-27
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