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Angew：靶向肿瘤和免疫细胞中GRPr的肽偶联的铱（III）复合物
胃泌素释放肽受体（GRPr）在生命系统中起着增生和炎性的作用。本文报道了一种高度选择性的GRPr拮抗剂（JMV594）-铱（III）络合物，用于探测活肿瘤细胞和免疫细胞中的GRPr。 这是第一个肽偶联的铱（III）复合物，被开发为GRPr生物成像探针和GRPr活性的调节剂。这种诊疗制剂在揭示GRPr在生命系统中的各种作用方面显示出巨大潜力。 总体而言，此工作为开发肽偶联的金属基探针提供了一种有效的方法，该探针不仅保留了金属化合物的优异光物理特性，而且还结合了肽的理想生化特性。
57310发布于 2021-02-04 - 来自专栏纳米药物前沿
氧化石墨烯-环R10肽核靶向纳米平台克服肿瘤多药耐药
在这项工作中，环状R10肽（cR10）与聚甘油覆盖的纳米氧化石墨烯缀合，该工程化纳米平台可克服肿瘤多药耐药性。 由cR10肽促进的纳米制剂的核靶向，以及随后的激光触发释放的阿霉素释放实现有效的抗癌活性，这在体外和体内实验中均得到证实。 合成的纳米平台具有多种不同特征的组合，包括主动核靶向，高负载能力，药物的受控释放和光热性质，为克服耐多药癌症提供了新的策略。 本文证明了通过聚甘油覆盖的石墨烯纳米片靶向细胞核可以在体内和体外成功克服肿瘤的多药耐药性。 这项工作介绍了一种新开发的环状肽的核靶向纳米药物，为克服肿瘤多药耐药打开了新的大门。
39620发布于 2021-02-04 - 来自专栏生命科学
科研助攻 | 一文讲清：如何破解 PPI 靶点成药难题 | MedChemExpress (MCE)
随着相关研究的深入，热点 (Hot Spots) 的发现使有效靶向 PPI 成为可能。 注意：丙氨酸扫描法鉴定热点是基于各个残基与靶标蛋白的结合能确定的，但并不意味这些残基就是药物设计中的有效靶向位点，需要具备一些能够与配体结合的结构特征才能被确定为有效结合位点。 ▐ 基于结构的药物设计基于结构的设计 (Structure-based design) 主要从蛋白复合物的结构出发，需要对靶标蛋白复合物的相互作用表面进行分析，然后设计出靶向抑制剂。 基于结构设计的 PPI 抑制剂策略分为两种，第一种是基于界面热点结构设计小分子药物，第二种是拟肽设计，依靠计算机建模模拟 PPI 中关键肽的二级结构，根据关键肽形成的 α 螺旋结构设计肽/拟肽类化合物。 Progress in biophysics and molecular biology vol. 116,2-3 (2014): 165-73. [5] Sheng, Chunquan et al.
45910编辑于 2024-06-27 - 来自专栏DrugOne
. | 跨物种线粒体靶向序列的生成式设计
因此，提升线粒体靶向能力对于核酸酶和药物分子的高效递送也具有重要意义。 要将蛋白质定向至线粒体，需在核编码蛋白的N端添加一段靶向肽。 然而，目前被系统表征的靶向肽数量有限，导致相关序列在工程应用中被反复使用。 结果 构建用于人工线粒体靶向序列设计的变分自编码器 线粒体靶向序列（MTSs）是一类带正电荷的肽段，具有形成两性α螺旋的倾向。 此外，双靶向肽的C末端保留了RR、R-2或R-3剪切位点模体，提示其具备在线粒体内被正确剪切的潜力。综合分析支持双靶向序列可能是由线粒体靶向序列进化而来。 随后，研究人员在潜在空间中进行线性插值，生成了62条假设具有双靶向能力的肽段。通过分析插值路径中肽段的特征变化，研究人员揭示了这类双靶向序列可能源自线粒体靶向肽的进化轨迹。
66810编辑于 2025-05-08 - 来自专栏纳米药物前沿
上海大学王艳丽Small Methods：一种通过细胞核靶向和线粒体介导的凋亡途径治疗肿瘤的高效碳基药物递送系统
据报道，负载DOX的CBNs可用于靶向肿瘤细胞核，但为了提高药物靶向率，通常需要修饰活性靶向配体，如抗体、叶酸和肽（RGD和核靶向肽）等，这些活性靶向配体在提高药物靶向性的同时也存在潜在的缺点，如抗体成本高 、肿瘤穿透率低（因其体积大）、适体稳定性低（因血浆中的核酸酶）以及肽的循环半衰期低（因血浆中的肽酶）等问题。 此外，修饰的靶向配体也使得合成过程繁琐且难以操作。 上海大学王艳丽教授课题组在之前的工作中通过改进的碱基介导的水热分子融合合成了一种新型石墨烯基肿瘤细胞核靶向荧光纳米探针，该探针具有肿瘤细胞靶向性的特点，是一种CBN。 结果表明，CPD在肿瘤细胞核中的DOX靶向率高达36.78 %，在肿瘤组织中的ID/g百分比高达30.09 %，肿瘤生长抑制率高达79.42±2.83 %，大大降低了DOX的全身副作用。
1K00编辑于 2022-08-15 - 来自专栏纳米药物前沿
中国药科大学周建平/丁杨团队AS：仿生脂质纳米复合物组装体实现“药物-载体”协同清除Aβ和抑制Tau蛋白磷酸化治疗
以天然高密度脂蛋白活性组分载脂蛋白A-I（ApoA-I）和磷脂仿生组装Aβ高亲和纳米复合物，并荷载Tau蛋白磷酸化抑制剂亚甲蓝（MB）；为高效渗透入脑，经apoA-I模拟肽仿生锚定并优化靶向配体Ang密度 通过修饰不同密度的脑靶向肽Ang，在细胞和动物水平进行靶向效果比较和优化：纳米复合物APLN/MB的脑靶向效果与靶向肽Ang的修饰密度并非正相关，过高的优势密度可能会因位阻作用降低纳米复合物与靶向配体的相互作用 图3 靶向肽Ang密度优化及APLN/MB靶向效果考察。 优化并评价纳米复合物体内靶向效果及体内致病毒蛋白Aβ清除和Tau蛋白磷酸化抑制效果和机制。 “药物-载体”协同治疗策略通过同时靶向AD双致病诱因，有望阻断甚至逆转AD病程，为AD药物研发提供新策略，极具应用前景。
1.3K50编辑于 2022-08-15 - 来自专栏DrugOne
. | 通过模拟结合界面实现精准肽分子设计
DRUGONE 肽类在靶向治疗中具有口服生物利用度、细胞通透性和高特异性等优势，使其区别于传统的小分子和生物制剂。 研究人员开发了一种人工智能算法 PepMimic，能够将已知受体或抗体转化为短肽结合剂，通过模拟已知结合界面生成候选肽。 表面等离子共振成像显示约 8% 的肽分子具有 10⁻⁸ M 级别的亲和力，26 条肽的 KD 值低至 10⁻⁹ M，明显优于随机文库筛选。 小鼠乳腺癌、骨髓瘤和肺癌模型中的注射实验验证了候选肽的膜结合效果，展示了其在临床诊断成像和靶向治疗中的潜力。 实验验证结果表明，该方法在多个肿瘤模型中展示了靶向成像和治疗的潜力。未来，PepMimic 不仅可用于药物开发，还可应用于基础研究中的蛋白互作机制解析和诊断工具开发。
40210编辑于 2025-10-14 - 来自专栏AI机器学习与深度学习算法
学习分类 2-3 感知机
要如何求出权重向量呢？基本做法和回归时相同，将权重向量用作参数，创建更新表达式来更新参数。这就需要一个被称为感知机的模型。
65610编辑于 2022-11-08 STTT | 从胰岛素到司美格鲁肽，读懂百年明星分子的现在与未来
不过，作为基于天然氨基酸的药物，多肽也有两大天生短板： 膜通透性差：多肽很难穿过细胞膜，因此约 90% 以上处于临床开发的多肽靶向的是细胞外靶点（如 GPCR、GnRH 受体、GLP-1 受体）； 体内稳定性差 心血管疾病：靶向 RAAS 与利钠肽 合成血管紧张素 II 于 2017 年获批，用于脓毒症 / 感染性休克的升压治疗； 利钠肽（ANP / BNP / CNP）是心血管稳态的关键调节因子。 肿瘤：诊疗一体化的新希望 多肽在肿瘤领域有四大应用方向：显像探针、偶联纳米材料、肽疫苗、靶向药物。 例如镥[Lu-177]氧奥曲肽用于神经内分泌肿瘤的诊断与治疗，多种靶向 PD-1 / PD-L1 的多肽正在研发。 图 4｜多肽在肿瘤治疗中的四大应用：(a) 候选肽筛选；(b) 显像与诊断；(c) 肽偶联纳米材料；(d) 肿瘤免疫与靶向治疗。
6500编辑于 2026-06-02- 来自专栏DrugOne
Briefings in Bioinformatics | 用于PPI抑制剂设计的深度分子生成模型
首次将针对PPI的抑制剂的定量类药性指标QEPPI用于PPI靶向化合物的分子生成模型的评估。结果表明生成的分子具有较好的PPI靶向药物的类药性。 结果表明，生成的分子具有更好的PPI靶向药物相似性和药物相似性。生成的分子与 iPPI-DB 共享化学空间。探索了 PPI 抑制剂的基于肽和基于配体的分子生成。 基于肽的生成分子案例 为了评估基于肽生成的化合物是否可以成为有效的候选分子，研究人员选择了基于p53(肽)生成 MDM2-p53 靶标的潜在候选抑制剂。 该方法依赖于分子或肽作为种子分子生成多样性的PPI类药性化合物库。目前是第一次将深度分子生成模型应用于 PPI 抑制剂的从头设计。 研究人员探索了基于肽的 PPI 抑制剂设计和基于配体的 PPI 抑制剂设计。结果表明，生成的分子具有更好的 PPI 靶向药物相似性和药物相似性。
77150编辑于 2022-11-28 - 来自专栏DrugOne
. | 挑战难成药蛋白，PepPrCLIP设计精准结合肽
设计结合剂以靶向难成药蛋白在药物研发中是一项重大挑战。在本研究中，作者提供了一个算法框架，用于设计短小、能与靶点结合的线性肽，仅需靶蛋白的氨基酸序列。 靶向蛋白降解已成为治疗疾病的一种有前途的替代方法，但主要依赖于小分子弹头结合并招募内源性E3泛素连接酶到靶点，因此仍然需要存在可接触的表面结合位点。 由于UltraID是一种高度结构化的新型蛋白，不存在于两种模型的训练集中，作者评估了PepPrCLIP和RFDiffusion生成靶向UltraID催化口袋的IP（抑制性肽）序列的能力，该催化口袋基于AlphaFold2 仅提供UltraID的靶序列并通过AlphaFold-Multimer确认其催化口袋靶向，作者使用PepPrCLIP生成了20个候选IP（IP_PpC_1至IP_PpC_20）。 相比之下，PepPrCLIP优先考虑多样化的序列，这些序列促进了与UltraID的强抑制性结合相互作用，这在靶向不同蛋白构象时可能进一步带来优势。
35300编辑于 2025-03-03 - 来自专栏算法无遗策
动画 | 什么是2-3树？
2-3树正是一种绝对平衡的树，任意节点到它所有的叶子节点的深度都是相等的。 2-3树的数字代表一个节点有2到3个子树。它也满足二分搜索树的基本性质，但它不属于二分搜索树。 2-3树查找元素 2-3树的查找类似二分搜索树的查找，根据元素的大小来决定查找的方向。 动画：2-3树插入 2-3树删除元素 2-3树删除元素相对比较复杂，删除元素也和插入元素一样先进行命中查找，查找成功才进行删除操作。 2-3树为满二叉树时，删除叶子节点 2-3树满二叉树的情况下，删除叶子节点是比较简单的。 动画：2-3树删除 -----END---
1.1K10发布于 2020-01-02 - 来自专栏DrugAI
Science | 靶向无序蛋白的新一代结合蛋白设计
DRUGONE 无结构蛋白质和肽在生物过程中发挥关键作用，但由于其缺乏明确定义的结构且具有高度可变的序列和构象特性，因此难以被传统方法靶向。 X射线晶体学结果显示设计结构与实际结构高度一致，NMR实验也证实靶肽在游离状态下为无序状态，在结合后被诱导形成有序结构。这说明设计策略能将无序肽诱导至结合构象。 疾病靶点识别：用于识别突变型肽段（如CTN4），在临床质谱检测中具有潜力。 肿瘤细胞标记：结合MSLN的设计子能特异性标记表达该受体的细胞，表现出良好的肿瘤靶向潜力。 讨论 研究人员提出，靶向无结构蛋白实际上比靶向折叠结构更具优势，因为其构象异质性使其能被诱导至有利的结合状态。 其框架还可推广至： 靶向多种肿瘤相关受体的无结构区域； 检测神经肽、非典型开放阅读框编码蛋白； 通过设计双特异性结合子，提高结合特异性与亲和力； 融入催化功能，实现结合与功能调控的一体化； 探索翻译后修饰靶标
21520编辑于 2026-01-06 - 来自专栏DrugOne
. | 机制驱动AI新策略：设计专门攻击MRSA持留细胞的抗菌肽
单细胞微流控实验显示，该肽能够杀死指数生长期的持留细菌，证明机制型人工智能可用于开发针对耐药和持留菌的新型抗菌肽。 为解决这一问题，研究人员提出一种机制型人工智能策略，将机器学习模型与生物物理约束评分结合，通过同时考虑统计预测和膜作用机制，从而优先筛选具有真实膜破坏能力的抗菌肽，并专门用于靶向持留细胞和生物膜。 通过这一双重筛选流程，研究人员能够在大规模候选肽库中优先选择具有膜靶向活性并可能对持留菌有效的序列，并进一步通过体外实验、单细胞分析和动物模型验证其抗菌效果。 图4：WP-CAMPER1靶向细菌膜的结构与生物物理机制解析。 研究人员认为，膜靶向抗菌肽是一种有前景的抗感染策略，而将机器学习与机制约束结合，可以显著提升新型抗菌分子的发现效率。
19910编辑于 2026-03-25 多肽与多肽的固相合成技术_MedChemExpress(MCE 中国)
近年来，科研工作者成功打造了一款针对肥胖的“神级装备”——司美格鲁肽，使“减肥”成为科研圈的现象级词条。 Section.02多肽的功能及其应用作为搭建多肽的“分子积木”，氨基酸种类、序列组合及修饰的多样性共同决定了多肽结构和功能的多样性，使其能执行信号转导与调控、免疫防御、酶催化、靶向识别运输等多种生理功能 药物与疫苗开发多肽可直接作为治疗性药物 (如胰岛素用于治疗糖尿病，司美格鲁肽被批准用于治疗 2 型糖尿病和肥胖)；也可作为靶向载体，辅助药物递送，例如 177Lu-dotatate (Lutathera ®)，其载体肽 Tyr3-octreotate 可将核素 177Lu 递送至表达生长抑素受体的肿瘤部位，实现靶向治疗。 多肽还可作为底物用于酶活研究，例如，MOCAc-PLGL(Dpa)AR 可作为荧光底物肽研究 MMP 的活性。
86110编辑于 2025-06-10靶向KRAS G12V突变的新型TCR疗法进展及蛋白降解策略展望
近期，中国科学院大学团队在《NatureCommunications》上发表的研究，揭示了通过T细胞受体疗法靶向KRASG12V突变新抗原的可行性。 1.TCR发现与功能验证：研究人员利用HLA-A*11:01转基因小鼠进行免疫，鉴定出两种能够特异性识别由该HLA分子呈递的9氨基酸KRASG12V突变肽的TCR。 3.结构生物学洞察：通过解析TCR-肽段-HLA三元复合物的晶体结构，研究揭示了G12V突变肽段独特的呈递构象，并明确了TCR通过其互补决定区与突变残基（缬氨酸）形成特异性相互作用的结构基础，这为理解免疫系统精确识别 此项研究证实了针对共享KRASG12V突变开发"现成"TCR-T细胞疗法的潜在可行性，为克服该突变亚型的靶向治疗困境提供了新的免疫学方案。 通过该工具，可系统评估蛋白降解对下游信号通路、细胞功能及肿瘤生长的影响，加速下一代靶向药物的发现。四、结论与展望KRASG12V突变作为重要的致癌驱动因素，其靶向治疗正处于多技术路径并行的突破前夜。
40210编辑于 2026-01-23- 来自专栏我是攻城师
什么是2-3树
2-3树 VS 二叉搜索树 同样的一组数据，在2-3树和二叉搜索树里面的对比如下： ? 可以看到2-3树的节点分布非常均匀，且叶子节点的高度一致，并且如果这里即使是AVL树，那么树的高度也比2-3树高，而高度的降低则可以提升增删改的效率。 2-3树的插入 为了保持平衡性，2-3树的插入如果破坏了平衡性，那么树本身会产生分裂和合并，然后调整结构以维持平衡性，这一点和AVL树为了保持平衡而产生的节点旋转的作用一样，2-3树的插入分裂有几种情况如下 2-3树的删除 2-3树节点的删除也会破坏平衡性，同样树本身也会产生分裂和合并，如下： ? 总结 本篇文章，主要介绍了2-3树相关的知识，2-3树，2-3-4树以及B树都不是二叉树，但与二叉树的大致特点是类似的，它们是一种平衡的多路查找树，节点的孩子个数可以允许多于2个，虽然高度降低了，但编码相对复杂
2.4K20发布于 2019-04-28 - 来自专栏生命科学
攻克 "不可成药" 研发策略有哪些？ ｜ MedChemExpress (MCE)
除了基于泛素‑蛋白酶体系统开发的双功能分子，溶酶体靶向嵌合体 (LYTAC)、自噬靶向嵌合体 (AUTAC) 及 ATTEC 则是通过溶酶体途径实现对靶蛋白的降解。 目前开发的大多数靶向蛋白的调节剂，无论是激动剂、拮抗剂还是抑制剂，绝大多数都属于正构类型 (Orthosteric) 的药物分子，即药物直接靶向受体的内源性分子结合点。 为了改善多肽的稳定性，药物研发人员也会采用环肽或拟肽来改善多肽药物的成药性。 近年来，“热点”位点的发现使得开发靶向 PPIs 药物变得更加有效。热点残基是指在蛋白质之间形成结合位点的 PPIs 界面，可以通过识别热点来设计靶向 PPIs 界面的药物[5]。 Prog Biophys Mol Biol. 2014 Nov-Dec;116(2-3):165-73.[6] Hu B,et al.
38200编辑于 2024-05-16 - 来自专栏刷题笔记
2-3 链表拼接 (20 分)
本文链接：https://blog.csdn.net/shiliang97/article/details/101050371 2-3 链表拼接 (20 分) 本题要求实现一个合并两个有序链表的简单函数
71540发布于 2019-11-08 - 来自专栏DrugOne
Bioact. Mater. | 基于集成计算策略开发新型抗胞内菌感染药物
通过以下规则确定候选肽序列：a）AMP_model预测为抗菌肽概率大于0.9；b）Hemolysis_model预测结果为非溶血肽；c）肽序列长度小于10个氨基酸。 2、跨尺度分子动力学模拟解析肽-膜相互作用 通过人工智能模型初步得到6条候选肽序列之后，研究者借助分子动力学模拟对候选肽和磷脂膜之间的相互作用进行系统性研究。 通过比较肽在细菌细胞膜体系（POPE/POPG）和哺乳动物细胞膜体系（POPC）中的行为差异分析其靶向性和作用机制。 靶向性是确保药物高效清除胞内菌而无细胞毒性的关键因素。 基于跨尺度分子动力学模拟构建肽-膜相互作用综合评价体系，从原子层面解析候选分子的靶向性与作用机制。随后，制定系统的实验方案对于目标分子的生物活性进行全面验证。
37510编辑于 2025-05-12
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