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人脐带间充质干细胞的异质性研究
文章信息 今天介绍的是关于人脐带间充质干细胞单细胞转录组文章，探索人脐带间充质干细胞的异质性，文章2019年5月发表于Cell Death and Diseas。 摘要 间充质干细胞（MSC）是一群多能细胞，具有通过调节再生和炎症优异的促进组织修复能力。MSCs在疾病治疗中的疗效依赖于产生的同源性细胞群体的相对数量。 背景 间充质干细胞（MSCs）是由俄罗斯科学家Alexander Friedenstein在20世纪60年代后期从骨髓（BM）中发现的多能细胞，他观察到骨髓是生物体出生后间充质组织的干细胞库。 p2，huc2_p5，huc1_p5）几个亚群 ? 在用IFNγ和TNFα刺激后，分析了159个UC-MSCs细胞huc1_sti_p5，huc2_sti_p2和huc2_sti_p5）(Figs 1 and 2)。
1.4K10发布于 2020-03-31 - 来自专栏Chris生命科学小站五年归档
图说 | 上皮-间充质转化
---- 上皮-间充质转化(epithelial-to-mesenchymal transition，EMT)，是指上皮细胞通过特定程序转化为具有间质表型细胞的生物学过程，它是上皮来源的恶性肿瘤细胞获得迁移和侵袭能力的重要生物学过程 本文对在发育和疾病过程中从上皮形态向间充质形态转变过程中激活的重要调控途径和主要细胞事件进行了阐述。 肌动蛋白细胞骨架，微管阵列和细胞间连接的组织在可能涉及支架蛋白(IQGP)的机制中紧密协调，但细节仍有待研究。 具有正负作用的信号转导机制的复杂网络在核上汇聚，以下调上皮表型所需的基因，并上调指定间充质特征的基因。GSK3β和NF-κB在协调这些途径中起着核心作用。 Snail转录调节子家族的成员，即Snail1和Snail2，已成为关键的调控节点。锌指转录因子Zeb1和Zeb2也对该调节起关键作用。EMT诱导信号促进其表达，调节其稳定性和/或改变其亚细胞位置。
2.1K30编辑于 2023-02-28 - 来自专栏纳米药物前沿
.: 间充质干细胞联合机械灌注应用于器官移植——一种新型供体器官保存方法
图1.间充质干细胞改善器官缺血再灌注损伤的机制 间充质干细胞一直以来都是治疗器官缺血再灌注损伤的一大热点。 间充质干细胞是一类具有多向分化潜能的细胞，具有免疫调节、抗氧化、抗凋亡和促进组织修复再生的能力。已经有大量研究证明，间充质干细胞可以有效地减轻器官缺血再灌注损伤。 而且，由于机械灌注是针对离体器官的保存方法，在此过程中使用间充质干细胞治疗供体器官更具有“靶向治疗”的效果（图2）。 图2.联合间充质干细胞与机械灌注应用于供体器官保存与修复 文章中归纳了近年来联合间充质干细胞与机械灌注应用于器官移植的研究，总结了各个研究中的间充质干细胞与机械灌注不同的联合应用方法，以及对不同器官移植的影响 郑少忆教授团队在文章中还提出关于间充质干细胞与机械灌注结合的一些思考，如针对不同器官间充质干细胞的最佳浓度、机械灌注系统对间充质干细胞的影响、间充质干细胞异质性对研究可重复性的影响等。
1.1K40编辑于 2022-08-15 - 来自专栏DrugOne
全球首款间充质基质细胞药物获FDA批准开展临床试验
天士力医药集团股份有限公司开发的全球首款异体脂肪间充质基质细胞（AD-MSCs）治疗急性缺血性脑卒中的药物（NR-20201），于2024年10月26日获得美国食品药品监督管理局（FDA）临床试验批准。 据悉，该公司在研发NR-20201的过程中，利用人工智能解析单细胞转录组学、分析细胞生命轨迹与命运结局[1,2]，确认天士力标准制备工艺生产的AD-MSCs为间充质基质细胞而非间充质干细胞。 基于基质细胞与干细胞的区别，该产品具有独特的鉴定标准和不同于干细胞的作用机制。该产品根据患者情况，选择适合的治疗时间窗，促使细胞静脉输入后有效归巢。 因此成为全球首款间充质基质细胞药物产品。 STAR Protocols, 2023. 4(2): p. 102268.
21310编辑于 2024-11-23 - 来自专栏纳米药物前沿
JNB:大鼠脂肪间充质干细胞来源的细胞外囊泡包载壳寡糖促进软骨损伤修复和缓解骨关节炎
间充质干细胞来源细胞外囊泡具有组织修复潜力，有望用于无细胞生物治疗，在多种组织损伤病变中展现出应用潜力。 近日，中国医科大学王小红教授团队报道了一种利用间充质干细胞来源细胞外囊泡递送壳寡糖的无细胞治疗策略，用于促进软骨损伤修复和缓解骨关节炎。 大鼠脂肪间充质干细胞(AMSCs)细胞外囊泡(EVs)和壳寡糖(COS)结合物(EVs-COS)的表征。 图2. EVs-COS对IL-1β诱导软骨细胞活力和凋亡的影响。 图3.
38110编辑于 2022-08-15 - 来自专栏纳米药物前沿
浙江大学彭丽华Nano Lett：植物外泌体作为miRNA转移的新型纳米平台在体内外刺激干细胞的神经分化
将骨髓间充质干细胞(BMSCs)分化为功能性神经细胞的策略在治疗神经疾病方面已被广泛研究。然而，如何解决骨髓间充质干细胞有限的神经分化性能仍然是一个很大的研究挑战。 体内研究表明，载有趋化因子和G-Exos的光交联水凝胶在募集骨髓间充质干细胞和指导其神经分化方面具有很好的功效。 实验结果表明，G-Exos是一种很有发展前景的纳米平台，它可以将植物来源的miRNA转移到哺乳动物干细胞中以用于体内外的神经分化。该策略在神经再生医学领域具有巨大的应用潜力。
78110编辑于 2022-08-15 课前准备--stereo-seq通讯分析策略
间充质：上段以Mes2（ALDH1A1+FN1+）持续主导内层；下段内层Mes1（PRRX1+HMGA2+）逐渐消失，两段的中外层最终都分化为成纤维细胞和平滑肌细胞。 结果2、不同间充质亚型的分子特征间充质亚型鉴定：通过单细胞数据，将间充质细胞细分为6个亚群：MSC样细胞、过渡态1（TS1）、过渡态2（TS2）、成纤维细胞（FIB）、平滑肌细胞（SMC）和周细胞。 MSC样2 富集HMGA2，维持干性。鉴定FRT上段和下段具有不同时空分布的间充质亚群明确的分层结构：间充质细胞在FRT中呈现内、中、外三层分布，这可能是成年FRT分层结构的基础。 结果3、FRT中的MSC样细胞通过特定的转录程序及空间信号分化为SMC和FIB谱系聚焦于间充质干细胞样细胞的分化轨迹及关键信号调控分化轨迹的建立：通过拟时间分析，发现MSC样细胞分化为两条主要谱系：谱系 潜在的上段特异性信号（SLIT2–ROBO）：上皮来源的SLIT2与MSC样1细胞上的ROBO1/ROBO2受体相互作用，可能参与间充质细胞的空间定位和上段子宫内膜基质区室的形成。
11020编辑于 2026-06-18- 来自专栏单细胞天地
单细胞遗传筛查确定上皮-间充质转化连续体中的调控点
单细胞转录组分析综述 单细胞入门-读一篇scRNA-seq综述 文章信息 今天介绍的文章于2019年9月2号发表在Nature Genetics，文章题目是：A pooled single-cell reliability: inner & outer cells的确有Epithelial & Mesenchymal marker genes表达的区别 （inner更Epi, outer更Mes） 2. 先说明模型valid： 存在EMT受到阻滞的cells TGFBR1/2的LOF (pos control)可以阻滞EMT ?
1K20发布于 2020-03-30 - 来自专栏镁客网
科学家颠覆医学旧有常识，通过研究揭示脂肪细胞可在放化疗后促进造血干细胞再生 | 黑科技
该研究还详细解释了造血干细胞巢在应激条件下的动态变化。 据悉，中科院上海周波研究组通过研究揭示了骨髓脂肪细胞有利于人们在放化疗后造血干细胞的再生，颠覆了此前将脂肪细胞作为造血抑制物质的认识。 然而周波及其研究团队发现骨髓脂肪细胞能够通过分泌SCF（造血干细胞必须生长因子）促进放化疗后造血干细胞的再生。 此外，在这项研究中，周波还发现，在人们接受放疗或者化疗之后，造血干细胞巢（其中主要是内皮细胞和间充质干细胞）的生理作用会受到暂时性破坏，为了维持骨髓内的SCF水平，间充质干细胞启动成脂分化，生成的脂肪细胞成为临时的 “造血干细胞巢”，通过分泌SCF维持机体基本的造血功能。 等到骨髓重新长成后，临时的就会被真正的造血干细胞巢取代。 所以这一研究不仅揭示了脂肪细胞具有促进造血干细胞再生的能力，还详细解释了造血干细胞巢在应激条件下的动态变化。
78500发布于 2018-05-30 - 来自专栏单细胞天地
内皮来源的基质细胞参与造血骨髓微环境形成
对小鼠的单细胞转录组学与谱系追踪证实了，内皮-间充质转化对骨前体和造血微环境池具有重要作用。IL-33在EndMT细胞亚群中高表达，并通过ST2受体信号驱动这种转化过程。 图2. LNGFR+内皮细胞表现经历间充质转化细胞的转录特征 2. 图4. scRNA-seq鉴定小鼠骨髓发育过程中内皮-间充质转化细胞 4. 此外，IL-33对体内驱动内皮-间充质转化发生在发育中还是发生在再生中，仍尚待充分阐明。 本文亮点 人体骨髓存在一类内皮细胞和基质细胞标记共表达的亚群 这些细胞通过EndoMT产生，能够形成造血龛 内皮来源的骨髓间充质干细胞是小鼠造血龛细胞的一个独特的亚群 IL-33驱动人内皮细胞向基质细胞的转化
66120编辑于 2022-06-13 - 来自专栏流式抗体推文
探索免疫奥秘的钥匙：Elabscience PE/Cyanine7 标记抗人 CD45抗体[HI30]，助力前沿生物医学突破
Mouse）亚型：Mouse IgG1, κ偶联物：PE/Cyanine 7适用物种：人（Human）应用范围：流式细胞术（FCM）规格：20 Tests / 100 Tests克隆号：HI30储存条件：2- 此外，CD45还与多种表面分子（如CD1、CD2、CD3、CD4）相互作用，是免疫细胞鉴定和功能研究的重要标志物。 应用领域免疫表型分析：用于区分淋巴细胞、单核细胞、粒细胞等造血细胞亚群；白血病/淋巴瘤研究：辅助诊断与分型，监测微小残留病灶；干细胞研究：鉴定造血干细胞及间充质干细胞表面标志；免疫治疗评估：监测CAR-T during long-term in vitro expansion by modulating autophagyDOI: 10.3389/fcell.2024.1489774样本类型: 大鼠骨髓间充质干细胞 differentiation of human umbilical cord mesenchymal stem cellsDOI: 10.1097/MD.0000000000039350样本类型: 人脐带间充质干细胞
19610编辑于 2026-02-28 - 来自专栏生信菜鸟团
【生信文献200篇】01 探究为何一个TNBC对gefitinib过于敏感
对GCRC1735的3500个细胞进行单细胞转录组测序分析，鉴定出6个细胞亚群，其中EGFR高表达的细胞在间充质/细胞样细胞亚群中显著富集。 EGFR hi Mesenchymal/Stem Subpopulation Is Functionally Enriched for Tumor Potential 通过拟时序分析(Monocle)发现，间充质 间充质/干细胞亚群与正常乳腺干细胞特征之间存在显著重叠，并且在正常乳房的基质细胞中间充质/干细胞 Marker 基因和 EGFR 高表达(图3B)，表现了间充质/干细胞亚群的未分化性质，及增强再生能力。 使用荧光激活细胞(FACS)分选EGFRhi和EGFRlo细胞亚群；EGFR表达增强，并且来自间充质/干细胞特征的基因显示其与单细胞测序的特征相同(图3C-D)。 ? 2. t-SNE t-SNE(t-distributed stochastic neighbor embedding) 是一种非线性降维算法，非常适用于高维数据降维到2维或者3维，进行可视化。
61110发布于 2021-01-05 - 来自专栏iPSC诱导多能干细胞培养
MSC来源EVs大规模生产研究：VWBR生物反应器如何提升外泌体产量与抗炎功能
摘要：随着间充质干细胞（MSC）及其来源细胞外囊泡（EVs）在再生医学、神经退行性疾病以及炎症相关研究中的应用不断增加，如何建立稳定、高产且具备功能活性的EVs生产体系，逐渐成为外泌体研究领域的重要方向 关键词：MSC；EVs；外泌体；间充质干细胞；VWBR；生物反应器；3D培养；细胞外囊泡；阿尔茨海默病；抗炎；RoosterBio一、为什么MSC来源EVs成为近年来的重要研究方向？ 在人类长期关于衰老、组织修复以及慢性疾病治疗的研究中，间充质干细胞（MesenchymalStemCells，MSCs）逐渐成为再生医学领域的重要研究对象。 间充质发生过程示意图，显示MSC能够被诱导进入不同间充质谱系分化路径。MSCs在人体中通常处于静息状态，当机体出现损伤或炎症时，这些细胞会被激活并参与组织修复。 图2：间充质干细胞具有免疫调节和营养支持作用。随着年龄增长，人体细胞会逐渐积累DNA损伤、线粒体功能异常以及炎症相关改变，最终导致衰老细胞积累。这些衰老细胞会持续释放促炎因子，影响周围正常组织功能。
21410编辑于 2026-05-14 顶刊分享--人类生殖道发育的时空细胞图谱
⁺HTR2B⁺间充质）。 ⁺RORB⁺间充质）及阴道细胞（苗勒管来源的DLX5⁺TP63⁺上皮与SRD5A2⁺GAP43⁺间充质，尿生殖窦来源的FOXA1⁺PRAC1⁺上皮与SRD5A2⁺FENDRR⁺间充质）。 ）及前列腺细胞（FOXA1⁺上皮与SRD5A2⁺GAP43⁺上段间充质、SRD5A2⁺FENDRR⁺下段间充质）。 双向信号传递机制上皮→间充质反馈：输卵管上皮表达RSPO1，可能激活间充质LGR5受体LGR5与TSPAN8在输卵管间充质共表达，提示干细胞微环境特征间充质主导模式：间充质先获得区域身份，再指令上皮分化 ：首次在人类发育中绘制WNT/BMP/IGF等多通路协同调控图谱揭示双向通讯机制：突破传统“间充质单向指令”模型，提出上皮反馈调控干细胞微环境的新假说为疾病研究提供线索：信号通路异常可能解释先天性生殖道畸形
89020编辑于 2025-12-21- 来自专栏生信菜鸟团
Cell | 单细胞转录组揭示肝实质细胞及NPC细胞的早期细胞谱系
通过聚类获得15个亚群，鉴定marker基因都对其进行了注释，包括内胚层、间充质细胞，内皮细胞系和造血细胞。细胞注释用先前发表的文章进行了验证。 为了更清楚地肝细胞类型的发生，该研究对内胚层、间充质干细胞和内皮细胞系分别进行了研究。这些细胞系单独进行了可视化，使用Harmony包和Palantir包进一步分析，在发育层面重建细胞系的关系。 2.肝窦和血管内皮细胞在E9.5由共同的内皮祖细胞分化而来 该研究分析了从E7.5到E10.5的2,066个内皮细胞和造血细胞的转录组。 3.早期肝脏中，横隔和肝间充质细胞的异质性 关于间充质（包括STM、间皮和肝星状细胞）的研究不多。因此，对于在早期肝脏中涌现的间充质细胞群体的完整多样性和时机了解甚少。 5.成肝细胞和肝间充质通过不同的迁移机制出现 用Palantir推测两种细胞的分化轨迹 ? ?
3.2K20发布于 2020-11-11 - 来自专栏单细胞天地
单细胞水平上解析人肝硬化的纤维化生态位
(fs,'_',simplify = T)[,3] samples2 samples2=samples1 lapply(1:length(samples2), function(i){ x=samples2 第一层次降维聚类分群 文章中提到肝纤维化涉及多种非实质细胞（NPC）谱系之间的复杂相互作用，包括免疫细胞、内皮细胞和间充质细胞，它们在纤维化区域内空间定位，被称为纤维化微环境。 所以文章针对这些细胞进行了一个细胞亚群分类，我们通过BioinfoArk提供的中国区chatGPT查询到：免疫细胞、内皮细胞和间充质细胞都是复杂的细胞群体，它们在纤维化微环境中可能存在不同的亚群，其中一些主要的亚群包括 间充质细胞： 成纤维细胞：包括活化的成纤维细胞和静止的成纤维细胞等亚群。 脂肪细胞：包括白色脂肪细胞和棕色脂肪细胞等亚群。 骨髓间充质干细胞：包括多能干细胞和成骨细胞等亚群。 通过对新的与疤痕相关的巨噬细胞、内皮细胞和PDGFRα+胶原产生间充质细胞之间的多线age配体-受体模型进行建模，揭示了几个促纤维化途径（包括TNFRSF12A、PDGFR和NOTCH信号通路）在疤痕内的活动
90120编辑于 2023-09-19 - 来自专栏单细胞天地
scRNA-seq 揭示UCOGCP的发生与异质性
本文研究了一名 UCOGCP 患者和三名 PDAC 患者的样本，对肿瘤微环境进行了分析，发现OGCS 起源于干细胞样间充质上皮细胞 (SMEC)，可能成为 UCOGCP 预后的新分子标记。 由于 OGC 可能起源于间充质上皮细胞，作者分析了 UCOGC 样本 (pca_ai1)、cluster 13 和 15 的两个导管 I 型细胞群中上皮细胞标记物 EPCAM 和 KRT19 以及 OGC KRT81 的 IHC 染色显示 OGC 为 KRT81 阳性，表明 OGC 最有可能起源于间充质上皮细胞而不是骨髓细胞。 cluster 4 和 1 表达癌症干细胞样细胞 (CSCLC) 基因标记 CD24、CD44 和 EPCAM，0 和 2 表达 CD44 和 NOTCH2。 对cluster 0进行GO富集分析，发现它在抗原呈递、造血干细胞分化和G2/M的负调控方面富集。
75330编辑于 2023-02-10 - 来自专栏空间转录组
经典的文章要反复读--单细胞测序和CODEX绘制人骨髓的组成和空间结构
；HSC，造血干细胞；Meg/E，巨核/红系；MSC，间充质基质细胞。 成骨谱系细胞被分为 IBSP/BGLAP 高表达的成骨细胞和 IBSP/BGLAP 低表达的成骨间充质干细胞（Osteo-MSCs）（图 2B）。 表达 CXCL12、高度表达 DPT 和 NT5E，并非常特异地表达 PDPN 和 HAS1 的成纤维细胞样细胞也被观察到，我们将其称为成纤维间充质干细胞（Fibro-MSCs）（图 2B）。 图 2 定义人类骨髓的非造血细胞组成(A) 12 名个体中 19,257 个间充质细胞的 UMAP 图，显示了不同的间充质细胞亚群，其中 RNA 低表达的 MSC 因其质量控制（QC）特征被排除。 (B) 点图显示了 MSC 亚群中关键间充质标志基因的标准化表达。
67010编辑于 2025-05-29 - 来自专栏细胞培养
化学成分限定MSC培养基使用指南：储存、培养参数与无血清传代操作规范
ChemicallyDefinedMedium，CDM）MSC培养体系的实际应用场景，系统介绍培养基储存与解冻要求、细胞接种密度设置、培养参数控制以及无血清条件下的消化传代规范，帮助研究人员建立标准化培养流程，提高间充质干细胞 关键词：化学成分限定培养基、MSC培养基、无血清培养基、间充质干细胞培养、MSC传代、细胞消化、无血清培养体系、细胞培养规范随着细胞治疗、组织工程以及再生医学的发展，间充质干细胞（MSC）的培养工艺正逐渐从传统含血清体系向化学成分限定 培养基解冻后应存放于2～8℃环境，并按照产品说明规定的期限使用。若储存时间过长，培养基中的部分活性成分可能发生降解，从而影响细胞培养效果。 图2.NordmarkCollagenase胶原酶2.3常见消化终止方案对于胰蛋白酶体系，可通过特异性抑制剂、无血清终止液或者低温稀释方式实现酶活终止。 总结化学成分限定MSC无血清培养基正在成为间充质干细胞培养的重要发展方向。与传统含血清培养体系相比，CDM体系在培养基储存、培养参数设置以及细胞消化传代等方面具有自身特点。
11510编辑于 2026-06-23 - 来自专栏单细胞天地
Ebf1缺陷的MSC能引发HSCs潜能的持续改变
文章利用单细胞转录组揭示了Ebf1转录因子在间充质基质细胞（MSC）与造血干细胞（HSCs）之间的相互作用及对造血稳态和造血作用至关重要。 ? 摘要 间充质基质细胞(MSCs)与造血干细胞(HSCs)之间的相互作用对于造血的持续及其谱系分化至关重要。在此，我们探讨骨髓间充质干细胞的转录改变如何对HSCs产生持续的影响。 多种非造血细胞,如间充质基质细胞(MSCs)、内皮细胞、成骨细胞、脂肪细胞和交感神经等，形成的高度复杂和动态的(造血)龛在维持血液发育中发挥重要作用。 HSCs主要与骨髓的血管系统和间充质干细胞密切相关，而间充质干细胞是血管周围龛的重要组成部分。 骨髓间充质干细胞由一个异质性的细胞群组成，可通过缺失造血和内皮标志物、粘附能力和分化为多种细胞类型(包括成骨细胞、脂肪细胞、软骨细胞和肌细胞)的能力来识别。
1.7K30发布于 2020-11-25
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