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  • 来自专栏生命科学

    MCE | 死亡抑制机制

    安德森癌症中心甘波谊教授团队在 Nature上发表的文章 “DHODH-mediated ferroptosis defence is a targetable vulnerability in cancer” 揭示了第三种死亡抑制机制 这项研究证实了线粒体二氢乳清酸脱氢酶 (DHODH) 介导的死亡防御机制,并且提出了通过抑制 DHODH 治疗癌症的新策略。 SLC7A11 介导的胱氨酸转运) 的敏感性。 总结: 作者团队发现至少存在三种死亡抑制机制,他们在亚细胞结构上都有独特的地位:胞质和线粒体中的 GPX4、质膜上的 FSP1 和线粒体中的 DHODH。 化合物库 死亡化合物库 收录了 500+ 种 ferroptosis 相关的产品,可以用于死亡机制及相关疾病的研究。

    1.1K50编辑于 2023-03-09
  • 来自专栏生命科学

    MCE | 死亡——调节性细胞死亡

    机制上简单来说,死亡是细胞膜上依赖性的高表达的不饱和脂肪酸,发生脂质过氧化,诱导的细胞死亡。 近年来,死亡相关研究是如火如荼,前途一片光明。 AMPK 缺失对死亡敏感性的作用机制。 并且如图 4c-d 所示,SLC7A11 高表达细胞相对于低表达细胞对死亡的抵抗力更高,值得注意的是,虽然在 SLC7A11 高表达细胞中 AMPK 激活状态与死亡的敏感性无关,但 SLC7A11 Ferrostatin-1 选择性的死亡抑制剂,人工合成的抗氧化剂,通过还原机制来防止膜脂的损伤,从而抑制细胞死亡死亡化合物库 收集了 500+ 种文献报道的具有诱导或抑制死亡相关的化合物及与死亡密切相关的靶点对应的化合物,可以用于死亡机制及相关疾病的研究。

    1.2K10编辑于 2023-03-09
  • 来自专栏用户7627119的专栏

    死亡相关基因集

    死亡(Ferroptosis)最早由哥伦比亚大学Dr. Brent R.Stockwell在2012年提出,是一种依赖性的,区别于细胞凋亡、细胞坏死、细胞自噬的新型的细胞程序性死亡方式。 死亡的的本质是谷胱甘肽的耗竭,谷胱甘肽过氧化物酶(GPX4)活性下降,脂质氧化物不能通过GPX4催化的谷胱甘肽还原酶反应代谢,之后二价的离子氧化脂质产生活性氧,从而促使死亡的发生。 今天我们就来聊聊如何获取死亡相关的基因集合。 FerrDb数据库(http://www.zhounan.org/ferrdb/current/)是广州医科大学附属脑科医院和四川大学生命科学学院,生物资源与生态环境教育部重点实验室共同开发的,是人工收集管理的死亡相关的标志物和调控因子以及死亡关联疾病的数据库 截止到目前为止,该数据库从PubMed数据库下载了784篇关于死亡的文章,并从中提取死亡的调控因子和标志物以及相关疾病。数据库在更新中。

    1.2K20编辑于 2022-09-21
  • 来自专栏作图丫

    旧瓶装新酒,这篇死亡lncRNA竟然发了11分!

    导语 GUIDE ╲ lncRNA通过ceRNA调节死亡,也可以通过直接与蛋白质相互作用或抑制翻译过程来影响死亡。然而,死亡相关的lncRNA对胰腺癌发生的潜在机制仍然未知。 背景介绍 今天小编为大家带来一篇刚刚发表在BIB的基于死亡相关lncRNA的预后模型。死亡可以说是老生常谈了,这篇文章有什么过人之处可以发表在11分+的BIB呢,让我们一起探究一下吧! 值得注意的是,一些 lncRNA与三个核心死亡调节因子ACSL4、SLC7A11和GPX4的表达高度相关,与之前的研究一致(图2A)。 考虑到SLCO4A1-AS1表达与SLC7A11表达之间的正相关性,作者进一步评估了SLCO4A1-AS1表达的降低是否影响对死亡的敏感性。 图3 03 死亡模型的差异表达基因揭示了胰腺癌代谢机制 在模型高风险组和低风险组之间共鉴定了726个差异表达的基因(图 4A)。

    49850编辑于 2022-03-29
  • 死亡机制全解析:五大核心通路 | MCE

    因此,研究死亡可为疾病机制的理解、治疗靶点的发现、抗肿瘤药物的开发、克服传统化疗的耐药性提供新方向[1][2][3]。 过量的 Fe2+ 可以通过两种机制产生活性氧(ROS),随后导致脂质过氧化,诱导死亡。1. 依赖性芬顿反应;2. 激活含酶如脂氧合酶(ALOXs)。 GCH1-BH4 轴 可控制 BH4 的内源性产生、CoQ10 丰度,以及异常磷脂的过氧化,从而抑制死亡[11]。 DHODH 所介导的抗死亡机制独立于细胞质中的 GPX4 和 FSP1 路径。 MCE 死亡化合物库 (HY-L051) 集合了 1,000+ 种 文献报道的具有诱导或抑制死亡相关的化合物及与死亡密切相关的靶点对应的化合物,可以用于 死亡机制及相关疾病的研究。

    3.2K21编辑于 2025-06-24
  • 来自专栏生命科学

    p53 与死亡有关?Nature 解锁新机制 | MedChemExpress

    p53 可以通过抑制 SLC7A11 的表达来增强死亡。 tumour suppression” 中已证明 p53 通过抑制 SLC7A11 (胱氨酸/谷氨酸逆向转运蛋白的关键成分) 的表达来抑制胱氨酸摄取,并且使细胞对死亡敏感。 他们发现在没有 Tet-on 诱导的情况下,p533KR 细胞对 Erastin 介导的死亡具有很强的抵抗力,SLC7A11 的过表达会挽救 p533KR 依赖性细胞死亡 (图 4c)。 他们发现 ALOX12 耗竭对 p53 水平或其转录靶标 (例如 SLC7A11、Mdm2 和 p21) 的表达没有明显影响,但可以挽救 p53 介导的死亡 (图 6a-b)。 死亡是一种新型的调节性细胞死亡形式,自被发现就引起了研究狂潮,热度不减。 p53 与死亡结合的研究发现,拓展了 p53 新的调控肿瘤发展的机制,也为研究出肿瘤抑制作用的新型药物开辟了新的方向。

    79810编辑于 2023-02-23
  • 来自专栏生命科学

    死亡化合物库 | MedChemExpress

    死亡是 2012 年新发现的一种细胞死亡机制,目前已经成为科研领域的研究热点。 死亡机制 死亡受细胞内信号通路的严密调控,包括氨基酸代谢,脂质代谢及离子代谢等。胱氨酸经胱氨酸运输蛋白 system Xc- 进入细胞后,被用来合成谷胱甘肽。 死亡与疾病 生命机体的正常生理进程是否有死亡的参与还不清楚,但很多疾病均报道与死亡有关,包括肿瘤、神经退行性疾病、局部缺血再灌注损伤、肾衰竭等。 另外死亡在肿瘤免疫治疗中也具有重要的作用,抑制肿瘤细胞的死亡通路后,会降低肿瘤细胞对免疫治疗的敏感性。综上说明,死亡在肿瘤治疗中或可发挥重要作用。 为方便科研研究,MCE 死亡化合物库,主要包含一些常用的死亡诱导剂及抑制剂,化合物主要靶向 GPX4,system Xc-,ROS,DPP4,p53,Nrf2 等与死亡密切相关的靶点,可以用于死亡机制及相关疾病的研究

    45120编辑于 2023-03-03
  • 来自专栏生命科学

    死亡,究竟该如何检测?- MedChemExpress

    死亡的调控机制关于死亡的调控,主要受 GSH/GPX4 途径的调节;代谢以及脂质代谢的相关通路也发挥着重要作用。 L-Cystine一种氨基酸,在细胞调节过程中起着重要作用,胱氨酸耗竭会诱导死亡。Ferrostatin-1选择性的死亡抑制剂,人工合成的抗氧化剂,通过还原机制来防止膜脂的损伤,从而抑制细胞死亡死亡化合物库收集了 500+ 种文献报道的具有诱导或抑制死亡相关的化合物及与死亡密切相关的靶点对应的化合物,可以用于死亡机制及相关疾病的研究。 Nano Lett. 2019 Nov 13;19(11):7781-7792.7. Cao J, et, al. Nat Commun. 2020 Mar 6;11(1):1251.

    1.3K30编辑于 2022-12-28
  • 来自专栏生命科学

    fer1死亡抑制剂介绍|死亡抑制剂fer-1原理|MCE

    01fer1死亡抑制剂介绍Ferrostatin-1 (Fer-1) 是一种有效的、选择性的 ferroptosis 抑制剂,抑制 Erastin 诱导的 HT-1080 细胞死亡 (EC50=60 Ferrostatin-1 是一种人工合成的抗氧化剂,通过还原机制来防止膜脂的损伤,从而抑制细胞死亡。Ferrostatin-1 具有抗真菌活性。 02死亡抑制剂fer-1原理Ferrostatin-1(Fer-1)是一种有效的死亡(ferroptosis)抑制剂,其主要作用原理是通过抑制脂质过氧化来阻止死亡的发生。 具体来说,死亡是一种依赖性的、由脂质过氧化驱动的程序性细胞死亡形式。 总之,Fer-1通过作为自由基清除剂,阻断脂质过氧化链式反应,从而有效抑制死亡,被广泛用于研究死亡在神经退行性疾病、缺血再灌注损伤、肿瘤等疾病中的作用。

    70011编辑于 2025-10-27
  • 来自专栏生命科学

    死亡标志:细胞形态变化、代谢改变、分子特征与程序性死亡比较 | MCE

    01细胞形态变化脂质过氧化是死亡的核心驱动因素,因此,死亡细胞的形态变化主要出现在细胞富含脂质的生物膜上以及细胞中维持氧化还原平衡的线粒体中。 02细胞代谢水平的变化铁死亡积累和脂质过氧化密切相关。 此外,过量的亚铁离子(Fe2+)可以产生过量活性氧(ROS),导致脂质过氧化,诱导死亡。同时,GSH 水平显著下降,导致细胞抗氧化能力减弱,进而加剧脂质过氧化物的积累,并诱导死亡。 03细胞分子水平的变化铁死亡受到多种机制调控,主要分为过氧化代谢部分(如代谢途径和脂代谢途径) 和抗氧化部分 (如 System xc--GSH-GPX4 途径,AIFM2-CoQ10, GCH1-BH4 例如,GPX4 含量和活性下降,SLC7A11 下调;转铁蛋白受体(TFRC)表达上调以增加的摄取,ACSL4 表达增加来增强多不饱和脂肪酸(PUFA) 含量等。

    1.1K12编辑于 2025-06-30
  • 来自专栏作图丫

    死亡相关预后signature轻松发6+~

    然而,先进的多学科治疗并不能挽救高危乳腺癌转移的死亡率。死亡是一种新发现的与癌症治疗相关的调节细胞死亡的形式,特别是在根除对传统疗法有抵抗力的侵袭性恶性肿瘤方面。 背景介绍 死亡在最近两年已然成为热点,今天小编为大家带来的这篇文章,作者通过死亡相关基因识别乳腺癌预后基因特征,文章发表在《Frontiers in Cell and Developmental Biology 图 1 02 TCGA中与预后死亡相关的DEGs的识别 本研究首先在 TCGA 队列中鉴定了预后死亡相关的 DEGs,结果显示大多数死亡相关基因在乳腺癌肿瘤组织和邻近的非肿瘤组织之间差异表达,包括 图 4 05 11基因死亡相关预后特征的独立预后价值 随后,本研究在 TCGA 数据库和 GEO 数据库中提取了可用的临床变量。 图 7 小编总结 本研究探索了乳腺癌组织中总共 259 个明确定义的死亡相关基因及其与 OS 的相关性。外部队列构建并验证了一种新的 11 基因死亡相关预后模型。

    61310编辑于 2022-12-04
  • AbMole| 焦距细胞焦亡、死亡与坏死性凋亡

    大多数肿瘤对细胞凋亡具有先天抵抗力,所以诱导细胞死亡机制而非细胞凋亡已逐渐成为一种新的癌症治疗策略。最近,一些研究揭示了不同的细胞死亡机制和抗肿瘤免疫之间的相互影响。 死亡细胞通过以下两种主要方法激活细胞焦亡:由 caspase 1/4/5/11 调节的 GSDMD(gasdermin D)依赖性激活和由 caspase 3 调节的 GSDME 依赖性激活。 酰基辅酶A合成酶长链家族成员4 (ACSL4)通过塑造细胞脂质组成来决定死亡的敏感性。从机制上讲,ACSL4 富含长多不饱和ω6脂肪酸的细胞膜,这些脂肪酸容易受到死亡的影响。 肿瘤抑制因子 p53 与死亡的敏感性密切相关,基于不同癌症中广泛存在的 p53 突变,推测死亡是抵抗肿瘤发生的内在机制。 由于最近报道 HMGB1 是与死亡相关的 DAMP,因此死亡细胞触发有效免疫反应的机制可能与传统免疫原性细胞死亡(ICD)有一些相似之处。

    28210编辑于 2025-12-24
  • AbMole小课堂:Ferrostatin-1如何高效阻断死亡

    死亡是一种依赖于的非凋亡形式的细胞死亡,其特征是细胞内离子水平升高和脂质过氧化反应加剧。 Ferrostatin-1(Fer-1,AbMole,M2698)是一种经典的死亡抑制剂,被大量高分文献使用以探究死亡的发生机制和生理作用。 一、作用机制1. 上述研究以斑马鱼为模式生物,通过神经行为分析、体内双光子成像、转录组测序、药理干预和分子生物学检测,全面探究 BAA 的毒性作用,揭示其分子机制。 转录组学分析显示受BAA刺激的斑马鱼表现出视觉转导相关基因的下调以及死亡和细胞凋亡的激活。通过抑制死亡和细胞凋亡可以抑制上述神经行为障碍。

    34810编辑于 2025-11-27
  • AbMole小课堂:Erastin—靶向System Xc⁻的死亡明星分子

    Erastin(AbMole,M2679)是一种细胞渗透性喹唑啉酮类化合物,常作为SLC7A11抑制剂和死亡诱导剂,其在细胞生物学领域备受关注。 ,不会被凋亡抑制剂阻断,这一发现为细胞死亡机制的研究开启了新的方向[1]。 后来经过持续研究,将上述细胞死亡形式命名为死亡,其特征是细胞的活性氧(ROS)以及脂质过氧化物累积。Erastin(AbMole,M2679)诱导死亡的关键机制之一是对System Xc⁻的抑制。 Erastin调节线粒体功能线粒体在细胞的能量代谢和氧化还原平衡中起着核心作用,而 Erastin(AbMole,M2679)对线粒体功能有着显著的影响,这也是其诱导死亡的重要机制之一。 从机制上讲,LPC 通过 GPR119抑制 ACSL4 表达,进而抑制死亡并改善 AD 病理。

    35310编辑于 2025-11-27
  • 来自专栏作图丫

    7分+死亡相关基因与预后和免疫关联分析

    死亡作为一种新的程序性细胞死亡,已被证明在肿瘤治疗中具有潜力。 背景介绍 作为前段时间的研究热点,死亡方向一直有不少文章产出,今天小编给大家介绍的一篇文章,基于已经报道的死亡相关基因,构建预后模型,并通过分析不同风险类型和免疫特征的差异,得到了很好的结果,文章题目为 数据介绍 TCGA:PAAD的RNA-seq数据和临床随访数据 GEO:GSE57495和GSE71729芯片数据(含生存时间) 结果解析 01 与预后差异一起识别差异表达的FRGs 作者收集了关于死亡的文献 ,获得了60个FRGs(死亡相关基因)。 图8 小编总结 这类死亡相关基因的预后模型构建和免疫分析的文章之前也解读过,研究的思路和方法大致相似,但本文的模型通过与之前研究的模型进行比较,具有一定的优越性,这也可以给大家提供参考!

    1.3K30编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏生命科学

    死亡细胞实验相关抑制剂、激动剂 | MedChemExpress

    而且该文中,作者还选用了 10 μM 这个浓度进行了细胞超微结构观察进一步确定死亡。 当然,勤快的小白还看了其他文献。 关卡二:一石二鸟 上面提到小白证明了 Erastin 诱导 786-O 细胞的死亡。现在小白手里有个实验室自己合成的药物 X,未知是否具有保护细胞免受死亡的作用。 小白的实验分组),并且在 MCE 购买了文献中常用的死亡抑制剂 Ferrostatin-1 作为阳性对照。 综上所述,Erastin 诱导的死亡需要 MDMX,而 MDMX 发挥作用独立于 p53。 Ferrostatin-1 选择性的 ferroptosis 抑制剂,人工合成的抗氧化剂,通过还原机制来防止膜脂的损伤,从而抑制细胞死亡

    61910编辑于 2023-03-07
  • 来自专栏生信小驿站

    文献复现之一篇死亡生信文章(1)

    文章摘要 在本研究中,系统地研究了透明细胞肾细胞癌中铁死亡的特征模式(ccRCC) ,死亡和肿瘤微环境(TME)的相互作用。 高死亡评分特点是预后差、T 细胞增浸润、更高的免疫和基质评分、高肿瘤突变负荷和较高的CTLA4 免疫疗法药物反应。同时,低死亡分与高肿瘤纯度、氨基酸和脂肪酸代谢途径有关。 经验证,死亡评分为独立有效的预后因子。总的来说,死亡可能与TME相关。对死亡的评估可能提高对 TME 中免疫浸润的理解,协助肿瘤学家制定个性化的免疫治疗策略。 3. 基于死亡的一致聚类分析 无监督聚类的亚型数量是基于57个的死亡相关基因(Supplementary table 2)的 mRNA 表达谱上进行的。应用t-SNE在上述基因的表达谱 来验证亚型。 降维和死亡评分 来自 TCGA 数据库的ccRCC 患者被分为不同的死亡亚型,亚型之间的差异基因(DEGs)也被筛选出来。

    2K43发布于 2021-06-17
  • 来自专栏作图丫

    死亡+免疫相关亚型分析轻松可发7+!

    对 1160 名 LUAD 患者的基质活性进行定量分析,正如预期的那样,A 簇中的 EMT2 和 Pan-F-TBRS 显著高于其他两个簇,而簇 C 与抗原加工机制和免疫检查点有关(图 2e)。 图 4 接下来,本研究进一步探讨了死亡评分与死亡簇A-C和死亡基因簇A-C之间的关系。结果显示,C 簇与低死亡评分显著相关,表明低死亡评分可能与免疫激活有关。 这些结果表明,死亡评分可能与免疫相关,可能有助于预测 LUAD 中的死亡亚型。 接下来,本研究在高死亡评分组和低死亡评分组中进一步研究了 28 种免疫细胞浸润到 TME 中的情况。 通过构建死亡特征,将 imvigor210 队列分为高死亡评分组和低死亡评分组,各组的预后显著不同(图6a)。 死亡评分低的患者预后较好,这也提供了初步证据表明,死亡评分低的患者免疫治疗的结果优于死亡评分高的患者。

    68611编辑于 2022-12-14
  • 来自专栏聊点学术

    细胞“死亡(Ferroptosis)”的那些事。

    ——故死亡主要在氨基酸代谢、氧化应激、代谢相关机制机制中发挥了作用。 ---- 胱氨酸-谷氨酸反向转运体是细胞内重要的抗氧化体系,可以摄取胱氨酸,排出谷氨酸。 因此,累积是区别于氧化应激通路,诱发死亡的一种独特的机制。 下图是死亡机制: ? 图片来源:Cell, 2017, 171 (2) 273-285. ③ 活性氧的水平:细胞内活性氧和脂质活性氧通过流式细胞术使用DCFH-DA(表达上调)或C11-BODIPY 荧光探针检测(在死亡细胞中,探针会由红色转化为绿色)。 在MPTP治疗前24小时给小鼠注射死亡抑制剂ferrostatin-1可显著挽救行为障碍和神经元丢失,这表明常见的PD毒素在动物模型中引起神经退行性变的机制可能是死亡。 4、细胞死亡与肝脏损伤的关系 有研究运用多种基因敲除小鼠模型,发现高状态以及遗传性血色病过载可诱发肝脏(肝细胞及巨噬细胞)发生铁死亡,并且揭示了转运蛋白Slc7a11调控死亡的新机制,为肝脏损伤及血色病等系列重大疾病的防治提供了新思路

    7.1K20发布于 2020-11-02
  • 来自专栏作图丫

    死亡的生信思路可以用在非肿瘤上?

    导语 死亡在吸烟诱导的慢性阻塞性肺病 (COPD)的发展中起着至关重要的作用。 背景介绍 死亡相关基因用于肿瘤分型预后已经发表过大量研究,但是在非肿瘤疾病上却仍然是热点。 (图3F) 接下来,作者分析了3个数据集中214个死亡相关基因的表达,发现差异的死亡基因有:GPX2、SLC7A11、DUOX2、AKR1C3、NQO1、AKR1C1、SRXN1、TXNRD1、SLC2A3 作者最终鉴定出NQO1、AKR1C3、AKR1C1、GPX2、TXNRD1、SRXN1和SLC7A11同时为hub基因和死亡差异表达基因(图3H)。 结果显示,在慢性阻塞性肺病吸烟者和非吸烟健康受试者中,7个死亡hub基因(NQO1、AKR1C3、AKR1C1、GPX2、TXNRD1、SRXN1、SLC7A11)的表达与预测一致(图5A-5G)。 综上,香烟烟雾可导致小气道上皮细胞中与死亡相关的基因NQO1、AKR1C3、AKR1C1、GPX2、TXNRD1、SRXN1、SLC7A11表达上调。

    1.2K20编辑于 2022-06-24
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