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Nucleic Acids Res | 药物代谢酶的相互作用
药物代谢酶（drug-metabolizing enzyme，DME）是介导药物活化、失活、毒化和解毒的主要因素，长期以来受到研究者的广泛关注。 由于DME不同类型相互作用之间的交叉分析对理解药物代谢过程至关重要，INTEDE的构建与深入开发有望对未来精准医疗和创新药物发现研究起到推动作用。 ? 1 全面整理具有临床价值药物的DME信息 在药物临床实验中，仅有约30个人类DME获得了重点关注，却忽视了人体微生物及其DME在药物代谢过程中的重要作用(Nature. 570: 462-7, 2019 )，因而严重影响了对药物代谢特异性（个体或组织）的理解和对创新药物（针对微生物靶标）的发现。 448个人体DME和599个微生物DME所共同代谢(如下图)，为药物代谢研究提供了重要的参考信息。
1.4K30发布于 2021-02-01 - 来自专栏DrugOne
. | 绘制药物代谢扰动图谱，解码1520种药物的隐秘作用机制
细胞在96孔板中生长16小时后，用上述化合物以10μM浓度处理。通过每2小时测量一次细胞融合度来持续监测生长48小时，并在药物暴露48小时后收集代谢组学样本(图1)。 为了研究药物扰动如何传播到代谢网络，作者估计了药物诱导的代谢变化与相应注释靶点的邻近程度。为此，作者着重研究了342种具有注释代谢酶靶点的药物。 为测试不同药物浓度对各自靶点附近药物代谢效应的影响，作者对两种抗叶酸药物、一种黄嘌呤氧化酶抑制剂、一种DHODH抑制剂和两种ATP酶抑制剂在三种不同剂量——1μM、10μM和50μM下进行了测定（图2l 然而，对于所有其余药物，1μM就足以诱导酶前体物质的快速积累，而在10μM时，其效果在数量上与50μM观察到的相似（图2m），这表明10μM是筛选药物诱导的代谢效应的最佳折中浓度。 平均而言，具有相同注释MoA的药物之间的相似性显著高于具有不同MoA的药物对（双侧t检验，P = 3.1 × 10−119）（图3b），这表明存在药物MoA特异性的代谢特征。
49500编辑于 2025-03-17 - 来自专栏DrugOne
eLife | NICEdrug.ch : 可进行药物代谢分析的药设平台
该论文开发了一个药物设计平台（数据库），收录了25万个具有生物活性的小分子，并研究了它们的代谢产物、代谢过程和毒性。 对于计算化学的两种方法都没解释药物在细胞中的生物化学反应及代谢过程。 在5-FU代谢附近的8个副代谢物，展示了最相似的人类天然代谢物、被抑制的酶和反应的天然产物 NICEdrug识别抗癌药物5-FU的代谢产物毒性 作者收集了LTKB和超级毒性数据库中的毒性分子，然后利用BridgIT 通过对32种疟原虫特有的酶催化分子进行分析，得到68个代谢物和157个独特的代谢物-酶反应对。然后在数据库中48544种药物计算与32种疟原虫特有酶之间的药效，进行药物重定位。 Elife, 2021, 10: e65543. https://elifesciences.org/articles/65543
1K40发布于 2021-08-24 - 来自专栏智药邦
AI+代谢性疾病药物开发｜Biolexis完成1000万美元A轮融资
新一轮融资将推动Biolexis的研发管线，其中包括一系列前景广阔的代谢候选药物。这些药物有望解决影响全球数百万人的各种代谢性疾病，这些疾病与肥胖症和糖尿病等重大健康并发症有关。 Biolexis首席执行官David Bearss 表示：“Clarke Capital的资金支持证明了我们代谢药物组合的潜力。我们的科学是正确的，我们的团队已经准备好解决代谢紊乱领域尚未满足的需求。 此次重组将使公司能够扩大业务，加快主要候选药物的临床开发。随着代谢性疾病的发病率不断上升，而目前的治疗药物供应有限，对新的有效治疗方案的需求比以往任何时候都更加迫切。 Biolexis采用其独特的人工智能驱动的MolecuLern™流程，目前有40个在研项目和10个处于IND申请阶段的在研项目。 关于 Biolexis Biolexis Therapeutics是一家私营临床阶段生物制药公司，致力于开发针对癌症、免疫介导、神经退行性疾病、自身免疫性疾病、代谢性疾病和炎症性疾病的小分子药物。
33610编辑于 2024-03-05 - 来自专栏用户7627119的专栏
2021年全球最贵药物TOP10
近日，美国药品价格跟踪网站GoodRx公布了全球10大最贵药物榜单。 同时，整体来看TOP10主要以罕见病药物为主。 Myalept是首个获批用于治疗该罕见疾病的药物，也是控制该病的唯一治疗方法。 在每个阶段，患者需要使用不同数量的药物，但通常每年需要使用约168瓶。 10、Soliris Alexion的Soliris于2007年3月获得FDA批准上市，用于治疗成人和儿童阵发性睡眠性血红蛋白尿症（PNH），随后又被批准用于非典型溶血性尿毒症综合征（aHUS）。
1.2K10编辑于 2022-09-21 - 来自专栏生命科学
MCE 肿瘤代谢
肿瘤细胞的核苷酸代谢通路中的一些关键酶也可以成为抗肿瘤药物靶点。 除肿瘤之外，物质代谢紊乱还跟许多慢性疾病的发生或发展密切相关，如糖尿病、肥胖、心血管疾病等。针对代谢相关疾病的基础研究和药物研发也变得越来越重要。 相关化合物库 作用 代谢/蛋白酶化合物库 MCE 收录了 1800+ 种代谢/酶相关的小分子化合物，是代谢相关疾病药物研发的有力工具。 Front Oncol. 2020Feb 25;10:207. 5. Liem Minh Phan, et al. Br J Pharmacol. 2016 Mar;173(6):970-9. 10. Nuno Santos, et al.
60520编辑于 2023-03-15 - 来自专栏生物信息与临床医学专栏
玩转铁代谢
此外，铁代谢紊乱与癌症等疾病发展有关。下面，我将带领大家回顾一下机体铁代谢的过程。 人体的铁元素除了日常从食物中摄取1-1.5mg外，主要来自衰老红细胞的分解。 图1衰老红细胞在人体的代谢过程 铁被吸收后，大部分与血红素结合用于各种生化过程，被称为“功能铁”。另一部分在铁氧化酶的作用下，重新被氧化成Fe3+。 以上，就是对机体铁代谢的简单阐释。近年来，关于机体铁代谢的研究成为热点，也有不少研究生信者将眼光投向这一领域。 Metabolism- Related Gene Signatures forPredicting the Prognosis of Patients With Sarcomas》利用TCGA和GEO数据库研究了铁代谢相关基因特征和骨肉瘤患者生存关系 Frontiers in oncology. 2020;10:599816.
1.3K10编辑于 2022-08-21 - 来自专栏空间转录组数据分析
10X单细胞（10X空间转录组）数据分析之代谢推断篇
由于代谢网络的复杂性，某代谢的扰动可以产生级联效应，从而影响网络中看似相对较远的部分，因此亟待工具将特定反应/酶的观测与代谢及其在疾病中的失调系统地联系起来。 compass --data-mtx expression.mtx genes.tsv sample_names.tsv --num-processes 10 --lambda 0.25 --species 分析使用到的文件包括单细胞转录组数据和对应的代谢基因集，可以使用单细胞转录组的RDS文件和软件自带的代谢基因集。 代谢活性分析 首先，使用Vision算法进行代谢打分计算得分。 图片 scFEA同样是基于已有的一些代谢相关的功能通路，不过作者将代谢图谱中的网络图案被简化为代谢模块，其中反应和代谢物用黑色和蓝色的矩形表示，模块和代谢物用绿色和粉色表示。 final_df$flux)/abs(mean(final_df$flux)) ppp_all <- c(ppp_all, pp) } tg_ids <- which(ppp_all > 1e-10
4K12编辑于 2023-03-29 - 来自专栏智药邦
AI+免疫代谢重编程｜莱芒生物完成近亿元天使轮融资，晶泰科技参投
融资将用于加速其免疫代谢重编程的生物大分子药物的临床前研究，推进全新代谢增强型CAR-T细胞治疗药物管线向临床试验进展，并拓展自主研发的免疫代谢重编程平台的应用范围，在更多免疫治疗领域赋能新一代抗肿瘤药物的研发 基于EPFL最新的两项研究成果，团队研发了全球首创的Meta 10免疫代谢重编程技术，建立了具有自主知识产权的生物大分子药物和新型免疫细胞药物的发现、研发、生产技术平台。 Meta10 代谢重编程技术平台显著增强多种肿瘤免疫疗法原理示意图 本次轮融资后，莱芒生物将积极推进两款代表性候选药物率先进入临床前和临床研究，并重点布局对黑色素瘤、结肠癌、乳腺癌等多个实体肿瘤的临床研究 莱芒生物联合创始人兼董事长唐力教授表示：“很荣幸在投资人与战略伙伴的支持下，莱芒生物从免疫代谢重编程这一独特角度入手开发出核心技术Meta 10，在短时间内就实现研发进展的快速突破，这也让我们更加坚信Meta10 基于源头创新的Meta10免疫代谢重编程技术，公司创建了具有自主知识产权的免疫代谢重编程生物大分子药物平台、代谢增强型免疫细胞治疗平台、以及基于AI计算的超级免疫代谢调节因子研发平台。
68220编辑于 2022-03-04 - 来自专栏生命科学
药物筛选化合物库 | MedChemExpress缺氧诱导因子 HIF在细胞代谢中的作用 | MedChemExpress
氧气对于人类以及地球上其他绝大多数生物的重要性是不言而喻的，我们可以几天不吃饭不喝水，却一分钟也离不开氧气，我们需要氧气参与体内物质的代谢，提供能量。 因此，细胞和机体对氧气浓度的感知也必然是生命的基本功能，但细胞对氧气的感受机制在最近 10 年才逐渐研究清楚。William G. Kaelin、Sir Peter J. 细胞感受氧气的机制 细胞对氧气感知的关键分子是缺氧诱导因子 HIF，HIF 是低氧相关基因的转录因子，能促进各种应对低氧的基因表达，在肿瘤发生、血管增殖、无氧代谢等细胞基本代谢调节中的发挥重要作用。 MCE 紧跟科研步伐，该化合物库也处于不断更新中，可为您筛选氧感应机制相关的药物提供更多便利。 参考文献 [1] Semenza, G.L, et al.
72710编辑于 2023-03-01 . | DeepMetab：首个实现 CYP450 介导代谢端到端预测的图学习框架
在药物研发领域，药物代谢预测始终是药代动力学研究的核心难题。 一、药物代谢预测的行业痛点：从实验困境到计算工具局限 药物代谢（即生物转化）是药物在体内被酶系统修饰的关键过程，其中肝脏中的细胞色素P450（CYP450）酶系承担了约75%的药物代谢任务，其介导的代谢产物不仅决定药物疗效 如羟基化反应占比最高，约为一半）；B 部分分析底物训练数据集，b1 子图对比了各 CYP 亚型的底物与非底物分子数量分布，揭示了数据集中的类别不平衡问题（如 CYP2A6、CYP2E1 的正负样本比不足 1:10 DeepMetab采用多任务学习策略，针对9种主要CYP亚型（CYP1A2、CYP2A6等）共享特征表示与学习参数，同时通过损失加权策略解决数据不平衡问题——例如CYP2A6等“小众”亚型的正负样本比不足1:10 这些案例表明，DeepMetab能为药物安全性评估提供精准指导——早期识别毒性代谢产物，减少后期研发失败风险；同时为药物结构优化提供方向，例如通过修饰高风险代谢位点提升药物安全性。
33110编辑于 2026-01-08- 来自专栏智药邦
莱芒生物完成超亿元A轮融资首关，加速推进代谢增强型免疫疗法临床转化
莱芒生物由瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）唐力教授团队联合晶泰科技创立，是一家专注于免疫代谢重编程（Meta 10）+前沿人工智能（AI）相结合的肿瘤免疫治疗创新药物研发公司。 针对T细胞耗竭这一长期制约肿瘤免疫治疗疗效的关键问题，依托创始团队前沿的研究成果，莱芒生物开发了全球首创的IL-10介导的免疫代谢重编程技术（Meta 10）。 临床前研究表明，Meta 10代谢重编程技术平台能够有效克服T细胞耗竭并诱导干性样免疫记忆细胞的形成。 其中，进展最快的为代谢增强型CD19 CAR-T疗法（Meta10-19注射液）。 基于免疫代谢重编程（Meta 10）+前沿人工智能（AI）的创新技术，公司专注于研发代谢增强型肿瘤免疫治疗药物。
42610编辑于 2024-11-18 - 来自专栏细胞培养
人原代肝细胞长期培养模型比较：HepatoPac、Spheroids与TCS在慢代谢药物ADME研究中的应用解析
，往往难以满足慢代谢药物、连续代谢产物以及复杂I相/II相代谢研究需求。 关键词：人原代肝细胞；PrimaryHumanHepatocytes；HepatoPac；Spheroids；TCS；药物代谢；慢代谢药物；肝细胞模型；ADME；药物筛选；LifeNetHealth一、 其中，TCS模型中M545（1）代谢物占比达到约10%，显示其在连续II相代谢物生成方面具有较好表现。这一结果说明，长期培养模型对于II相代谢研究以及连续代谢过程模拟具有更高价值。 总体来看，TCS与Spheroids在多种慢代谢药物研究中表现出更稳定的代谢活性，而HepatoPac在不同药物之间存在较明显差异。 八、总结随着慢代谢药物研究、复杂连续代谢研究以及ADME评价需求不断增加，长期原代人肝细胞培养模型正在逐渐成为药物研发中的重要工具。
20010编辑于 2026-05-13 - 来自专栏DrugOne
. | DeepMetab：首个实现 CYP450 介导代谢端到端预测的图学习框架
DRUGAI 在药物研发领域，药物代谢预测始终是药代动力学研究的核心难题。 药物代谢预测的行业痛点：从实验困境到计算工具局限 药物代谢（即生物转化）是药物在体内被酶系统修饰的关键过程，其中肝脏中的细胞色素P450（CYP450）酶系承担了约75%的药物代谢任务，其介导的代谢产物不仅决定药物疗效 如羟基化反应占比最高，约为一半）；B 部分分析底物训练数据集，b1 子图对比了各 CYP 亚型的底物与非底物分子数量分布，揭示了数据集中的类别不平衡问题（如 CYP2A6、CYP2E1 的正负样本比不足 1:10 DeepMetab采用多任务学习策略，针对9种主要CYP亚型（CYP1A2、CYP2A6等）共享特征表示与学习参数，同时通过损失加权策略解决数据不平衡问题——例如CYP2A6等“小众”亚型的正负样本比不足1:10 这些案例表明，DeepMetab能为药物安全性评估提供精准指导——早期识别毒性代谢产物，减少后期研发失败风险；同时为药物结构优化提供方向，例如通过修饰高风险代谢位点提升药物安全性。
43710编辑于 2025-10-14 - 来自专栏单细胞天地
单细胞时代|| 单细胞代谢组学之免疫代谢
如今使用 10x Genomics，scRNA-seq实验每样本多达1万个细胞，常规检测每个细胞2到4千个基因。 基于流式细胞术的方法称为Met-Flow，使用10个氟铬偶联抗体靶向不同代谢途径中的限速酶和关键蛋白，结合表型标记生成27色流式细胞术面panel，以查询免疫细胞的代谢状态。 利用10个代谢标记的表达谱，Ahl等人可以聚类和分离血液白细胞亚群到不同的代谢。 值得注意的是，Met-Flow仅用10种代谢蛋白鉴定了血液白细胞亚群，其分辨率与500个基因的scRNA-seq分析相当，而单独分析相同的10个基因的表达不能区分免疫人群的差异。 例如，基于最近于面板之间的重叠，可以用代谢panle组成的10代谢抗体，也适用于多色流式细胞术和一组更大的panle包括一个额外的10个抗体。
3.9K40发布于 2021-03-10 - 来自专栏药物代谢与原代肝细胞研究
人原代肝细胞PHH与肝非实质细胞应用解析：药物代谢、肝毒性检测与MASH模型研究
摘要： 人原代肝细胞（PHH）和人肝非实质细胞是药物代谢、肝毒性检测、药物相互作用研究以及肝病机制研究中的重要体外模型。 理想的肝脏细胞资源应覆盖不同年龄阶段，包括新生儿、儿童、青少年及成人来源细胞，以便支持儿科药物研发、年龄相关性代谢差异研究和成人药物代谢评价。 10至14天，更适合慢代谢化合物研究、长期毒性检测和需要较长观察窗口的体外肝脏模型。 中期贴壁型细胞通常可维持5至9天，长期贴壁型可维持10至14天，可支持研究人员在较长培养窗口内观察CYP1A2、CYP2B6、CYP3A4等代谢酶对诱导剂的响应。 不同发育阶段肝脏中药物代谢酶表达谱和成熟度存在差异，因此儿童来源细胞能够为儿科药物剂量设计、药物安全性评价和发育相关代谢研究提供更合适的体外模型。图1.
4410编辑于 2026-07-06 - 来自专栏DrugOne
Nature Protocols | 基于机器学习和并行计算的代谢组学数据处理新方法
目前，代谢组学已经被应用于药物开发的各个阶段（如药物靶标识别、先导化合物发现、药物代谢分析、药物响应和耐药研究等）。基于代谢组学的高性价比特性，它被药学领域的研究者给予了厚望，有望加速新药开发的进程。 这一方法实现了对药学领域常见的“时间序列”和“多分类”代谢组学问题的数据处理，对药物靶标发现、药物代谢、药物响应与疾病发生发展的病理学机制研究都具有重要的价值。 2针对药学问题，实现时间序列和多分类代谢组数据处理 时间序列和多分类问题是药学研究中的常见问题，因而已经成为当前药物代谢组学研究的前沿热点。 有别于传统的二分类研究，时间序列代谢组研究可以动态监测不同的生物过程（如微生物生长、疾病发展、药物代谢与响应等）。同时，多分类代谢组对揭示某些生理过程、疾病转移等潜在机制也至关重要。 测试显示，相比串行运算来说，新方法整合的并行计算仅在个人电脑上就将运行效率提高了10倍以上。 参考资料 J. B. Fu, Y. Zhang, Y. X. Wang, H. N.
2.8K30编辑于 2021-12-31 - 来自专栏智药邦
10个开放获取的ADMET预测工具
候选化合物的不良药代动力学和毒性是药物开发失败的重要原因之一，尽早评估吸收、分布、代谢、排泄和毒性(ADMET)属性，可以及早规避失败风险。 计算机ADMET预测模型可以辅助药物化学家设计和优化先导物，下面这10个目前可以开放获取的ADMET预测工具值得收藏! XenoSite Web可以被药物化学家和生物学家用来预测人体的体内代谢和小分子的反应性。它可以详细预测CYP代谢酶的代谢位点和代谢产物。 主要集成了代谢位点和毒性预测。 http://crdd.osdd.net/oscadd/drugmint/ 10 CypRules CypRules 预测CYP450 (细胞色素P450)代谢抑制，包括CYP1A2、CYP2C19、
4.6K30编辑于 2023-02-14 - 来自专栏DrugOne
J. Med. Chem. | 重磅综述告诉你：口服药，长啥样？
药代动力学：高蛋白结合与高清除率并存 对药物代谢动力学参数的深入分析进一步揭示了现代口服药物的多样性特征。 获批药物的主要代谢酶 此外，P-gp和BCRP等转运蛋白相关的DDI也较为常见，分别涉及22种和12种药物。 尽管广泛的DDI可能限制部分药物的使用场景，但在缺乏替代疗法的疾病中，此类风险仍可通过临床监测与管理得以控制。 活性代谢物：隐藏在体内的“第二战场” 活性代谢物的普遍存在是另一个值得深入探讨的议题。 在所分析的104种药物中，至少有14种会在体内转化为具有药理活性的代谢产物。 其中，N-脱烷基化是常见的代谢路径，如司美替尼（Selumetinib）通过CYP3A4代谢生成N-去甲基司美替尼，尽管其在血浆中的水平不足母药的10%，但其药理活性更强，贡献了21-35%的总药理活性
32710编辑于 2025-11-29 - 来自专栏代谢检测试剂盒推文
赋能科研突破！Elabscience 增强型氧消耗率（OCR）荧光法测试盒助力线粒体机制研究
能量代谢研究：探究细胞糖酵解与氧化磷酸化的代谢切换机制。 肿瘤研究：分析肿瘤细胞代谢重编程特征，筛选针对代谢通路的抗癌药物。 代谢疾病研究：揭示糖尿病、肥胖等疾病中细胞能量代谢紊乱机制。 药物研发：筛选影响线粒体功能的药物，评估药物对能量代谢的调控作用。 低代谢样本可测 针对代谢水平较低的A549细胞，E-BC-F070仍能稳定检测，信号强度提升高达10倍以上，轻松应对“难测”样本。 3.细胞密度与荧光信号成正比 在不同密度（1×10⁵ cells/mL-4×10⁵ cells/mL）的HL-60细胞中，E-BC-F070均能呈现良好的信号响应，且信号与细胞密度成正比，结果趋势更准确 无论是基础科研中的机制探索，还是药物研发中的活性筛选，它都能提供可靠的数据支持，助力科研人员高效推进研究进程。选择这款高性价比的测试盒，让 OCR 检测更简单、数据更可信，加速科研成果落地！
41110编辑于 2025-11-10
腾讯云开发者
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