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单细胞转录组探索小鼠肝脏发育
现在你看到的是文献速递 肝脏背景知识 肝脏是一种多倍体器官，由具有一个或两个细胞核的肝细胞组成，每个细胞核含有2,4,8或更多单倍体染色体组。 肝脏是人体新陈代谢最旺盛的器官，负责着各种生理反应，像一个巨大的“化工厂”。除了代谢功能之外，肝脏还负责分泌胆汁、清除身体的毒素、表达血液中主要的载体蛋白以及免疫防御。 表明肝脏细胞至少可分为9种不同的类型，每一种都行使着自己的职责。” 而一些特定组织如心脏、肝脏等就含有多倍体细胞，特别是肝脏组织含有较高比例的四、八倍体等多倍体细胞。 肝脏是人体的重要解毒器官，同时酒精、肝炎病毒等毒性物质或毒性代谢物容易诱发肝细胞的基因突变，多倍体被认为有利于提供代偿性的正常基因来维持肝脏稳态。
1.3K10发布于 2020-03-27 - 来自专栏GiantPandaCV
轻量级肝脏与肝脏瘤2.5D分割网络阅读笔记
因为在肝脏与肝肿瘤分割中，尤其是肿区域大小不一，如果使用 U-Net 中固定的卷积序列，势必会导致感受野受到限制，降低分割精度。 请添加图片描述 上面两个表对应的可视化对应下图，红色代表肝脏区域，绿色代表肿瘤区域。 在处理肝脏边界含有肿瘤情况时，FCN、U-Net、R2U- Net 和 Attention U-Net 没有将肿瘤区域分割出来或将肝肿瘤误分割成肝脏，而且肝脏分割或多或少出现了过分割或欠分割，虽然 U-Net ++ 分割出来了肿瘤区域，但是出现了严重的错误分割，将大量肝脏区域分割成肝肿瘤，然而论文中的模型分割的结果接近于金标准。 请添加图片描述 最后，在下图中，分别在 LiTS17 和 3DIRCAb 数据集上对肝脏和肝脏肿瘤分割进行 3D 错误可视化（红色和蓝色区域分别表示明显的过分割和欠分割错误，而绿色区域表示与金标准的一致性
71240编辑于 2022-05-27 - 来自专栏最新医学影像技术
2018Medical Segmentation Decathlon——10项医学分割任务之task8肝脏肿瘤及肝脏血管分割
今天将分享10项医学分割任务之task8肝脏肿瘤及肝脏血管分割完整实现版本，为了方便大家学习理解整个流程，将整个流程步骤进行了整理，并给出详细的步骤结果。感兴趣的朋友赶紧动手试一试吧。 四、技术路线 任务1、肝脏血管分割 1、根据2018Medical Segmentation Decathlon——10项医学分割任务之task3肝脏肿瘤分割文章中肝脏分割出来的结果先进行形态学膨胀（核大小为 任务2、肝脏肿瘤分割 1、根据2018Medical Segmentation Decathlon——10项医学分割任务之task3肝脏肿瘤分割中肝脏分割出来的结果先进行形态学膨胀（核大小为5），再提取原始图像和标注图像的
67830编辑于 2023-09-20 - 来自专栏单细胞天地
解码人胎儿肝脏造血功能
方法及分析概览 样品：共收集17个胎儿标本，包括14个肝脏样本、7个皮肤样本、3个肾脏样本、3个卵黄囊标本，其中皮肤、肾脏被称为非淋巴组织（non-lymphoid tissues，NLTs）。 Fig. 3b 从卵黄囊到肝脏，红细胞血红蛋白基因表达以及从原始血红蛋白HBZ和HBE1表达到胎儿血红蛋白（HBA1和HBG2）表达的时间变化。 ? 与肝脏和卵黄囊相比，非淋巴组织中存在Pro-B，pre-B和B细胞，但缺少HSC / MPP和pre-B前体细胞。 ? Extended Data Fig. 5h & 5i NLT中的早期淋巴/ T淋巴细胞，NK细胞和ILC与肝脏相比相同的基因表达趋势。 髓样细胞组织分布特征 Fig. 5a & Fig. 5b 胎儿肝脏，胎盘和卵黄囊的HSC / MPP，髓系祖细胞，单核细胞和巨噬细胞的FDG图。 ?
1.2K30发布于 2020-03-27 - 来自专栏最新医学影像技术
ATLAS2023——MRI肝脏及肿瘤分割
今天将分享MRI肝脏及肿瘤分割完整实现版本，为了方便大家学习理解整个流程，将整个流程步骤进行了整理，并给出详细的步骤结果。感兴趣的朋友赶紧动手试一试吧。 二、ATLAS2023任务 肿瘤和肝脏自动分割 三、ATLAS2023数据集 该数据集包括来自90名不可切除肝癌患者的T1 CE-MRI肝脏扫描，还有90个肝脏和肝脏肿瘤分割Mask，分为训练集和测试组 所选择的图像通常是三个造影后注射阶段(动脉，门静脉或延迟)中的一个，也被专家用来描绘肝脏和肿瘤。在一些罕见的情况下，所选图像不需要注射造影剂。 最后，ATLAS数据集的CE-MRI由覆盖整个肝脏和肿瘤的44至136个胸腔和腹部横向切片的3D图像组成。 使用选定的CE-MRI，肝脏和肿瘤的轮廓由经验丰富的MRI放射科医生在横向切片上手动划定以产生标签。
1.3K20编辑于 2023-10-25 - 来自专栏单细胞天地
空转与肝（上）：肝脏的空间异质性
导言 肝脏是人体当中最重要的器官之一，具有代谢、解毒、造血、分泌胆汁等功能。肝脏也是再生能力最强的器官之一。在肝脏受到损伤以后，残存的肝细胞能够迅速增殖，补偿损伤的肝组织，恢复正常的肝脏功能。 在肝脏疾病当中，肝癌是我国最常见的恶性肿瘤之一。肝脏发育、肝脏再生、肝脏造血、肝脏肿瘤这一系列的科学问题都得到了生物医学界的广泛关注。 然而，肝脏的不同空间位置的基因表达、表观调控、代谢功能、再生特性均存在很大的差异。因而，深入研究肝脏的功能需要建立在空间水平上，而空间转录组的出现为肝脏的研究提供了极为有效的帮助。 对肝脏研究具有转折点意义的事件是单细胞转录组测序的出现，为肝脏异质性的研究提供了不同物种的肝脏细胞图谱。但是，单细胞转录组的测序数据会丢失细胞的空间信息。 在这一年里，结合空间转录组、单细胞转录组研究肝脏的文章深入到不同物种的胎肝、成年健康肝脏、肝脏肿瘤的研究当中（主要是小鼠和人）。
1.6K10编辑于 2022-03-14 - 来自专栏聊点学术
【科研作图】AI快速画出一个肝脏
昨天闲着，我用AI画了一个肝脏，感觉还行。 ? 总结了一下，我发现绘制这么一个肝脏，好像4个大步骤就能完成。绘图期间只需要使用铅笔工具、平滑工具、效果工具。 ? ---- 1.铅笔工具 铅笔工具主要是用于绘制肝脏外形。最快捷的办法就是在搜索一张肝脏的图片，然后置入到AI中，用铅笔工具顺着外形去描绘勾勒肝脏外形。要点是尽量贴着慢慢勾勒好。 ? （2）风格化-内发光，这个可以营造光照在肝脏表面，形成过中间亮，四周暗的效果。 ? ? （3）风格化-羽化，这个工具可以虚化图形。我一般都是先用椭圆工具画一个圆形（填充白色，无外框）。
2.7K20发布于 2021-01-25 - 来自专栏PaddlePaddle
基于Res-Unet网络实现肝脏肿瘤分割任务
这篇文章我主要介绍如何使用深度学习计算机视觉方法对CT扫描中的肝脏和肝脏肿瘤进行分割。 根据2018年的统计数据[1]，肝脏肿瘤是全球第7常见的肿瘤，但致死病例总数却在所有肿瘤类疾病中排名第二。 早发现早治疗能有效提升肝脏肿瘤疾病的治愈率，但人工在大量的肝脏CT影像中寻找体积很小的肿瘤工作量极大，也很容易漏检。 这个场景下，使用深度学习算法自动进行快速、准确的肝脏及肝脏肿瘤分割筛查是一个很好的解决方案。 LiTS数据集是目前最大的开源肝脏分割数据集，其中包含130名患者的CT扫描和医生对患者肝脏及肿瘤的分割标注，下图是数据集中的一个示例： ? 而且从分割结果中，我们可以计算获得肝脏体积，肿瘤数量，肿瘤体积，肝脏肿瘤负担等数量化的指标，更好地辅助医生进行诊断。
4.4K21发布于 2020-09-14 - 来自专栏镁客网
全新泵洗细胞技术采用猪肝脏，融合干细胞培育实现无排异反应的异种肝脏移植 | 黑科技
2015年，美国斯坦福大学和日本东京大学通过基因技术处理猪的受精卵，然后将人类的iPS细胞在猪的身体内培育成肝脏。 ，培育出可移植的肝脏。 据该公司的研究者Jeff Ross表示，他们的方法很简单，他们首先会采用一种猪的器官，然后利用他们的专利技术--泵洗细胞技术，去除动物肝脏内所有的细胞物质，然后用被移植者的人体细胞再生成功能性器官。 但他还是指出，每一项技术都有自己的挑战，因为在植入肝脏时，我们只要培育出20%必要的功能就可以了；而心脏却要难得多，在植入的瞬间就会需要100%的功能，目前该技术还无法实现对心脏的培育和移植。 虽然该技术的成本较低，但也并不是任何肝脏都可以移植的，该公司表示他们也专注于开发可移植的肝脏，未来将会每年解决4万名患者的需求。
65900发布于 2018-05-30 - 来自专栏类器官/器官芯片/3D培养
肝脏器官芯片用于siRNAASO寡核苷酸递送研究
更近的进展，如脂质纳米颗粒和GalNAc偶联技术，实现了向肝脏的靶向药物递送。GalNAc通过肝细胞上的去唾液酸糖蛋白受体靶向肝脏。 二、研究目的：建立肝脏MPS寡核苷酸递送评价体系我们介绍CNBioPhysioMimix肝脏MPS，用于研究寡核苷酸向肝脏的递送及其被原代人肝细胞的摄取。 (D)在14天内对肝脏MPS进行寡核苷酸给药的时间线。(E)通过明场显微镜成像的支架上的3D人肝脏微组织。比例尺：200μm。 四、讨论分析：肝脏MPS在寡核苷酸摄取与基因敲低中的应用价值在这项研究中，我们展示了肝脏MPS在检测靶向肝脏的寡核苷酸的摄取和基因敲低方面的有效性。 五、结论与展望：肝脏芯片用于寡核苷酸疗法体外筛选我们的研究证明了原代人肝脏MPS和寡核苷酸递送测定在克服非人模型局限性方面的实用性，可用于评估靶向肝脏的寡核苷酸的摄取和基因敲低效力。
7710编辑于 2026-05-07 - 来自专栏最新医学影像技术
LLD-MMRI2023——多模态MRI 的肝脏病变诊断挑战
今天将分享多模态MRI 的肝脏病变诊断完整实现版本，为了方便大家学习理解整个流程，将整个流程步骤进行了整理，并给出详细的步骤结果。感兴趣的朋友赶紧动手试一试吧。 为了提高肝脏病变诊断的准确性，多模态对比增强磁共振成像 (MRI) 已成为一种很有前途的工具。 您需要根据相应的8卷来诊断患者肝脏病变的类别。 labels：Annotation.json包含真实的体积间距信息、边界框信息和病变的类别信息。 各类别肝脏病变对应标签如下： 注：-1表示该数据未提供类别标签，需要预测和提交。换句话说，带有标签-1的案例意味着数据属于验证集。 参与者需要对每种情况下的肝脏病变类型做出诊断。 4、每个病变有 8 个不同的阶段，提供不同的视觉线索。
1.3K20编辑于 2023-09-29 - 来自专栏单细胞天地
10x单细胞测序技术揭示肝脏细胞全景图
文章总览 肝脏是人体内最大的实体器官，对代谢和免疫功能至关重要。然而人们对构成人体肝脏的细胞类型和免疫微环境知之甚少。 作者使用10x单细胞RNA测序手段绘制了人类肝脏细胞全景图，从来自五个人新鲜肝脏组织中分离得到的8444个实质和非实质细胞转录谱。 背景知识 肝脏对人体新陈代谢和免疫功能至关重要。单细胞分辨率的健康人肝脏细胞全景图对于理解肝病的发病机制和治疗至关重要。 因此本文一是应用作者以前开发的肝脏组织解离技术来分离肝脏组织，二是使用单细胞转录组测序技术（scRNA-seq），结合两者来绘制正常人肝脏细胞全景图。 以前有过小鼠肝脏图谱的研究，而现在人肝脏转录图谱则又向前发展了一大步，对研究微环境及肝功能和疾病提供了支持。 ?
4.9K31发布于 2020-03-30 - 来自专栏最新医学影像技术
Liver segmentation 3D-IRCADb2010——对比增强CT肝脏分割
今天将分享对比增强CT肝脏分割完整实现版本，为了方便大家学习理解整个流程，将整个流程步骤进行了整理，并给出详细的步骤结果。感兴趣的朋友赶紧动手试一试吧。 由于与邻近器官的接触、肝脏的非典型形状或密度、甚至图像中的伪影，肝脏分割软件可能遇到的主要困难。 二、Liver segmentation 3D-IRCADb2010任务 对比增强CT肝脏分割，分割器官包括骨，门静脉，肝脏，肝肿瘤，静脉系统，动脉。 下表提供了图像信息，例如肝脏大小（宽度、深度、高度）或根据库尼诺分割的肿瘤位置。其中只有骨头，门静脉，肝脏是20例都有标注的，其他器官只有部分标注的。
73910编辑于 2024-01-03 - 来自专栏单细胞天地
单细胞测序中小鼠肝脏组织细胞悬液制备流程
背景介绍 肝脏，是脊椎动物身体内以代谢功能为主的一个器官，并在身体里面充分扮演着去氧化，储存肝糖，分泌性蛋白质的合成等。肝脏是由肝细胞组成，肝细胞极小，肉眼看不到，必须通过显微镜才能看到。 肝脏的主要连接成分主要是结缔组织，因此我们选择使用胰蛋白酶对肝脏进行第一轮解离，枯草芽孢杆菌蛋白酶可水解天然和变性蛋白，并且在碱性条件下具有活性。我们使用其对肝脏组织进行进一步解离。 为了保存小鼠肝脏完整的基因表达谱，我们将成年小鼠肝脏置于冰上进行解离。小鼠肝脏第一层由0.25%胰蛋白酶在4℃下离解离10min，第二层解离由添加地衣芽孢杆菌酶，胶原酶及DNase I 组成的混合酶。 小鼠肝脏组织解离部分试剂耗材参考表 名称 厂家 货号 1×DPBS Thermo·Fisher 14190 胰蛋白酶 Thermo·Fisher 15400054 牛血清白蛋白 无要求 无要求 EDTA 结果及注意 注意：肝脏组织中杂质及碎片较多，且肝细胞容易破裂；所以解离过程中要注意根据实际情况适当下调。
3.6K30发布于 2021-10-09 AbMole | Alirocumab助力揭秘HTR期间肝脏免疫调节新机制
C，对受体小鼠的移植物和肝脏进行PCSK9的免疫组化染色。比例尺，100μm。D，进行Western印迹检测PCSK9在受体小鼠肝脏中的表达，并使用GAPDH作为内参。 此外，研究人员还进行了体内研究，通过构建心脏转基因动物模型进行实验，实验结果显示，在HTR期间，Tnf或Ifn缺乏不仅能抑制受体肝脏SREBP2的表达，还可以降低肝脏Pcsk9 mRNA的表达和血清PCSK9 图 3 A和B，在心脏移植后第6天收集受者的肝脏和血清。A, 肝脏中SREBP2的mRNA和蛋白水平通过qPCR（n=4）和WB测量。 B, 肝脏中SREBP2的mRNA水平通过qPCR测定，血清中PCSK9的水平通过ELISA测定（n=4）。 从而揭示了在HTR期间，肝脏通过PCSK9/CD36通路进行免疫调节的新机制，以及该通路可能是HTR的潜在治疗靶点。
14510编辑于 2025-12-22- 来自专栏类器官/器官芯片/3D培养
肝脏微生理系统在胆汁淤积性DILI预测中的应用分析
二、研究设计：不同模型的系统对比在一项针对肝脏模型的系统性研究中，对以下模型进行了对比评估：肝脏微生理系统（MPS）模型不同结构的器官芯片模型传统二维静态培养模型实验选用三类常见细胞来源：原代人肝细胞（ iPSC衍生肝细胞并围绕以下关键指标进行分析：胆汁酸代谢转运体表达（如BSEP、MRP2/3）核受体信号通路（如FXR、PXR）代谢功能（CYP活性）细胞功能指标（白蛋白、尿素）三、微生理系统的结构特点典型肝脏微生理系统通常具备以下结构特征 ：多腔室结构设计连续流动培养体系可调控流速这种结构能够：提供稳定的营养与氧气分布降低局部应激更接近体内肝脏微环境四、关键实验结果分析1长期功能维持能力在约30天培养周期内：白蛋白分泌保持稳定尿素生成持续 微环境模拟程度流体力学条件细胞状态维持能力对于胆汁淤积性DILI这类复杂机制问题：更高生理相关性的模型通常具有更好的预测能力六、总结在药物安全评估中：单一模型难以覆盖所有毒性机制模型选择应基于具体研究目标肝脏微生理系统通过模拟体内动态环境 ：提高细胞功能稳定性增强机制研究能力有助于提升DILI预测的可靠性未来在体外模型发展中：如何平衡复杂度、稳定性与可重复性，将成为重要方向参考说明本文内容基于公开研究资料整理，用于分析不同肝脏模型在胆汁淤积性
3000编辑于 2026-03-25 - 来自专栏生信菜鸟团
【生信文献200篇】10 单细胞转录组探索小鼠肝脏发育
更广泛地说，我们发现编码肝脏分泌蛋白的基因的mRNA存在门脉周围偏向。将需要ATP的血浆蛋白生产任务分配给门脉周围氧合良好的层可能在能量上是有效的，因为估计有20%的肝脏氧气消耗专门用于这一任务。 尽管这些基因没有明显的GO注释，它们包括关键的肝脏基因，如HAMP和HAMP2，它们编码Hepcidin，一种调节全身铁水平的分泌型肝脏激素。其他非单调基因包括IGFBP2、Mup3和Cyp8b1。 肝脏背景知识 肝脏是一种多倍体器官，由具有一个或两个细胞核的肝细胞组成，每个细胞核含有2,4,8或更多单倍体染色体组 肝脏是人体新陈代谢最旺盛的器官，负责着各种生理反应，像一个巨大的“化工厂”。 尽管基本协议概念相似，但是每种样本类型都需要专用协议（在文献中非常丰富） 4.肝脏代谢分区 肝脏代谢包含大量相互关联的合成代谢和分解代谢功能，这些功能可以同时执行而不会浪费能量。 肝脏显示出明显的均匀解剖结构，该结构由呈蜜梳状图案的主要六边形小叶的规则排列组成。
2.9K10发布于 2021-02-03 医学分割数据集B超图片肝脏分割数据集labelme格式271张1类别
数据集格式：labelme格式(不包含mask文件，仅仅包含jpg图片和对应的json文件)
22910编辑于 2025-07-16- 来自专栏生信宝典
Nature Immunology｜肝脏肿瘤逃脱自然杀伤细胞免疫监视的新机制
自然杀伤细胞（Natural killer cells， NK cells）是一种效应性淋巴细胞，在人体抗肿瘤过程中发挥重要作用，但是，仍然有一些肿瘤细胞能够逃避机体NK细胞的攻击，逐步发生发展，侵袭转移，严重危害人体健康，其机理有待进一步探讨。
82310发布于 2019-10-28 - 来自专栏山丘安全攻防实验室
看我如何利用社会工程学+XSS组合拳击碎骗子的心肝脏脾！
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92850发布于 2020-03-06
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