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最新人类肝细胞图谱
摘 · 要 本篇文章对从来自9个人提供的正常肝组织捕获的约10,000个细胞进行单细胞RNA测序，构建了人类肝细胞图谱。 文章发现并定义了内皮细胞，库普弗细胞和肝细胞中以前未知的亚型，并且这些细胞具有transcriptome-wide zonation。 https://cran.r-project.org/web/packages/RaceID/vignettes/RaceID.html 总结 这篇文章首次发现了肝细胞、内皮细胞和巨噬细胞的新亚型
1.5K40发布于 2020-03-30 - 来自专栏作图丫
8+！免疫相关：肝细胞癌中 T 细胞介导的肿瘤杀伤的分子特征
导语 尽管检查点阻断是治疗肝细胞癌 (HCC) 的一种有前途的方法，但尚未确定预期会出现反应的患者亚群。T 细胞介导的肿瘤杀伤 (TTK) 是免疫检查点抑制剂治疗的基本原理。 结合生存分析结果（图 2E），与有利生存结果相对应的簇 2 中的样本显示，效应记忆 CD8+ T 细胞、Th1 细胞、CD56 自然杀伤细胞、嗜酸性粒细胞、自然杀伤 T 细胞、中性粒细胞和浆细胞样树突状细胞大量浸润
69820编辑于 2022-12-14 - 来自专栏聊点学术
Image Pro Plus测量肝细胞脂滴。
This is the dividing line. 1 — 背景知识 众所周知，缺氧、缺血、中毒、感染时，肝细胞脂肪代谢失衡，细胞会出现不同程度的脂肪变性，中性脂肪会在胞质内堆积 镜下可见在变性的肝细胞胞浆内出现大小不一的圆形空泡，初见于核周，以后变大，较密集散布于整个胞浆，严重时可融合为一大空泡，形似脂肪细胞。这些脂滴在病理制片过程中溶解了，所以切片上仅剩残留的脂滴轮廓。 肝细胞空泡变性最严重的区域常在中央静脉周围。甚至正常动物肝脏的中央静脉周围也可见类似的空泡。 ? 由此可见，肝细胞空泡变时，胞浆中空泡大小及所占据的面积是评价肝细胞损伤的一个重要指标。 在传统病理分析中，我们只能通过轻微、轻度、中度和重度分级法评价肝细胞损伤。 文献显示，IPP可测量肝细胞空泡变，但是无法分清这种改变到底是来自中性脂肪还是磷脂。这种情况需要我们结合实际情况具体分析。 此外，中央静脉附近肝细胞内的糖原也会对测量造成影响，动物取材前禁食会起到很大帮助。 ?
8.6K21发布于 2020-07-22 - 来自专栏细胞培养
CYP450酶诱导研究模型解析：全人源肝细胞TCS体系的应用表现
研究结果表明，TCS在维持肝细胞长期功能及CYP诱导能力方面表现稳定，尤其在CYP2C酶诱导研究中具有一定应用潜力，可为药物研发中的体外诱导模型选择提供参考。 关键词全人源肝细胞；三培养体系；TCS；原代人肝细胞；PHH；CYP450；CYP酶诱导；CYP2C酶诱导检测；肝细胞诱导评估模型；药物代谢研究一、引言在药物研发阶段，新型化合物对主要细胞色素P450（ 尽管PHH结合监管指南往往能较合理地预测临床诱导风险，但对于新一代的肝细胞模型在CYP诱导评估中的表现，目前仍缺乏充分认知。 表4.各CYP酶的最大诱导倍数（Eₘₐₓ）和半数效应浓度（EC₅₀）四、研究讨论传统PHH模型虽然被广泛用于CYP诱导研究，但在长期培养过程中，常会出现：肝细胞功能下降；CYP表达水平降低；细胞状态不稳定 总体来看，全人源肝细胞三培养体系（TCS）在长期培养稳定性与CYP450酶诱导研究中表现出良好应用潜力，可作为体外药物代谢与诱导评价的重要研究模型之一。
18110编辑于 2026-05-08 - 来自专栏Python与算法之美
8，模型的训练
根据问题特点选择适当的估计器estimater模型： 分类(SVC,KNN,LR,NaiveBayes,...) 回归(Lasso,ElasticNet,SVR,...) 一，分类模型的训练 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 二，回归模型的训练 ? ? ? ? ? ? ? ? 三，聚类模型的训练 KMeans算法的基本思想如下： 随机选择K个点作为初始质心 While 簇发生变化或小于最大迭代次数： 将每个点指派到最近的质心，形成K个簇 重新计算每个簇的质心 ? 四，降维模型的训练 PCA主成分分析(Principal Components Analysis)是最常使用的降维算法，其基本思想如下： 将原先的n个特征用数目更少的m个特征取代，新特征是旧特征的线性组合 可以结合FeatureUnion 和 Pipeline 来创造出更加复杂的模型。 ?
90031发布于 2020-07-17 - 来自专栏生信菜鸟团
Cell | 单细胞技术揭示人肝细胞图谱
其进一步使用研究的图谱来阐明发生在肝癌细胞和移植到小鼠肝脏的人肝细胞和肝内皮细胞中的表型变化。该人类肝细胞图谱提供了一个强大的资源，使我们能够在正常和病变的肝脏中发现以前未知的细胞类型。 方法： ? 个移植后小鼠细胞 使用RaceID3（FateID包）进行后续分析；并标准化 6.扩散伪时间分析和自组织映射 使用destiny包 7.对比小鼠 使用GSE84498的数据来分析了人和小鼠肝区进化保护情况 8. 总结 该研究建立了一个人肝细胞图谱，揭示了主要肝细胞群的异质性和成人肝脏中上皮祖细胞的存在。 我们的图谱揭示了肝细胞和内皮细胞的转录组范围的分带，并提示不同的肝细胞类型可能会相互合作来完成必要的功能。 关于HCC的分析表明，该图谱为肝脏疾病的研究提供了关键参考，将有助于开发迫切需要的人类肝脏模型，包括类器官和人性化的肝脏嵌合小鼠模型。
6.7K31发布于 2020-03-30 - 来自专栏药物代谢与原代肝细胞研究
人原代肝细胞PHH与肝非实质细胞应用解析：药物代谢、肝毒性检测与MASH模型研究
关键词：人原代肝细胞、PHH、人肝非实质细胞、Kupffer细胞、肝星状细胞、肝内皮细胞、肝细胞培养基、药物肝毒性检测、MASH模型、体外肝脏模型 一、人原代肝细胞选型主要标准人原代肝细胞是药物研发中评估代谢稳定性 三、人原代肝细胞PHH的主要类型与应用场景人原代肝细胞是药物研发中使用广泛的肝脏细胞模型。 培养基验收后，复苏、铺板和维持培养基基础液通常置于2℃至8℃保存，补充剂则按照说明置于-20℃保存。复苏前，应提前20至30分钟将复苏培养基置于37℃水浴预热。 随后用70%酒精擦拭冻存管外部，将细胞悬液转移至含预热复苏培养基的离心管中，并在室温下以100×g离心8分钟。离心后轻轻吸弃上清，加入预热铺板培养基，轻柔重悬细胞沉淀，再进行细胞计数、活率和产量评估。 细胞进入37℃、5% CO₂培养箱后，可按照“南北向、东西向、8字形”的方式轻轻摇晃培养板，使细胞均匀分布。培养前60分钟内，每隔约15分钟重复轻柔摇晃一次，有助于提高细胞铺板均一性。
5910编辑于 2026-07-06 - 来自专栏细胞培养
人原代肝细胞长期培养模型比较：HepatoPac、Spheroids与TCS在慢代谢药物ADME研究中的应用解析
为什么慢代谢药物研究越来越依赖长期原代肝细胞模型？ 其中，HepatoPac是一类微图案化共培养模型，常用于延长原代肝细胞功能维持时间；Spheroids通过三维肝细胞球体结构维持细胞间相互作用；TCS则通过三培养系统构建更加稳定的长期培养环境；SHH作为传统悬浮人肝细胞模型 这种比较方式不仅关注模型是否能够消耗原药，也关注其是否能够生成具有体内相关性的代谢产物，因此更适合评价长期肝细胞模型在真实药物代谢研究中的应用价值。表1：三种长期原代人肝细胞培养模型。 研究结果显示，在HepatoPac、Spheroids和TCS三种长期培养模型中，均能够检测到人体内11种循环代谢物中的8种，而SHH体系则存在明显缺失。 表4：人血浆和肝细胞中鉴定出的TAK-041及其代谢产物。六、不同长期培养模型在原药消耗方面的差异除代谢物种类之外，原药消耗比例也是评价不同肝细胞模型代谢能力的重要指标。
20010编辑于 2026-05-13 顶刊分享--激活的ATF6α是限制免疫监视的肝脏肿瘤驱动因子
结果2、肝细胞ATF6α活化诱导损伤的机制及FBP1的保护作用肝细胞特异性ATF6α活化小鼠模型的建立与表型通过他莫昔芬诱导的肝细胞特异性nATF6α转基因小鼠（TGAlb-cre+）及AAV8-cre 肝细胞特异性Atf6敲除（Atf6ΔHep）的多模型验证CD-HFD模型：58周喂养后，Atf6ΔHep小鼠肝癌发生率、肿瘤数量显著降低，肝糖原恢复、Fbp1表达上调、糖酵解通路下调，CD8+及PD-1 核心结论Atf6缺失（全局或肝细胞特异性）通过维持FBP1水平、抑制糖酵解及UPR、减轻免疫耗竭，在多物种肝癌模型中发挥保护作用。 机制模型：ATF6α活化肝细胞通过增强糖酵解/乳酸产生，在细胞非自主层面上抑制CD8+ T细胞抗肿瘤免疫监视。 核心结论肝细胞ATF6α活化通过代谢重编程（增强糖酵解/乳酸产生）塑造免疫抑制微环境，限制CD8+ T细胞功能。
45020编辑于 2026-02-21- 来自专栏药物代谢与原代肝细胞研究
器官芯片应用方向：CN Bio肝芯片联合PBMC共培养如何重现免疫介导肝损伤？【SOT2026研究解读】
由于传统模型难以同时兼顾肝细胞功能和免疫系统参与，因此越来越多研究开始采用微生理系统（MPS）等新方法学（NAMs）工具，以提高临床前研究的人体相关性。 原代人肝细胞接种于PhysioMimix Liver-12板中，并在持续灌流条件下培养8天，以形成稳定的肝脏微组织结构。 肝芯片与PBMC共培养模型的研究价值研究表明，将HLA匹配的PBMC整合到原代人肝细胞微生理系统中，可以有效模拟免疫相关药物诱导肝损伤过程。 相比传统体外模型，该体系能够持续提供营养、氧气和动态流体环境，从而维持肝细胞长期功能稳定，并促进免疫细胞与肝组织之间的真实相互作用。 通过同时整合肝细胞功能和免疫系统参与，该模型能够更加真实地模拟人体药物反应过程，为药物研发、机制研究以及风险评估提供更加可靠的人体相关性数据支持。
17000编辑于 2026-06-03 - 来自专栏类器官/器官芯片/3D培养
肝脏器官芯片用于siRNA/ASO寡核苷酸递送研究
一、引言：寡核苷酸疗法临床前测试的核心痛点随着新药物模式进入临床试验，对与人体相关的体外模型的需求日益增加。传统的临床前动物模型通常无法准确预测药物的疗效和毒性，导致后期药物损耗率居高不下。 原代人肝细胞在第0天接种到各孔中，每2-3天更换培养基并取样，寡核苷酸在第4天添加一次，或在第4、6、8天添加三次，或用培养基对照处理（图1D）。 原代人肝细胞用浓度为0nM和100nM的小干扰RNA处理三次（第4、6、8天）。(A)在为期11天的实验中，观察到低乳酸脱氢酶和稳定的白蛋白产量，表明细胞健康。 原代人肝细胞用浓度为0、10、50和100nM的小干扰RNA处理三次（第4、6、8天）。(A)在为期11天的实验中，观察到低乳酸脱氢酶和稳定的白蛋白产量，表明细胞健康。 原代人肝细胞在14天周期内，用靶向白蛋白基因表达的反义寡核苷酸处理一次（单次；第4天）或三次（重复；第4、6、8天）。
16110编辑于 2026-05-07 - 来自专栏细胞培养
人肝非实质细胞NPC如何突破传统肝细胞模型局限？Kupffer Cells、肝星状细胞与LSECs应用解析
摘要：在人肝病研究、药物肝毒性评价以及3D肝脏模型构建过程中，传统单一肝细胞模型由于缺乏真实肝脏微环境，往往难以完整复现炎症、纤维化以及免疫相关损伤等关键病理过程。 关键词：人肝非实质细胞；肝NPC；KupfferCells；肝星状细胞；LSECs；肝病模型；药物ADME-Tox；NASH；肝纤维化；3D肝脏模型；原代肝细胞一、为什么传统单一肝细胞模型越来越难满足现代肝病研究需求 在肝病机制研究、药物肝毒性评价以及新药研发过程中，原代肝细胞长期以来一直是重要研究工具。然而，随着研究不断深入，研究人员逐渐发现，传统单一肝细胞模型存在明显局限。 六、为什么肝NPC共培养体系正在成为高生理相关性肝病模型的重要方向？随着肝病研究不断深入，研究人员逐渐认识到，仅依赖单一肝细胞模型已经难以满足复杂疾病研究需求。 例如，在NAFLD/NASH研究中，单一肝细胞模型通常只能诱导脂肪变性，而难以同步复现炎症与纤维化过程；在药物ADME-Tox研究中，单一肝细胞体系也难以完整模拟免疫介导型肝毒性与药物转运过程。
15010编辑于 2026-05-18 - 来自专栏聊点学术
【探索】肝细胞肥大图像之定量分析（一）
也就是说，一旦肝细胞肥大这一诊断成立，即大可能地说明肝脏处在代偿阶段，如果损伤因素不及时撤除，经过一段时间，肝细胞可能会因为失代偿而走向凋亡。 当大量的肝细胞凋亡后，纤维组织会逐渐替代，发展为肝纤维化，甚至是肝衰竭。 ▼ 2. 肝细胞肥大的诊断要点？ 大鼠、小鼠中肝细胞肥大呈弥漫性或带状，常常见于中央静脉区域。通常低倍镜下肝细胞的形态变化表现为区域性肝细胞大小和嗜酸性增加，伴有核密度的相对减少，肝脏窦状隙压缩。 肝细胞肥大的分析难点？ 正所谓，心中了了，眼下难明。诊断是容易的，困难的是如何界定肥大的程度。实操时，常常难以界定肝细胞肥大的程度，最多只能通过分级法解决。 （圆框为肝细胞肥大区，方框为正常肝细胞区） ▼ 4. 肝细胞肥大有可能定量分析吗？ 如果想要在切片上定量分析肝细胞肥大，肝细胞平均大小这一重要指标必须得到。
1.7K21发布于 2020-10-21 - 来自专栏细胞培养
全长Laminin在肝细胞培养与3D肝类器官中的应用：LN521、LN111、LN411促进hPSC来源肝细胞成熟的研究解析
本文围绕LN521、LN111与LN411三种全长层粘连蛋白在肝细胞二维培养、原代肝细胞维持、hPSC来源肝细胞成熟以及3D肝类器官培养中的应用展开介绍，并结合相关实验数据分析其在肝脏研究、药物代谢模型以及体外肝脏微环境构建中的应用价值 在体外肝细胞研究中，研究人员长期面临一个核心问题：如何在培养体系中更真实地模拟人体肝脏细胞外基质（ECM）环境，从而获得功能更稳定、成熟度更高且更接近人体真实状态的肝细胞模型。 因此，越来越多研究开始采用全长laminin替代传统动物来源ECM体系，以建立更适合标准化研究的培养模型。三、LN521与LN111如何促进hPSC来源肝细胞分化？ 这对于长期培养、药物筛选以及标准化肝细胞模型建立具有重要意义。四、LN411在原代肝细胞培养中的作用除了hPSC来源肝细胞之外，LN411在原代肝细胞培养中同样表现出较好的应用价值。 目前，这些全长层粘连蛋白已经广泛应用于hPSC来源肝细胞分化、原代肝细胞培养、3D肝球体构建以及肝类器官研究等方向，并在提高细胞成熟度、维持功能稳定以及优化药物代谢模型等方面表现出较好的应用潜力。
17110编辑于 2026-05-12 - 来自专栏Java编程技术
K8s网络模型
每个Pod自己看到的自己的ip和其他Pod看到的一致 k8s网络模型设计基础原则:每个Pod都拥有一个独立的 IP地址，而且 假定所有 Pod 都在一个可以直接连通的、扁平的网络空间中 。 由于 Kubemetes 的网络模型假设 Pod 之间访问时使用的是对方 Pod 的实际地址，所以一个 Pod 内部的应用程序看到的自己的 IP 地址和端口与集群内其他 Pod 看到的一样。 其实是使用Docker的一种网络模型：–net=container container模式指定新创建的Docker容器和已经存在的一个容器共享一个网络命名空间，而不是和宿主机共享。 网络模型需要每个pod必须通过ip地址可以进行访问，每个pod的ip地址总是对网络中的其他pod可见，并且每个pod看待自己的ip与别的pod看待的是一样的（虽然他没规定如何实现），下面我们看不同Node 24 = 16,777,216（一千多万），一般每个 VNI 对应一个租户，也就是说使用 vxlan 搭建的公有云可以理论上可以支撑千万级别的租户 Tunnel：隧道是一个逻辑上的概念，在 vxlan 模型中并没有具体的物理实体想对应
4.4K24发布于 2019-04-18 - 来自专栏csico
K8s网络模型
Docker网络模型 容器 容器不是模拟一个完整的操作系统，而是对进程进行隔离，对容器里的进程来说它接触到的各种资源都是独享的，比虚拟机启动快、占用资源少。 但是容器重启后又恢复原值，若想永久的修改可通过/etc/docker/daemon.conf里制定dns，/etc/hosts记录容器的ip，/etc/hostname记录容器的名称 Calico网络模型 K8s网络模型 K8s术语 K8S 是一个用于容器集群的分布式系统架构。 K8s网络 K8s网络包括CNI、Service、Ingress、DNS 在K8s网络模型中，每个节点上的容器都有自己独立的IP段，节点之间的IP段不能重复，而节点也需要具备路由能力，使从本节点Pod里出来的流量可以根据目的 K8s主机内网络模型 K8s采用的是veth pair+bridge的模式，veth pair将容器与主机的网络协议栈连接起来，可以使pod之间通信。
2.6K32发布于 2021-09-02 知识扩展--细胞衰老
PS-Hep（CDKN1A+）：表达CDKN1A及NFKB1、CCL2、CXCL8等SASP相关因子。CRP+肝细胞：高表达C反应蛋白，提示炎症状态。 CDKN1A+管周内皮细胞和胆管上皮细胞与年龄及肝病相关衰老胆管细胞的特征两个亚群：PS-Chol（SASP）：表达趋化因子/细胞因子类SASP（CXCL1、CXCL6、CXCL8、CCL2）。 人类衰老细胞在小鼠纤维化肝脏中重现模型：使用小肠切除术诱导的肠衰竭相关肝病小鼠模型，在术后2、10、26周收集肝脏样本进行分析。目的：验证在人类肝脏中观察到的衰老细胞群是否在该疾病模型的小鼠体内重现。 表达CDKN2A/CDKN2B的胆管细胞：占胆管细胞的~10%，表达独特的SASP因子（TNC、ITIH5、LAMC2、CXCL8、TGFB2）和转录因子活性。 结论：THBS介导的衰老信号网络在物种间和疾病模型中具有高度保守性。
43320编辑于 2026-03-13- 来自专栏生物医药
类器官内单细胞CRISPR筛选揭示肝细胞分化和成熟的决定因素
为了识别这些未干扰的细胞，我们在P2和P4组中每个基因的干扰概率分布上拟合了一个双组分高斯混合模型（图3a及补充文件1：图S8）。 由于Fos敲除导致我们的小鼠ICO模型中肝细胞分化加速，我们想探究Fos是否在体内肝细胞分化中发挥作用。 [8]。 另一方面，已有研究证明Fos缺失可在肝脏条件性敲除小鼠模型中上调代谢通路[44]，这与我们从类器官模型获得的数据一致。总的来说，我们提出Fos是肝细胞分化和成熟的抑制因子。 GSEA分析进一步确认，一组成熟肝细胞富集基因在Ubr5敲除肝细胞中下调（图5h及附加文件2：表S8d），而一组胚胎肝脏富集基因在Ubr5敲除肝细胞中上调（图5i及附加文件2：表S8d）。
14810编辑于 2026-05-25 HD文章分享--肝细胞癌早期恶变的分子机制研究
基于8个已发表的肝细胞癌队列所编目的37个肝癌功能基因列表进行分析后发现，TERT基因变异（包括HBV整合、启动子突变及拷贝数增加）在癌 prone DN中的检出率高达82%，显著高于癌未定DN的32% ，8/11），同时在65%的极早期肝细胞癌中端粒长度也未恢复甚至进一步缩短，表明即使在TERT变异存在的情况下，端粒损耗仍持续贯穿恶性转化过程。 类器官模型的功能验证：通过人诱导肝细胞（hiHep）类器官模型，验证了c-MYC和CTNNB1激活可显著促进类器官生长，与临床观察一致。 结果5、炎症型极早期肝细胞癌免疫表型的空间定位visium HD细胞类型与浸润特征：炎症型极早期肝细胞癌相比配对不典型增生结节，CD4+ T细胞、CD8+ T细胞、巨噬细胞和B细胞的丰度增加，其中2例中癌症相关成纤维细胞显著增多 CD8+ T细胞与巨噬细胞之间存在相互作用，与炎症型极早期肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞浸润增加的多重染色结果一致。
15920编辑于 2026-03-31- 来自专栏类器官/器官芯片/3D培养
人原代肝细胞3D肝球培养技术解析：LifeNet长期稳定肝球模型在药物代谢与肝脏研究中的应用
摘要：随着药物代谢研究、肝毒性评价以及肝脏疾病模型研究不断发展，传统二维肝细胞培养体系由于难以维持长期肝功能与细胞间相互作用，逐渐难以满足现代体外研究需求。 近年来，基于人原代肝细胞（PrimaryHumanHepatocytes，PHH）的3D肝球模型逐渐成为肝脏研究的重要方向。 关键词：人原代肝细胞；PrimaryHumanHepatocytes；3D肝球；肝细胞球体；LifeNetHealth；肝毒性；药物代谢；ADME；肝细胞培养；长期培养模型一、为什么3D肝球模型正在逐渐替代传统 在人原代肝细胞相关研究中，3D肝球还可用于构建NASH、肝纤维化以及药物性肝损伤等疾病模型，从而帮助研究人员分析疾病相关机制。 相关培养方案显示，通过标准化细胞复苏、接种密度控制以及长期维持培养，可获得形态均一、结构稳定且功能持续的人原代肝细胞球体模型。
16910编辑于 2026-05-14
腾讯云开发者
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