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细胞活力检测方法大盘点，CTG 法放大招？- MedChemExpress
细胞活力检测产品大 PK 常用的细胞活力检测试剂主要有 MTT、CCK8 等检测方法 (图 1)。MTT法：又称 MTT 比色法。 科研汪 ：莫非你说的是细胞活力检测的“金标准”？ 小 M：CTG 细胞活力检测，简单、灵敏、快速的均质检测方法，反应 10 分钟即可得到“Bling Bling”的检测结果，你就说“快不快”？ ，CTG 发光法通过 ATP 含量来进行细胞计数或活力测定，且不受化合物自发荧光的影响 (图 2)，是细胞增殖测定，细胞活力测定和细胞毒性高通量筛选分析的理想选择。 结果表明，过表达 RRM2 时，细胞活力明显增强，反之，敲除 RRM2 时，细胞活力明显降低[1]。 由于整个发光反应非常迅速，建议加入 CTG 试剂孵育 10 分钟后，立即检测荧光。
1.4K10编辑于 2023-03-29 - 来自专栏生命科学
细胞活力检测尽掌握，分组、数据分析技能全囊括！｜ MedChemExpress (MCE)
迅速转移至 10 mL 完全培养基中，800 rpm 3 min 常温离心收集细胞，细胞沉淀用完全培养基重悬，接种于培养皿中，并置于 37℃，5% CO2 培养箱培养。 【检测】：药物处理后选择合适的方法进行细胞活力检测。▐ 1. CCK-8 检测基于 WST-8 检测细胞增殖和细胞毒性的比色检测法，主要用于细胞活性检测。 KN93 和 Gemcitabine 对 CCLP1 细胞活力影响[1]。CCK-8 检测细胞活力发现 KN93 可以增强 Gemcitabine 对 CCLP1 的敏感性。▐ 2. SIPL1 对 TNBC 细胞活力的影响[2]。CCK-8 (a) 和 CTG 发光细胞活力测定 (b) 用指示载体转导 BT-549 和 MDA-MB-231 细胞增殖能力的分析。▐ 3. 此方法与 CCK-8 联用可以用于死、活细胞的同步检测。 具体操作如下：注意：此方法需要设置高对照组，即在培养基中加入10 μL Lysis Solution。
89201编辑于 2024-05-16 - 来自专栏yw的数据分析
10X单细胞测序细胞分类
介绍 文章对已知的多种细胞系混合后进行单细胞10X RNA测序，研究多克隆之间的互作模式。我们这里介绍里面的单细胞测序基因表达细胞分类操作。 & n_cls < 100+param_range) { clust_res <- 4 } else { stop('Not implemented') } 根据之前QC时的标记，选择过质控的细胞 = 'pca', dims = 1:n_pcs, k.param = 10 FindClusters(seuObj, resolution = clust_res, verbose = FALSE) 原文出处 http://www.thecodesearch.com/2021/02/04/10x 单细胞测序细胞分类/
67410发布于 2021-02-22 - 来自专栏生物信息云
单细胞专题 | 10.细胞周期分析
最重要的两个特点就是DNA复制、分裂成两个一样的子细胞。 在分析单细胞数据时，同一类型的细胞往往来自于不同的细胞周期阶段，这可能对下游聚类分析，细胞类型注释产生混淆；由于细胞周期也是通过cell cycle related protein 调控，即每个阶段有显著的 marker基因；通过分析细胞周期有关基因的表达情况，可以对细胞所处周期阶段进行注释；在单细胞周期分析时，通常只考虑三个阶段：G1、S、G2M。 下面文章中的：sce3 单细胞专题 | 9.如何人工注释单细胞类群？ 具体参考文章【单细胞数据分析中scran包进行细胞周期分析时细胞周期marker基因的转换】 ###基因转换 library(clusterProfiler) library(org.Hs.eg.db)
2.5K31编辑于 2022-11-24 - 来自专栏技术文章
Elabscience化学发光法细胞活力试剂盒重磅来袭
Elabscience® 新一代细胞活力检测产品——细胞活力化学发光法测试盒，化学发光法检测细胞活力的核心优势的在于“发光机制”的革新，无需激发光照射，依赖特异性化学反应释放光子，从源头规避荧光检测的固有缺陷 产品原理细胞活力化学发光法测试盒基于ATP发光法实现对细胞活性的检测，其核心机制为：ATP是氧化磷酸化的主要能量代谢物质，其含量变化可反应细胞活力变化。 该荧光信号与体系中ATP的浓度呈良好线性关系，而ATP浓度直接对应裂解前的细胞数量，因此通过检测荧光强度即可实现对细胞活性的精准定量分析。 产品核心亮点1.检测灵敏度高、细胞线性广拥有500-50000个细胞的宽线性检测能力，适配高/低活力细胞检测，即使稀少细胞样本也能精准检测。 分别用0.2 μM和2 μM抗霉素A处理Hela细胞1小时，与不加抗霉素A的Hela细胞用E-BC-F200对比检测得到的细胞活力数据呈现出理想的趋势效果。
5300编辑于 2026-02-28 - 来自专栏腾讯文旅
中国为世界旅游发展注入活力
杜江指出，“一带一路”沿线是旅游资源的富集区，汇集了80%的世界文化遗产，涉及60多个国家、44亿人口，被视为世界上最具活力和潜力的黄金旅游之路。
49710发布于 2020-06-17 - 来自专栏腾讯位置服务
中部特色小镇活力诊断书
中部特色小镇春节活力诊断书 文港镇 ? 文港镇位于江西省南昌市进贤县西南部，抚河下游东岸，是北宋宰相著名词人晏殊的故里，被誉为当今中国的“华夏笔都”、“中国毛笔之乡”和“中国楹联之乡”。 在初始阶段和中后期，心电图出现了两次猛烈的心跳，这可能是文港镇正处于激烈运动状态，活力高，心脏跳动更加有力。 同时，坚持以品牌带品牌的战略，依托现有品牌资源，打造品牌联合格局，一是提高经济效益，二是宣传大寨本身，三是宣扬精神，以此布局中国，提升大寨古镇活力。 大瑶镇 ? 综合来看，大瑶镇的心脏较为平稳，健康水平中等偏上，但缺乏活力度，建议改善作息习惯，，例如改革传统花炮产业，整合产业资源。 血常规检验 ? 其中宏村镇的心脏振幅持续增长，这说明宏村镇在春节期间活力度呈现增长趋势，并未因春节假期的结束而丧失活力。
72240发布于 2018-11-07 - 来自专栏生物信息云
单细胞专题 | 1.单细胞测序（10×genomics技术）的原理
单细胞测序技术以单个细胞作为对象，通过对单个细胞遗传物质均匀扩增，标记建库后进行测序，最后对单个细胞基因组或转录组展开数据分析，其技术原理主要包括单细胞分离、扩增测序和数据分析3方面。 市场上，较成熟的商业单细胞测序公司主要有 10X Genomis 公司 的Chromium( 液滴法) 及 BD 公司的Ｒhapsody( 微孔法)。 这里重点介绍 10×genomics技术。 10个碱基长的UMI，有100万种序列的变化（4^10 = 1,048,576），UMI的作用是为了区分哪些哪些reads是来自于一个原始cDNA分子，区分基因片段重复还是duplication及区分是真实的 3' 端文库的构建 通过10×genomics仪器将单个细胞与单个凝胶微珠通过油相混在一起，形成油包水的小微滴，接下来把细胞膜破掉，让细胞当中的mRNA游离出来。 10x Chromium是一种高通量方法，使用UMIs进行定量，适合研究高度异质组织和大量的细胞样本。 后面介绍数据怎么分析............
46.5K31编辑于 2022-06-13 - 来自专栏单细胞天地
10x单细胞测序技术揭示肝脏细胞全景图
然而人们对构成人体肝脏的细胞类型和免疫微环境知之甚少。作者使用10x单细胞RNA测序手段绘制了人类肝脏细胞全景图，从来自五个人新鲜肝脏组织中分离得到的8444个实质和非实质细胞转录谱。 10x样品处理和cDNA文库制备 将组织破碎获得悬浮细胞溶液后，用台盼蓝染色计数检测细胞活率，在49-90%范围，使用10x Genomics Single Cell 3′ v2 Reagent Kit 用10x官方的CellRanger产生表达矩阵，接着用R包进行过滤、归一化、聚类。 过滤器阈值通常设定为10％，但是肝细胞线粒体含量很高，因此作者选择了阈值为50％，以优化保留肝细胞而去除死亡和垂死的细胞。作者还过滤除去了双核细胞。 ? 定义细胞群 将所有捐赠者的细胞汇集起来，滤掉活力低的细胞后，共计捕获了8444个细胞，在无监督聚类t-SNE图中这些细胞聚集成了20个群体。用肝细胞/免疫细胞的已知基因表达谱进行热图分析。
4.9K31发布于 2020-03-30 - 来自专栏腾讯位置服务
西部特色小镇活力诊断书
中部特色小镇春节活力诊断书 喜洲镇 ? 喜洲镇位于大理市北部，西倚苍山，东临洱海，隋唐时期称“大厘城”，是南诏时期“十睑之一”，是电影“五朵金花”的故乡，云南省著名的历史文化名镇和重点侨乡之一。 总体而言，喜洲镇的心脏十分健康，跳动均匀，且富有活力。因此建议继续保持良好的生活习惯，运动量要适度，如贯彻适度开发的理念，维护生态环境可持续等。 血常规检验 ? 综合来看，吞巴乡的心脏较为健康，心跳均匀，活力度较高，但是在末期心跳虚弱时，应注入补气强心的药物进行适当治疗，如特色产业引进政策、旅游服务配套升级等。 血常规检验 ? 安仁古镇呈现心律不齐的态势，前期低缓，活力不足，一月28日有一个高峰随后呈下降趋势，或许与其对资源的价值缺乏清晰定位与共识有关。 特色小镇春节活力诊断书 ? 双江古镇 ? 喜洲镇——云南大理的新发现 西部特色小镇同样存在许多值得琢磨的地方。位于云南省的喜洲镇是评分最高的一个小镇。
99821发布于 2018-11-07 - 来自专栏生信技能树
单细胞分析的10个基础问题
单细胞数据质量控制的核心诉求是什么？ 答：去掉各种各样的低质量的细胞 。 单细胞数据质量控制的主要做了什么？ 一般是指细胞的过滤，其实是从一个barcode X gene矩阵中过滤掉一部分不是细胞的barcode，如细胞碎片，双细胞，死细胞等。 percent_hb(红细胞基因表达比例)：表明红细胞这个单细胞亚群的比例，一般来说不研究红细胞，所以过滤它没有问题。 percent_mito(线粒体基因表达比例)：表明细胞状态，值过高可能是濒临死亡的细胞，同样，不能一概而论，有些组织样本的细胞处于高代谢过程，该值会高于正常组织。 关于整不整合数据，时要根据实验设计和单细胞数据本身决定的，其中，在整合数据是为了更好的注释细胞亚群，而不用纠结为什么相同的细胞亚群在UMAP展示的时候相隔千里，当然这可能是因为样本特异性导致的离群细胞亚群
4.6K32编辑于 2022-07-26 - 来自专栏腾讯位置服务
东部特色小镇活力诊断书
北滘镇心电图波动颇为有趣，极富生机与活力，在一段时间的平缓后，幅度上升，并到达峰值。 综合来看，乌镇的心脏较为健康，心率快，活力度较高，前期可采用互联网大会，戏剧节等方式进行起搏。 血常规检验 ? 乌镇动脉血管富有活力，血管口径大，前期血红蛋白浓度偏低。 这要归因于云龙镇特殊的地理位置，先天处于中国的海岛上导致与其他城市的联系相对要不方便一些，这应该属于血红蛋白浓度偏低的红细胞膜酶遗传性缺陷症状。 其中乌镇活力度最高，北滘镇和汀溪镇紧随其后，相对来说古北口镇和崔黄口镇的健康状态欠佳。 东部区域特色小镇诊断排名 ? 特色小镇春节活力诊断书 ? 互联网小镇+乌镇水乡 ? 如何保持当前活力，并提升活力？如何利用当地有限资源搭配周围城市资源带动当地产业发展？这些问题值得我们思考。 ?
80420发布于 2018-11-07 - 来自专栏纳米药物前沿
宋继彬刘小龙Angew：比率NIR-II荧光成像用于对过继自然杀伤细胞免疫治疗的细胞活力进行体内示踪
基于自然杀伤细胞(NK)的免疫治疗的疗效与过继的NK细胞的存活效率有很大关系。然而，目前还没有有效的方法可以在体内过继免疫治疗过程中对NK细胞的活力进行监测。 该纳米探针由IR786s（一种对活性氧(ROS)敏感的近红外染料）包裹的、基于镧系元素的下转换纳米颗粒(DCNP)组成，能够直接对NK细胞进行标记。 细胞死亡后，NK细胞内会有过量的ROS产生，导致IR786s发生降解，并且开启DCNP在808 nm光激发下产生1550 nm的NIR-II荧光信号，而DCNP在980 nm光激发下产生的1550 nm 研究表明，细胞内ROS诱导的比率NIR-II荧光信号与NK细胞在体内的生存能力密切相关。 本文利用该纳米探针进一步证明了将NK细胞与IL-2、IL-15和IL-21相结合的联合治疗可以提高NK细胞在体内的生存能力，进而增强对原位肝细胞癌的免疫治疗。
62220编辑于 2022-08-15 - 来自专栏用户6486726的专栏
中国数字经济发展活力增强
相关部门负责人表示，数字经济持续快速增长，质量效益明显提升，到去年年底数字经济核心产业增加值占GDP比重达到7.8%，发展活力不断增强。
42720发布于 2021-03-22 10X官方发布10X visium HD细胞分割方法
细胞分割一直都是空间组学的一大难题，横平竖直的bin模式不是细胞真实的分布状态（这个在之前的文章中屡次提到）。 首先关于visium HD， poly-A based gene expression和probe-based gene expression均已可用，也就是说新鲜组织样本与FFPE样本均可以做10X的 万个图块进行训练，包括如下组织类型：人类：胸腺、皮肤（黑色素瘤）、前列腺、结肠、结肠癌、乳腺癌、乳腺癌、扁桃体、胸腺、脑癌、脑癌、肺癌、肺癌和脾脏小鼠：脑、骨、睾丸、小肠、脾、胚胎、肝、肺、肾和胸腺（10X 从目前搜集的情况来看，有4篇HD的实验类文章，其中一篇用到的是单细胞空间联合，另外三篇全部是细胞分割，由此可见细胞分割是大趋势。 ）顶刊分享----组织驻留记忆CD8 T细胞多样性具有时空印记（HD + cellpose + Xenium）文献分享--颗粒酶K+CD8+ T细胞与成纤维细胞相互作用，促进鼻息肉中性粒细胞炎症（首篇10X
65810编辑于 2025-06-16- 来自专栏CODING DevOps
纯净与活力，打造云端工作美学
现今，工具效率型产品已经不仅仅只强调功能升级，而是更注重用户的感官和体验感受，这一方面既是常伴手边的温度感，也是产品价值的完整塑造和呈现策略。在线代码编辑器/云端 IDE 平台，是云端工作平台的新星，而目前业界的在线编辑器在结构、功能层面混合了终端产品的设计理念，虽然是新产品，但延续着旧体验。当前市面上相似产品的功能叠加，品质和设计也日趋同质化，无论是在品牌 UI 等视觉层面，还是在产品体验感上都已经难以满足用户在云端工作的效率和对品质的预期。 本文约 2550 字 预计阅读时间：7 分钟 ----
62720编辑于 2023-04-17 - 来自专栏生信技能树
一个10x单细胞转录组项目从fastq到细胞亚群
最近在安排学徒单细胞分享的时候，有一个学徒提到了GSE168522这个数据集，是很标准的6个10x单细胞转录组样品，如下所示： GSM5145401 Sample 16_Normal-1 GSM5145402 》有它的介绍：单细胞测序揭示阿尔兹海默症的B细胞相关标志物 可以看到原文提到的每个10x的单细胞转录组样品细胞数量蛮合理（5到8千），如下所示： 细胞数量蛮合理 作者的降维聚类分群也是超级简单，就是第一层次而已 10X公司为主流，我们也是在单细胞天地公众号详细介绍了cellranger全部使用细节及流程，大家可以自行前往学习，如下： 单细胞实战(一)数据下载 单细胞实战(二) cell ranger使用前注意事项 一个简单的脚本就可以处理全部的6个10x单细胞转录组数据文件： cat id.txt |while read id;do (nohup bash run-cellranger.sh $id 1>log 首先是批量读取6个10x的单细胞转录组样品 rm(list=ls()) options(stringsAsFactors = F) library(Seurat) library(ggplot2) library
2.5K32编辑于 2022-03-03 - 来自专栏巴山学长
活力全开，再荐三款公式识别工具
说这个名字大家可能陌生，说妈咪说大家应该就知道了，咱也是经常看他们发布的科普视频，非常不错。与公式编辑器不同，这个公式识别模块需要登陆之后才能使用，大家按照提示登陆即可。以下是咱的一个测试图示：
2.7K30编辑于 2023-03-15 - 来自专栏腾讯位置服务
东北部特色小镇活力诊断书
初期阶段的心跳幅度要高于中后期，同时观察纵轴数据，金川镇每日的最高人流量并不乐观，活力值相比偏低。 换个角度，小镇充满活力，也将为东北三省的复兴提供新思路、新源泉。 ? 金川镇70%的供血都是由心脏地——通化市——贡献，其他器官贡献则相对较少。 在后期的发展，再加以多元化营销策略，拓展优化活力结构。 汤河镇 ? 汤河镇位于辽宁省中南部、辽阳市东南部，临近沈阳等六座大中型城市，区位条件一流，交通便利。 但是从纵轴数据看，小镇春节期间整体活力水平并不高，心跳幅度相比其他特色小镇要弱。总体而言，亚健康的水平不利于长远发展，还需要进一步调养身体。 但是汤河镇位于东北地区，自身活力因子储备不足，对外吸引力也有限。 血常规检验 ? 将小镇春节期间每日人流量对比，画出汤河镇血红蛋白检验图。
1.4K20发布于 2018-11-07 - 来自专栏单细胞天地
混样的10X单细胞转录组
最近有粉丝提到是否可以把多个样本混杂到一起建立一个10X单细胞转录组库进行测序后数据分析，的确是有这样的例子，比如我前些天在Twitter看到的发表在Nephrology Dialysis Transplantation 实验设计非常简单 就是10个ESRD病人，10个正常人志愿者的血液，提取PBMC进行10X仪器的单细胞转录组数据而已。 值得注意的是，其中研究团队就做了两个10X哦，也就是说他们把 10个ESRD病人混合成为一个样品，10个正常人志愿者也混合成为一个样品。 下面的流程图写的很清楚具体细胞数量，平均检测到的基因数量是1000，每个样品检测到1万个左右的细胞数量，都符合10X仪器的技术水平。 ? 然后研究者单独看某一群细胞继续细分 因为本研究设计非常简单，就一个变量，就是10 healthy volunteers and 10 patients with ESRD ，所以主要的分析都是围绕这个变量来进行
1.8K20发布于 2020-03-30
腾讯云开发者
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