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流式分选后指定细胞亚群的表达量差异(无需单细胞)
现在有了单细胞转录组数据的加持，细胞亚型会越来越清晰。如果要整合多组学数据，分类也会更加复杂。 但是呢，传统的bulk转录组测序，其实虽然说测序的样品仍然是肿瘤组织，但是它是一个复杂的生态系统，不仅仅是有恶性的肿瘤细胞，还有围绕它的各式各样的免疫细胞，以及以内皮细胞和成纤维细胞为代表的多种基质细胞 所以很多研究，在找到了癌症特异性的表达量差异基因后，会去单细胞数据集里面验证一下，表明它仅仅是在恶性肿瘤细胞里面高表达，而不是肿瘤的微环境的其它细胞亚群高表达。 其实没有单细胞也是可以研究具体的细胞亚群的表达量差异，那就是流式分选指定细胞亚群，比如： Hepatic CD4+ or CD8+ T-cells of 12 months NASH-diet + 8 更多类似的先分选指定细胞亚群再进行差异表达量分析的研究 比如数据集：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?
87110发布于 2021-03-24 - 来自专栏流式抗体推文
告别杂细胞干扰！Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒，精准富集人初始 T 细胞
内容概要Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒凭借阴性分选技术，可从新鲜或冻存的人 PBMC 样本中快速分离高纯度人初始 T 细胞。 产品介绍Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒是一款操作快速简便的细胞分离产品，核心用于分离人初始 T 细胞。 支持 1 Assay 处理 1×10⁷个原始细胞，分离后细胞纯度可达 95.2%（分选前纯度仅 6.0%），能满足科研对高纯度细胞的需求。 检测原理Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性去除样本中 CD3⁻非 T 细胞、CD45RO⁺记忆 T 细胞等非目标细胞，实现人初始 T 细胞（CD3⁺CD45RA 分选过程中，试剂盒中的特异性抗体与非目标细胞结合，再通过磁珠分离等步骤去除杂细胞，最终保留高纯度、高活性的目标细胞，确保下游实验的稳定性和重复性。
18410编辑于 2025-11-13 - 来自专栏技术文章
告别分选困扰，Elabscience 让记忆 T 细胞分离快人一步～
如何高效分离记忆T细胞？传统分选方法往往需要对细胞进行标记或刺激，可能影响其天然状态与后续功能。 为此，Elabscience®全新推出的人Memory CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒，采用磁珠阴性分选技术，通过去除非目的细胞，从而富集未被标记的目标细胞，分选后可得到一种最接近天然状态、功能完整 产品速览Elabscience®人Memory CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒通过阴性分选法从新鲜人外周血PBMC细胞样本中分离出Memory CD4/CD8 T细胞。 它可以保持目的细胞未受刺激的原始状态，得到的细胞不带有任何抗体和磁珠标记，可直接进行下游应用。产品优势无刺激，分选目的细胞无抗体和磁珠标记，细胞状态不受影响。纯度高，分选后细胞纯度大于85%。 结果展示以上就是Elabscience®人Memory CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒的相关介绍，更多细胞分选试剂盒持续上线中。
11100编辑于 2025-12-31 - 来自专栏流式抗体推文
Elabscience 阴性分选技术！人初始 CD4⁺T 细胞分离一步到位，省时高效
内容概要Elabscience 人初始CD4+T细胞阴性分选试剂盒专为分离人初始 CD4⁺T 细胞设计，适配新鲜或冻存的人 PBMC 样本。 凭借高效阴性分选技术，可实现 96% 以上的高纯度分选，1 次实验能处理 1×10⁷个细胞，且细胞可直接用于下游研究，为免疫相关研究提供可靠工具支持。 传统分选方法存在操作复杂、分选纯度低、细胞活性受损等问题，难以满足高精度科研需求。而精准分离高纯度初始 CD4⁺T 细胞，是开展相关基础研究与临床转化研究的前提，市场对高效、可靠的分选工具需求迫切。 检测原理Elabscience 人初始CD4+T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性去除样本中 CD4⁺T 细胞以外的杂质细胞（如 CD8⁺T 细胞、B 细胞、单核细胞等），实现初始 CD4⁺ 药物研发：评估候选药物对初始 CD4⁺T 细胞功能的影响，筛选免疫调节类药物。产品优势高纯度分选：分选后细胞纯度可达 96% 以上，显著优于传统方法，减少杂质细胞干扰。
17610编辑于 2025-11-14 - 来自专栏技术文章
Elabscience 高纯度初始 T 细胞分选试剂盒来破局
随着分选技术的不断精进和对T细胞亚群认知的深化，未来将能设计出更具战斗力、作用更持久的活细胞药物，造福更多患者。 Elabscience®全新推出的人naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒，采用磁珠阴性分选技术，无需直接标记人naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞，避免抗体结合导致的细胞激活或表位遮蔽 产品内容Elabscience®人naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒通过阴性分选法从新鲜人外周血PBMC细胞样本中分离出naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞 无刺激，分选目的细胞无抗体和磁珠标记，细胞状态不受影响。纯度高，分选后细胞纯度大于95%。无需分离柱进行分离。实验耗时短，最快15分钟可完成阴性细胞分选。可用于新鲜人PBMC样本或冻存PBMC样本。 ，分选前后人初始Pan T细胞CD3+CD45RA+CD45RO-CD197+的细胞纯度分别为6.0%和95.2%。
51910编辑于 2025-11-03 - 来自专栏生物信息云
单细胞专题 | 9.如何人工注释单细胞类群？
单细胞专题 | 1.单细胞测序（10×genomics技术）的原理 单细胞专题 | 2.如何开始单细胞RNASeq数据分析 单细胞专题 | 3.单细胞转录组的上游分析-从BCL到FASTQ 单细胞专题 | 4.单细胞转录组的上游分析-从SRA到FASTQ 单细胞专题 | 5.单细胞转录组的上游分析-从FASTQ到count矩阵 单细胞专题 | 6.单细胞下游分析——不同类型的数据读入 单细胞专题 | 7.单细胞下游分析——常规分析流程案例一 单细胞专题 | 8.单细胞类型注释之SingleR包详解 1.细胞类型的marker基因 单细胞人工注释依赖于marker gene的调查，简单来说，就是收集各种细胞类型的标志物 ，根据标志物在不同细胞亚群中的表达来判断细胞类型。 ，因为这个类群是很确定的癌细胞。
8.8K21编辑于 2022-12-16 - 来自专栏生信技能树
你认为比较单一和纯粹的细胞亚群仍然是有异质性
但是其实中性粒（单核）细胞也有很多细化的空间，比如 发表在《Nat Immunol 》杂志 2020 Sep;21(9):1119-1133. 其单细胞样品制备之前都经过了细胞分选哦： 4 mouse control samples: BM sorted by cKit+ Gr1+; BM, PB, SP sorted by Gr1+. 6 mouse 虽然是经过细胞分选，但是也不可能保证百分百数据都是自己想要的单核/中性粒细胞，可以看到全部的来源于 bone marrow (BM), peripheral blood (PB), and spleen 如果看图，就能发现，细胞分选是有效果的，至少保证了绝大部分都是作者想要的 neutrophils (Neu) (S100a8 and S100a9) 单细胞亚群（这里我 就很奇怪，为什么作者不选择S100a8 和 S100a9，而是 cKit+ Gr1+ 的流式分选 ）： 第一层次降维聚类分群 接下来就开始对neutrophils (Neu) (S100a8 and S100a9)取子集，独立分析
83220编辑于 2022-03-03 - 来自专栏抗体蛋白
单B细胞筛选加速羊驼VHH发现：Hypercell高通量微流控系统在纳米抗体研发中的应用
本文结合真实药企案例，对Hypercell高通量单细胞分选系统在羊驼VHH纳米抗体发现中的应用流程进行整理，包括羊驼PBMC处理、B细胞激活、单细胞液滴包裹、高通量功能分选、NGS测序以及AbFinder 关键词：单B细胞筛选、单细胞筛选、单B细胞分选、B细胞抗体发现、B细胞抗体筛选、羊驼纳米抗体、单B细胞分选、纳米抗体筛选、VHH抗体发现、抗体药物研发、涛烜Hypercell、纳米抗体快速筛选为什么纳米抗体发现越来越关注单 Hypercell系统：单日分选+一周获得VHH序列涛烜科学推出的Hypercell高通量单细胞分选系统，构建了从羊驼PBMC、B细胞激活、单细胞分选、建库测序到序列分析的完整工作流，可实现单日完成高通量单细胞功能分选 Day9阶段则开展高通量单细胞分选与破乳回收。实验采用HypercellSM66系统，芯片、硬件以及耗材运行稳定。 更多关于Hypercell高通量单细胞分选系统、羊驼VHH抗体发现以及单细胞抗体筛选也可参考曼博生物相关技术资料关于技术来源本文基于Hypercell单B细胞分选系统、羊驼VHH抗体发现方案、单细胞抗体筛选系统
12910编辑于 2026-05-19 - 来自专栏单细胞天地
单细胞测序技术在循环肿瘤细胞检测中的应用
单细胞分选和测序分析 分选 传统的单细胞分选方法，如荧光激活细胞分选 (FACS)，不适用于 CTC 单细胞分选。 用于CTC单细胞分选的方法主要有显微操作分选法、微流控技术分选法、DEPArray和Cell Celector分选系统 微量移液器分离（micropipette isolation）涉及使用微机械机械手或视觉镊子完成单细胞分选的高倍显微镜 这种方法已在单细胞水平上用于研究乳腺癌和结直肠癌中的 CTC Cell celector 分选系统是一种自动分选系统，可将稀有细胞从混合细胞群中分离出来。 通过多功能机器人系统自动检索单细胞和细胞克隆，实现单细胞分选，直接机械分离目标细胞或克隆，不影响细胞活力，实时、高精度观察细胞图像进行细胞分选；但是，这种方法很耗时 单细胞全基因组扩增 单个细胞的DNA 对原发肿瘤、转移灶和CTC单细胞进行外显子组测序分析，发现其中9个CTC与原发肿瘤相关。
2.4K20编辑于 2022-03-14 - 来自专栏文献分享及代码学习
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现9
单细胞数据复现-肺癌文章代码复现1https://cloud.tencent.com/developer/article/1992648单细胞数据复现-肺癌文章代码复现2https://cloud.tencent.com /developer/article/1995619单细胞数据复现-肺癌文章代码复现3https://cloud.tencent.com/developer/article/1996043单细胞数据复现 /developer/article/2008487单细胞数据复现-肺癌文章代码复现6https://cloud.tencent.com/developer/article/2008704单细胞数据复现 /results", width = 10, height = 9, units = "cm")CXCL9 <- read_excel("Quantification_CXCL9.xlsx")CXCL9 因此对上面的一系列的流程结果进行总结，可以发现是首先流程性的分析，然后开始对注释后的亚群进行了精细的分析，将不同的细胞类群叶放到脚本里面进行分析。
1.1K40编辑于 2022-07-11 - 来自专栏单细胞天地
OSCA单细胞数据分析笔记9—Clustering
clust <- igraph::cluster_walktrap(g)$membership table(clust) #clust # 1 2 3 4 5 6 7 8 9 clust.5 <- igraph::cluster_walktrap(g.5)$membership table(clust.5) # 1 2 3 4 5 6 7 8 9 18 19 20 21 22 #523 302 125 45 172 573 249 439 293 95 772 142 38 18 62 38 30 16 15 9 .50 <- igraph::cluster_walktrap(g.50)$membership table(clust.50) # 1 2 3 4 5 6 7 8 9 second=NNGraphParam(k=5) #5个最近邻居 ) ) table(kgraph.clusters) # 1 2 3 4 5 6 7 8 9
2.7K21发布于 2021-07-02 - 来自专栏流式抗体推文
Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒，快速分离CD8+T 细胞，直接用于下游实验
内容概要Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是一款专为生命科学与医学研究打造的高效细胞分离工具。 产品介绍人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是 Elabscience 品牌推出的核心产品，专注于人初始 CD8+T 细胞的精准分离。 每 1 Assay 可处理 1×10⁷个原始材料细胞，分选后细胞纯度高达 95.4% 以上，远优于分选前 8.4% 的基础比例。 检测原理人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性结合非目标细胞的抗体与磁珠复合物，在磁场作用下将 CD8+T 细胞以外的杂细胞（如 CD56+、CD57+、CD45RO + 细胞等 总结Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒凭借高纯度、便捷性、强兼容性等核心优势，成功解决了传统细胞分选的诸多痛点。
19210编辑于 2025-11-14 - 来自专栏微生态与微进化
Nature新技术分享：自动化拉曼光谱仪用于活细胞功能分类
结果讨论 1微流体分选、3D聚焦与系统配置 RACS平台使用微流控装置来捕获与移动微生物细胞，用于后续的拉曼光谱测量与细胞分选。 http://mpvideo.qpic.cn/tjg_3873103208_50000_297df61571b740049feabf0bcb9d9571.f10002.mp4? 根据这个参数，全自动化的RACS平台分选细胞的速度达到200细胞每小时（也即3.3细胞每分钟）。 图2. 微流控装置内的细胞分选操作（a. 接下来评估分选准确率，作者将没有氘标记的大肠杆菌细胞用DAPI染色，并与氘标记的细胞进行1比1混合（附件图2b所示），然后输入平台连续一小时的运行分选，然后检测收集的细胞中DAPI染色细胞（也即未标记细胞 然后将小鼠结肠微生物组的细胞使用葡萄糖在有重水条件下进行培养，也即所有细胞都做氘标记，根据PL>6.14作为判断标记的标准进行分选，如附件图3b所示37%捕获的细胞被成功分选，这个效率可以与人工分选媲美
1.4K30编辑于 2022-05-05 - 来自专栏凋亡检测试剂盒推文
Elabscience 小鼠CD8 T细胞阴性分选试剂盒，助力成果突破
内容概要Elabscience 推出的 EasySort™小鼠 CD8+T 细胞阴性分选试剂盒（货号：MIM003N），凭借阴性分选技术实现小鼠脾脏和淋巴结中 CD8+T 细胞的快速高效分离，分选后细胞纯度高达 检测原理本试剂盒采用阴性分选技术实现 CD8+T 细胞的高效分离。 产品优势高纯度保障：分选后 CD8+T 细胞在 CD45 + 细胞群中占比达 93.4%，远高于分选前的 13.7%，满足高精度实验需求。 细胞活性优异：阴性分选技术不损伤目标细胞，分离后的细胞可直接用于下游培养、染色、功能检测等应用。适配性强：明确适用于小鼠脾脏和淋巴结样本，覆盖免疫研究常用组织来源。 结合亲民的价格与完善的品质保障，无疑是实验室分选小鼠 CD8+T 细胞的优选之选，赶快入手解锁你的免疫研究新突破！
32810编辑于 2025-09-22 AbMole | FGF-9在原代细胞、干细胞及类器官培养中的应用
FGF9促进腰椎黄韧带原代细胞体外增殖的划痕实验[2]二、 FGF-9（重组FGF-9蛋白）在干细胞培养中的应用1. FGF-9在神经干细胞的研究中也显示出促进增殖的作用，FGF-9能够增加神经干细胞细胞的增殖速率[5, 6]。 FGF-9诱导胚胎干细胞定向分化重组成纤维细胞生长因子-9（FGF-9）在胚胎干细胞（ESC）和诱导多能干细胞（iPSC）的定向分化中具有重要的调控作用。 FGF9 诱导脂肪干细胞（ASCs）分化为施万细胞（SCs）谱系[8]FGF-9（重组FGF-9蛋白）在上皮细胞的分化中同样发挥着重要作用。 研究表明，FGF-9能够加速上皮细胞的内陷过程，并促进上皮细胞向特定表型分化。例如，在牙胚细胞的研究中，FGF-9能够诱导上皮细胞表达牙釉质细胞（ameloblasts）的特异性标志物[9]。
10210编辑于 2026-05-12- 来自专栏单细胞天地
人类胸腺发育的细胞图谱揭示了T细胞组库的形成
作者总共采集了 15 个胎儿胸腺（从 7 - 17 孕周）和 9 个出生后至成人期的胸腺样本，同时采用了不同的细胞分选策略保证细胞亚群的覆盖率。 ，则将比例简单定义为：特定类型细胞数 / 细胞总数 如果细胞来自不同的分选门，则为每个分选门计算一个归一化因子：给定分选门的细胞数 / 所有分选门的总细胞数。 CD8αα+ T(I) 和 Treg 都表达表面蛋白 marker CD137（TNFRSF9），于是作者通过流式分选和 Smart-seq2 建库测序，验证了 CD3+CD137+CD4- 可以作为 CD8αα+ T(I) 的分选策略。 aDC 还可能通过 CXCL9/10:CXCR3 募集其他 DC 和成熟 Treg，并在 Treg 成熟过程中提供共刺激信号。
4.5K51发布于 2021-04-16 - 来自专栏生信喵实验柴
单细胞测序原理
一、细胞捕获分选技术 1.1 细胞分选技术 单细胞测序主要包括以下四个步骤。其中非常关键的一点就是如何进行单细胞的捕获/分选，这是决定单细胞检测成本和通量的关键步骤。 单细胞测序分析流程图 不同单细胞测序平台主要差别也主要在于单细胞捕获分选的方法不同。在细胞分选的方法里，主要包括特异性分选和非特意性分选两类方法。 下表中根据选择类型，样品要求以及分选细胞数目对几种技术进行了比较。 几种常见单细胞分选技术比较 技术 微吸管分离 激光捕获显微分离 荧光激活细胞分选 抗体磁珠分选 微流控分选 微液滴分选 微孔分选 选择类型 特异性选择 特异性选择 特异性选择 特异性选择 非特异性选择 数千个细胞 1.2 非特异性分选类技术 特异性分选细胞往往捕获细胞数较少，操作复杂，不适合大规模操作，且手工操作步骤较多，对技术人员有较高的要求，重复性不好。
2.7K20编辑于 2022-10-25 - 来自专栏单细胞天地
单细胞分析十八般武艺9：DoubletFinder
Doublets及其形成的原因 单细胞测序期望每个barcode标签下只有一个真实的细胞，但是实际数据中会有两个或多个细胞共用一个barcode的情况，业内称之为doublets或multiplets 此外，使用磁珠分选细胞，操作不当也会增加doublets形成的概率。 10X genomics单细胞平台的dulblets比率 ? CellRanger可以检测doublets吗？ T细胞和B细胞的marker基因。 DoubletFinder简介 分析原理 依据单细胞表达矩阵建立的低维空间中，表达特征相似的细胞彼此之间距离更近。 需要注意的是DoubletFinder对相同细胞类型构成的doublets不敏感，因为这些细胞在表达特征上与真实的单细胞没有明显的差异。 分析流程 ?
13.4K68发布于 2021-05-18 - 来自专栏数据科学（冷冻工厂）
R中单细胞RNA-seq分析教程 (9)
seurat_ref, group.by="celltype") plot3 <- FeaturePlot(seurat_ref, c("SOX2","DCX","FOXG1","EMX1","DLX2","LHX9" 基于细胞簇的转录组相似性分析 可以将查询数据集中每个细胞群体的转录组特征与参考数据集中不同细胞类型的转录组特征进行比较。 通过这种比较，查询数据中的细胞簇可以被归类为参考数据集中转录组特征最相似的细胞类型。 首先，需要分别计算参考数据集中每种注释细胞类型和查询数据集中每个细胞簇的平均转录组特征。 比如查询数据里的不少细胞簇，像被标注为“Dorsal telen. IP”的那个细胞簇，就和参考数据中的“Cortical IP”细胞类型，有着最高的相似度。
39810编辑于 2025-02-18 - 来自专栏单细胞天地
单细胞RNA测序揭示了胶质母细胞瘤进展过程中免疫景观的演化
(h) hsEGFR+PDGFRA+和hsEGFR+GAL1+流式分选细胞的批量RNAseq的差异表达基因的热图。 统计分析，相对于对照组脑小胶质细胞（天0）。 (e) EdU+和EdU–流式分选微胶质细胞的差异表达基因的热图。 (f) 流式分选小胶质细胞（EdU+、EdU–）、巨噬细胞和对侧微胶质细胞的转录组的Spearman相关性与指示的RNAseq数据集的相关性。 (g) EdU+和EdU–流式分选小胶质细胞群之间的差异表达基因和GO分析。 (h) 流式分选正常脑小胶质细胞和携带GBM的对侧微胶质细胞之间的差异表达基因和GO分析。 (e) GBM中EGFR+和CD45+细胞的流式细胞筛选。 (f) 指示GBM细胞类型的流式细胞筛选。 (g、h) 寡突细胞群9和12的拟时间轨迹（root聚类12）（g）和差异表达基因（h）。
79510编辑于 2024-03-22
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