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流式分选后指定细胞亚群的表达量差异(无需单细胞)
其实没有单细胞也是可以研究具体的细胞亚群的表达量差异，那就是流式分选指定细胞亚群，比如： Hepatic CD4+ or CD8+ T-cells of 12 months NASH-diet + 8 digestion and percoll gradient enrichment and subsequently single-cell sorted (sorted gate: L/D-,CD11b -,CD11c-,CD19-,CD45+,CD4+ or CD8+ cells) and frozen on dry-ice . -,CD11c-,CD19-,CD45+,CD4+ or CD8+ treatment: CDHFD1 + anti-PD1 mouse age: 14 感兴趣的可以去分析这个数据集看看，能不能得到文献类似的图表哈 更多类似的先分选指定细胞亚群再进行差异表达量分析的研究 比如数据集：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?
87110发布于 2021-03-24 - 来自专栏流式抗体推文
告别杂细胞干扰！Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒，精准富集人初始 T 细胞
内容概要Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒凭借阴性分选技术，可从新鲜或冻存的人 PBMC 样本中快速分离高纯度人初始 T 细胞。 产品介绍Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒是一款操作快速简便的细胞分离产品，核心用于分离人初始 T 细胞。 支持 1 Assay 处理 1×10⁷个原始细胞，分离后细胞纯度可达 95.2%（分选前纯度仅 6.0%），能满足科研对高纯度细胞的需求。 检测原理Elabscience 人初始T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性去除样本中 CD3⁻非 T 细胞、CD45RO⁺记忆 T 细胞等非目标细胞，实现人初始 T 细胞（CD3⁺CD45RA 分选过程中，试剂盒中的特异性抗体与非目标细胞结合，再通过磁珠分离等步骤去除杂细胞，最终保留高纯度、高活性的目标细胞，确保下游实验的稳定性和重复性。
18410编辑于 2025-11-13 - 来自专栏技术文章
告别分选困扰，Elabscience 让记忆 T 细胞分离快人一步～
如何高效分离记忆T细胞？传统分选方法往往需要对细胞进行标记或刺激，可能影响其天然状态与后续功能。 为此，Elabscience®全新推出的人Memory CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒，采用磁珠阴性分选技术，通过去除非目的细胞，从而富集未被标记的目标细胞，分选后可得到一种最接近天然状态、功能完整 产品速览Elabscience®人Memory CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒通过阴性分选法从新鲜人外周血PBMC细胞样本中分离出Memory CD4/CD8 T细胞。 它可以保持目的细胞未受刺激的原始状态，得到的细胞不带有任何抗体和磁珠标记，可直接进行下游应用。产品优势无刺激，分选目的细胞无抗体和磁珠标记，细胞状态不受影响。纯度高，分选后细胞纯度大于85%。 结果展示以上就是Elabscience®人Memory CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒的相关介绍，更多细胞分选试剂盒持续上线中。
11100编辑于 2025-12-31 - 来自专栏数据科学（冷冻工厂）
单细胞分析：marker鉴定（11）
缺点：可能会错过那些在所有细胞中表达但在这种特定细胞类型中高度上调的细胞标记 min.pct：仅测试在两个群体中的任何一个中的最小部分细胞中检测到的基因。旨在通过不测试很少表达的基因来加速。 如果我们仔细查看标记基因列表，我们还会发现一些 T 细胞相关基因和激活标记。这些可能是激活的（细胞毒性）T细胞。有大量研究支持热休克蛋白与反应性 T 细胞在慢性炎症中诱导抗炎细胞因子的关联。 例如，我们可能对基因 TPSB2 感兴趣，它显示簇中的大部分细胞表达该基因，但其他簇中表达该基因的细胞很少。 因此簇20可能代表肥大细胞。肥大细胞是免疫系统的重要细胞，属于造血谱系。 我们将标记幼稚细胞并将剩余的簇标记为 CD4+ T 细胞。 现在获取所有这些信息，我们可以推测不同簇的细胞类型并绘制带有细胞类型标签的细胞。 + monocytes", "10" = "CD4+ T cells", "11
1.2K40编辑于 2023-02-27 - 来自专栏流式抗体推文
Elabscience 阴性分选技术！人初始 CD4⁺T 细胞分离一步到位，省时高效
内容概要Elabscience 人初始CD4+T细胞阴性分选试剂盒专为分离人初始 CD4⁺T 细胞设计，适配新鲜或冻存的人 PBMC 样本。 凭借高效阴性分选技术，可实现 96% 以上的高纯度分选，1 次实验能处理 1×10⁷个细胞，且细胞可直接用于下游研究，为免疫相关研究提供可靠工具支持。 传统分选方法存在操作复杂、分选纯度低、细胞活性受损等问题，难以满足高精度科研需求。而精准分离高纯度初始 CD4⁺T 细胞，是开展相关基础研究与临床转化研究的前提，市场对高效、可靠的分选工具需求迫切。 检测原理Elabscience 人初始CD4+T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性去除样本中 CD4⁺T 细胞以外的杂质细胞（如 CD8⁺T 细胞、B 细胞、单核细胞等），实现初始 CD4⁺ 药物研发：评估候选药物对初始 CD4⁺T 细胞功能的影响，筛选免疫调节类药物。产品优势高纯度分选：分选后细胞纯度可达 96% 以上，显著优于传统方法，减少杂质细胞干扰。
17610编辑于 2025-11-14 - 来自专栏技术文章
Elabscience 高纯度初始 T 细胞分选试剂盒来破局
随着分选技术的不断精进和对T细胞亚群认知的深化，未来将能设计出更具战斗力、作用更持久的活细胞药物，造福更多患者。 Elabscience®全新推出的人naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒，采用磁珠阴性分选技术，无需直接标记人naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞，避免抗体结合导致的细胞激活或表位遮蔽 产品内容Elabscience®人naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞阴性分选试剂盒通过阴性分选法从新鲜人外周血PBMC细胞样本中分离出naive Pan(CD3)/CD4/CD8 T细胞 无刺激，分选目的细胞无抗体和磁珠标记，细胞状态不受影响。纯度高，分选后细胞纯度大于95%。无需分离柱进行分离。实验耗时短，最快15分钟可完成阴性细胞分选。可用于新鲜人PBMC样本或冻存PBMC样本。 Anti-Human CD8a Antibody[OKT-8]（E-AB-F1110H）、FITC Anti-Human CD56/NCAM Antibody[5.1H11]（E-AB-F1239C）、
51910编辑于 2025-11-03 - 来自专栏流式抗体推文
Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒，快速分离CD8+T 细胞，直接用于下游实验
内容概要Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是一款专为生命科学与医学研究打造的高效细胞分离工具。 产品介绍人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒是 Elabscience 品牌推出的核心产品，专注于人初始 CD8+T 细胞的精准分离。 每 1 Assay 可处理 1×10⁷个原始材料细胞，分选后细胞纯度高达 95.4% 以上，远优于分选前 8.4% 的基础比例。 检测原理人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒采用阴性分选技术，通过特异性结合非目标细胞的抗体与磁珠复合物，在磁场作用下将 CD8+T 细胞以外的杂细胞（如 CD56+、CD57+、CD45RO + 细胞等 总结Elabscience 人初始CD8+T细胞阴性分选试剂盒凭借高纯度、便捷性、强兼容性等核心优势，成功解决了传统细胞分选的诸多痛点。
19210编辑于 2025-11-14 - 来自专栏凋亡检测试剂盒推文
Elabscience 小鼠CD8 T细胞阴性分选试剂盒，助力成果突破
内容概要Elabscience 推出的 EasySort™小鼠 CD8+T 细胞阴性分选试剂盒（货号：MIM003N），凭借阴性分选技术实现小鼠脾脏和淋巴结中 CD8+T 细胞的快速高效分离，分选后细胞纯度高达 检测原理本试剂盒采用阴性分选技术实现 CD8+T 细胞的高效分离。 产品优势高纯度保障：分选后 CD8+T 细胞在 CD45 + 细胞群中占比达 93.4%，远高于分选前的 13.7%，满足高精度实验需求。 细胞活性优异：阴性分选技术不损伤目标细胞，分离后的细胞可直接用于下游培养、染色、功能检测等应用。适配性强：明确适用于小鼠脾脏和淋巴结样本，覆盖免疫研究常用组织来源。 结合亲民的价格与完善的品质保障，无疑是实验室分选小鼠 CD8+T 细胞的优选之选，赶快入手解锁你的免疫研究新突破！
32810编辑于 2025-09-22 - 来自专栏用户7627119的专栏
Nature 子刊：生物信息挖掘单细胞数据金矿
文章概览 研究结果展示 通过对 Batch1 进行单细胞转录组测序，注释细胞类型主要包括上皮细胞、单核-巨噬细胞系、T 细胞、内皮细胞、成纤维细胞、肥大细胞等主要群体。 转移至 T 细胞并降低其杀伤功能，为了证明该途径的可行性，我们反复通过流式分选、RNA 荧光原位杂交、免疫组化等验证实验，发现了表达 PSA/KLK3 的 T 细胞，进一步证实肿瘤细胞通过外泌体驯化 T 除了这一发现，我们还注意到 Batch2 样本采用 BD Rhapsody 平台进行单细胞分选时，我们分析存在一群中性粒细胞，而 Batch1 样本采用 10X Genomics 分选平台的数据中没有分析到中性粒细胞的存在 Fig.6 aEC 与上皮细胞有强作用关系 （图片来源：Nature Cell Biology） 于是，重新设计 11 例不同时期前列腺癌样本（Batch3），分选出内皮细胞进行单细胞测序，通过拟时序分析发现 我们利用流式分选，证明了大部分 aEC 细胞亚群来自于 CRPC 样本；通过共培养发现 aEC 细胞亚群能够提高前列腺癌细胞的侵袭能力，这些实验都证实了 aEC 这一细胞亚群在前列腺癌发生发展过程中起着重要的作用
56330编辑于 2022-09-21 - 来自专栏单细胞天地
单细胞RNA测序揭示了胶质母细胞瘤进展过程中免疫景观的演化
统计分析，相对于对照组脑小胶质细胞（天0）。 (e) EdU+和EdU–流式分选微胶质细胞的差异表达基因的热图。 (f) 流式分选小胶质细胞（EdU+、EdU–）、巨噬细胞和对侧微胶质细胞的转录组的Spearman相关性与指示的RNAseq数据集的相关性。 (g) EdU+和EdU–流式分选小胶质细胞群之间的差异表达基因和GO分析。 (h) 流式分选正常脑小胶质细胞和携带GBM的对侧微胶质细胞之间的差异表达基因和GO分析。 (b) 晚期与早期GBM肿瘤中DC群1、中性粒细胞/PMN-MDSCs群11和巨噬细胞群6和20的差异表达基因的火山图。 (c) 细胞因子配体：受体对分析。 (b) 与a中的肿瘤相同的Tregs、CD4+T和CD8+T的流式细胞筛选比例， (c) 低级别和GBM肿瘤中CD11b+细胞的百分比， 以及IDH1 R132H突变体和IDH1野生型胶质瘤的流式细胞筛选比例
79510编辑于 2024-03-22 - 来自专栏单细胞天地
人类胸腺发育的细胞图谱揭示了T细胞组库的形成
，则将比例简单定义为：特定类型细胞数 / 细胞总数 如果细胞来自不同的分选门，则为每个分选门计算一个归一化因子：给定分选门的细胞数 / 所有分选门的总细胞数。 DCs（DC1、DC2）和浆细胞样 DC（plasmacytoid DC, pDC） 成纤维细胞细被细分为 Fb1（COLEC11, C7, GDF10）、Fb2（PI16, FN1, FBN1）和 Fb1 表达固有免疫相关的重要基因 COLEC11 以及调节上皮细胞发育的维甲酸反应酶 ALDH1A2。而 Fb2 表达细胞外基质基因和信号素（semaphorins），调控血管发育。 ；而 RANKL-RANK 信号（TNFRSF11:TNFRSF11A）局限于 ILC3 和 mTEC(II) / 淋巴管内皮细胞；FGF 信号（FGF7:FGFR2）从成纤维细胞到 TEC，且 FGFR2 CD8αα+ T(I) 的分选策略。
4.5K51发布于 2021-04-16 - 来自专栏微生态与微进化
Nature新技术分享：自动化拉曼光谱仪用于活细胞功能分类
结果讨论 1微流体分选、3D聚焦与系统配置 RACS平台使用微流控装置来捕获与移动微生物细胞，用于后续的拉曼光谱测量与细胞分选。 根据这个参数，全自动化的RACS平台分选细胞的速度达到200细胞每小时（也即3.3细胞每分钟）。 图2. 微流控装置内的细胞分选操作（a. 准确率评估测试中检测的185个大肠杆菌细胞拉曼光谱对比） 为了检测该平台分选的准确率，作者将同一物种氘标记和未标记的细胞以1：1比例混合到一起进行分选。 接下来评估分选准确率，作者将没有氘标记的大肠杆菌细胞用DAPI染色，并与氘标记的细胞进行1比1混合（附件图2b所示），然后输入平台连续一小时的运行分选，然后检测收集的细胞中DAPI染色细胞（也即未标记细胞 然后将小鼠结肠微生物组的细胞使用葡萄糖在有重水条件下进行培养，也即所有细胞都做氘标记，根据PL>6.14作为判断标记的标准进行分选，如附件图3b所示37%捕获的细胞被成功分选，这个效率可以与人工分选媲美
1.4K30编辑于 2022-05-05 - 来自专栏单细胞天地
单细胞测序技术在循环肿瘤细胞检测中的应用
单细胞分选和测序分析 分选 传统的单细胞分选方法，如荧光激活细胞分选 (FACS)，不适用于 CTC 单细胞分选。 用于CTC单细胞分选的方法主要有显微操作分选法、微流控技术分选法、DEPArray和Cell Celector分选系统 微量移液器分离（micropipette isolation）涉及使用微机械机械手或视觉镊子完成单细胞分选的高倍显微镜 ，一步完成单细胞分选、裂解、扩增，如Fluidigm的C1单细胞放大器，具有高通量（每个芯片可完成96个单细胞扩增）细胞分选），反应体积小（可提高扩增效率，减少试剂消耗），污染少，对测序影响小。 这种方法已在单细胞水平上用于研究乳腺癌和结直肠癌中的 CTC Cell celector 分选系统是一种自动分选系统，可将稀有细胞从混合细胞群中分离出来。 通过多功能机器人系统自动检索单细胞和细胞克隆，实现单细胞分选，直接机械分离目标细胞或克隆，不影响细胞活力，实时、高精度观察细胞图像进行细胞分选；但是，这种方法很耗时 单细胞全基因组扩增 单个细胞的DNA
2.4K20编辑于 2022-03-14 - 来自专栏抗体蛋白
单B细胞筛选加速羊驼VHH发现：Hypercell高通量微流控系统在纳米抗体研发中的应用
本文结合真实药企案例，对Hypercell高通量单细胞分选系统在羊驼VHH纳米抗体发现中的应用流程进行整理，包括羊驼PBMC处理、B细胞激活、单细胞液滴包裹、高通量功能分选、NGS测序以及AbFinder 关键词：单B细胞筛选、单细胞筛选、单B细胞分选、B细胞抗体发现、B细胞抗体筛选、羊驼纳米抗体、单B细胞分选、纳米抗体筛选、VHH抗体发现、抗体药物研发、涛烜Hypercell、纳米抗体快速筛选为什么纳米抗体发现越来越关注单 Hypercell系统：单日分选+一周获得VHH序列涛烜科学推出的Hypercell高通量单细胞分选系统，构建了从羊驼PBMC、B细胞激活、单细胞分选、建库测序到序列分析的完整工作流，可实现单日完成高通量单细胞功能分选 首先，在workflow效率方面，该系统能够实现单日完成单细胞分选，包括：液滴包裹单细胞孵育信号检测高通量分选目标细胞回收整体流程约2周即可完成从PBMC到阳性VHH序列的发现，相比传统方案可明显缩短研发周期 更多关于Hypercell高通量单细胞分选系统、羊驼VHH抗体发现以及单细胞抗体筛选也可参考曼博生物相关技术资料关于技术来源本文基于Hypercell单B细胞分选系统、羊驼VHH抗体发现方案、单细胞抗体筛选系统
12910编辑于 2026-05-19 - 来自专栏生信喵实验柴
单细胞测序原理
一、细胞捕获分选技术 1.1 细胞分选技术 单细胞测序主要包括以下四个步骤。其中非常关键的一点就是如何进行单细胞的捕获/分选，这是决定单细胞检测成本和通量的关键步骤。 单细胞测序分析流程图 不同单细胞测序平台主要差别也主要在于单细胞捕获分选的方法不同。在细胞分选的方法里，主要包括特异性分选和非特意性分选两类方法。 下表中根据选择类型，样品要求以及分选细胞数目对几种技术进行了比较。 几种常见单细胞分选技术比较 技术 微吸管分离 激光捕获显微分离 荧光激活细胞分选 抗体磁珠分选 微流控分选 微液滴分选 微孔分选 选择类型 特异性选择 特异性选择 特异性选择 特异性选择 非特异性选择 数千个细胞 1.2 非特异性分选类技术 特异性分选细胞往往捕获细胞数较少，操作复杂，不适合大规模操作，且手工操作步骤较多，对技术人员有较高的要求，重复性不好。
2.7K20编辑于 2022-10-25 - 来自专栏单细胞天地
hECA—人类单细胞表达图谱平台
网址：http://eca.xglab.tech 1、数据规模 116份已发表单细胞数据集 38个人类器官(如下表)与11个组织系统 146种细胞类型 1,093,299个细胞(43,878个基因) 3.1 'in data' cell sorting 该平台提供了一种新型的基于数据的细胞分选方式。具体来说可从网页界面或者API工具快速筛选特定样本、特定器官、特定基因表达模式的细胞群。 多器官T细胞的代谢通路表达概况 首先使用ECAUGHT"分选"了来自18个器官的T细胞群，简单分为了CD4+与CD8+亚群 然后使用GSVA对代谢相关通路进行了单细胞水平的打分，分析相应的器官活性特征。 首先在hECA数据库中分选到2566个CD19+，其中53%是B细胞；其余细胞还包括脑内的内皮细胞、小胶质细胞与神经元，这验证了CART治疗的神经毒性。 针对特定细胞在不同细胞表达、表达marker等 器官水平organ portait 针对特定器官，分析其细胞组成比例等 3.3 label transfer 使用hECA人类特定器官的单细胞表达矩阵
1.4K20编辑于 2023-02-16 - 来自专栏单细胞天地
人乳腺癌中成纤维细胞的异质性和免疫抑制微环境研究
结果 流式分选指标，CD45-, EPCAM-, CD31-，去除血细胞、上皮细胞、内皮细胞；成纤维细胞的分群指标： FAP, integrin b1/CD29, aSMA, S100-A4/ FSP1 下图是流式分选和鉴定的结果（图A-C）。图D是CytoSPADE分析流式数据来进一步证明这个分群的合理性。 也就是说 CAF-S1富集的TNBC T 细胞浸润程度更高，同时CD8+ T细胞的减少可能影响TN乳腺癌的预后。 CAF-S1,CAF-S4 的分子水平表征 流式分选出这两个细胞亚群，做RNA测序。 主要涉及到的细胞因子 CCL11, CXCL12, CXCL13, 和 CXCL14), 细胞粘附 (JAM2) 免疫调节功能(TNFSF4/OX40L, PDCD1LG2/PD-L2, DPP4, NT5E 总结 主要用流式分选的方法分出四个细胞亚群。CAF-S1 在免疫抑制过程中有重要角色。CAF-S1能吸引CD4+CD25+ T细胞并促进其分化为CD25+FOXP3 细胞。
1.7K30编辑于 2022-03-14 - 来自专栏单细胞天地
单细胞分析十八般武艺11：xCell
往期相关 单细胞初级8讲和高级分析8讲 单细胞分析十八般武艺1：harmony 单细胞分析十八般武艺2：LIGER 单细胞分析十八般武艺3：fastMNN 单细胞分析十八般武艺4：velocyto 单细胞分析十八般武艺 5：monocle3 单细胞分析十八般武艺6：NicheNet 单细胞分析十八般武艺7：CellChat 单细胞分析十八般武艺8：Garnett 单细胞分析十八般武艺9：DoubletFinder 单细胞分析十八般武艺 xCell的工作原理是用机器学习算法提取了64种免疫细胞和基质细胞的signature，待检测bulkRNA数据先用ssGSEA算法计算样本在每个细胞类型signature的富集分数，然后用特别设计的算法将样本中各种细胞类型的富集分数转换为细胞类型分数 xCell评分用于下游分析时，可以在不同样本之间对比同一细胞类型的得分，但是不要在同一样本内比较不同细胞类型的得分。 不要把xCell用于单细胞数据的细胞类型鉴定。 关于介绍 xCell 的说明 xCell并不是一款分析单细胞数据的工具，我向大家介绍它并收录在《单细胞分析十八般武艺》专题中，是因为它与单细胞的分析密切相关。
7.1K72发布于 2021-05-18 - 来自专栏数据科学（冷冻工厂）
R中单细胞RNA-seq分析教程 (11)
在这些方法中，签名列表中的每个基因都被同等对待，但实际上，这些基因在区分细胞类型时的作用可能大不相同。如果忽视了这些基因重要性的差异，那么分析结果很难达到最佳效果。 所谓锚点，是指参考数据集中的一个细胞和查询数据集中的一个细胞，它们在经过降维变换后的数据中互为最近邻。这些锚点还会经过进一步筛选，要求它们在原始基因表达空间中具有一定相似性。 之后，会构建一个权重矩阵，用来定义每个查询细胞与每个锚点之间的关系。最后，通过这个权重矩阵，将锚点细胞的标签或值传递给查询细胞。 对于需要转移的分类信息（比如细胞类型标签），输出数据框中还记录了每个细胞对不同参考细胞类型的预测分数。这些分数可以理解为每个查询细胞属于不同细胞类型的估计概率。 因此，我们可以通过汇总这些分数到查询细胞簇中，来进行进一步的比较分析。
32710编辑于 2025-03-04 - 来自专栏单细胞天地
单细胞揭示人胎儿肝造血图谱
卵黄囊和AGM祖细胞在肝脏等胎儿组织中定植，肝脏承担胎儿主要的造血功能直至孕中期。胎儿骨髓在11 PCW 左右开始定植，20 PCW 后成为造血主要部位。 用 FACS 分选 CD45+ 和 CD45− 细胞，送 10x 和 smart-seq2 单细胞测序。为了综合评估 NLTs 和卵黄囊中血液及免疫细胞状态，同时分选了胎儿皮肤、肾脏和卵黄囊细胞。 分选策略 总体来看，肝脏细胞分选138,575个，另有小部分用来做smart-seq2，皮肤细胞分选54,690个，肾脏细胞9,643个，卵黄囊细胞10,071个用于测序。 PAGA结果 基因动态修饰在红系细胞、肥大细胞、巨核细胞三类细胞是明显不同的：红系细胞特异TAL1、KLF1，巨核细胞特异F11R、PBX1和MEIS1，肥大细胞特异HES1。 其中，DC1不同于嗜中性粒细胞祖细胞和与DC2密切相关的DC前体，DC分化涉及CLEC11A，BATF3和ID2的动态调节，而单核细胞分化涉及S100A8 / A9，FCGR1A / 2A和S100A12
1.7K10发布于 2020-03-30
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