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科研文献绘图
- y[nchar(y)>=2] #统计频数 table(y) #排序获得前50个关键字 top50 <- sort(table(y),decreasing = TRUE)[1:50] top50 #绘图 在 R 中，可以利用 qqman 包来绘制 Manhattan 图，Plink 软件的输出结果可以直接作为输入数据进行绘图。
1.4K10编辑于 2022-10-25 - 来自专栏二猫の家
科研绘图配色
04 参考顶刊论文配色 对于科研绘图，一个很好的学习途径是从top论文中观摩学习。多总结好的论文配图的共性，比如展示某类数据时，通常采用哪种图表，哪些色系。 基于操作简便和美观的两个原则，小编从中选取了最适合绘图的五个网址进行详细介绍，做科研收藏这五个网址足够啦。其余配色网站只进行了简单汇总，大家有时间也可以点开试试。
5.9K10编辑于 2023-11-30 科研绘图系列：tidyplots取代ggplot2的科研绘图利器
介绍tidyplots----取代ggplot2的科研绘图利器。tidyplots的目标是简化为科学论文准备出版的情节的创建。它允许使用一致和直观的语法逐渐添加，删除和调整情节组件。
35810编辑于 2025-02-27- 来自专栏聊点学术
科研绘图系列 ：① 小老鼠
科研绘图是一个非常有趣的内容。 在论文体量较大且逻辑复杂时，漂亮的示意图能够锦上添花。既直观呈现研究内容，也能增强论文的可读性。 学习方法：首先要从模仿开始，操作熟练后再自我创作。
2.6K10发布于 2020-08-04 - 来自专栏科研猫
【科研猫·绘图】高级科研做图 – AI入门
当然，有些工作做得特别出色的，杂志编辑会推荐科研做图润色。 创建绘图文件 AI的版本有很多，目前应用最广的是Adobe CC系列的，飞飞老师用的版本是Adobe Illustrator CC 2018版本。打开AI，将出现如下界面。 对其操作在我们科研绘图中是非常常用的，可能很多人都停留在手动对齐以及目测对齐的水平上，其实是很不规范的操作！ AI中的对齐工具非常简单，选择这两个对象，然后选择垂直对齐即可。 小结 好了，一个简单的绘图操作就完成了，从“创建绘图文件-绘制图形-对齐操作-图形输出，一整套操作基本涵盖了AI绘图的主要操作。 当然了，科研做图，绝非一朝一夕之事，各位一定要勤加练习，多阅读高质量的文献，才能做出一眼让人看到就觉得非常惊艳的图。科研是一条漫长的图，一篇优秀的文章，既是科学的积淀，也是艺术的结晶。
2.8K51发布于 2019-10-08 - 来自专栏科研猫
Hiplot Pro，凤凰涅槃，全新上线，更懂你的科研绘图平台
2020年7月，科研猫发起Hiplot项目，而后与来自多方高校及研究所的科研人员共建了学术版Hiplot/Hiplot academic。 01 新的起点，新的目标2021年05月起，为解决Hiplot学术版用户反复反馈的痛点问题，深度优化用户体验，扩展平台功能，简化开发者部署流程，科研猫开发团队从底层完全重构后台框架及UI设计，历时18 为了提升绘图速度，避免单一参数修改后要需要重新提交任务的耗时耗力操作，Hiplot Pro中所有的原生应用均使用了全新的自研加速框架，参数改修不再需要重头计算，使得图形修改速度极大提升，实现极速响应。 入驻Hiplot平台，拥有自己的workbench，随心所欲地发布自己专属的分析工具，然后通过Hiplot平台部署开放给全世界的用户使用。 此外，为了那些有特殊绘图分析需求，却苦于找不到解决方案的人，用户还可以登录需求市场，只要说出您的需求，即可招募全网开发者前来揭榜。
1.2K30编辑于 2022-11-04 - 来自专栏科研菌
绘图教程：科研插图复现(1)
- 网址：https://biorender.com/ - 又见面了~不知不觉就来到BioRender专辑的第3篇推送了，小编今天如期地来和大家一起用BioRender复现科研插图啦！ 今天要复现的这幅插图主要是关于染色体、RNA和siRNA的，原综述里面是一幅占了整个版面的大图，那小编在这里的话就只取其中的一个子图来进行复现，后面类似的绘图操作相信大家一定都能做下来。 —《Nature Reviews Genetics》 原文链接：https://www.nature.com/articles/s41576-020-0247-7 ? 总结：BioRender里面的模板图标很齐全，容易上手，操作简单，在绘图过程里面可以省下不少构建模型的时间，出来的图片还原度和清晰度都蛮不错的。
2.1K30发布于 2021-02-19 - 来自专栏科研猫
【科研猫·高级绘图】 tSNE 分析
我们建立一个data.frame，将绘图需要用到的数据都存入进来。 ? 然后，便是绘图的时刻了~ 3. 基础作图 ggpubr提供了非常多的作图函数，可以方便大家绘制更美观的科研做图。 另外，我们也可以修改图的样式和颜色，来对绘图结果进行提升。 ? ? 5. 高级美化 当然，我们还不能仅仅满足于现有的成果，作图是一个细致的过程，我们需要精雕细琢。
8.1K20发布于 2019-11-23 - 来自专栏生物信息学、python、R、linux
R科研绘图调色板—ggsci
里面包括了一些知名杂志期刊或者软件（甚至是知名科幻电影、动画等）的经典配色风格，对于科研绘图是相当有帮助的。
2K10发布于 2020-04-01 - 来自专栏科研猫
【科研猫·绘图】世界地图绘制
这些图频繁出现在Lancet或者NEJM、CNS等顶级杂志中，不过对于很多科研人员来说，地图的绘制由于没有现成软件可以直接操作，一直以来都是一大难题。 ? 前面一期的教程中，我们给大家讲解了中国地图的绘制方法【科研猫·绘图】中国地图绘制：R语言版，在我们发布这篇教程后，马上有同学反映想要学习世界地图的绘制，作为实力宠粉的科研猫团队，粉丝的要求岂能不去满足。 在这里需要大家在代码中手动做一件事情，由于不知道各位绘图的数据到底长啥样，所以，当你用自己的数据绘图时，请在代码中务必指定一下：最小值，最大值和间隔。 LEVEL 4 那有没有更加高级的方法，使得数值不要按照分层去进行绘图，而是直接作为一个连续性变量进行绘图呢？这样可能看上去颜色会更流畅一些。当然可以！ 不过，作为力臻完美的科研猫技术宅，有没有可能更进一步呢？试着把NEJM当中的配色或者Lancet当中的配色直接用到图中去。
5.2K21发布于 2020-03-26 R语言生存分析和科研绘图
图表示10个参与者，在事件为发生前有7位患者出现了删失情况。忽略删失样本会导致生存概率结果出现偏差。生存分析是一种可以适当考虑被删失患者的方法。
45300编辑于 2024-06-12科研绘图分级指南！7 款工具从零基础到顶刊全覆盖
BioGDP特点：一个拥有10000+原创手绘素材、200+顶刊模板、支持高清多格式导出的全学科覆盖型国产生物医学在线绘图平台。 优势：所有素材均为平台原创并官方提供版权授权文件，消除发表版权风险，同时凭借顶刊级审美与极简中文界面，大幅缩短绘图时间、提升科研产出效率。 Hiplot特点：一个支持超过200种可视化图表并内置医学统计学分析模块的国产免费在线科研数据可视化平台。 SciDraw特点：一个由科学家创作上传、提供大脑、神经元、小鼠、细胞器等矢量图素材且无需注册即可直接下载的完全免费科研绘图素材网站。 二、进阶专业型：需一定学习，但功能强大这类工具需要一定的学习成本（如统计基础、软件操作习惯），但功能更专业，是科研绘图的中坚力量。
1.3K20编辑于 2026-03-25- 来自专栏数据 学术 商业 新闻
Python科研绘图保姆级教程！
绘图代码全面更新原因： 一些绘图工具包的更新，导致学员在使用过程中，安装了较为新的版本，某些绘图函数无法使用； 一些作者自定义的颜色系函数，在对初学者而言，引用起来较为繁琐，造成不好的学习体验； 在使用一些特定绘图工具包时 ； 绘图代码常规的定期更新(这点我们承诺长期更新且定期调整) 调整和新增 对每个绘图工具包的使用给出了详细的官网介绍和安装语句、使用版本等重要信息，学员可直接通过点击给出的链接，直接学习该工具的使用； 新增后的绘图案例 我们以最为复杂的泰勒图绘制为例： 使用前工具包介绍情况 使用SkillMetrics工具包进行绘制，在使用之初，贴心的给出这个包的介绍，如下图所示： 自定义修改绘图函数后的操作 SkillMetrics 工具包默认的绘图函数，在绘图一些较为繁琐或者需求较高的图形时，还是不能较好地完成。 所以，作者对其源码进行了修改，同时也给出了相关介绍，如下： 修改后绘图结果 针对使用修改后的SkillMetrics工具包绘图，我们也给出了绘图结果，如下：
52610编辑于 2024-07-05 - 来自专栏巴山学长
matlab科研绘图模板，直接奉上源代码！
同时也希望大家多多用matlab作科研绘图，绝大部分科研图表都有能用matlab来做(论文级的那种)，咱对matlab用于各种科研图表都有研究，欢迎大家留言交流，还可特殊定制哦！ 模板的实现原理很简单，就是通过修改matlab的相关默认设置即可完成，完整步骤如下： 1、新建一个名为startup.m的matlab脚本文件，在该文件中添加所有与matlab科研绘图属性设置相关的命令 使用matlab科研绘图模板的优点： 1、不用再死记各种绘图属性设置； 2、全自动加载，打开matlab即可使用，无需多余设置、方便快捷； 3、本代码完全开源免费，可根据自行需求实现完全个人化设置； 4、让科研者更专注于科研本身而无需考虑matlab绘图设置。 如有疑问请看视频讲解 视频中所用到的代码如下： % matlab科研绘图模板测试 % 作者：bashan (巴山) % 欢迎关注：matlab爱好者 clc;clear;close all; % 定义自变量
1.9K30编辑于 2023-03-15 - 来自专栏R语言交流中心
R语言中科研绘图神器ggpubr
在整理图像的时候会让人觉得苦恼的就是怎么让绘图风格统一、画风高级。今天就跟大家介绍一个画图的神器，据说可以直接赢得主编的好感。此包就是ggpubr，一个联合ggplot2包进行绘图工具包。 lab.col = "white") ##添加分组 ggbarplot(df, "dose", "len", color = "dose", palette = c("#00AFBB", "#E7B800 #改变填充方式 ggbarplot(df, "dose", "len", fill = "dose", color = "dose", palette = c("#00AFBB", "#E7B800 ", "#FC4E07")) ###多组数据绘制 ggboxplot(df, "dose", "len", color = "supp", palette = c("#00AFBB", "#E7B800 ")) ###QQ图 ggqqplot(wdata, x = "weight", color = "sex", palette = c("#00AFBB", "#E7B800")) 5.
2.2K20编辑于 2022-11-21 - 来自专栏优雅R
好用的免费科研绘图神器，推荐试试
想必很多科研和临床的同道，都会感叹科研的苦和累。既要处理众多的临床病人、收集样本，又要忙实验、分析数据，同时还要紧跟科研前沿文献和撰写文章。 涉及到文章的门面，科研绘图，很多伙伴又需要在纷繁的软件大海、眼花缭乱的公司之间进行选择。Hiplot的出现为大家解决了这些问题。 免费的科研绘图神器—Hiplot，是2020年7月推出的全网首个开源绘图平台，目前提供基于R语言的70余种基础可视化和60余种进阶绘图的功能，同时还部署了多个 openbiox社区项目（如bget下载文献附录 Hiplot简介 Hiplot 致力于建立一个快速迭代、支持中英文环境的科研数据可视化平台。 目前该平台建设已初具规模，已提供基于 R 语言的 70 余种基础可视化的功能： area，面积图 barplot，柱状图 barplot-3d，三维柱状图 beeswarm，蜜蜂群图 boxplot，箱线图
3.6K40发布于 2021-04-25 科研绘图工具分级指南：从新手到顶刊，这7款神器如何搭配？
科研绘图没有“一招鲜”，只有“组合拳”。面对从数据到图表的完整流程，如何选择最适合自己的工具组合？ 本文从“素材+出图”、“数据分析”、“高阶设计”三大功能维度，为你梳理7款核心工具的定位与搭配策略，助你构建属于自己的科研绘图工作流。 一、素材与出图：快速构建高质量初稿这类工具解决的是“画什么”的问题，提供原创素材、模板和便捷的出图方式，是科研绘图的起点。1. BioGDP——全学科覆盖的国产绘图平台定位：生物医学绘图的“全能型选手”。 适用场景：绘制跨学科的复杂科研图表、期刊封面及示意图，尤其适合需要精细打磨图表细节并冲击顶刊的研究者。7. MATLAB——工程生物学建模与仿真“王者”定位：复杂系统可视化的“算法平台”。
61010编辑于 2026-04-02- 来自专栏科学计算
7 Julia绘图工具
官方推荐 Plots 简单的绘图 using Plots y = rand(20,1) plot(y,linewidth=2,title="My Plot") ? Plots配合portfoliocomposition能够画出代码量少而且有内容丰富的图片，但在Julia v1.0版本中好像目前还不支持，等支持后会专门做一个用Plots绘图的教程。 快速绘图工具 GR GR的速度比较快，一般画一些简单的图时可以选择用GR。 绘简单的正弦曲线，加上标题，label using GR x = 0:0.1:100 y = sin. 科学计算绘图工具Gadfly using Gadfly plot(x=rand(10), y=rand(10)) ?
1.6K40发布于 2020-06-30 - 来自专栏生信小驿站
科研绘图系列：（1）使用PPT绘制各类细胞
如上所示，这是最常见的细胞，我们可以看出这样的通用细胞，大约是一侧比另外一侧略微宽或者窄的椭圆。
3.4K40发布于 2020-05-18 - 来自专栏天意云&天意科研云&天意生信云
科研绘图不求人，你自己就能做！
是的，那个一直被我们苦逼科研人奉为“绘图神器”的 Banana 终于迎来了史诗级更新。 接下来，我将为您详细拆解 Banana 到底更新了什么，以及它在科研绘图领域究竟带来了哪些实质性的飞跃。 本文所有信息均来自谷歌官方发布内容，我会尽量用人话把核心功能和在科研绘图中的具体用法讲清楚。 05、7个实用技巧，帮你用好这个工具 官方给了一些使用建议，我结合自己的理解重新整理了一下： 充分利用文字渲染能力：既然文字生成是这次的重点升级，那就多用它来做海报、图表、标语类的内容。 尝试不同的宽高比：不同平台对图片尺寸的要求不一样。你可以生成多个比例的版本，不用每次都重新调整。 进入到科研绘图界面，每个人都可以免费体验试用一下绘图功能，相信你使用过后一定和我一样会被强大的绘图性能所震撼。
1.4K10编辑于 2025-11-29
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