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科研文献工具Histcite介绍
我研一也上过一门类似的讲科研文献检索，整理的课程，老师讲了web of science网站本身的文献分析技巧，也讲了对领域文献的跟踪订阅，但当时没有体会到这些技能的美妙之处，现在马上研二，磕盐压力越来越大 这个工具是某个失眠的夜里在知乎上逛到的。第二天到教研室就下载了一个，果然不错。可以通过它大概的把握一个领域的上下几十年。 可以在工具条的“分析”一栏看到找到最有贡献的作者，研究机构，方便找到领域大牛以跟对方向，也可以看出这个领域的发展历史，哪几年文献少，哪几年突然火起来文献暴增····· 然后用Histcite软件做文献分析 LCS是同行引用量，GCS是总引用量，一般LCS数据更具有参考价值 可以在工具栏调整字号，看的更清晰 左边会给出年份，让你可以看到领域的发展脉络 圆圈里的数字是文献的编号，这个只是为了跟上图的文献分析对上号 但是这30篇文章里还是有机器学习领域的经典高贡献文章，比如 6号文献： A MORE BIOLOGICALLY PLAUSIBLE LEARNING RULE FOR NEURAL NETWORKS
86920编辑于 2022-12-05 工具：iSeq下载公开SRA数据科研利器
retrieve the metadata of the accession, then proceed to download each Run contained within.目前支持以下5个数据库的6种数据格式 FASTQ, 然后通过pigz工具对FASTQ文件进行压缩，最终得到gzip格式的FASTQ文件。 总之，SRA文件下载完成后，iSeq会通过fasterq-dump工具转换为FASTQ文件，除此之外，可以通过-t参数指定转换的线程数。 6. -e, --merge将Experiment中的多个FASTQ文件合并为一个FASTQ文件。 iseq -i PRJNA211801 -a -g由于Aspera下载速度较快，因此，可以通过-a参数让iSeq调用ascp工具进行下载。
88210编辑于 2025-03-12科研绘图 | 这6款工具，让你的数据图表和机制图都拿得出手！
科研绘图大致分两类：数据图表和机制示意图。前者考验统计分析和数据可视化能力，后者考验素材积累和审美水平。很多科研人员只擅长其中一类，另一类就成了短板。 今天推荐的6款工具，从数据统计到机制绘图，从配色设计到矢量精修，帮你全面补齐短板！BioGDP：机制图与流程图首选如果你需要绘制信号通路图、实验流程图或综述机制图，BioGDP是绝佳选择。 对于跨学科研究者来说，Origin是硬核之选。Adobe Illustrator：矢量设计行业标准Adobe Illustrator是专业的矢量图设计工具，适合绘制跨学科的复杂科研图表、封面及示意图。 学习Illustrator需要一些时间，但掌握钢笔工具、路径查找器、色板工具这几个核心功能，就足够应对大部分科研绘图需求了。B站和小红书有很多免费教程，2小时就能上手。 总结：这 6 款科研绘图工具覆盖全场景需求：BioGDP 以原创素材、顶刊模板及版权授权，成为机制图与流程图首选；GraphPad Prism 适配生物医学统计绘图，Origin 专攻多学科复杂数据处理
82220编辑于 2026-04-01- 来自专栏DrugScience
更好的科研辅助工具-scholarscope
更好的科研辅助工具-scholarscope ? 简介： 你需要做的只是安装浏览器插件，不用再考虑其他问题 。 6.随便检索一些 新的页面上出现了分区以及排名，后面还可以自己diy ? 7.随便点进去一篇 右边的custom database就可以启动scihub进行下载，不过需要我们先配置一下 ?
1.3K21发布于 2021-03-04 - 来自专栏气象杂货铺
科研工具｜写论文和文献调研必备神器
最近发现了一个非常好用的文献调研工具——Connected Papers，这是一个免费的文献图谱可视化工具，可以帮助研究人员和科学家查找和探索与其研究领域相关的论文。 该工具不仅可以在线分析文献的引文信息，而且能够提供文献的引用和被引用关联，从而更方便地对一篇文献或某个领域进行调研。 对于写综述时进行文献调研或者写论文时防止错过一些重要参考文献都非常有帮助。 总的来说，这个工具对于文献搜索而言还是非常有用的。如果你有什么更有意思的科研工具，欢迎推荐与大家分享。
1.8K40编辑于 2022-09-23 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
科研绘图篇 | 火山图超简单工具推荐~~
今天给大家介绍一个快速绘制火山图(volcano map) 拓展工具包-ggVolcano，绘图结果为ggplot2对象，也就可以灵活进行相关主题的设置。 详细介绍如下： 安装方法 由于ggVolcano包属于单独开发的只用于绘制火山图的拓展工具，这里使用devtools工具进行安装，安装代码如下： # install.packages("devtools "row", label_number = 10, output = FALSE) ggVolcano包绘制修改颜色的go term 火山图样例 总结 今天给大加介绍了一个绘制火山图超简单的拓展工具包
2.6K21编辑于 2023-08-23 - 来自专栏轮子工厂
科研工具篇 | 我敢打赌，看完之后提高你80%的科研工作效率
为知笔记像大多数其他笔记类工具，如印象笔记和有道云笔记一样，支持多终端同步、mardown笔记、笔记分类与标签等主要功能。自己的使用场景如下： ? 思维导图 说起思维导图，很多人不以为然，其实这是一款被很多人远远低估的工具。大部人拿思维导图来做笔记，而且花费大量的时间来使脑图做的更加漂亮，这有些本末倒置。本质上，思维导图是一个帮助我们思考的工具。 6. 图表绘制工具 漂亮的图表和流程图一样不可或缺，他使你的论文更加有说服力。这里我推荐matplotlib。 7. overleaf 最后介绍一款云端的latex编辑工具。overleaf能够帮助你省去很多的latex配置时间，而且它还支持实时的编译和预览以及期刊投稿。 ? 这七款工具就介绍到这里了。 它们的使用仁者见仁，智者见智，大家完全可以有自己的使用方式，重要的是，要真正理解这些工具背后的逻辑和思维方式，做一个无招胜有招的装备精良派。
2.2K30发布于 2019-05-14 - 来自专栏气象杂货铺
工具推荐｜一款优秀的MATLAB科研绘图工具箱
文末可获取工具手册和安装包链接。
2.1K20编辑于 2022-08-24 - 来自专栏光城(guangcity)
科研神器推荐之那些年你用过的工具
科研神器推荐之爱科研、爱生活 1.论文下载神器篇 1.1 Sci-Hub 关于论文下载神器篇，大家知道有sci-hub,地址如下： https://sci-hub.tw 使用需要配上Sci-Hub插件！ 丰富的生态，配合其它工具可实现浏览器外划词，OCR 查词（图片文字识别）。 情境模式快速切换词典组合 已预设多种场景，每种情景模式下可设置不同词典搭配，一键快速切换。
1.1K10发布于 2019-11-15 - 来自专栏Chris生命科学小站五年归档
“散养”研究生的福音~科研之路必备工具~
小站工具地址赶紧收藏： http://www.chrislifescience.club:3838/R/AnnoE2/ ---- 小站工具v2.8 更新报告 肿瘤中如何找个“靠谱”的基因做研究？ 小站工具上一个版本已经将TCGA转录组数据接入，这样通过选择肿瘤就可以知道哪些基因相对于正常组织高表达或低表达。 而且可以通过小站工具直接做一个火山图出来（TCGA转录组分析网站，查询某肿瘤中高/表达的基因，顺便做个火山图！还可以分析GSEA+生存期图+ROC！赶紧收藏！） 小站工具已经接入TCGA生存期信息，并且已经批量做完了单基因COX分析。通过网站工具交互，大家就可以得到下面这两个图。 这一点曾经让站长痛不欲生～ 所以这个工具至少在开题的时候，可以给大家一个定心丸，至少有这两张图，你可以放心去筛临床样本，结果契合，那么在往下做一定会有很好的结果----
38510编辑于 2023-02-28 - 来自专栏天意云&天意科研云&天意生信云
Nature推荐：搞科研就该用这5款AI工具
文献综述耗时翻倍，实验设计思路受限，数据处理效率迟迟难以突破——你是否也正经历科研的瓶颈期？ 据调查显示，越来越多的大学生和科研人员开始使用AI工具以提升科研效率，频率甚至达到每周甚至每天。 2025年4月7日，Nature期刊发表了一篇文章《Al for research: the ultimate guide to choosing theright tool》，详细介绍了不同AI工具在科研各个环节的应用 科研基金申请 Thesisfy是一款针对科研基金申请设计的AI工具，其“会议和期刊查找器”功能，可以帮助研究者寻找与其研究成果匹配的最佳发表渠道。 一站通用，全模型无缝切换 天意科研AI平台是一家专门针对国内科研人的宝藏站点，提供一站式AI大模型辅助服务。 科研场景优化 ✅️【高效】针对科研核心场景进行专业化适配 ✅️【省心】跨模型上下文记忆 ✅️【稳定】云端计算资源调度（国家级大数据中心支持） 平台背景 天意科研云平台自2023年创建以来 已拥有6w+科研用户
3.2K11编辑于 2025-05-14 - 来自专栏往期博文
【科研工具】文献管理阅读工具Zotero7的安装与常用插件配置
并且，ReadPaper免费版文献上限为200篇，为了长久的科研和钱包考虑，我放弃了ReadPaper，开始使用开源免费的文献管理工具Zotero。 1.Zotero下载 Zotero官网：https://www.zotero.org/download/ 如果直接去官网下载，默认下载的是Zotero6版本，它的界面长这样： 目前，Zotero7 已开始beta内测，很多插件最新版本均是支持Zotero7而不兼容Zotero6。 3.1官方同步 Zotero的每个账户有300M的免费云端存储空间，使用官方同步工具，只需要在设置中登录账户，勾选自动同步。 6.Zotero插件下载 作为开源软件，Zotero有非常丰富的插件生态，安装插件可以让阅读体验更流畅，比如补充一些划词翻译等刚需功能。
14.6K01编辑于 2024-05-24 - 来自专栏巴山学长
C盘爆满标红，电脑卡死，不妨试试这两款工具【科研工具】
今天给大家介绍两款磁盘占用可视化工具，有了它们可以非常方便地揪出那些悄悄咪咪疯狂占用磁盘空间地软件、文件及文件夹，可以说是磁盘清理的最佳伴侣。 打开SpaceSniffer后选择需要扫描浏览的磁盘或文件夹即可，软件界面如下： 咱C盘的SpaceSniper剪影 从图中很容易就能发现超级占内容的文件，比如咱之前给大家推荐过的一款超级文本检索工具 可谁能想到，只有几十兆的小工具，运行之后居然会产生十多个G的记录文件呢？当然还有很多其他的非常占用空间但是又是无关紧要的的文件，处理方法当然就是果断删除了。 咱将持续为大家分享各类编程趣闻和各种学习工具。
3.7K30编辑于 2023-03-15 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
试试这个宝藏科研图表在线绘制工具吧~~
前段时间小编给大家推荐了一个非常优秀的在线图表绘制工具：绘图技巧 | 超多种类在线可视化图表制作工具推荐。 这个工具偏商业化图表绘制，这两天小编再查阅资料时发现了一个宝藏在线可视化工具-Hiplot，这个网站绘制的图表全部都是学术类型的，这下，不会代码的小伙伴也可以绘制高质量的科研学术类图表啦。 主要模块 Hiplot网站主要包括以下几大模块： Hiplot网站主要模块 而我们常规绘图只需要使用基础模块绘图即可，进阶模块则适合绘制较复杂的科研图表，小工具箱模块则包含如拼图工具、文本提取、在线加密解密等工具 接下来，小编就基础模块演示下Hiplot如何进行科研图表的绘制过程的： 绘制过程演示 Hiplot优秀案例欣赏 「热图」 热图 「相关性热图」 相关性热图 「主成分分析 (PCAtools)」 」 GO圈图 -「Histostats」 Histostats -「基因密度图」 基因密度图 -「误差线柱状图」 误差线柱状图 -「小提琴图」 小提琴图 总结 Hiplot网站还有更多的优秀科研可视化样例及学习资源
1.5K20编辑于 2021-12-27 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
所有科研地理图形它都有，这个工具有点猛····
cf-plot绘图工具介绍 cf-plot 是一套 Python 绘图案例，用于绘制气候研究人员常用的等值线图、矢量图和折线图。 地理空间科研绘图注意事项 在论文中编写地图可视化插图时，地图的准确性非常重要，特别是在绘制中国地图时，还需要申请对应的审图编号，才可以进行绘制。 地理信息系统 (GIS) 工具：利用GIS工具和软件来创建、分析和编辑地理数据，以提高制图效率和准确性。 地理数据隐私：在制图过程中，尤其是当使用敏感地理数据时，要注意保护数据隐私和安全。 如何快速的掌握科研绘图技巧？ 如何快速的掌握科研绘图技巧？可以考虑以下几点： 学习基本工具和软件: 先熟悉常用的科研绘图工具和软件，例如Python或者R语言等，选择一款适合你的工具。 模仿和实践: 查看优秀的科研绘图范例，模仿它们的风格和技巧。同时，勤练手，多做练习，实践是提高技能的关键。
93150编辑于 2023-10-10 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
学术科研绘图宝藏工具，推荐收藏~~
推文的主要内如下： SciencePlots 库介绍 SciencePlots 实例演示 SciencePlots 库介绍 使用Python-matplotlib绘制科研图表，其默认的颜色和格式并不能满足一般的期刊要求 而SciencePlots就是为解决科研图表繁琐设置而定制的一系列科研绘图样式库，可以绘制很合适科研发表的图表。 = scatter.D6.values fig,ax = plt.subplots(figsize=(4,3),dpi=300) scatter_01 = ax.plot(x,y1,marker='s ,label='D5') scatter_06 = ax.plot(x,y6,marker='^',ls='--',lw=.5,label='D6') ax.set_ylim(bottom=10,top ,label='D5') scatter_06 = ax.plot(x,y6,marker='^',ls='--',lw=.5,label='D6') ax.set_ylim(bottom=10,top
1.4K30编辑于 2022-02-17 - 来自专栏啄木鸟软件测试
DevOps工具介绍连载（6）——Capistrano
最近在折腾这个，弄了好多次都不成功，看了官方文档和很多博客，都没有说清楚，因此，我觉得有必要把它记录下来，以帮助更多像我这样被弄得烦躁的人。
1.3K20发布于 2020-02-19 - 来自专栏钱塘大数据
“奴才式科研”是中国科研圈的毒瘤
▲ 题图：第五届索维尔会议参加者合影（1927年） 本文原系某国家级科研机构负责人的自述，在作者看来，中国科研表面上看起来一片繁荣，实际深藏危机，如果继续跟班式搞科研，中国科研就没戏了。 我身边一些做科研的朋友，其实也都做得挺顺，但当大家在一起聊天、喝酒，到了最后比较酣畅的时候，就会发出同样的感慨、产生深深的忧虑：如果再这么玩下去，中国的科研就没戏了。 我认为，制约我国科学研究的，是流行的科研方式——跟班式科研，说的恶心一点，是奴才式科研。 替代今天的高铁和飞机，这种新型高速运输工具的基本思路是：建成一种人工制造的真空管道，让密闭舱利用磁悬浮技术，能在管道中实现超高速的飞驰。 而在交通工程领域，大多数专家们考虑交通工具的提速问题，一般的思维方式都是通过对交通工具外形的改变，减少空气阻力。
2.5K30发布于 2018-10-26 - 来自专栏科研猫
【科研猫·绘图】高级科研做图 – AI入门
当然，有些工作做得特别出色的，杂志编辑会推荐科研做图润色。 打开后是一个空白文档界面，一般我们常用的就是工具箱，菜单和文档。 图形绘制 选择矩形工具，新建一个矩形，然后使用移动工具移动这个矩形。 我们把这个图形放大，可以看到这个矩形是由路径组成。 对齐工具 接下来，就是最最重要的时刻了，我们将使用一个工具，名为对齐。对其操作在我们科研绘图中是非常常用的，可能很多人都停留在手动对齐以及目测对齐的水平上，其实是很不规范的操作！ 这样，是不是对的很整齐了~ 同理，大家可以试着操作一下，然后修改文字，做成Figure 1- Figure 6这六张figure。并且图片两两之间距离相等。 当然了，科研做图，绝非一朝一夕之事，各位一定要勤加练习，多阅读高质量的文献，才能做出一眼让人看到就觉得非常惊艳的图。科研是一条漫长的图，一篇优秀的文章，既是科学的积淀，也是艺术的结晶。
2.8K51发布于 2019-10-08 - 来自专栏啄木鸟软件测试
精准测试及其工具（连载6）
前置条件：函数调用图的展示需要分析class文件，在被测程序插装编译时需要选择源码路径和class文件路径。
74010发布于 2019-12-12
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