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科研文献工具Histcite介绍
我研一也上过一门类似的讲科研文献检索，整理的课程，老师讲了web of science网站本身的文献分析技巧，也讲了对领域文献的跟踪订阅，但当时没有体会到这些技能的美妙之处，现在马上研二，磕盐压力越来越大 这个工具是某个失眠的夜里在知乎上逛到的。第二天到教研室就下载了一个，果然不错。可以通过它大概的把握一个领域的上下几十年。 可以在工具条的“分析”一栏看到找到最有贡献的作者，研究机构，方便找到领域大牛以跟对方向，也可以看出这个领域的发展历史，哪几年文献少，哪几年突然火起来文献暴增····· 然后用Histcite软件做文献分析 LCS是同行引用量，GCS是总引用量，一般LCS数据更具有参考价值 可以在工具栏调整字号，看的更清晰 左边会给出年份，让你可以看到领域的发展脉络 圆圈里的数字是文献的编号，这个只是为了跟上图的文献分析对上号
86920编辑于 2022-12-05 工具：iSeq下载公开SRA数据科研利器
FASTQ, 然后通过pigz工具对FASTQ文件进行压缩，最终得到gzip格式的FASTQ文件。 However, considering IO limitations, iSeq currently does not support parallel-fastq-dump.4. 总之，SRA文件下载完成后，iSeq会通过fasterq-dump工具转换为FASTQ文件，除此之外，可以通过-t参数指定转换的线程数。 Note注意2：-q和-g同时使用的时候，会先下载SRA文件，然后通过fasterq-dump工具转换为FASTQ文件，最后通过pigz压缩为gzip格式。 iseq -i PRJNA211801 -a -g由于Aspera下载速度较快，因此，可以通过-a参数让iSeq调用ascp工具进行下载。
88210编辑于 2025-03-12- 来自专栏DrugScience
更好的科研辅助工具-scholarscope
更好的科研辅助工具-scholarscope ? 简介： 你需要做的只是安装浏览器插件，不用再考虑其他问题 。 4.再次点击添加 ? 5.出现下个界面，成功安装，会自动跳转到pubmed ? 6.随便检索一些 新的页面上出现了分区以及排名，后面还可以自己diy ?
1.3K21发布于 2021-03-04 - 来自专栏气象杂货铺
科研工具｜写论文和文献调研必备神器
最近发现了一个非常好用的文献调研工具——Connected Papers，这是一个免费的文献图谱可视化工具，可以帮助研究人员和科学家查找和探索与其研究领域相关的论文。 该工具不仅可以在线分析文献的引文信息，而且能够提供文献的引用和被引用关联，从而更方便地对一篇文献或某个领域进行调研。 对于写综述时进行文献调研或者写论文时防止错过一些重要参考文献都非常有帮助。 1）每个圆点表示一篇文献，最中间的原点就是搜索的文献； 2）圆点的大小表示引用数； 3）原点的颜色表示出版年份； 4）文献按照与搜索文献的相似性排序； 5）相似的文献连接线条更明显，并且会积聚在一起 总的来说，这个工具对于文献搜索而言还是非常有用的。如果你有什么更有意思的科研工具，欢迎推荐与大家分享。
1.8K40编辑于 2022-09-23 - 来自专栏庄闪闪的R语言手册
基于 R 语言的科研论文绘图技巧详解（4）
这个图在科研绘图中较为常用，例如：将算法的收敛情况和计算所耗时间同时绘制。 前三幅图的详细代码介绍可见：基于 R 语言的科研论文绘图技巧详解（3）基于 R 语言的科研论文绘图技巧详解（2）基于 R 语言的科研论文绘图技巧详解（1）。 这一部分在第一篇推文 基于 R 语言的科研论文绘图技巧详解（1）给出，代码将在文末中完整代码给出。 手动修改大部分面板，具体可以参考本篇文章[2]。 1 0.588519612 # 5 4 0.036782476 这里绘制，小编带大家一步步解释，尤其注意作者的思想。 学会融会贯通，用到自己的科研绘图中。 先简单绘制出线性图，可以看到：在 x 轴附近， y 轴下降的很快。
1.1K20编辑于 2022-05-24 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
科研绘图篇 | 火山图超简单工具推荐~~
今天给大家介绍一个快速绘制火山图(volcano map) 拓展工具包-ggVolcano，绘图结果为ggplot2对象，也就可以灵活进行相关主题的设置。 详细介绍如下： 安装方法 由于ggVolcano包属于单独开发的只用于绘制火山图的拓展工具，这里使用devtools工具进行安装，安装代码如下： # install.packages("devtools manually: p1 <- ggvolcano(data, x = "log2FoldChange", y = "padj", fills = c("#e94234","#b4b4d8 ","#269846"), colors = c("#e94234","#b4b4d8","#269846"), label = "row", label_number "row", label_number = 10, output = FALSE) ggVolcano包绘制修改颜色的go term 火山图样例 总结 今天给大加介绍了一个绘制火山图超简单的拓展工具包
2.6K21编辑于 2023-08-23 - 来自专栏轮子工厂
科研工具篇 | 我敢打赌，看完之后提高你80%的科研工作效率
为知笔记像大多数其他笔记类工具，如印象笔记和有道云笔记一样，支持多终端同步、mardown笔记、笔记分类与标签等主要功能。自己的使用场景如下： ? 4. 思维导图 说起思维导图，很多人不以为然，其实这是一款被很多人远远低估的工具。大部人拿思维导图来做笔记，而且花费大量的时间来使脑图做的更加漂亮，这有些本末倒置。 图表绘制工具 漂亮的图表和流程图一样不可或缺，他使你的论文更加有说服力。这里我推荐matplotlib。 7. overleaf 最后介绍一款云端的latex编辑工具。overleaf能够帮助你省去很多的latex配置时间，而且它还支持实时的编译和预览以及期刊投稿。 ? 这七款工具就介绍到这里了。 它们的使用仁者见仁，智者见智，大家完全可以有自己的使用方式，重要的是，要真正理解这些工具背后的逻辑和思维方式，做一个无招胜有招的装备精良派。
2.2K30发布于 2019-05-14 - 来自专栏气象杂货铺
工具推荐｜一款优秀的MATLAB科研绘图工具箱
文末可获取工具手册和安装包链接。
2.1K20编辑于 2022-08-24 - 来自专栏光城(guangcity)
科研神器推荐之那些年你用过的工具
科研神器推荐之爱科研、爱生活 1.论文下载神器篇 1.1 Sci-Hub 关于论文下载神器篇，大家知道有sci-hub,地址如下： https://sci-hub.tw 使用需要配上Sci-Hub插件！ 丰富的生态，配合其它工具可实现浏览器外划词，OCR 查词（图片文字识别）。 情境模式快速切换词典组合 已预设多种场景，每种情景模式下可设置不同词典搭配，一键快速切换。
1.1K10发布于 2019-11-15 - 来自专栏自学气象人
【科研利器】Python处理大数据，推荐4款加速神器
本文向大家介绍几个好用的加速工具，可以很好地补齐现有 PyData 技术栈的短板。有了这些工具，即便是处理亿级数据你也可以应对自如。 该工具能用于多个工作站，而且即使在单块 CPU 的情况下，它的矩阵运算速度也比 NumPy（MKL）快。
1.6K90编辑于 2022-11-02 - 来自专栏生信小驿站
科研绘图系列：（4）使用PPT绘制蛋白质序列
第二步：右键选择填充颜色，设置为清灰色；插入新的矩形，选择不带弧度角的矩形；设置颜色为#E64B35。
3.3K30发布于 2020-07-21 - 来自专栏Chris生命科学小站五年归档
“散养”研究生的福音~科研之路必备工具~
小站工具地址赶紧收藏： http://www.chrislifescience.club:3838/R/AnnoE2/ ---- 小站工具v2.8 更新报告 肿瘤中如何找个“靠谱”的基因做研究？ 小站工具上一个版本已经将TCGA转录组数据接入，这样通过选择肿瘤就可以知道哪些基因相对于正常组织高表达或低表达。 而且可以通过小站工具直接做一个火山图出来（TCGA转录组分析网站，查询某肿瘤中高/表达的基因，顺便做个火山图！还可以分析GSEA+生存期图+ROC！赶紧收藏！） 小站工具已经接入TCGA生存期信息，并且已经批量做完了单基因COX分析。通过网站工具交互，大家就可以得到下面这两个图。 这一点曾经让站长痛不欲生～ 所以这个工具至少在开题的时候，可以给大家一个定心丸，至少有这两张图，你可以放心去筛临床样本，结果契合，那么在往下做一定会有很好的结果----
38510编辑于 2023-02-28 - 来自专栏气象杂货铺
Basemap工具函数(4)
map.drawcoastlines() for lon in range(0, 360, 20): for lat in range(-60, 90, 30): map.tissot(lon, lat, 4,
1.8K10发布于 2020-04-21 - 来自专栏天意云&天意科研云&天意生信云
Nature推荐：搞科研就该用这5款AI工具
文献综述耗时翻倍，实验设计思路受限，数据处理效率迟迟难以突破——你是否也正经历科研的瓶颈期？ 据调查显示，越来越多的大学生和科研人员开始使用AI工具以提升科研效率，频率甚至达到每周甚至每天。 2025年4月7日，Nature期刊发表了一篇文章《Al for research: the ultimate guide to choosing theright tool》，详细介绍了不同AI工具在科研各个环节的应用 科研基金申请 Thesisfy是一款针对科研基金申请设计的AI工具，其“会议和期刊查找器”功能，可以帮助研究者寻找与其研究成果匹配的最佳发表渠道。 一站通用，全模型无缝切换 天意科研AI平台是一家专门针对国内科研人的宝藏站点，提供一站式AI大模型辅助服务。 科研场景优化 ✅️【高效】针对科研核心场景进行专业化适配 ✅️【省心】跨模型上下文记忆 ✅️【稳定】云端计算资源调度（国家级大数据中心支持） 平台背景 天意科研云平台自2023年创建以来 已拥有6w+科研用户
3.2K11编辑于 2025-05-14 - 来自专栏往期博文
【科研工具】文献管理阅读工具Zotero7的安装与常用插件配置
并且，ReadPaper免费版文献上限为200篇，为了长久的科研和钱包考虑，我放弃了ReadPaper，开始使用开源免费的文献管理工具Zotero。 3.1官方同步 Zotero的每个账户有300M的免费云端存储空间，使用官方同步工具，只需要在设置中登录账户，勾选自动同步。 4.文献下载 Zotero添加文献可以手动上传pdf，但这样做效率太低。此时可以通过Zotero Connector的chrome浏览器插件进行下载。 Zotero插件社区：https://zotero-chinese.com/plugins/charts.html Zotero安装插件很方便，只需要在工具->Plugins界面，拖进xpi文件，即可完成安装
14.6K01编辑于 2024-05-24 - 来自专栏巴山学长
C盘爆满标红，电脑卡死，不妨试试这两款工具【科研工具】
今天给大家介绍两款磁盘占用可视化工具，有了它们可以非常方便地揪出那些悄悄咪咪疯狂占用磁盘空间地软件、文件及文件夹，可以说是磁盘清理的最佳伴侣。 打开SpaceSniffer后选择需要扫描浏览的磁盘或文件夹即可，软件界面如下： 咱C盘的SpaceSniper剪影 从图中很容易就能发现超级占内容的文件，比如咱之前给大家推荐过的一款超级文本检索工具 可谁能想到，只有几十兆的小工具，运行之后居然会产生十多个G的记录文件呢？当然还有很多其他的非常占用空间但是又是无关紧要的的文件，处理方法当然就是果断删除了。 咱将持续为大家分享各类编程趣闻和各种学习工具。
3.7K30编辑于 2023-03-15 - 来自专栏新智元
斯坦福AI科研神器开源，一键成文GPT-4o mini加持！科研写作彻底解放双手
背后模型是由必应搜索，以及GPT-4o mini加持。 简单来讲，STORM&Co-STORM系统分为两部分。 具体流程是这样的：使用STORM生成4篇文章，然后将其中2篇提交给GPT-4o分析并提出后续主题。最后再把它们添加到NotebookLM里，一期有声的播客就做好了。 而将来一年的课程内容也足以媲美如今4-7年才能修读到的课程内容。」
34200编辑于 2025-02-15 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
试试这个宝藏科研图表在线绘制工具吧~~
前段时间小编给大家推荐了一个非常优秀的在线图表绘制工具：绘图技巧 | 超多种类在线可视化图表制作工具推荐。 这个工具偏商业化图表绘制，这两天小编再查阅资料时发现了一个宝藏在线可视化工具-Hiplot，这个网站绘制的图表全部都是学术类型的，这下，不会代码的小伙伴也可以绘制高质量的科研学术类图表啦。 主要模块 Hiplot网站主要包括以下几大模块： Hiplot网站主要模块 而我们常规绘图只需要使用基础模块绘图即可，进阶模块则适合绘制较复杂的科研图表，小工具箱模块则包含如拼图工具、文本提取、在线加密解密等工具 接下来，小编就基础模块演示下Hiplot如何进行科研图表的绘制过程的： 绘制过程演示 Hiplot优秀案例欣赏 「热图」 热图 「相关性热图」 相关性热图 「主成分分析 (PCAtools)」 」 GO圈图 -「Histostats」 Histostats -「基因密度图」 基因密度图 -「误差线柱状图」 误差线柱状图 -「小提琴图」 小提琴图 总结 Hiplot网站还有更多的优秀科研可视化样例及学习资源
1.5K20编辑于 2021-12-27 - 来自专栏产品的技术小课
效率工具：4个语音转文字工具
转好的文件可导出，如果想选择免费工具的话，首推飞书妙记！ 使用方法：打开飞书网页版，找到飞书妙记，然后选择上传文件，选择语言，等待翻译，转好后直接导出。 0.33元/分钟 传送门： 网站：https://www.iflyrec.com app：应用市场直接搜 4、网易见外工作平台 - 网站 只要注册就能免费使用！
11.8K20编辑于 2022-05-17 - 来自专栏数据 学术 商业 新闻
所有科研地理图形它都有，这个工具有点猛····
cf-plot绘图工具介绍 cf-plot 是一套 Python 绘图案例，用于绘制气候研究人员常用的等值线图、矢量图和折线图。 地理空间科研绘图注意事项 在论文中编写地图可视化插图时，地图的准确性非常重要，特别是在绘制中国地图时，还需要申请对应的审图编号，才可以进行绘制。 地理信息系统 (GIS) 工具：利用GIS工具和软件来创建、分析和编辑地理数据，以提高制图效率和准确性。 地理数据隐私：在制图过程中，尤其是当使用敏感地理数据时，要注意保护数据隐私和安全。 如何快速的掌握科研绘图技巧？ 如何快速的掌握科研绘图技巧？可以考虑以下几点： 学习基本工具和软件: 先熟悉常用的科研绘图工具和软件，例如Python或者R语言等，选择一款适合你的工具。 模仿和实践: 查看优秀的科研绘图范例，模仿它们的风格和技巧。同时，勤练手，多做练习，实践是提高技能的关键。
93150编辑于 2023-10-10
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