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多区域测序分析肺腺癌的瘤内异质性
导语 GUIDE ╲ 瘤内异质性（intratumor heterogeneity，ITH）是指同一恶性肿瘤在同一患者的不同肿瘤部位的细胞之间，在基因型和表型上存在差异。 3.评估相对于ITH的拷贝数变化 大规模染色体畸变没有观察到实质性差异（Fig.S2A），同一肿瘤内不同区域的log2比值分布相似（Fig. S2B）。 Fig.3 6.分析肿瘤内突变的动态变化 另外在6个肿瘤中观察到突变谱的显著差异（Fig.3B和C），表明在这些肿瘤的发展过程中，可能在不同的时间发生了特定的突变。 使用ABSOLUTE算法评估每个肿瘤区域内的亚克隆部位异质性，至少29（共48）个肿瘤区域存在区域内亚克隆细胞群。 ABSOLUTE算法评估48个肿瘤区域内的亚克隆部位异质性，发现存在区域内亚克隆细胞群，且患者的克隆和亚克隆突变分布存在差异。
80621编辑于 2022-03-29 - 来自专栏用户7627119的专栏
单细胞测序在肿瘤研究中的新进展，文献集锦
肿瘤是指机体在各种致瘤因子作用下，局部组织细胞增生所形成的赘生物，肿瘤细胞会出现不同于正常细胞的代谢变化，并形成不同的谱系，导致肿瘤内异质性。 作者在研究中使用细针抽吸(FNAs)在原发皮肤B细胞淋巴瘤(pCBCL)中注射和对非注射病变的临床、组织学、单细胞转录组和免疫库水平进行了研究。 13名患者接受病灶内T-VEC治疗，其中11名患者在病灶注射处显示肿瘤反应。作者利用FNAs的单细胞测序，在恶性肿瘤人群中分离并鉴定出三种pCBCL亚型。 注射后24小时，检测到HSV-1T-VEC转录体存在于注射病灶的恶性和非恶性细胞中，但在非注射病灶中没有检测到。溶瘤病毒疗法能迅速消灭恶性细胞。 在这里，作者应用单细胞RNA测序分析室管膜瘤的分子群和解剖位置，以调查其瘤内异质性和发育起源。室管膜瘤是由未分化的细胞群组成的细胞层次结构，这些细胞向三种神经-胶质命运谱系分化受损。
1.5K20编辑于 2022-09-21 缺氧协调胶质母细胞瘤内髓系细胞的空间分布
髓系细胞在胶质母细胞瘤(GBM)中非常普遍，存在于表型和激活状态的频谱中。现在对影响GBM中不同髓系细胞群定位和功能的肿瘤微环境(TME)决定因素的了解有限。 为了了解髓系细胞定位的潜在驱动因素，将髓系细胞群的丰度与每个SPOT内生物过程的基因特征联系起来。 特定细胞因子信号通路的基因特征也与spot内髓系细胞丰度相关。对趋化因子基因重复这一分析表明，髓系细胞的特定亚群的定位也由不同的趋化因子组控制。 评估这些环境在TME内的分布发现，它们组织成跨越几个相互连接的spot的更大区域，因此spot之间的连接比例由相同环境的spot之间的连接所主导。 结果9、非髓细胞成分对髓细胞环境的贡献 分析了非髓细胞成分(即来自非髓细胞的基因的贡献)如何在不同的髓细胞环境中变化，特别关注髓细胞群体之间无差异表达的基因。
33400编辑于 2024-05-24- 来自专栏DrugOne
Nat. Commun. | 病毒3C蛋白酶mRNA疗法实现多癌种广谱治疗
研究内容 研究团队创新性地将编码病毒3C蛋白酶的mRNA装载进脂质纳米颗粒 (3C-LNPs)，通过多种给药途径（颅内、皮下和静脉注射）在多种实体瘤模型中展开研究，包括胶质母细胞瘤、乳腺癌和肝细胞癌模型 在胶质母细胞瘤模型中，与对照组相比，接受 3C-LNPs 治疗的小鼠肿瘤生长显著受到抑制，生存率得到显著提高（图1）；在乳腺癌模型中，皮下注射 3C-LNPs 可减少肿瘤体积，抑制肿瘤血管生成（图2）； 而在肝细胞癌模型中，静脉注射 3C-LNPs 不仅抑制了肿瘤生长和血管生成，还延长了小鼠的生存时间（图3）。 同时，研究采取多种体内模型证实，将3C-LNP以上述多种给药途径注射入正常小鼠体内具有良好的安全性。 颅内原位给药、皮下给药以及尾静脉给药三种给药途径在不同的小鼠肿瘤模型中均显示出较高的体内疗效。
37710编辑于 2025-05-17 - 来自专栏生信宝典
癌中之王：基质微环境塑造胰腺癌瘤内结构|Cell
肿瘤腺体分型提供了更为详细的肿瘤内异质性分型，且该分型与基质丰度和临床结果的差异有关。这证明了基质通过改变人PDAC中肿瘤腺体的固有模式来改变肿瘤结构的影响。 条件培养基（CAF-CM）（其实就是CAF分泌的因子）对不同的PDAC细胞系的PRO和EMT表型的影响;作者发现在三种不同的CAF-CM中均发现了相对较高的PRO和EMT表型的细胞，并且作者在免疫缺陷小鼠中注射入不同比例
2.1K20发布于 2019-06-17 - 来自专栏单细胞天地
单细胞测序揭露小细胞肺癌化疗后瘤内异质性
tumor cell ,CTC），以此构建CDX模型 (CTC-derived xenograft, CDX)，然后通过对患者CTC，以及化疗耐药和化疗敏感患者CDX模型进行单细胞测序，以阐释SCLC瘤内异质性 genes) Elbowplot选dims 降维-RUNTSNE(default perplexity value of 30) 数据分析思路 1 CDX数据样本聚类及常见肿瘤相关marker展示 同一样本内肿瘤 marker表达不一致如MDA-SC49r里MYC、EMTscores表达不一致，体现了瘤内异质性的存在。
2.3K41发布于 2020-04-27 - 来自专栏科研菌
看腻的纯生信？这篇基于生信的湿实验换个口味
过表达上调Notch1进而导致黑色素瘤病情加重，同时验证了G9a抑制剂作为黑色素瘤患者治疗方案的可行性。 总之，以上实验结果说明了G9a可以通过Notch1通路调节黑色素瘤细胞的增殖、侵袭、转移。 ? 最后，作者在图7.I、J中进行了in vivo水平的实验，对裸鼠进行A375细胞的皮下注射，一周后开始每隔一天对实验组注射一次UNC0642，共注射10天后测量肿瘤体积，发现注射了UNC0642的小鼠的肿瘤体积比对照组更小 这一步动物实验让针对G9a靶点的UNC0642可以作为黑色素瘤患者潜在治疗方案更具有说服力。 ? ，证明了G9a通过激活Notch1通路促进黑色素瘤的癌症进展，进而说明针对G9a靶点的抑制剂UNC0642可以作为黑色素瘤患者的潜在治疗方案。
1.5K40发布于 2020-07-28 - 来自专栏DrugAI
Nat. Rev. Immunol. | 单抗五十年：抗体治疗的过去、现在与未来
与此同时，皮下注射等递送方式的创新，极大提升了患者的便利性与治疗获益。 1975年，研究人员首次提出了杂交瘤技术：通过将免疫小鼠的B细胞与骨髓瘤细胞融合，获得了能够无限增殖并持续分泌特定抗体的“杂交瘤细胞”。 抗体给药的现状与未来趋势 当前，约63%的抗体药物通过静脉输注，25%通过皮下注射，少数通过眼内或肌肉注射。皮下注射因其便捷性而被越来越多地采用。 从杂交瘤到人源化，从单一IgG到ADC与双特异性，从静脉输注到皮下注射，每一次技术革新都显著提升了临床价值。 未来，随着人工智能、工程化设计与递送创新的加入，抗体治疗将继续突破边界，攻克更多复杂疾病。 https://doi.org/10.1038/s41577-025-01207-9 内容为【DrugOne】公众号原创｜转载请注明来源
41020编辑于 2026-01-06 纳米快递员已上线! LNP 精准投递_MedChemExpress(MCE 中国)
(目标器官肝脏/脾脏)-效果和专业包封设备等效 (Balb/c 小鼠，静脉注射 Fluc mRNA-LNP 复合物，单次给药剂量 0.5 mpk (10 μg/只)，给药后 6 h 组织分布)• 肌肉注射 -实现注射部位、肝脏、脾脏等部位高效递送 (Balb/c 小鼠，肌肉注射 Fluc mRNA-LNP 复合物，单次给药剂量 0.5 mpk (10 μg/只)，给药后 6 h 组织分布)• 腹腔注射-实现注射部位 OptiLNP RNA Transfection Reagent (Local Effect)• 瘤内注射-实现 RNA 在肿瘤组织的高效表达 (Balb/c 小鼠，瘤内注射 Fluc mRNA-LNP 复合物，单次给药剂量 0.35 mpk (7 μg/只)，给药后 6 h 组织分布)• 肌肉注射-长链 mRNA 和短链 siRNA 均可实现在注射部位的高效表达HY-K2024 In vivo OptiLNP RNA Transfection Reagent (Liver-targeted)• 静脉注射-实现肝脏靶向递送，靶向率高于 90% (Balb/c 小鼠，尾静脉注射 Fluc mRNA-LNP 复合物
72710编辑于 2025-06-25- 来自专栏生信技能树
转录组讲师带你读文献(6)-多发性骨髓瘤微环境
杂志：Cancer Cell；April 9, 2018 通讯作者：Ludovic Martinet,2,12,* and Mark J. 使用可移植骨髓瘤细胞系测试抗骨髓瘤药物的疗效：注射the Vk*MYC-derived MM cell line, Vk12653 MM到wild-type (WT), Il1r-/-, and Il18 为了评估NLRP3和接头蛋白ASC的参与，我们使用hVk12653 MM 细胞注射到WT, Nlrp3-/-, and Asc-/-小鼠中。 为此，我们利用我们的全转录组分析MM的微环境,在MM患者BM内确定了308个基因与IL18基因表达密切相关(相关系数> 0.70,p < 10e-8 )，如下图： GSEA分析结果显示（Reactome CEACAM8，和MMP9)，包括最近鉴定的人类癌症PMN-MDSCs特异性基因(OLR1, RETN, LCN2, CD24, MMP8，和COL17A1)。
1.3K20发布于 2021-05-27 - 来自专栏生命科学
Science & Nature 双开花：改善过继性免疫细胞疗法的新手段 - MedChemExpress
临床结果表明，ACT 疗法在血液瘤已经表现出优秀的成绩[2]；但实体瘤异质性大，很少只表达一种肿瘤特异性抗原[7]，并且瘤内免疫抑制检查点的信号的限制，ACT 疗法在实体瘤治疗中的使用还是有很大局限。 在该模型中，注射野生型 IL-2 和 orthoIL-2 突变体后，IFNγ+ T 细胞均会增多，细胞杀伤力增强。 此外，在黑色素瘤的动物模型中，过继转移 orthoIL-2Rβ Pmel-1 改造的 T 细胞和注射 orthoIL-2 突变体的小鼠肿瘤生长速度更慢，生存情况也得到了改善 (Fig. 3c-d)。 +化疗组 (67% 肿瘤完全消退) 或 Ad-oIL-2+CAR-o9R T 细胞+化疗组 (50% 肿瘤完全消退) 的联合治疗有明显抑瘤效果(Fig. 7b)。 在没有化疗组的情况下，Ad-oIL-2+CAR-o9R T 细胞抑瘤效果更加明显，肿瘤完全消退率为 42%。
67620编辑于 2022-12-28 - 来自专栏纳米药物前沿
【汇总】上海药物所李亚平老师在肿瘤免疫治疗领域的研究成果
到达肿瘤后，抗体纳米粒在肿瘤微环境基质金属蛋白酶作用下特异性切除聚乙二醇外壳，实现αPD-L1的瘤内缓慢释放。 在808 纳米波长近红外光照射下，ICG光敏剂可发挥光动力效应，生成活性氧诱导肿瘤部位炎症反应，提高肿瘤免疫原性，促进细胞毒性T淋巴细胞瘤内浸润。 2. 同时利用渗透性多肽制备温敏水凝胶，包载载药肿瘤细胞，从而制备成个性化肿瘤疫苗PVAX，PVAX可在肿瘤手术切除的创口注射给药。 通过单次注射，sHDLs减轻了肿瘤负担，触发了免疫原性细胞死亡（ICD），促进了树突状细胞（DC）的成熟，并增加了CD8 + T细胞的浸润使肿瘤对PD-1阻断敏感。 奥沙利铂可刺激肿瘤细胞发生免疫性细胞死亡，提高肿瘤组织免疫原性，诱导机体对肿瘤细胞的特异性免疫反应，增加肿瘤组织内CTL的浸润，促使“冷瘤”转变为“热瘤”。
1K20发布于 2021-02-04 简报 | ADC迎来总生存兑现，AI制药闯入III期，细胞疗法开始赚钱
B7-H3 在多种实体瘤中高表达，但正常组织表达相对有限，因此成为近年来 ADC 研发的热门靶点。 ，可通过 CirCLIQ 可穿戴式注射器给药，适用范围覆盖 Sarclisa 静脉制剂当前在多发性骨髓瘤中的全部美国获批适应症。 Sanofi 称，这是美国首个可通过可穿戴式注射器给药的抗癌治疗，同时也可选择人工皮下注射。 批准主要得到 III 期 IRAKLIA 非劣效研究支持。 全身给药相关反应由静脉组的 25% 降至皮下组的 1.5%；注射部位反应仅出现在约 0.4%的注射过程中，且几乎均为 1 级。 这一批准反映了成熟生物药竞争逻辑的变化。 术前新辅助给药后，两组肿瘤内 CD8⁺ T 细胞浸润均有所增加。探索性分析提示，基线干扰素信号较高、T 细胞克隆性较强的肿瘤，可能更容易从联合治疗中获得持久获益。
15910编辑于 2026-07-13- 来自专栏单细胞天地
scRNA-seq揭示胰腺导管腺癌的瘤内异质性和恶性进展
总 · 览 胰腺导管腺癌（PDAC）是最常见的胰腺癌类型，具有明显的肿瘤内异质性和不良预后的特点。 肿瘤和对照胰腺中一共获得了57530（41,986 cells from PDAC and 15,544 cells from control pancreases）个细胞转录组图谱，全面描述了PDAC肿瘤内异质性和 总之，该研究结果为破译PDAC中的肿瘤内异质性提供了宝贵的资源。 ? 具有高丰度增殖性导管标志物的PDAC患者中T细胞失活 作者使用TCGA数据分析了PDAC基质内的T细胞活化状态，观察到增殖性导管标志物表达量高时T细胞标志物表达量低。 总结 PDAC的特征在于高度的肿瘤内异质性，这是有效治疗PDAC的主要障碍。因此，非常需要探索肿瘤内异质性和对PDAC预后改善至关重要的潜在机制。
1.5K31发布于 2020-03-30 内容汇总--CD8+ T细胞肿瘤浸润的屏障、机制与治疗机遇
瘤内三级淋巴结构（TLSs）/微生态位“瘤内免疫枢纽”，含DC、B、T细胞。局部激活前体效应T细胞和再激活循环记忆T细胞；存在TLSs与ICB更好响应相关；B细胞活性对TLS功能至关重要。 TLSs的双重作用促进浸润：HEVs提供物理通道；TLSs作为激活生态位；Tfh和PD-1⁺效应记忆T细胞分泌CXCL13/IL-21维持炎症环境阻碍浸润（位置依赖性）：瘤内TLSs支持T细胞效应功能； 代谢屏障缺氧、酸中毒、营养剥夺、毒性代谢物累积HIF1α、乳酸、胆固醇、精氨酸缺乏昼夜节律时间依赖性黏附分子和迁移能力波动Bmal1、ICAM-1、CD80克服CD8⁺ T细胞浸润屏障的策略与机遇一、瘤内免疫刺激通过在肿瘤局部注射细胞因子 策略代表方法机制与效果TLR激动剂咪喹莫特（TLR7激动剂，FDA批准）上调EAMs（如E-选择素）和趋化因子（如CXCL10）→ 促进T细胞黏附血管和外渗局部细胞因子注射瘤内注射IL-2使注射病灶消退 ，但对远处转移缺乏系统性疗效瘤内注射IFN-γ（联合疫苗）增强局部CXCL10表达，选择性地富集疫苗诱导的抗原特异性CD8⁺ T细胞趋化因子基因递送纳米颗粒递送CXCL9/10/11质粒DNA激活CXCR3
41420编辑于 2026-07-18- 来自专栏纳米药物前沿
姜新义Nat Nanotechnol：免疫刺激水凝胶抑制恶性胶质瘤术后复发
免疫疗法已彻底改变了许多原发性癌症的治疗策略，但并未改善多形性胶质母细胞瘤（GBM）的疗效，其仍是最具致死性的恶性脑肿瘤之一。 在此，山东大学药学院姜新义教授开发了一种可注射的水凝胶系统，该系统可在GBM手术切除后刺激肿瘤免疫，从而减轻其复发。 由于神经胶质瘤的浸润性质及其与正常组织的接近性，即使在显微镜下进行手术切除也无法完全清除脑实质中弥散的肿瘤细胞。显微镜下的赘生性外围组织通常被遗忘，导致肿瘤的复发。 腔内给药提供了一种便捷有效的治疗方法，可以与临床外科手术无缝整合，而无需进行其他手术。 本文报道的腔注射水凝胶系统在体内具有出色的可降解性，并具有持续的药物释放特性，可显著减轻肿瘤复发并延长术后颅内肿瘤小鼠的生存期。
1.2K30发布于 2021-02-04 - 来自专栏最新医学影像技术
BraTS2023-MEN——BraTS2023颅内脑膜瘤分割挑战赛
一、BraTS2023-MEN介绍 脑膜瘤是成人最常见的原发性颅内肿瘤，可导致患者显着的发病率和死亡率。 此外，与其他颅内肿瘤不同，脑膜瘤通常仅通过影像学诊断，这增加了 MRI 对治疗计划的重要性。 脑肿瘤分割 (BraTS) 2023 脑膜瘤挑战赛的目的是开发一种针对颅内脑膜瘤的自动多室脑 MRI 分割算法。该算法如果成功，将为客观评估肿瘤体积以制定手术和放疗计划提供重要工具。 此外，该算法将为未来的研究提供一个起点，重点是仅根据 MRI 结果确定脑膜瘤分级、评估侵袭性和预测复发风险。 二、BraTS2023-MEN任务 颅内脑膜瘤的多室分割。 包含任何放射学或病理学上与脑膜瘤不相符的颅内肿瘤的 MRI 研究被排除在外。
1.3K10编辑于 2023-11-24 AbMole丨Oxidopamine：经典神经毒素及其在帕金森病研究中的应用
在科研应用中，6-OHDA常通过颅内注射（如大鼠纹状体或黑质部位）建立帕金森病动物模型。 例如，单侧纹状体注射6-OHDA可导致黑质多巴胺能神经元退化，并伴随运动行为异常[3]，这种模型被用于研究神经保护策略的潜在效果。 此外，6-OHDA（6-OHDA，6-Hydroxydopamine，AbMole，M7832）hydrochloride还被用于模拟非运动症状（如焦虑和呼吸异常），例如大鼠模型中发现6-OHDA注射可降低延髓后疑核区 在细胞模型中，6-OHDA常用于构建细胞损伤模型，例如Oxidopamine hydrochloride（6-羟基多巴胺盐酸盐）可用于人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞系或大鼠嗜铬细胞瘤PC-12细胞系，
23110编辑于 2025-12-25- 来自专栏纳米药物前沿
山东大学姜新义教授和威斯康辛大学胡全银教授团队在Sci Transl Med上发表CAR-巨噬细胞在体编辑新策略
近日，山东大学药学院姜新义教授团队与美国威斯康辛大学-麦迪逊分校药学院胡全银教授团队、山东大学齐鲁医院等多家单位合作构建了一种可注射的基因纳米载体-水凝胶超结构递药系统，并成功应用于恶性脑胶质瘤动物模型的术后免疫治疗 多形性胶质母细胞瘤（GBM）是恶性程度最高的中枢神经系统肿瘤。 外科手术切除是GBM病人临床治疗最基础的干预手段，手术所致物理创伤会在术后瘤腔周围“局部”加剧炎症因子释放，使得在术后瘤腔“局部”富集大量小胶质/巨噬细胞。 我们利用课题组开发的可注射水凝胶“药物贮库”系统，在GBM术后瘤腔内以“填充形式”共递送MΦ靶向编辑纳米载体（pCAR-NPs）和CD47抗体，对术后瘤腔周围“局部”MΦ进行原位编辑，在瘤腔周围生成可靶向清除 同时，在瘤腔“一次性”给予水凝胶共载药贮库，通过水凝胶系统的缓释作用可实现术后瘤腔周围残余脑肿瘤干细胞的持久抑制；（3）利用水凝胶在术后瘤腔内共递送CD47抗体，避免了CD47抗体临床试验中系统给药对红细胞的副作用
1.3K40编辑于 2022-08-15 - 来自专栏拓端tecdat
2026创新药出海报告：小核酸、TCE及口服VEGF策略|附100+报告、数据合集下载
从医药健康行业研究《TCE：血液瘤商业化兑现、自免接棒，实体瘤静待技术进一步突破》可以勾勒出一条清晰的三阶段演化路径。 阶段一：血液瘤临床数据全面突破。 3. 2025医药生物行业创新与出海专题 文章链接：http://mp.weixin.qq.com/s/sS9UmNyQFWvK50qD4zTZ0Q发布时间：2026-01-21核心内容：包含200+份报告 图7：眼科VEGF治疗方式对比：注射vs口服（灰底比例条形图CH10） 图7数据EXCEL及图表PDF模板已分享到会员群 解读：口服VEGF的核心价值不在于对注射VEGF的替代，而在于创造了一个注射剂覆盖不了的增量市场 从图9（中国创新药出海模式演变趋势）观察，2021至2026年License-out交易仍为中国药企出海主流模式，但本土化运营占比从近乎为零提升至近一成五，且增速仍在攀升。 图9：中国创新药出海模式演变趋势（刻度线图CH03） 图9数据EXCEL及图表PDF模板已分享到会员群 这一转型的驱动力来自经济账：License-out模式下中国企业仅能获得产品最终商业价值的不足两成
46610编辑于 2026-07-14
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