- 综合排序
- 最热优先
- 最新优先
Former系列总结 | 生物化学领域🧬| Magicformer? AI 魔法是否能点亮生物化学的未来？
4. molecular docking paradigm for large-scale virtual screening 期刊: arxiv 链接: https://arxiv.org/abs/2411.06740v4
13810编辑于 2026-01-08- 来自专栏博文视点Broadview
GNN 模型在生物化学和医疗健康中的典型应用
计算生物化学和医疗健康的数据常常通过图来表示。 例如，分子和化合物可以自然地表示为以原子为节点、以键为边的图。 图神经网络模型具有强大的图表示学习能力，已被应用于许多生物化学和医疗健康应用中，包括药物开发与发现、药物相似性整合、复方药物副作用预测、药物推荐和疾病预测。 下面将讨论GNN 模型在生物化学和医疗健康中的一些典型应用。 图神经网络已经被用来推动药物开发和发现中的许多重要任务。 从而有助于将候选分子的搜索范围缩小到具有合适性质的分子上； 2）分子图生成，旨在生成具有某种期望性质的分子； 3）药物–靶标结合亲和力预测，即预测药物–靶标的相互作用强度，以便于新药开发和药物再利用； 4） 在药物–靶标亲和力预测任务中，经常涉及的靶标主要有4 种，即蛋白质、疾病、基因和副作用。本节以蛋白质为例说明如何在这项任务中使用图神经网络模型。
1.1K20发布于 2021-07-05 - 来自专栏AI科技大本营的专栏
赠书 | GNN 模型在生物化学和医疗健康中的典型应用
计算生物化学和医疗健康的数据常常通过图来表示。 例如，分子和化合物可以自然地表示为以原子为节点、以键为边的图。 图神经网络模型具有强大的图表示学习能力，已被应用于许多生物化学和医疗健康应用中，包括药物开发与发现、药物相似性整合、复方药物副作用预测、药物推荐和疾病预测。 下面将讨论GNN 模型在生物化学和医疗健康中的一些典型应用。 图神经网络已经被用来推动药物开发和发现中的许多重要任务。 在药物–靶标亲和力预测任务中，经常涉及的靶标主要有4 种，即蛋白质、疾病、基因和副作用。本节以蛋白质为例说明如何在这项任务中使用图神经网络模型。 在文献[4]中，这些蛋白质被表示为氨基酸序列，本节用如图1 所示的氨基酸序列说明药物–靶标结合亲和力预测的框架。
34820编辑于 2023-05-08 - 来自专栏生信技能树
问了一下chatGPT实验室常见的生物化学试剂哪些对人体有害
因为我个人没有实验室技能，所以我通过BioinfoArk提供的中国区chatGPT查询到 一些生物化学试剂具有毒性，对人体有害，希望大家尽可能的避开或者安全使用它！ 以下是一些常见的具有毒性的生物化学试剂： 有机溶剂：有机溶剂如二甲苯、甲苯、氯仿、乙酮、乙醚、甲醇等，可以对人体的中枢神经系统和呼吸系统造成损害。吸入高浓度的蒸汽或接触皮肤可能引起中毒。 并不是所有的实验试剂都有毒 实验室中常见的生物化学试剂有很多种，它们用于生物学、生物化学、分子生物学、细胞生物学、遗传学和其他生命科学领域的研究和实验。 以下是一些常见的生物化学试剂： 缓冲液： 磷酸缓冲液 氢氧化钠缓冲液 三氯乙酸缓冲液 Tris缓冲液 试剂盐： 氯化钠（盐） 氯化钾 磷酸二氢钠 硫酸铵 氨水 蛋白质分析试剂： 苯甲醛 吡啶 酚 布拉德福试剂 异硫氰酸盐 氯仿 丙酮 硅胶 缓解剂： 乙二胺四乙酸（EDTA） 二硫代硫酸（DTT） 巯基乙醇（β-ME） 其他： 乙醇 甘油 硝酸银 聚丙烯酰胺凝胶（SDS-PAGE凝胶） 这些试剂在实验室中用于各种生物化学和分子生物学实验
67040编辑于 2023-11-08 - 来自专栏DrugOne
一个用于量化生物化学下游任务中跨模态蛋白质表示的框架
图 4 模型在几个蛋白质相互作用基准测试上进行了评估，包括SHS27k、SHS148k、STRING和SKEMPI。 有五个实验组代表了不同的模态组合：1）随机初始化，2）仅序列，3）序列+结构，4）结构+GO和5）序列+GO。正如所证明的，组3至组5的表现优于组2，表明多种模态的结合对所有这些PPI数据集都有优势。
57430编辑于 2023-08-31 - 来自专栏DrugOne
JCIM综述 | 人工智能在化学领域的发展与未来
截止至2020年，超过半数与AI相关的化学文献是在过去4年中发表的。 生物化学是AI相关专利中最具代表性的领域之一。但与其他研究领域相比，生物化学在期刊论文中所占的比例相对较小。这表明生物化学领域中AI技术申请专利的强烈愿望，这可能与药物研发的激励相关。 作者的分析确定了大约 15000 篇和 3000 篇跨学科期刊论文和专利，并分析了其中一级学科和二级学科的组合（图4）。 在期刊论文中，观察到分析化学和生物化学、材料科学和物理化学、以及生物化学应用于药理学、毒理学和制药的主要和次要研究领域之间的相关性最强。 在生物化学、药理学、毒理学和药物学研究中，许多论文将AI技术应用于高通量药物筛选、核酸序列分析和蛋白质结构预测等研究课题。
3.1K20发布于 2021-09-17 - 来自专栏镁客网
够疯狂！NASA前科学家望改变基因创造超级人类 | 黑科技
这位生物化学家试图通过注射DIY基因疗法，去除一种抑制他左臂肌肉生长的蛋白质，试图赋予自己超强的力量。 在新的采访中，赞内尔博士声称，人类是“自己所拥有基因组的奴隶”。 这位在加利福尼亚州工作的生物化学家已经出版了一本免费指南，为那些想要进一步了解他的入门DNA工具的人们提供介绍，并对那些想在自己身上亲身进行DNA改造试验的人们做出指导。 后来，这位36岁的生物化学家退出了该项目，开始从事人类基因工程技术的研究工作，从此成为日益壮大的“生物黑客”运动的领军人物。 在今年11月这位生物化学家在网上直播DIY基因编辑技术之后，赞内尔博士承认，他还没有看到自己的实验效果。 赞内尔博士在接受《卫报》采访时表示，类似的动物实验需要经过4到6个月的基因治疗后才能显示出实验结果。 赞内尔博士的基因治疗技术包括使用Crispr-Cas9，这是一种能够在DNA中进行精确编辑的工具。
52600发布于 2018-05-30 - 来自专栏科研猫
一年时间发文量从2000跌至200，JCB还能起死回生吗？
图4：1982年-2017年JCB文章的国别统计 如果说2018年时前所未有，那么2019年对于JCB来说才是真正的空前绝后。 Christian Behl是德国美因茨大学医学中心病理生物化学研究所所长，病理生物化学系的全职教授和系主任。 Subscription：无版面费； 可选Gold Open Access：USD4400 （折合人民币约 30862元，贵啊~） 分区： 中科院分区：①大类：生物3区；②小类：生化与分子生物学 3区、细胞生物学 4区 JCR分区：生化与分子生物学 2区、细胞生物学 2区 主要发表内容 发表有关细胞的生物化学和分子研究的文章，包括分子生物学，生物化学，病理生物化学和分子医学， 计算/生物信息学。
1.7K30发布于 2021-07-16 - 来自专栏科研猫
中科院预警名单，IF却历史最高，国人投稿60%，你还敢试投吗？
它是一本完全OA的杂志，期刊收录范围广，属于生物化学和分子生物学、细胞生物学大类。 影响因子排名：生物化学和分子生物学类：153/297、细胞生物学类：126/105。 JCI评分0.54分，提示该期刊明显低于该领域的平均水平。 JCI排名：生物化学和分子生物学类：201/311、细胞生物学类：138/201。 4.JCR及中科院分区 JCR分区Q3。中科院分区基本都在3-4区，详见图片。 小编大致查阅了一下，平均2-4个月可以接收。但还是看具体文章，我们对最新一期的文章进行随机查阅发现，也有5-7个月的。 -7-30；接收：2021-8-4 8.版面费 该刊是一本纯OA期刊，版面费在1-1.2万人民币左右。
3K20发布于 2021-09-29 - 来自专栏渗透靶机
hackmyvm靶机：p4l4nc4
hackmyvm.eu/1.在官网搜索你想要的镜像,然后下载2.下载好后解压得到.ova的文件，右击选择VMware或者Oracle VirtualBox进行打开3.在弹出的框中，选择存放的位置，然后点击导入4. /n3gr4后面还跟一个php页面。也是得要扫出来的。m414nj3.php然后就是爆破参数。这里ffuf或者抓包都可以，我就选我熟悉的用了。文件包含漏洞，直接弹shell了。 friendster那就可以登录p4l4nc4这个用户了。用私钥登录就好了。登录上去之后直接跑脚本就好了。可以从/etc/passwd提权。那就直接把密码删了就完了。nano改一下就好了。
54400编辑于 2025-05-18 - 来自专栏技术杂记
4
因此对于上边界就是从200，280，180，300开始的一块内存区域，仅需要猜4次。2 多数“影子栈”以F5结尾，所以这个2位我不去猜，我默认猜测的区域以F5结尾。
58910编辑于 2022-06-29 - 来自专栏百味科研芝士
这本IF逐年攀升的4分以上SCI，审稿居然快到平均只要15天！
International Journal of Molecular Sciences是瑞士MDPI出版社发行的国际同行评审OA期刊，广泛收录所有生物化学、分子医学及细胞生物学领域的研究论文及综述，是 在JCR分区里位于生物化学、分子生物学领域1区；在中科院分区位于生物化学、分子生物学领域3区。 芝士君从茫茫刊海里选中这本来推，主要是因为它有三个巨大的优势: ? 1. 影响因子稳步上升 ?
2.7K20发布于 2019-11-11 - 来自专栏量子位
新冠疫情使新科研项目减少36%，生物化学研究下降最多，女性科学家最受影响 | Nature子刊
在非疫情研究中，生物化学领域的新项目减少最多。 同时，在不同的科研人群中，女性科学家或已有年幼子女的科学家受到的影响最大。 论文在最后表示： 科学研究受到的影响在疫情第二年得到了一定程度的恢复。 结果显示，在2020年4月份，科学家的平均每周工作时间比疫情前减少了7.1小时： 不过这个情况在今年得到了缓解：2021年1月，平均每周的工作时间与疫情前的差异缩短到了2.2小时。 而在下降的科研领域中，与生物化学有关的新项目的启动下降最多，远低于平均值： 女性及有子女科学家最受影响 这些科研时间、项目、领域等不同指标的下降同时也与人群特征显著相关。
32810发布于 2021-11-16 - 来自专栏数据和云
典型案例：Oracle数据库中超700TB的LOB存储
MPSA是桑格研究院其中的一个系统，数据库使用的是Oracle 11g，采用的SecureFiles存储方式，以下是几年前的公开数据说明，当时的数据容量是 512TB，每周增长4~5TB。 ? 桑格研究院的数据库系统系统架构，采用的是Oracle标准的体系，RAC集群，ASM存储，生产中心是2套4节点的RAC集群，灾备中心是一套4节点RAC集群。 ? 弗雷德里克·桑格 弗雷德里克·桑格（Frederick Sanger，1918年8月13日－2013年11月19日），是一位英国生物化学家，曾经在1958年及1980年两度获得诺贝尔化学奖，是第四位两度获得诺贝尔奖 他原本打算研究医学，但后来转而对生物化学感兴趣，而剑桥在当时也正好有许多早期的生物化学先驱。桑格在1943年获得哲学博士学位。 2007年，维康信托提供英国生物化学学会（British Biochemical Society）一项补助，使其为桑格从1989年以后的实验研究纪录进行建档及保存。
1.5K40发布于 2018-03-05 - 来自专栏Spring Cloud设计原理
Junit 4 Tutorials(Junit 4 教程)
本教程是比较全面的、较新的Junit 4 实用教程，译自：http://www.javatutorials.co.in/junit-4/，希望对大家有所帮助！ Junit 4注解 Junit4 注解提供了书写单元测试的基本功能。 Junit 4断言方法（Assert methods） 断言方法检查 测试得到的真实值和期望值。 Junit 4参数化测试 参数化测试允许使用不同范围的参数测试Java类中的方法。 Junit 4测试套件(Test Suite) 使用测试套件类来同时运行各种测试类。 Junit 4忽略测试(Ignore Test) 忽略测试 用于禁止 运行单元测试类中一些或全部测试方法。
75120发布于 2021-09-14 - 来自专栏前端加油站
angular4实战（4）ngrx
ngrx主要有四个模块，分别是 ngrx/store， ngrx/effects， ngrx/router-store， ngrx/store-devtools 本次实例用的是ngrx 4. 比如{name:j_bleach}=>{name:bleach} 或者输入属性为一个数组的时候[1,2,3]=>[1,2,3].push(4) 以上这两种方式都不会引发angular的检查策略 如Object.assign({}, {name:j_bleach}, {name:bleach}); 或者[…[1,2,3],4]这样返回一个新的对象。 项目地址：https://github.com/jiwenjiang/angular4-material2
2.4K30发布于 2019-07-02 - 来自专栏生信技能树
Hic建库测序实验流程视频讲解（附送福利资源）
JOVE科研实验视频期刊:13个学科专辑 JoVE Biology 生物 细胞学、分子生物学及有机体生物学，视频内容包含标准技术的新应用以及创新型研究方法，涉及物理生物学、细胞生物化学、遗传学、发育学 JoVE Chemistry 化学 广泛涉及分子间的相互作用以及结构生成的基础及应用性研究，核心研究领域包括分析化学、有机化学、有机金属、无机化学、生物无机化学和生物化学， 还包括小分子材料的设计、准备以及应用 JoVE Biochemistry 生物化学 生物化学专辑主要涉及有关细胞内各组分，如蛋白质、糖类、脂类、核酸等生物大分子的结构、功能和相互作用的研究方法。
1.5K20发布于 2018-08-16 - 来自专栏Mac软件分享
ChemDraw Professional 20 for Mac(化学绘图软件) v20.0.0.38激活版
它提供常见的通路元素（膜、DNA、酶、受体等）以及导入其他实体生物途径绘图功能，能够绘制生物通路图、绘制化学结构、反应式等生物化学构造。 同时它还可以编辑和建立分子式、立体图形、实验装置、结构式、方程式等生物化学构造，辅助专业学科工作者及相关科技人员的交流活动和研究开发工作。 4、从剪贴板复制和粘贴cdxml和molfile文本与其他应用程序交换数据，其格式都如同PerkinElmer E-Notebook一样通用。 4、绘制装置图 chemdraw16支持绘制装置图，包括化学和生物装置图，其中的Clipware part 1和part 2模板库下包含大量的仪器设备图形，选择所需要的组件，点击即可应用。
2K40编辑于 2023-02-28 - 来自专栏DrugOne
nature | 基于深度学习方法的虚拟组织染色
图1-生物化学组织染色的不确定性 在组织病理学中染色组织样品的标准过程是耗时的，因为它是劳动密集型的工作，并且需要专门的实验室环境，化学试剂和训练有素的人员，例如组织技术人员。 GAN网络由深度学习大牛Goodfellow于2014年提出，包括两个部分：生成器（Generator）和判别器（Discriminator），Ozcan研究团队所使用的模型结构如图4 所示，生成器使用的是 图4-模型概览 生成器和判别器的损失函数被分别定义为： ? 其中MSE代表L2范数，TV代表总变化量，λ和α为超参数。 其中4分代表完美，3分代表很好，2分代表可以接受，1分代表不能接受。这些病理学家对所要检查地图像起源并不知情，即病理学家不知道哪些图像实际上是被专业技术人员染色，哪些图像是通过神经网络虚拟染色生成。 表1-肝组织使用虚拟染色（VS）和传统生物化学染色（HS）方法得到的图像结果评测 ?
1.9K40发布于 2021-01-28 - 来自专栏物联网知识
4X4矩形键盘
介绍 什么是矩阵键盘 矩阵键盘是单片机外部设备中所使用的排布类似于矩阵的键盘组，由于电路设计时需要更多的外部输入，单独的控制一个按键需要浪费很多的IO资源，所以就有了矩阵键盘，常用的矩阵键盘有4X4和8X8 ,其中用的最多的是4X4。 矩阵键盘的原理 矩阵键盘又称为行列式键盘，它是用4条I/O线作为行线，4条I/O线作为列线组成的键盘。 在行线和列线的每一个交叉点上，设置一个按键。这样键盘中按键的个数是4×4个。 驱动电路图 按4*4矩阵搭建的按键矩阵还是比较简单的，也有的人为了保证电路的稳定性，加上二极管保护和上拉电阻，但是一般要求不太高的电路就不需要加了，向下面设置的电路那样就可以了。 ? S5,S6,S7配置为下拉输入 GPIOInit.GPIO_Mode=GPIO_Mode_IPU; GPIOInit.GPIO_Pin=S4|S5|S6|S7; GPIO_Init(KEY_PORT,&
85410发布于 2021-01-29
腾讯云开发者
Copyright © 2013 - 2026 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有
深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 
粤公网安备44030502008569号
腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号