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生信入门DAY7-9
本篇内容引自生信技能树 DAY7-9 课前提问： 1、为什么要做数据挖掘？ 即用别人的数据用在自己的文章里面，多半是从别人的数据里筛选自己想要的基因。 step2output.Rdata") #比较复杂的探针注释参考资料 #资料1：拆分取列https://www.yuque.com/xiaojiewanglezenmofenshen/kzgwzl/sv262capcgg9o8s5
52110编辑于 2025-05-22- 来自专栏生信宝典
生信分析Python实战练习 9 | 视频27
生信专用简明 Python 文字和视频教程 源码在：https://github.com/Tong-Chen/Bioinfo_course_python Reference 一些练习题 给定FASTA
28741编辑于 2023-09-22 生信星球--生信入门DAY1
R 语言与 C 语言都是贝尔实验室的研究成果，但两者有不同的侧重领域，R 语言是一种解释型的面向数学理论研究工作者的语言，而 C 语言是为计算机软件工程师设计的。
36410编辑于 2024-01-17生信技能树Day9 GEO数据挖掘 差异分析
clusterProfiler-book/index.html# GOplot：https://mp.weixin.qq.com/s/LonwdDhDn8iFUfxqSJ2Wew# 网上的资料和宝藏无穷无尽，学好R语言慢慢发掘~生信技能树
69911编辑于 2024-04-21生信学习
生信学习第6天之函数学习和操作1.R包是多个函数的集合，使用之前要加载合适的镜像，提高下载的速度。 1列或某几列对整个表格进行排序5.summarise()：汇总6.管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)7.count统计某列的unique值8.內连inner_join,取交集9.
24710编辑于 2024-03-10- 来自专栏淡淡
3.7生信
x <- c(1,3,5,1) 规范的赋值符号： Alt+减号（上下两种等效）
26730编辑于 2023-03-09 - 来自专栏淡淡
3.9生信
all.x = all, all.y = all，“不放弃每一个人”，不舍弃无法合并的内容 图片 矩阵 取子集：不支持$ 图片 新建矩阵： m = matrix(1:9, nrow = 3) colnames 加行名 矩阵的转置和转换： 转置：t(m) 行变列，列变行 转换：as.data.frame(m) 转换为数据框 列表 列表新建和取子集 新建 q = list(m1 = matrix(1:9, nrow = 3), m2 = matrix(2:9, nrow = 2)) 取子集 如果有m1、m2这些元素名字，可以用$取子集； 如果没有m1、m2这些元素名字，用双括号取子集。
1.8K30编辑于 2023-03-14 生信星球——生信入门DAY7:测序
关于测序的入门，零基础的非常推荐【陈巍学基因】视频1，讲的很清晰，可以对二代测序有一个最基本的了解。
21210编辑于 2024-01-24- 来自专栏生信小驿站
R语言之生信（9）R语言多个生存分析曲线比较
====================================== 这篇博客的目的主要是计算当需要计算多个不同组之间的成对比较，并计算P值。
6.2K30发布于 2019-03-22 生信星球——生信入门DAY4:R语言
rnorm(n,mean,sd)函数用于从具有特定均值和标准差的正态分布生成n个随机值。
39810编辑于 2024-01-21生信学习笔记
生信学习第四天之R语言生信学习第四天之R语言1Ｒ语言学习和了解1.1 之前就安装过R和Ｒstudio，浅学习过《r语言实战》，及基本的语言。后续可以再计划学习R for Data Science。
20810编辑于 2024-03-08- 来自专栏嗨嗨嗨
生信学习小组
安装和加载R包1.镜像设置生信星球公众号：你还在每次配置Rstudio的下载镜像吗？
51020编辑于 2023-07-02 - 来自专栏黄金榜
生信技能树
::opts_chunk$set(echo = TRUE,message=F,warning=F) R Markdown head(iris) plot(iris$Sepal.Length) 引用自生信技能树
66320编辑于 2023-04-05 生信星球--生信学习DAY2：适应Linux
权限控制多用户的权限控制命令行模式linux的操作靠命令行来实现目录结构文件系统呈树状，宿主目录放在home目录下2.为什么学生信要用linux？
46000编辑于 2024-01-19- 来自专栏简说基因
生信软件，就是赢家通吃：最佳生信比对软件
在生物信息学中，比对软件是解析和处理生物序列数据的核心工具。它们广泛应用于基因组学、转录组学以及蛋白质组学研究中。今天，我将带大家了解几款常用的比对软件，分析它们的功能特点、优缺点，以及它们在不同研究场景中的适用性。
88410编辑于 2024-12-23 - 来自专栏生信马拉松
生信马拉松 Day9-10 GEO数据分析笔记
里的第二栏里，带“--”说明不对应任何symbol，需要删去 7、一个探针对应多个基因（非特异性探针），难以解释，这些行直接去掉 8、对于lnkRNA不能直接用页面上的TargetID，尽量寻找symbol列 9、 str_detect(pd$title,"and");table(keep) exp = exp[,keep] pd = pd[keep,] 总结： 小洁老师讲的真的非常好，细腻又形象，准备学生信的一定要来学一波让你丝滑入门
59500编辑于 2024-01-26 - 来自专栏优雅R
生信爱好者周刊（第 9 期）：统计建模之道和术
生信科技动态 1、Nature｜可解释深度学习用基因组图谱预测前列腺癌转移状态 麻省理工学院、哈佛大学等高校联合在Nature发表了Biologically informed deep neural 该研究提出可解释深度学习P-NET模型，该模型能够在前列腺癌症患者基因属性的基础上结合生信中的层次信息预测癌症的状态。 该项研究成果以scMethBank: a database for single-cell whole genome DNA methylation maps为题于2021年9月在国际学术期刊《核酸研究 4、usethis包新增`pr_*`系列函数[8] 工具 1、r-script[9] 一个简单的小模块，用于将数据从NodeJS传递给R（并返回）。 r-operate-database/ [8] usethis包新增pr_*系列函数: https://www.garrickadenbuie.com/blog/pull-request-flow-usethis/ [9]
91620发布于 2021-11-25 生信学习笔记
生信学习第二天1.登录服务器，下载安装好xshell7、xftp7等软件，根据账号密码和ip地址等信息正确远程登录服务器2.学习了解什么是linux系统及它的用处2.1 Linux系统下所有皆由“文件夹组成
20410编辑于 2024-03-06生信学习笔记
生信学习之第五天R语言实操1.R语言基本数据类型重点掌握向量和数据框，明确元素、向量、标量的定义元素：数字或者字符串（chr）标量：一个元素组成的变量向量：多个元素组成的变量图片2.提取元素2.1向量x
21810编辑于 2024-03-09生信学习笔记
生信学习第三天1 生信软件的安装图片2 具体安装步骤2.1 百度搜索清华镜像下的安装链接=》进入：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda
25610编辑于 2024-03-07
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