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生信学习笔记
生信学习第四天之R语言生信学习第四天之R语言1Ｒ语言学习和了解1.1 之前就安装过R和Ｒstudio，浅学习过《r语言实战》，及基本的语言。后续可以再计划学习R for Data Science。
21510编辑于 2024-03-08生信学习笔记
生信学习之第五天R语言实操1.R语言基本数据类型重点掌握向量和数据框，明确元素、向量、标量的定义元素：数字或者字符串（chr）标量：一个元素组成的变量向量：多个元素组成的变量图片2.提取元素2.1向量x
23310编辑于 2024-03-09生信学习笔记
生信学习第二天1.登录服务器，下载安装好xshell7、xftp7等软件，根据账号密码和ip地址等信息正确远程登录服务器2.学习了解什么是linux系统及它的用处2.1 Linux系统下所有皆由“文件夹组成
21210编辑于 2024-03-06生信学习笔记
生信学习第三天1 生信软件的安装图片2 具体安装步骤2.1 百度搜索清华镜像下的安装链接=》进入：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda
26710编辑于 2024-03-07生信学习笔记
DAY1--生信学习前准备1学习方式，使用电脑进行学习，与小伙伴交流讨论，共同进步2解决问题，利用搜索引擎学会搜索，推荐虫快搜部落，去解决学习过程中的问题3提高效率的软件，浏览器推荐如chrome，电脑文件搜索 ，Windows用everything，Mac自带搜索；快捷截图软件snipaste或者电脑版微信；思维导图记录，推荐xmind，便于后期整理回顾学习4学习Markdown语法做笔记4.1展示代码a=14.2
29110编辑于 2024-03-05生信入门DAY7-9
本篇内容引自生信技能树 DAY7-9 课前提问： 1、为什么要做数据挖掘？ 即用别人的数据用在自己的文章里面，多半是从别人的数据里筛选自己想要的基因。 step2output.Rdata") #比较复杂的探针注释参考资料 #资料1：拆分取列https://www.yuque.com/xiaojiewanglezenmofenshen/kzgwzl/sv262capcgg9o8s5
54010编辑于 2025-05-22- 来自专栏生信马拉松
生信马拉松 Day9-10 GEO数据分析笔记
里的第二栏里，带“--”说明不对应任何symbol，需要删去 7、一个探针对应多个基因（非特异性探针），难以解释，这些行直接去掉 8、对于lnkRNA不能直接用页面上的TargetID，尽量寻找symbol列 9、 str_detect(pd$title,"and");table(keep) exp = exp[,keep] pd = pd[keep,] 总结： 小洁老师讲的真的非常好，细腻又形象，准备学生信的一定要来学一波让你丝滑入门
60800编辑于 2024-01-26 第4天生信学习笔记-微信公众号生信星球
百度网盘里的软件下载链接： 链接：https://pan.baidu.com/s/1YVf9lvI5jiK_7pPcdAQtvA 提取码：glgk 一.认识R和Rstudio R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境 查看这一篇，养成好习惯： https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA 2.显示文件列表 直接打命令不跟路径会显示哪里？
59410编辑于 2024-02-25第6天生信学习笔记-微信公众号生信星球
R包是多个函数的集合，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。
42510编辑于 2024-02-25第5天生信学习笔记-微信公众号生信星球
（1）R的规范赋值符号是<-，也可以用=代替 （2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行 （3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。 （4）显示工作路径 getwd() （5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。 （6）表格在R语言中称为数据框^_^ （7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。 （8）数据类型（重点只有两个）
51810编辑于 2024-02-24- 来自专栏叶潭生信笔记
生信技能树数据挖掘笔记
[]中括号里面的可以是逻辑值判断，可以是具体的值（即下标），可以是函数，可以是向量
1.1K10编辑于 2023-02-08 - 来自专栏小张的学习笔记
生信技能树学习笔记1
视为一个整体，一个向量只能有一种数据类型，可以有重复值）数据框（约等于表格，一列只能有一种数据类型）矩阵列表4.1 向量的生成c(2,3,15,5,7)## [1] 2 3 15 5 7c(1:9) ## [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9rep("x",times=3)## [1] "x" "x" "x"##有重复的用rep()，有规律的序列用seq(),随机数用rnorm()seq(from =3,to=21,by=3)## [1] 3 6 9 12 15 18 21paste0(rep("x",times=3),1:3)## [1] "x1" "x2" "x3"###paste0函数是把数据连在一起
71320编辑于 2023-05-10 - 来自专栏生信宝典
生信分析Python实战练习 9 | 视频27
生信专用简明 Python 文字和视频教程 源码在：https://github.com/Tong-Chen/Bioinfo_course_python Reference 一些练习题 给定FASTA
28941编辑于 2023-09-22 岩酱的生信学习笔记DAY9—R语言数据结构（向量）
"two" "three" "four" "five" 构建等差数列、重复数列> seq(from=1,to=100,by=2)#从1到100，通过2来排序 [1] 1 3 5 7 9 (x)#函数length计算向量的长度[1] 10> x[1]#通过方括号来检索查找向量中第几位的值[1] 1> x[-1]#列出除了第1位所有的值[1] 2 3 4 5 6 7 8 9 10> y[c(T)]#循环输出TRUE所有的值 [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10> y[c(T,F)]#循环输出对错对错的值[1] 1 3 5 7 9> y[c(T, >5]#检索大于5的值[1] 6 7 8 9 10> y[y>5 & y<9]#通过&来合并两个检索命令[1] 6 7 8> z<-c("one","two","three","four","five after = 8)#对向量v在第8位后面赋值9 [1] 1 2 3 4 5 6 NA NA 9 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20> v[2]<-4#
20410编辑于 2024-05-10- 来自专栏技能板块
生信技能树学习笔记 Day 2
如果代码可以运行但是不出图，可能是因为画板被占用，可以多次dev.off()关闭画板
52120编辑于 2023-02-07 - 来自专栏黄金榜
阿榜的生信笔记9—GEO分析
非常感谢您能够点击进来查看我的笔记。我致力于通过笔记，将生物信息学知识分享给更多的人。如果有任何纰漏或谬误，欢迎指正。 图片以上是我这次在学习生物信息学过程中所整理的笔记。如果大家对这个领域也感兴趣，欢迎加我好友，我的qq号是1841113542。希望大家能够一起学习，共同进步。 如果在笔记中有错误或者不足之处，欢迎大家指正，我们一起加油鸭引用自生信技能树——小洁老师
65600编辑于 2023-05-02 - 来自专栏技能板块
生信技能树学习笔记 Day 3
arrange(test, desc(Sepal.Length)) #从大到小 desc()
63421编辑于 2023-02-09 - 来自专栏2023生信技能树学习记录
生信技能树笔记day5
---title: "生信技能树学习笔记"引用自生信技能树author: "天空"date: "2023-01-02"output: html_document---一、文件读写1. id## 2 66e33592-2e6e-4e50-8a5b-8a3f902eb2b5## 3 142aea0e-7a7b-4ac4-9dbb id## 1 66e33592-2e6e-4e50-8a5b-8a3f902eb2b5## 2 142aea0e-7a7b-4ac4-9dbb -0f62e2379599## 3 9d951ff8-ce21-4c69-86f2-0d1eeb2e40e3## filename
51861编辑于 2023-01-16 第二天生信学习内容笔记-微信公众号生信星球
mkdir biosoft #存放生信软件 mkdir project #存放生信项目 mkdir tmp #存放一些杂七杂八 mkdir src #存放源代码 第三个 ls ls 显示列表，不管是目录还是文件
36500编辑于 2024-02-21- 来自专栏2023生信技能树学习记录
生信技能树笔记day4
---title: "生信技能树学习笔记"引用自生信技能树author: "天空"date: "2023-01-02"output: html_document---一、函数和R包1. 函数与参数图片图片jimmy <- function(a,b,m = 2){ (a+b)^m}jimmy(a = 1,b = 2)## [1] 9jimmy(1,2)## [1] 9jimmy(3,6 R符号图片9. 认清函数和数据图片10. 解决问题的秘诀图片
46120编辑于 2023-01-16
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