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第6天生信学习笔记-微信公众号生信星球
R包是多个函数的集合，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。 ",'D'))test1test2 <- data.frame(x = c('a','b','c','d','e','f'), y = c(1,2,3,4,5,6) test1, y = test2, by = 'x') 5.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_joinanti_join(x = test2, y = test1, by = 'x') 6. 函数则需要两个数据框有相同的行数test1 <- data.frame(x = c(1,2,3,4), y = c(10,20,30,40))test1test2 <- data.frame(x = c(5,6)
42510编辑于 2024-02-25- 来自专栏生信星球--生信入门
生信星球学习小组笔记 Day 6——LIU
生信星球学习小组笔记 2023年12月2日一、R包的下载与装载设置镜像（解决因网络问题不能下载）options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn package")即可二、R包的使用方法（以dplyr包为例）*示例数据test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]> head(test) #head()函数观察下数据的前6行 2.7 5.1 1.9 virginica5 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa6
35310编辑于 2023-12-03 - 来自专栏2023生信技能树学习记录
生信技能树学习笔记-day6
---title: "生信技能树学习笔记"author: "天空"引用自生信技能树date: "2023-01-04"output: html_document---R语言作图1. Petal.Length))+ geom_smooth()+ geom_point()## `geom_smooth()` using method = 'loess' and formula = 'y ~ x'图片（6） Please use `after_stat(prop)` instead.（7）ggplot2位置关系图片#6.位置关系# 6.1抖动的点图ggplot(data = iris,mapping = aes
80600编辑于 2023-01-16 生信学习笔记
生信学习第四天之R语言生信学习第四天之R语言1Ｒ语言学习和了解1.1 之前就安装过R和Ｒstudio，浅学习过《r语言实战》，及基本的语言。后续可以再计划学习R for Data Science。
21410编辑于 2024-03-08生信学习笔记
生信学习第三天1 生信软件的安装图片2 具体安装步骤2.1 百度搜索清华镜像下的安装链接=》进入：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda
26410编辑于 2024-03-07生信学习笔记
生信学习第二天1.登录服务器，下载安装好xshell7、xftp7等软件，根据账号密码和ip地址等信息正确远程登录服务器2.学习了解什么是linux系统及它的用处2.1 Linux系统下所有皆由“文件夹组成
21010编辑于 2024-03-06生信学习笔记
生信学习之第五天R语言实操1.R语言基本数据类型重点掌握向量和数据框，明确元素、向量、标量的定义元素：数字或者字符串（chr）标量：一个元素组成的变量向量：多个元素组成的变量图片2.提取元素2.1向量x
22810编辑于 2024-03-09- 来自专栏用户10800790的专栏
生信星球 day 6
半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_joinsemi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')5.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join6. 简单连接：bind_rows()函数需要两个表格列数相同，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数生信星球
34860编辑于 2023-10-26 - 来自专栏生信技能树
2022年6月_生信入门班_微信群答疑笔记
下面是2022年4月_生信入门班_微信群答疑笔记 上一期答疑笔记是： 2022年5月_生信入门班_微信群答疑笔记 课前答疑 Q1：R官网上不去了 换个网络环境，关掉访问国外网站，再不行就不要上R官网了， 建议卸载重装C盘 Q5：请问这代码没有视频里说的KEGG呢 现在更新，不需要了 Q6：请问这个warning是不是只是说明我的R版本老，但其实是包安好了 包确实是装好了 Q7：我之前的R是4.0.5 Q6：在补前两次课的笔记，对数据框取子集后的结果有点好奇，为啥数据框取行和列子集时，取出来的结果不一样呢？ 学习的时候就用讲师目录的参考基因组 Q31：老师下载了一晚上的sra中断了，现在是得全部从头下载吗 建议删除没下完的文件重新下载，同时建议采取更高级的方法下载，比如用aspera下载fastq格式 优秀笔记
2.4K30编辑于 2022-07-26 生信学习笔记
DAY1--生信学习前准备1学习方式，使用电脑进行学习，与小伙伴交流讨论，共同进步2解决问题，利用搜索引擎学会搜索，推荐虫快搜部落，去解决学习过程中的问题3提高效率的软件，浏览器推荐如chrome，电脑文件搜索 ，Windows用everything，Mac自带搜索；快捷截图软件snipaste或者电脑版微信；思维导图记录，推荐xmind，便于后期整理回顾学习4学习Markdown语法做笔记4.1展示代码a=14.2
29110编辑于 2024-03-05- 来自专栏Chocolate Ice 学习笔记
生信学习小组Day6笔记—Chocolate Ice
Renviron，它是为了设置R的环境变量（这里先不说它）；而.Rprofile就是一个代码文件，如果启动时找到这个文件，那么就替我们先运行一遍（这个过程就是在启动Rstudio时完成的） ------微信公众号 ：生信星球首先用file.edit('~/.Rprofile')打开.Rprofile文件；然后在.Rprofile文件内添加下列两行代码# options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置options "B","C",'D')test2 <- data.frame(x = c('a','b','c','d','e','f'), y = c(1,2,3,4,5,6) )函数则需要两个数据框有相同的行数test1 <- data.frame(x = c(1,2,3,4), y = c(10,20,30,40))test2 <- data.frame(x = c(5,6)
1.2K30编辑于 2023-01-16 - 来自专栏生信学习笔记之按时毕业
Day6-zhh- 学习R包(生信星球学习笔记)
R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上的各种生信分析R包，且包的使用是一通百通的。 安装和加载R包1.镜像设置 https://mp.weixin.qq.com/s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw2.安装和加载示例数据直接采用内置数据集iris的简化版dplyr 五个基本函数 1.mutate()，新增列2.按列号筛选3.按列名筛选这两行代码需要一行一回车4.filter（）筛选行5.arrange(),按某一列或某几列对整个表格进行排序6.summarise()汇总管道操作
38120编辑于 2023-11-04 生信星球——生信入门DAY6:学习R包
（library() : library(package)将加载名为package的命名空间，并添加到包的搜索列表中。加载前对搜索列表进行检查并更新，如果package不存在则报错，如果之前已加载package，则不会重复加载。如没有参数package即library()，则列出lib.loc指定的库中的所有可用包。library(help=package)将返回package的基本信息。
56610编辑于 2024-01-23生信入门DAY5-6
DAY5 本篇内容引自生信技能树 六、R语言作图 1、作图分三类 #作图分三类 #1.基础包 略显陈旧 了解一下 plot(iris[,1],iris[,3],col = iris[,5]) text （2）属性设置 练习6-1 # 时间有限，先在现有的代码基础上修改，课后再自己敲 # 6-1 # 1.加载test.Rdata,分别test的以a和b列作为横纵坐标，change列映射颜色，画点图。 position='jitter')#全局设置 （4）位置调整 #geom_point(position = "jitter") geom_jitter() （5）坐标系 coord_flip() （6） 5、画图扩展部分 （1）STHDA网站 （2）工作目录里有扩展学习的代码 （3）小洁老师语雀画图合集 DAY6 七、R语言的综合运用 引自生信技能树 1、玩转字符串 引自生信技能树 rm(list = #匹配 （2）order() #用的少，用arrange （3）dir() #和文件打交道 （4）file.creat() #和文件打交道 （5）file.exists() #和文件打交道 （6）
42720编辑于 2025-05-27- 来自专栏生信入门
生信星球Day6 conda
今日学习内容：了解conda下载和安装miniconda下载个软件看看---condaconda是linux的软件商店minconda包含了Python和conda，可用于生信使用装载miniconda
39920编辑于 2023-07-22 - 来自专栏笔记生信
生信提升day6-婷
的平均值和标准差dplyr两个实用技能1：管道操作%in%（ctr+shift+m），一步实现三步操作，简便2：count()#统计某列的重复值unique报错原因，没有区分大小写#dplyr处理关系数据6： 简单合并思维导图生信星球
24420编辑于 2023-11-18 - 来自专栏生信星球学习小组每日作业
生信星球学习小组-Day6学习笔记--学习R包
为了一劳永逸地完成镜像配置，我们需要在将镜像链接设置在R的初始配置文件.Rprofile里。
55600编辑于 2023-02-11 第4天生信学习笔记-微信公众号生信星球
5.删除变量 a<-3 b <- 1 c <- 4 u <- 5+6 rm(b) rm(u,c) rm(list = ls())#清空所有变量 代码可以复制，更推荐的方式是用键盘上q前面的那个tab
59310编辑于 2024-02-25第5天生信学习笔记-微信公众号生信星球
（6）表格在R语言中称为数据框^_^（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：? 行- a[,y]#第y列- a[y] #也是第y列- a[a:b]#第a列到第b列- a[c(a,b)]#第a列和第b列- a$列名#也可以提取列（优秀写法，支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）（6）
51410编辑于 2024-02-24- 来自专栏小张的学习笔记
生信技能树学习笔记1
，可以有重复值）数据框（约等于表格，一列只能有一种数据类型）矩阵列表4.1 向量的生成c(2,3,15,5,7)## [1] 2 3 15 5 7c(1:9)## [1] 1 2 3 4 5 6 4.2 对单个向量进行操作#简单计算x<-c(1,3,5,6)log(x)## [1] 0.000000 1.098612 1.609438 1.791759sort(x,decreasing=T)## [1] 6 5 3 1##默认从小到大，T会变成从大到小常用函数：x<-c(1,3,5,6)var(x)#方差## [1] 4.916667sd(x)#标准差## [1] 2.217356length (x)#x长度## [1] 4unique(x)#去重复## [1] 1 3 5 6duplicated(x)#判断是否重复## [1] FALSE FALSE FALSE FALSEtable(x)# 重复值统计## x## 1 3 5 6 ## 1 1 1 1sort(x,decreasing=T)#排序##默认从小到大，T会变成从大到小## [1] 6 5 3 14.3 对两个向量进行操作 在R
71120编辑于 2023-05-10
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