生信星球 day 5 ——橙子🍊

生信星球数据结构 向量vector 标量：1个元素 向量：多个元素 从向量中提取元素 x[4] x[x==10] 位置、逻辑值 数据框 a <- read.table(file='huahua.txt'

生信星球Day5 Linux

生信星球——生信入门DAY5:数据结构

)表示1-10之间每0.5取一个数从向量中提取元素x[4] #x第4个元素x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素x[2:4]#第2到4个元素x[-(2:4)]#除了第2-4个元素x[c(1,5) ] #第1个和第5个元素x[x==10]#等于10的元素x[x<0]x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素数据框read.table(file="",sep="",header

第5天生信学习笔记-微信公众号生信星球

（4）显示工作路径 getwd()（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。（6）表格在R语言中称为数据框^_^（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。 这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改x[4] #x第4个元素x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素x[2:4]#第2到4个元素x[-(2:4)]#除了第2-4个元素x[c(1,5) ] #第1个和第5个元素（2）根据值x[x==10]#等于10的元素x[x<0]x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素Part2：数据框将示例数据放在你的工作目录下（！ "bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量save(a,file="test.RData")#保存其中一个变量load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令（5）

生信星球学习小组Day5-云朵

（1）R的赋值符号是**<-**> （2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行 > （3）R的代码都是**带括号**的，括号必须是英文> （4）显示工作路径 getwd()> （5） 这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改x[4] #x第4个元素x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素x[2:4]#第2到4个元素x[-(2:4)]#除了第2-4个元素x[c(1,5) ] #第1个和第5个元素（2）根据值x[x==10]#等于10的元素, *两个等号*x[x<0]x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素# 3.

​Day5生信星球小组学习-LuKa

Day5数据结构生信星球小组学习-LuKa如果你在执行 save(X, file = "test.RData") 时出现 "object X not found" 的错误，这通常表示在保存之前，R 无法找到名为

生信星球学习小组笔记 Day 5——LIU

生信星球学习小组笔记 2023年12月1日今天对R语言数据结构进行学习，★划重点：向量和数据框一、向量新知初印象：变量、一串数字、一串字符、不止一个、数据分析的直接对象。 x <- rnorm(5) #利用正态分布函数生成5个符合正态分布的数字> x[1] 0.4565827 0.0398871 0.9193298 1.0669231 -1.2529013TIPS 二、从一串向量取出需要的值通过上面的结果，我们得到了有5个数值的向量。 #第4至5个x[c(1,2,5)] #第1，2，5个获得结果> x[1][1] 0.4565827> x[-1][1] 0.0398871 0.9193298 1.0669231 -1.2529013 > x[4:5][1] 1.066923 -1.252901> x[c(1,2,5)][1] 0.4565827 0.0398871 -1.2529013三、数据框（data frame）*英文名字很重要

生信星球 —— day 7

生信星球1. 一二三代测序每一代测序都是为了解决上一代的问题，但又不完美一代测序准确度高，但通量低二代测序即高通量测序，但读长短三代测序读长长，但准确度低2.

​生信星球--生信入门DAY1

R 语言与 C 语言都是贝尔实验室的研究成果，但两者有不同的侧重领域，R 语言是一种解释型的面向数学理论研究工作者的语言，而 C 语言是为计算机软件工程师设计的。

生信星球 day 6

dplyr")library(dplyr)dplyr五个基础函数1. mutate()新增列2. select()按列筛选3. filter()筛选行4. arrange()按某1列或某几列对整个表格进行排序5. full_joinfull_join( test1, test2, by = 'x')4.半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_joinsemi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')5. 反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join6.简单连接：bind_rows()函数需要两个表格列数相同，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数生信星球

生信星球 Day 4 —— 橙子🍊

源自生信星球，由于有R基础，内容1、2、3跳过了基础代码1、显示文件列表（右下角窗口file直接有显示，在R中其实不那么重要）dir()list.files()图片2、显示历史命令（右上角history 的某一列值来定义对应图的某属性（要是离散型变量）ggplot(data = mpg)+ geom_point(mapping = aes(x=displ,y=hwy,color=class))图片ggplot详解有些长，day5继续

生信星球——生信入门DAY7:测序

关于测序的入门，零基础的非常推荐【陈巍学基因】视频1，讲的很清晰，可以对二代测序有一个最基本的了解。

生信星球 day 3 —— 橙子🍊

安装一切顺利，愉快学习的一天，感谢生信星球，感恩豆豆花花，继续磕cp安装操作记录1. biosoftwget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh5.

生信星球 day 2 —— 橙子🍊

n3 … #显示前3行|3可替换tail -n3 … #显示后3行cp file1 file2 #复制file1，命名file2mv #移动或重命名图片生信星球学习小组

生信星球 DAY 1 —— 橙子🍊

搜狗微信、搜狗知乎、github*STEP 2：高效学习1. 高效软件chrome浏览器|沙拉查词*、scholarscopesnipaste2. clinical,KLRB1_tr,by='CGGA_ID')View(CGGA_325_KLRB1)write.csv(CGGA_325_KLRB1,file = 'CGGA_325_KLRB1.csv')生信星球学习小组第

生信星球——生信入门DAY4:R语言

rnorm(n,mean,sd)函数用于从具有特定均值和标准差的正态分布生成n个随机值。

Day5-i 生信星球学习-数据结构

Day5-i 生信星球学习-数据结构新手笔记：（1）R的规范赋值符号是<-，也可以用=代替（2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行 （3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文。 （4）显示工作路径:getwd()（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。（6）表格在R语言中称为数据框（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。 从向量中提取元素根据元素位置#这里的x是签名赋值的变量名，根据需要进行修改x[4] #x第4个元素x[-4]#除了第4个元素之外剩余的元素x[2:4]#第2到4个元素x[-(2:4)]#除了第2-4个元素x[c(1,5) ] #第1个和第5个元素根据值x[x==10]#等于10的元素x[x<0]x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素数据框读取本地数据read.table(file = "

生信星球--生信学习DAY2：适应Linux

权限控制多用户的权限控制命令行模式linux的操作靠命令行来实现目录结构文件系统呈树状，宿主目录放在home目录下2.为什么学生信要用linux？ ，系统开源、免费，不需要图形界面，有效节约资源.3.怎样召唤linux--阿里云服务器1 单纯linux2 Windows10上的linux3 Windows7 上的linux4 Mac上的linux5 5.linux有哪些最基本的操作？ from deb cd5 command 'cdb' from deb tinycdb command 'cdv' from deb codeville command 'cde' from deb from deb cd5 command 'cdo' from deb cdo command 'cdi' from deb cdo command 'cdp' from deb irpas

生信星球day7-毽子

v=fCd6B5HRaZ8 from一只小蛮要 Fastq格式：一种基于文本的，保存生物序列（通常是核酸序列）和其测序质量信息的标准格式,一般都包含有4行。

生信星球Day6 conda

今日学习内容：了解conda下载和安装miniconda下载个软件看看---condaconda是linux的软件商店minconda包含了Python和conda，可用于生信使用装载miniconda