生信星球 Day 4 —— 橙子🍊

源自生信星球，由于有R基础，内容1、2、3跳过了基础代码1、显示文件列表（右下角窗口file直接有显示，在R中其实不那么重要）dir()list.files()图片2、显示历史命令（右上角history

生信星球——生信入门DAY4:R语言

rnorm(n,mean,sd)函数用于从具有特定均值和标准差的正态分布生成n个随机值。

生信星球学习day4-毽子

生信星球调整字体大小图片1.新建project按红色框框图片设置工作目录：setwd()查看工作目录：getwd()2.显示文件列表dir()或 list.files()图片显示运算加减 1+2 回车乘方 abs（-3)赋值赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号x<- 1+2  意思是把1+2的运算结果赋值给x，  赋值后，x会显示在右上角的框，Environment里的Value列表里生信星球删除变量 b <- 1c <- 4u <- 5+6rm(b)rm(u,c)  rm(list = ls())#清空所有变量代码可以复制，更推荐的方式是用键盘上q前面的那个tab键补齐。

第4天生信学习笔记-微信公众号生信星球

今天的学习内容： 1.安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面） 2.粗略了解R语言是什么，干什么的，认识Rstudio的工作界面 3.学会外观设置和基本操作 4.完成第一个R做的图 如果已经安装或者基础较好 3.加减乘除 1+2 回车 4.赋值 赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号 x<- 1+2  意思是把1+2的运算结果赋值给x，  赋值后，x会显示在右上角的框，Environment 5.删除变量 a<-3 b <- 1 c <- 4 u <- 5+6 rm(b) rm(u,c)   rm(list = ls())#清空所有变量 代码可以复制，更推荐的方式是用键盘上q前面的那个tab

生信星球学习小组笔记 Day 4——LIU

生信星球学习小组笔记 2023年11月30日*之前已对R语言和Rstudio的基本操作有了初步的入门了解，但每次对R语言学习都能够获得“新知”。电脑用户名要设置为英文名，否则会带来潜在的麻烦。 = （之前有看过相关说法，<-是R语言特有，部分老师推荐使用更简洁的=）高级绘图：ggplot2学习 参考豆豆和花花老师公众号文章https://mp.weixin.qq.com/s/jOIJLpCN4qTznPH0b-qJdw

生信星球Day4 学习R包

iris[c(1:2,51:52,101:102),]t1 <- mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)t2 <- select(test,c(2,4) )t3 <- filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 )t4 <- arrange(test, desc(Sepal.Length))t5 <

生信星球学习小组Day4-土

R和Rstudio的下载安装 生信星球：【R软件和R包安装】 https://www.bilibili.com/video/BV1J44y1R7ci/? share_source=copy_web&vd_source=ba670d5a7ca081b044384f15866b88ef R语言学习：生信技能树https://m.bilibili.com/video /av25643438.htm 新建工作目录 生信星球：https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA 显示文件列表 相当于linux的ls dir（

生信星球学习小组Day4-云朵

. → Appearance→Editor Font size →Apply4.

生信星球 —— day 7

生信星球1. 一二三代测序每一代测序都是为了解决上一代的问题，但又不完美一代测序准确度高，但通量低二代测序即高通量测序，但读长短三代测序读长长，但准确度低2. 二代测序大致流程1 DNA文库构建2 桥式PCR3 测序4 数据产出3. NGS组学基因组学、转录组学、蛋白组学、代谢组学图片

​生信星球--生信入门DAY1

R 语言与 C 语言都是贝尔实验室的研究成果，但两者有不同的侧重领域，R 语言是一种解释型的面向数学理论研究工作者的语言，而 C 语言是为计算机软件工程师设计的。

生信星球 day 6

bioc/") install.packages("dplyr")library(dplyr)dplyr五个基础函数1. mutate()新增列2. select()按列筛选3. filter()筛选行4. = "x")2.左连left_joinleft_join(test1, test2, by = 'x')3.全连full_joinfull_join( test1, test2, by = 'x')4. by = 'x')5.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join6.简单连接：bind_rows()函数需要两个表格列数相同，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数生信星球

生信星球——生信入门DAY7:测序

fastqc`chmod 用3个数字来表达对 用户（文件或目录的所有者），用户组（同组用户），其他用户 的权限：　　如：chmod 755 fastqc　　数字7是表达同时具有读，写，执行权限：(7 = 4 + 2+ 1)　　读取--用数字4表示；　　写入--用数字2表示；　　执行--用数字1表示; 三者皆否：0将FastQC文件夹导入环境变量echo 'export PATH=/YOUR/FASTQC PATH

生信星球学习小组DAY4-R语言基础

生信星球 day 5 ——橙子🍊

生信星球数据结构 向量vector 标量：1个元素 向量：多个元素 从向量中提取元素 x[4] x[x==10] 位置、逻辑值 数据框 a <- read.table(file='huahua.txt'

生信星球 day 3 —— 橙子🍊

安装一切顺利，愉快学习的一天，感谢生信星球，感恩豆豆花花，继续磕cp安装操作记录1. 选择相应的miniconda，右键复制链接网址图片4.

生信星球 day 2 —— 橙子🍊

n3 … #显示前3行|3可替换tail -n3 … #显示后3行cp file1 file2 #复制file1，命名file2mv #移动或重命名图片生信星球学习小组

生信星球 DAY 1 —— 橙子🍊

搜狗微信、搜狗知乎、github*STEP 2：高效学习1. 高效软件chrome浏览器|沙拉查词*、scholarscopesnipaste2. clinical,KLRB1_tr,by='CGGA_ID')View(CGGA_325_KLRB1)write.csv(CGGA_325_KLRB1,file = 'CGGA_325_KLRB1.csv')生信星球学习小组第

Day4-i 生信星球学习 R语言基础

Day4-i 生信星球学习 R语言基础下载R和Rstudio##注意：电脑用户名必须是英文作图plot(rnorm(50))plot主要用于绘制散点图和折线图boxplot(iris$Sepal.Length Appearance--Editor Font size用Rproject管理工作目录（1）设置一个工作目录设置工作目录：setwd()查看工作目录：getwd()（2）新建project点击箭头处：新建图片来源：生信星球公众号新建

生信星球--生信学习DAY2：适应Linux

权限控制多用户的权限控制命令行模式linux的操作靠命令行来实现目录结构文件系统呈树状，宿主目录放在home目录下2.为什么学生信要用linux？ 生物软件基于linux，系统开源、免费，不需要图形界面，有效节约资源.3.怎样召唤linux--阿里云服务器1 单纯linux2 Windows10上的linux3 Windows7 上的linux4 4.怎样登录服务器--xshell和terminal恰好手头有台macbookmacbook，terminal启动！5.linux有哪些最基本的操作？

生信星球学习小组Day4-R语言基础 Jerry

今天是学习小组学习的第4天，主要是学习了解R语言 1. R和Rstudio的安装 用户名需要是英文 下载R和Rstudio 2. 图片 图文来自微信公众号生信星球 3. 设置字体 Tools -> Global Options -> Apperance自行设置 4. R语言基本操作 a. 删除变量 a<-3 b <- 1 c <- 4 u <- 5+6 rm(b) rm(u,c) rm(list = ls())#清空所有变量，需要是英文括号 f.