- 综合排序
- 最热优先
- 最新优先
生信星球——生信入门DAY4:R语言
rnorm(n,mean,sd)函数用于从具有特定均值和标准差的正态分布生成n个随机值。
39910编辑于 2024-01-21- 来自专栏用户10800790的专栏
生信星球 Day 4 —— 橙子🍊
源自生信星球，由于有R基础，内容1、2、3跳过了基础代码1、显示文件列表（右下角窗口file直接有显示，在R中其实不那么重要）dir()list.files()图片2、显示历史命令（右上角history
32630编辑于 2023-10-24 第4天生信学习笔记-微信公众号生信星球
今天的学习内容： 1.安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面） 2.粗略了解R语言是什么，干什么的，认识Rstudio的工作界面 3.学会外观设置和基本操作 4.完成第一个R做的图 如果已经安装或者基础较好 3.加减乘除 1+2 回车 4.赋值 赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号 x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x， 赋值后，x会显示在右上角的框，Environment 5.删除变量 a<-3 b <- 1 c <- 4 u <- 5+6 rm(b) rm(u,c) rm(list = ls())#清空所有变量 代码可以复制，更推荐的方式是用键盘上q前面的那个tab
57310编辑于 2024-02-25生信入门Day3-4
引自生信技能树引自生信技能树DAY3三、数据结构——数据框1、数据框的来源（1）用代码新建（2）由已有数据转换或处理得到（3）读取表格文件（4）R语言内置数据注意：向量是一维的，且只存储一种数据类型；matrix DAY4练习题2-4# 练习2-4# 说明：运行load("gands.Rdata"),即可得到和使用我准备的向量g和s，# 如有报错，说明你的代码写错或project没有正确打开load("gands.Rdata (-2)]四、函数与R包1、函数与参数引自生信技能树#↑如果此处↑↑↑↑出现黄色提示条，你就阅读理解一下，然后随便选择↑jimmy <- function(a,b,m = 2){ (a+b)^m}jimmy #<-之间要有空格或打个括号，不然会被当成赋值符号2、R包介绍3、R包镜像引自生信技能书使用镜像，加快R包的下载，不用从大洋彼岸去下载4、R包的安装与来源（1）CRAN网站（2）Bioconductor sdlibrary(limma)browseVignettes("limma") #不是每个包都有ls("package:limma")5、R包的安装和使用逻辑引自生信技能书引自生信技能树练习题4-1#
49210编辑于 2025-05-15- 来自专栏笔记生信
生信提升day4-婷
以iris内置数据集画箱线图，以length为纵坐标，species为横坐标2：字体设置学到新的知识跳转以后可自行修改，蛙去~牛啊生信星球公众号
22940编辑于 2023-11-16 - 来自专栏生信星球每日学习
生信星球学习day4-毽子
生信星球调整字体大小图片1.新建project按红色框框图片设置工作目录：setwd()查看工作目录：getwd()2.显示文件列表dir()或 list.files()图片显示运算加减 1+2 回车乘方 abs（-3)赋值赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x， 赋值后，x会显示在右上角的框，Environment里的Value列表里生信星球删除变量 b <- 1c <- 4u <- 5+6rm(b)rm(u,c) rm(list = ls())#清空所有变量代码可以复制，更推荐的方式是用键盘上q前面的那个tab键补齐。
54900编辑于 2023-01-13 - 来自专栏2023生信技能树学习记录
生信技能树笔记day4
---title: "生信技能树学习笔记"引用自生信技能树author: "天空"date: "2023-01-02"output: html_document---一、函数和R包1. 当一个代码需要复制粘贴三次，就应该写成函数或使用循环jimmy <- function(i){ plot(iris[,i],col=iris[,5])}jimmy(1)jimmy(2)jimmy(3)jimmy(4) mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/ # 中科大镜像# http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/# http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/4.
44820编辑于 2023-01-16 - 来自专栏生信马拉松
生信马拉松 Day4
就应该写成函数或使用循环#plot画iris的前四列jimmy <- function(i){ plot(iris[,i],col=iris[,5])}jimmy(1)jimmy(2)jimmy(3)jimmy(4) 不用管情况2：package not available原因1：包名写错原因2：安装命令使用错误，用cran安装非cran的包原因3：本机的R语言版本与包所要求的版本不符（极少），可以选择历史版本的R包原因4： 学R语言高冷，能no就no，no不行再yes；学linux要听话，让你yes你就yes情况4：加载A包，报错B包不存在先安装B包再说，一般来讲问是否更新时，“不存在”的是依赖包此时可能是依赖包未安装或依赖包版本不够新注意 +函数（2）网页找R包介绍页面（包括可引用的文献）（3）Vignettes R包作者的在线教程，阅读时需要package安装并加载好? 影响转化为逻辑值，if(FALSE)则后面的代码被跳过，if(TRUE)则后面的代码被执行3.ls()函数ls('package:stringr') #列出包里有哪些函数生信技能树，生信马拉松
37300编辑于 2024-01-12 - 来自专栏Jely’s生信笔记
Jelys Note之生信入门class4
class 4#本文引用自生信技能树一、课前导言【R语言的版本99%的情况下没有问题，最后才应考虑是他的问题】【R语言报错让你选择时，先选否定的答案，如果还不行，就该yes就yes；而linux报错时有选择则应该优先选 x = c(2,5,6,2,9);plot(x)：横坐标是坐标、纵坐标是xx = seq(2,80,4);plot(x)：数据大了，看起来会有趋势x = rnorm(10);plot(x)：随机数x = jimmy(1/2/3/4/5)相应的画出五张点状图4.R包【找到R包的使用规则】（1）是什么？ 下载的方法· 方法1【代码在脚本里】· 方法2【每次使用都要运行，一次性的】options("repos"=c(CRAN=""))options(BioC_mirror="xxxx")（4）R包的安装和使用的逻辑函数存在于
42820编辑于 2023-05-17 - 来自专栏生信学习小组
生信学习day4-R语言基础
二、下载R和Rstudio生信星球 【R软件和R包安装】B站公开课认识R和R studio(1)R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。 2.显示文件列表dir ()list.files()3.加减乘除 + - * /4.赋值赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x，
40710编辑于 2024-01-19 - 来自专栏生信宝典
生信分析Python实战练习 4 | 视频22
开源生信 Python教程 生信专用简明 Python 文字和视频教程 源码在：https://github.com/Tong-Chen/Bioinfo_course_python 一些练习题 给定 aDict[key] = [] aDict[key].append(value) 用到的知识点 提取给定名字的序列 (2分) 用到的知识点 print >>fh, or fh.write() 取模运算，4 (4分) 逻辑与操作符 and 文件中读取的内容都为字符串，需要用int转换为整数，float转换为浮点数 用到的知识点 写程序 transferMultipleColumToMatrix.py 将文件 x4 TCCTACGAGTTGCATGGATTC 简化的短序列匹配程序 (map.py) 把short.fa中的序列比对到ref.fa, 输出短序列匹配到ref.fa文件中哪些序列的哪些位置。 第4列为短序列自身的序列.)。 附加要求：可以只匹配到给定的模板链，也可以考虑匹配到模板链的互补链。这时第5列可以为短序列的名字，第六列为链的信息，匹配到模板链为’+’，匹配到互补链为’-‘。
22950编辑于 2023-09-12 - 来自专栏生信入门笔记
Day4 生信入门——R语言基础
显示文件列表 dir 3.加减乘除 1+2 回车 4.赋值 赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号 x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x， 赋值后，x会显示在右上角的框 5.删除变量 a<-3 b <- 1 c <- 4 u <- 5+6 rm(b) rm(u,c) rm(list = ls())#清空所有变量 TIP: 7.列出历史命令 history()直接点右上角的
476100编辑于 2023-10-05 - 来自专栏生信星球--生信入门
生信星球学习小组笔记 Day 4——LIU
生信星球学习小组笔记 2023年11月30日*之前已对R语言和Rstudio的基本操作有了初步的入门了解，但每次对R语言学习都能够获得“新知”。电脑用户名要设置为英文名，否则会带来潜在的麻烦。 = （之前有看过相关说法，<-是R语言特有，部分老师推荐使用更简洁的=）高级绘图：ggplot2学习 参考豆豆和花花老师公众号文章https://mp.weixin.qq.com/s/jOIJLpCN4qTznPH0b-qJdw
27010编辑于 2023-11-30 - 来自专栏生信入门
生信星球Day4 学习R包
认识dplyr，函数、功能等---安装和加载R包镜像设置方法一：手动设置，Tools→Packages→Primary CRAN repository方法二：自动运行教程来自：https://www.jianshu.com iris[c(1:2,51:52,101:102),]t1 <- mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)t2 <- select(test,c(2,4) )t3 <- filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 )t4 <- arrange(test, desc(Sepal.Length))t5 <
64140编辑于 2023-07-21 - 来自专栏嗨嗨嗨
生信星球学习小组Day4-土
R和Rstudio的下载安装 生信星球：【R软件和R包安装】 https://www.bilibili.com/video/BV1J44y1R7ci/? share_source=copy_web&vd_source=ba670d5a7ca081b044384f15866b88ef R语言学习：生信技能树https://m.bilibili.com/video /av25643438.htm 新建工作目录 生信星球：https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA 显示文件列表 相当于linux的ls dir（
21330编辑于 2023-06-30 - 来自专栏生信学习ing
生信星球学习小组Day4-云朵
. → Appearance→Editor Font size →Apply4.
66140编辑于 2023-11-03 生信技能树-R语言-day4
不如用函数效率高可以用函数代替复制粘贴jimmy <- function(i){ plot(iris[,i],col=iris[,5]) } jimmy(1) jimmy(2) jimmy(3) jimmy(4)
20810编辑于 2024-04-19- 来自专栏生信技能树
2022年4月_生信入门班_微信群答疑笔记
下面是2022年4月_生信入门班_微信群答疑笔记 上一期答疑笔记是：2022年3月_生信入门班_微信群答疑笔记 请问老师有没有相关的书籍推荐呢，跟课程相关的书籍。 还有一句dev.off你没运行 小洁老师，我看生信技能树公众号您写的一篇文章，讲的是怎么处理GPR格式的原始数据（链接：https://mp.weixin.qq.com/s/AnXKIQrMGnnG5Td62v961w 老师，我在R4的环境中安装R包之后library，发现有个error，该怎么处理呢 缺啥补啥就好，如果用conda安装的话，conda install r-rvcheck；可以通过搜索关键字找到安装的命令和在 包可以--help成功，但是当我切换环境回来之后发现还是报错了，包括安装install libstdcxx-ng=9.1.0也没用 看看error.pdf 有类似的报错，你还缺了一步 我网页安装的R4环境 你要先把 R4.yaml 文件保存到当前文件夹下 老师为啥我的geneid还有小数点 因为gtf文件中的geneid有小数点 老师，请问featurecounts的比对率低于多少属于结果不太好呢？
1.8K10编辑于 2022-07-26 生信技能树 Day4 R语言入门
plot(iris[,1],col = iris[,5])plot(iris[,2],col = iris[,5])plot(iris[,3],col = iris[,5])plot(iris[,4], 当一个代码需要复制粘贴三次，就应该写成函数或使用循环jimmy <- function(i){ plot(iris[,i],col=iris[,5])}jimmy(1)jimmy(2)jimmy(3)jimmy(4)
29900编辑于 2024-04-12生信星球--生信入门DAY1
R 语言与 C 语言都是贝尔实验室的研究成果，但两者有不同的侧重领域，R 语言是一种解释型的面向数学理论研究工作者的语言，而 C 语言是为计算机软件工程师设计的。
36410编辑于 2024-01-17
腾讯云开发者
Copyright © 2013 - 2026 Tencent Cloud. All Rights Reserved. 腾讯云 版权所有
深圳市腾讯计算机系统有限公司 ICP备案/许可证号：粤B2-20090059 
粤公网安备44030502008569号
腾讯云计算（北京）有限责任公司 京ICP证150476号 | 京ICP备11018762号