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生信学习
生信学习第6天之函数学习和操作1.R包是多个函数的集合，使用之前要加载合适的镜像，提高下载的速度。 )筛选行4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序5.summarise()：汇总6.管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)7.count统计某列的unique值8.
30510编辑于 2024-03-10生信学习笔记
生信学习第四天之R语言生信学习第四天之R语言1Ｒ语言学习和了解1.1 之前就安装过R和Ｒstudio，浅学习过《r语言实战》，及基本的语言。后续可以再计划学习R for Data Science。 系统学习作图。 2.R语言作图2.1 利用R语言中自带的数据集进行作图学习plot(rnorm(50))#plot 绘制图形的函数；rnorm(50)随机产生正态分布的50个数boxplot(iris$Sepal.Length 3.R语言学学习思维导图图片
26410编辑于 2024-03-08- 来自专栏作图丫
8+非肿瘤生信分析！快来学习吧~
图 4 其中，MDK、LGALS1、CD74、PYCARD、BMP7、IL2、IGF1、IL13、KITLG、ANGPT4、OSM、IL3、EDIL3、TNFSF8在BPs、CCs和MFs至少两个方面富集 RRMS 患者的 Del-1 和 resolvinD1 水平升高，RRMS 患者的 IL17A 水平降低（图 8A-C）。 三种细胞外分子与临床指标的相关性分析显示，RRMS患者脑脊液中resolvinD1水平与Del-1呈正相关，而resolvinD1水平与蛋白质和IgA呈负相关（图8D-F）。 图 8 06 Del-1诊断疗效和生存分析 为了研究Del-1对RRMS诊断和预后的预测作用，本研究进行了ROC曲线和生存分析。 总之，本研究使用了公共数据库的数据，分析方法不难，值得大家学习！
1.1K30编辑于 2022-12-14 - 来自专栏嗨嗨嗨
生信学习小组
安装和加载R包1.镜像设置生信星球公众号：你还在每次配置Rstudio的下载镜像吗？
61520编辑于 2023-07-02 生信学习笔记
生信学习第三天1 生信软件的安装图片2 具体安装步骤2.1 百度搜索清华镜像下的安装链接=》进入：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda 复制代码后回车，注意理解代码意思conda list#开始使用condaconda install fastqc -yfastqc --help#确认是否安装成功3 实践操作图片4后续计划4.1 选修内容学习 4.2 linux系统详细视频学习
31610编辑于 2024-03-07生信学习笔记
生信学习之第五天R语言实操1.R语言基本数据类型重点掌握向量和数据框，明确元素、向量、标量的定义元素：数字或者字符串（chr）标量：一个元素组成的变量向量：多个元素组成的变量图片2.提取元素2.1向量x
28710编辑于 2024-03-09生信学习笔记
生信学习第二天1.登录服务器，下载安装好xshell7、xftp7等软件，根据账号密码和ip地址等信息正确远程登录服务器2.学习了解什么是linux系统及它的用处2.1 Linux系统下所有皆由“文件夹组成 用户分为管理员和一般用户，一般用户能到的最高级目录为宿主目录，放在home目录下3.学习了解Linux系统中最常见的几个基础命令图片4.实践操作图片
25110编辑于 2024-03-06生信学习笔记
DAY1--生信学习前准备1学习方式，使用电脑进行学习，与小伙伴交流讨论，共同进步2解决问题，利用搜索引擎学会搜索，推荐虫快搜部落，去解决学习过程中的问题3提高效率的软件，浏览器推荐如chrome，电脑文件搜索 ，Windows用everything，Mac自带搜索；快捷截图软件snipaste或者电脑版微信；思维导图记录，推荐xmind，便于后期整理回顾学习4学习Markdown语法做笔记4.1展示代码a=14.2
34010编辑于 2024-03-05- 来自专栏生信技能树
生信编程8.ID转换
最近他们跟我反馈面试找不到或者说很难直接考核筛选到认真干活的生信工程师，挺有意思的。让我想起来了早在生信技能树论坛创立之初我为了引流，而规划的200个生信工程师面试题。 值得继续分享： 200个生信工程师面试考题 为什么要进行ID转化？ 简单来说，ID转换就是找到对应的关系表，然后用bash或者字典对应一下即可。
2.3K10发布于 2021-03-24 第一天生信学习-生信星球学习小组
一、学习小组正确打开方式 1.如何开启高效学习 每日学习完成后，与小伙伴一起学习讨论，并在腾讯云记录学习笔记。 2.如何解决学习中遇到的问题 （1）搜索引擎 首选-谷歌，其次-必应，另外推荐一个大神级的搜索引擎：虫部落快搜。 （2）专业教程（推荐） 搜狗微信、搜狗知乎、github 直接去搜网站名字，就能搜到 （3）正确的提问 礼貌提问，描述问题需要用截图（快捷截图软件用微信截图或snipaste） 学习小组课程范围内的问题课在微信群里问 ，学习小组范围外的问题邮件提问。 (4)电脑版微信功能使用 截图功能，文件传输助手。 2.学习流程 （1）思维导图 幕布：兼具大纲与思维导图两种模式。 xmind：仅有思维导图一种模式，简单易上手。
38010编辑于 2024-02-20生信星球--生信学习DAY2：适应Linux
权限控制多用户的权限控制命令行模式linux的操作靠命令行来实现目录结构文件系统呈树状，宿主目录放在home目录下2.为什么学生信要用linux？
57700编辑于 2024-01-19生信星球——生信入门DAY6:学习R包
（library() : library(package)将加载名为package的命名空间，并添加到包的搜索列表中。加载前对搜索列表进行检查并更新，如果package不存在则报错，如果之前已加载package，则不会重复加载。如没有参数package即library()，则列出lib.loc指定的库中的所有可用包。library(help=package)将返回package的基本信息。
74110编辑于 2024-01-23- 来自专栏生信学习小组
生信学习day3
anaconda是总管，职务比conda低，但干的活不少，也是个有内涵的家伙miniconda是区域经理，说白了就是干事的，而且比较专一，主要负责生信领域二、如何下载软件1.创建biosoft（mkdir 从某链接下载软件：wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh生信星球 然后出现这个界面：3.下载完成后，运行 ：bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh,然后开始安装过程4.激活：source ~/.bashrc（注意空格）生信星球：激活不成功就将 add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/conda config --set show_channel_urls yes生信星球三
44310编辑于 2024-01-18 第5天生信学习笔记-微信公众号生信星球
（8）数据类型（重点只有两个）向量（vector）重要数据框（Data frame）重要part1：向量1.标量和向量的区分首先明确“元素”的意思，元素指的是数字或者字符串（用chr表示）等，根据它可以区分两个词 提取某两列作散点图：plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)学习一下脚本的使用和保存：将上面的代码复制到一个新的R脚本中。
67410编辑于 2024-02-24第6天生信学习笔记-微信公众号生信星球
R包是多个函数的集合，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。
51310编辑于 2024-02-25第4天生信学习笔记-微信公众号生信星球
今天的学习内容： 1.安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面） 2.粗略了解R语言是什么，干什么的，认识Rstudio的工作界面 3.学会外观设置和基本操作 4.完成第一个R做的图 如果已经安装或者基础较好 ，可以看下R for Data Science的第一章，系统学习作图。 share_source=copy_web&vd_source=ba670d5a7ca081b044384f15866b88ef 注意：只看R和Rstudio的下载部分，剩下的非学习范围（不需要装R包） 8.清空控制台 快捷键ctrl+l
67110编辑于 2024-02-25- 来自专栏生信学习小组
生信学习day2
图片——来源：生信星球2.为什么学生信要用linux？（1）生物软件基于linux，系统开源、免费，不需要图形界面，有效节约资源。（2）命令行模式可以批量、高效地处理文件，满足数据分析的要求。 同时安装Xftp如何登录生信星球https://www.jianshu.com/p/8a340b103a411.ip地址。ip是代表服务器的一个“编号”。2.用户名。bio开头的那个3.密码。
41010编辑于 2024-01-17 - 来自专栏小张的学习笔记
生信技能树学习笔记1
可以有重复值）数据框（约等于表格，一列只能有一种数据类型）矩阵列表4.1 向量的生成c(2,3,15,5,7)## [1] 2 3 15 5 7c(1:9)## [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 paste0(rep("student",times=7),seq(from=2,to=15,by=2))## [1] "student2" "student4" "student6" "student8"
79520编辑于 2023-05-10 - 来自专栏生信学习笔记之按时毕业
生信学习-Day1-zhh
如何学习1.学会搜索搜索引擎：谷歌必应虫部落快搜专业教程搜狗微信搜狗知乎github2.与队友讨论加正确的提问markdown练习引用列表有序列表把大象放进冰箱：1.打开冰箱2.放入大象3.关上冰箱无序列表发疯发疯哈哈哈代码块
30220编辑于 2023-11-01 Day1-生信学习装备
高效学习一、效率软件1.浏览器（chrome）：可以添加插件，如沙拉查词、Scholarscope等。2.文件搜索（everything）：之前就知道了这个宝藏软件，但是自己不经常用。 3.截图（snipaste、微信）4.微信"文件传输助手"二、学习流程1.思维导图（幕布、xmind）：帮助梳理思路2.电子笔记（腾讯云社区）：支持markdown语法，方便快捷3.补充几个重要的markdown
28300编辑于 2024-03-05
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