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生信学习小组DAY5
（4）显示工作路径 getwd() （5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。 （6）表格在R语言中改名叫数据框 （7）函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：? 图片 赋值 图片 从向量中提取元素 元素位置 x4 #x第4个元素 x-4#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素 x2:4#第2到4个元素 x-(2:4)#除了第2-4个元素 xc(1,5) #第1个和第 5个元素 图片 根据值 xx==10#等于10的元素 xx<0 xx %in% c(1,2,5)#存在于向量c（1，2，5）中的元素 图片 数据框 X=read.table("\Rstudiotestdoudou.txt
38420编辑于 2023-07-01 第5天生信学习笔记-微信公众号生信星球
（4）显示工作路径 getwd()（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。（6）表格在R语言中称为数据框^_^（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。 这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改x[4] #x第4个元素x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素x[2:4]#第2到4个元素x[-(2:4)]#除了第2-4个元素x[c(1,5) ] #第1个和第5个元素（2）根据值x[x==10]#等于10的元素x[x<0]x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素Part2：数据框将示例数据放在你的工作目录下（！ "bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量save(a,file="test.RData")#保存其中一个变量load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令（5） 提取某两列作散点图：plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)学习一下脚本的使用和保存：将上面的代码复制到一个新的R脚本中。
48310编辑于 2024-02-24- 来自专栏学新栏
生信学习小组day5--大姚
（4）显示工作路径 getwd() （5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。 （6）表格在R语言中改名叫数据框^_^ （7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。 test.RData中，会出现问题中的报错情况是因为还没有定义X这个变量又或者说没有这个变量存在，解决方法可以将需要保存的数据赋值到X这个变量或者将X改为已经定义的变量 以上代码以及新手小本本均来自生信星球
97420编辑于 2023-02-10 生信学习
生信学习第6天之函数学习和操作1.R包是多个函数的集合，使用之前要加载合适的镜像，提高下载的速度。 library(dplyr)#调用的时候无双引号2.常用的几个函数1.mutate(),新增列2.select(),按列筛选3.filter()筛选行4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序5.
24810编辑于 2024-03-10- 来自专栏生信学习小组
生信学习-Day5-数据结构
（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。（6）表格在R语言中称为数据框。（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。 5.提取元素a[x,y]#第x行第y列a[x,]#第x行a[,y]#第y列a[y] #也是第y列a[a:b]#第a列到第b列或者 a[,a:b]a[a:b,]#第a行到第b行a[c(a,b)]#第a列和第
56210编辑于 2024-01-20 - 来自专栏LuKa07777
Day5生信星球小组学习-LuKa
Day5数据结构生信星球小组学习-LuKa如果你在执行 save(X, file = "test.RData") 时出现 "object X not found" 的错误，这通常表示在保存之前，R 无法找到名为
33400编辑于 2023-10-06 - 来自专栏生信学习ing
生信星球学习小组Day5-云朵
（1）R的赋值符号是**<-**> （2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行 > （3）R的代码都是**带括号**的，括号必须是英文> （4）显示工作路径 getwd()> （5） 这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改x[4] #x第4个元素x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素x[2:4]#第2到4个元素x[-(2:4)]#除了第2-4个元素x[c(1,5) ] #第1个和第5个元素（2）根据值x[x==10]#等于10的元素, *两个等号*x[x<0]x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素# 3.
34240编辑于 2023-11-04 - 来自专栏生信星球--生信入门
生信星球学习小组笔记 Day 5——LIU
生信星球学习小组笔记 2023年12月1日今天对R语言数据结构进行学习，★划重点：向量和数据框一、向量新知初印象：变量、一串数字、一串字符、不止一个、数据分析的直接对象。 （不一定是正确的，仅本人粗显的理解）新知：标量：一个元素组成的变量；向量：多个元素组成的变量非常形象的一张图↓：说到变量，联想到中学时代所学习的函数中的X，同样，R语言中也是对某个“符合”赋值。 x <- rnorm(5) #利用正态分布函数生成5个符合正态分布的数字> x[1] 0.4565827 0.0398871 0.9193298 1.0669231 -1.2529013TIPS 二、从一串向量取出需要的值通过上面的结果，我们得到了有5个数值的向量。 #第4至5个x[c(1,2,5)] #第1，2，5个获得结果> x[1][1] 0.4565827> x[-1][1] 0.0398871 0.9193298 1.0669231 -1.2529013
29500编辑于 2023-12-01 生信学习笔记
生信学习第四天之R语言生信学习第四天之R语言1Ｒ语言学习和了解1.1 之前就安装过R和Ｒstudio，浅学习过《r语言实战》，及基本的语言。后续可以再计划学习R for Data Science。 系统学习作图。 2.R语言作图2.1 利用R语言中自带的数据集进行作图学习plot(rnorm(50))#plot 绘制图形的函数；rnorm(50)随机产生正态分布的50个数boxplot(iris$Sepal.Length 3.R语言学学习思维导图图片
20910编辑于 2024-03-08- 来自专栏嗨嗨嗨
生信学习小组
安装和加载R包1.镜像设置生信星球公众号：你还在每次配置Rstudio的下载镜像吗？ mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)图片2.select(),按列筛选(1)按列号筛选select(test,1)select(test,c(1,5) vars))图片3.filter()筛选行filter(test, Species == "setosa")filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 ),按某1列或某几列对整个表格进行排序arrange(test, Sepal.Length)#默认从小到大排序arrange(test, desc(Sepal.Length))#用desc从大到小图片5.
51020编辑于 2023-07-02 生信学习笔记
生信学习第二天1.登录服务器，下载安装好xshell7、xftp7等软件，根据账号密码和ip地址等信息正确远程登录服务器2.学习了解什么是linux系统及它的用处2.1 Linux系统下所有皆由“文件夹组成 用户分为管理员和一般用户，一般用户能到的最高级目录为宿主目录，放在home目录下3.学习了解Linux系统中最常见的几个基础命令图片4.实践操作图片
20410编辑于 2024-03-06生信学习笔记
生信学习之第五天R语言实操1.R语言基本数据类型重点掌握向量和数据框，明确元素、向量、标量的定义元素：数字或者字符串（chr）标量：一个元素组成的变量向量：多个元素组成的变量图片2.提取元素2.1向量x [4]x[-4]x[2:4]x[-(2:4)]x[c(1,5)]数据框重点：一定要将示例数据保存在工作目录下！！！
21810编辑于 2024-03-09生信学习笔记
生信学习第三天1 生信软件的安装图片2 具体安装步骤2.1 百度搜索清华镜像下的安装链接=》进入：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda 复制代码后回车，注意理解代码意思conda list#开始使用condaconda install fastqc -yfastqc --help#确认是否安装成功3 实践操作图片4后续计划4.1 选修内容学习 4.2 linux系统详细视频学习
25710编辑于 2024-03-07生信学习笔记
DAY1--生信学习前准备1学习方式，使用电脑进行学习，与小伙伴交流讨论，共同进步2解决问题，利用搜索引擎学会搜索，推荐虫快搜部落，去解决学习过程中的问题3提高效率的软件，浏览器推荐如chrome，电脑文件搜索 ，Windows用everything，Mac自带搜索；快捷截图软件snipaste或者电脑版微信；思维导图记录，推荐xmind，便于后期整理回顾学习4学习Markdown语法做笔记4.1展示代码a=14.2
28010编辑于 2024-03-05生信星球——生信入门DAY5:数据结构
)表示1-10之间每0.5取一个数从向量中提取元素x[4] #x第4个元素x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素x[2:4]#第2到4个元素x[-(2:4)]#除了第2-4个元素x[c(1,5) ] #第1个和第5个元素x[x==10]#等于10的元素x[x<0]x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素数据框read.table(file="",sep="",header
23500编辑于 2024-01-21- 来自专栏用户10800790的专栏
生信星球 day 5 ——橙子🍊
生信星球数据结构 向量vector 标量：1个元素 向量：多个元素 从向量中提取元素 x[4] x[x==10] 位置、逻辑值 数据框 a <- read.table(file='huahua.txt'
19250编辑于 2023-10-25 - 来自专栏生信学习小组（L）
生信学习小组Day5 -数据结构（L）
1.向量1.标量和向量的区分标量：一个元素组成的变量向量：多个元素组成的变量2.从向量中提取元素根据元素位置X[5]根据值X[x==10]2.数据框1.读取本地数据x<-read.table(file lyx.txt",sep = ",",quote=F)4.变量的保存与重新加载save.image(file="aa.RData")#保存变量load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令5.
32900编辑于 2023-01-13 - 来自专栏生信技能树
生信技巧第5课-生信人必须安装的软件
长期更新列表： 视频讲解-R爬取生信软件列表到思维导图 生信技巧第二课-使用markdown记录和分享笔记 生信技巧第3课-请你务必学好R语言 broad官网出品的 必须神器 IGV 资料大全，含视频 不知不觉就第5讲了，本次视频没有干货，只是为了保证入门系列视频的完整性而录制的，没啥事就不用看了，反正你需要安装一些软件就可以了。 生信软件安装及使用 (官网，例子，conda) 多版本软件发布：NCBI的 blast以及sratoolkit 等等 二进制软件(预编译版本)：下载即可使用 C源码软件：官网，readme，安装，解决配置文件及报错 系统软件中心：ubuntu的用apt-get，centos的用yum，macOS的App Store或者brew 成熟的软件管理中心：conda 保证一个纯粹的新手，生物学的本科生，经过3个小时的折腾
2K30发布于 2018-07-27 第一天生信学习-生信星球学习小组
一、学习小组正确打开方式 1.如何开启高效学习 每日学习完成后，与小伙伴一起学习讨论，并在腾讯云记录学习笔记。 2.如何解决学习中遇到的问题 （1）搜索引擎 首选-谷歌，其次-必应，另外推荐一个大神级的搜索引擎：虫部落快搜。 （2）专业教程（推荐） 搜狗微信、搜狗知乎、github 直接去搜网站名字，就能搜到 （3）正确的提问 礼貌提问，描述问题需要用截图（快捷截图软件用微信截图或snipaste） 学习小组课程范围内的问题课在微信群里问 ，学习小组范围外的问题邮件提问。 (4)电脑版微信功能使用 截图功能，文件传输助手。 2.学习流程 （1）思维导图 幕布：兼具大纲与思维导图两种模式。 xmind：仅有思维导图一种模式，简单易上手。
31310编辑于 2024-02-20Day5-i 生信星球学习-数据结构
Day5-i 生信星球学习-数据结构新手笔记：（1）R的规范赋值符号是<-，也可以用=代替（2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行 （3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文。 （4）显示工作路径:getwd()（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。（6）表格在R语言中称为数据框（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。 从向量中提取元素根据元素位置#这里的x是签名赋值的变量名，根据需要进行修改x[4] #x第4个元素x[-4]#除了第4个元素之外剩余的元素x[2:4]#第2到4个元素x[-(2:4)]#除了第2-4个元素x[c(1,5) ] #第1个和第5个元素根据值x[x==10]#等于10的元素x[x<0]x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素数据框读取本地数据read.table(file = "
38710编辑于 2024-02-23
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