第4天生信学习笔记-微信公众号生信星球

今天的学习内容： 1.安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面） 2.粗略了解R语言是什么，干什么的，认识Rstudio的工作界面 3.学会外观设置和基本操作 4.完成第一个R做的图 如果已经安装或者基础较好 ，可以看下R for Data Science的第一章，系统学习作图。 share_source=copy_web&vd_source=ba670d5a7ca081b044384f15866b88ef 注意：只看R和Rstudio的下载部分，剩下的非学习范围（不需要装R包） 3.加减乘除 1+2 回车 4.赋值 赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号 x<- 1+2  意思是把1+2的运算结果赋值给x，  赋值后，x会显示在右上角的框，Environment 5.删除变量 a<-3 b <- 1 c <- 4 u <- 5+6 rm(b) rm(u,c)   rm(list = ls())#清空所有变量 代码可以复制，更推荐的方式是用键盘上q前面的那个tab

生信星球学习day4-毽子

生信星球调整字体大小图片1.新建project按红色框框图片设置工作目录：setwd()查看工作目录：getwd()2.显示文件列表dir()或 list.files()图片显示运算加减 1+2 回车乘方 abs（-3)赋值赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号x<- 1+2  意思是把1+2的运算结果赋值给x，  赋值后，x会显示在右上角的框，Environment里的Value列表里生信星球删除变量 b <- 1c <- 4u <- 5+6rm(b)rm(u,c)  rm(list = ls())#清空所有变量代码可以复制，更推荐的方式是用键盘上q前面的那个tab键补齐。

生信学习

生信学习第6天之函数学习和操作1.R包是多个函数的集合，使用之前要加载合适的镜像，提高下载的速度。 install.packages("dplyr")#安装的命令有双引号library(dplyr)#调用的时候无双引号2.常用的几个函数1.mutate(),新增列2.select(),按列筛选3.filter()筛选行4.

生信学习day4-R语言基础

二、下载R和Rstudio生信星球 【R软件和R包安装】B站公开课认识R和R studio(1)R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。 2.显示文件列表dir ()list.files()3.加减乘除 + - * /4.赋值赋值符号用<-，这是小于号加上减号，也可以按Alt加上减号x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x，

生信星球学习小组Day4-土

R和Rstudio的下载安装 生信星球：【R软件和R包安装】 https://www.bilibili.com/video/BV1J44y1R7ci/? share_source=copy_web&vd_source=ba670d5a7ca081b044384f15866b88ef R语言学习：生信技能树https://m.bilibili.com/video /av25643438.htm 新建工作目录 生信星球：https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA 显示文件列表 相当于linux的ls dir（

生信星球学习小组Day4-云朵

. → Appearance→Editor Font size →Apply4.

生信星球学习小组笔记 Day 4——LIU

生信星球学习小组笔记 2023年11月30日*之前已对R语言和Rstudio的基本操作有了初步的入门了解，但每次对R语言学习都能够获得“新知”。电脑用户名要设置为英文名，否则会带来潜在的麻烦。 ightblue、lightyellow、lightpink）R语言能直接运算：1+1 2*3赋值：<- or = （之前有看过相关说法，<-是R语言特有，部分老师推荐使用更简洁的=）高级绘图：ggplot2学习 参考豆豆和花花老师公众号文章https://mp.weixin.qq.com/s/jOIJLpCN4qTznPH0b-qJdw

生信星球Day4 学习R包

今日学习内容：如何安装R包？ iris[c(1:2,51:52,101:102),]t1 <- mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)t2 <- select(test,c(2,4) )t3 <- filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 )t4 <- arrange(test, desc(Sepal.Length))t5 <

生信星球——生信入门DAY4:R语言

Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))这个确实也是最简单的函数了……但是还是搜了一圈才搞清楚它的意思：boxplot即箱线图，iris是机器学习中很经典的数据集

生信学习笔记

生信学习第四天之R语言生信学习第四天之R语言1Ｒ语言学习和了解1.1 之前就安装过R和Ｒstudio，浅学习过《r语言实战》，及基本的语言。后续可以再计划学习R for Data Science。 系统学习作图。 2.R语言作图2.1 利用R语言中自带的数据集进行作图学习plot(rnorm(50))#plot 绘制图形的函数；rnorm(50)随机产生正态分布的50个数boxplot(iris$Sepal.Length 3.R语言学学习思维导图图片

生信学习小组

安装和加载R包1.镜像设置生信星球公众号：你还在每次配置Rstudio的下载镜像吗？ (test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 )filter(test, Species %in% c("setosa","versicolor"))图片图片4. 从大到小图片5.summarise()：汇总summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))# 计算Sepal.Length的平均值和标准差图片92df4aeb915

生信学习笔记

生信学习第三天1 生信软件的安装图片2 具体安装步骤2.1 百度搜索清华镜像下的安装链接=》进入：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda show_channel_urls yes#复制代码后回车，注意理解代码意思conda list#开始使用condaconda install fastqc -yfastqc --help#确认是否安装成功3 实践操作图片4后续计划 4.1 选修内容学习4.2 linux系统详细视频学习

生信学习笔记

生信学习之第五天R语言实操1.R语言基本数据类型重点掌握向量和数据框，明确元素、向量、标量的定义元素：数字或者字符串（chr）标量：一个元素组成的变量向量：多个元素组成的变量图片2.提取元素2.1向量x [4]x[-4]x[2:4]x[-(2:4)]x[c(1,5)]数据框重点：一定要将示例数据保存在工作目录下！！！

生信学习笔记

生信学习第二天1.登录服务器，下载安装好xshell7、xftp7等软件，根据账号密码和ip地址等信息正确远程登录服务器2.学习了解什么是linux系统及它的用处2.1 Linux系统下所有皆由“文件夹组成 用户分为管理员和一般用户，一般用户能到的最高级目录为宿主目录，放在home目录下3.学习了解Linux系统中最常见的几个基础命令图片4.实践操作图片

生信学习笔记

DAY1--生信学习前准备1学习方式，使用电脑进行学习，与小伙伴交流讨论，共同进步2解决问题，利用搜索引擎学会搜索，推荐虫快搜部落，去解决学习过程中的问题3提高效率的软件，浏览器推荐如chrome，电脑文件搜索 ，Windows用everything，Mac自带搜索；快捷截图软件snipaste或者电脑版微信；思维导图记录，推荐xmind，便于后期整理回顾学习4学习Markdown语法做笔记4.1展示代码a=14.2

生信星球 Day 4 —— 橙子🍊

源自生信星球，由于有R基础，内容1、2、3跳过了基础代码1、显示文件列表（右下角窗口file直接有显示，在R中其实不那么重要）dir()list.files()图片2、显示历史命令（右上角history

生信星球学习小组DAY4-R语言基础

Day4-i 生信星球学习 R语言基础

Day4-i 生信星球学习 R语言基础下载R和Rstudio##注意：电脑用户名必须是英文作图plot(rnorm(50))plot主要用于绘制散点图和折线图boxplot(iris$Sepal.Length Appearance--Editor Font size用Rproject管理工作目录（1）设置一个工作目录设置工作目录：setwd()查看工作目录：getwd()（2）新建project点击箭头处：新建图片来源：生信星球公众号新建

生信学习小组 Day4 -R语言基础（L）

share_source=copy_web&vd_source=ba670d5a7ca081b044384f15866b88ef ------微信公众号 生信星球2.了解R语言和RstudioR是作为编程语言 （2）设置字体大小 （3）基本操作：用Rproject管理工作目录显示文件列表dir()加减乘除赋值<-删除变量rm列出历史命令history()清空控制台ctrl+l4.制作图片plot(rnorm(

生信星球学习小组-Day4学习笔记--R语言基础

的基本设置设置字体大小图片图片创建工作目录(Rproject)图片图片图片图片3.R语言基础显示文件列表dir() 或 list.files()图片基本运算图片赋值R语言的赋值符号为<-x <- 1 + 4 # 将1+4的值赋值给变量 x输入后会在Rstudio右上角框框Environment中显示，在控制台中输入x，回车后就会显示1+4的值，即5。 图片图片删除变量y = 6z = 9 + 3c = 5 * 4rm(y) # 删除变量 yrm(y, z) # 删除变量 y 和 zrm(list = ls()) # 删除所有变量，ls()函数的作用就是显示当前所有变量名