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生信学习
生信学习第6天之函数学习和操作1.R包是多个函数的集合，使用之前要加载合适的镜像，提高下载的速度。 )：汇总6.管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)7.count统计某列的unique值8.內连inner_join,取交集9.左连left_join10.全连full_join11
24810编辑于 2024-03-10生信学习笔记
生信学习第四天之R语言生信学习第四天之R语言1Ｒ语言学习和了解1.1 之前就安装过R和Ｒstudio，浅学习过《r语言实战》，及基本的语言。后续可以再计划学习R for Data Science。 系统学习作图。 2.R语言作图2.1 利用R语言中自带的数据集进行作图学习plot(rnorm(50))#plot 绘制图形的函数；rnorm(50)随机产生正态分布的50个数boxplot(iris$Sepal.Length 3.R语言学学习思维导图图片
20910编辑于 2024-03-08- 来自专栏嗨嗨嗨
生信学习小组
安装和加载R包1.镜像设置生信星球公众号：你还在每次配置Rstudio的下载镜像吗？
51020编辑于 2023-07-02 生信学习笔记
生信学习第二天1.登录服务器，下载安装好xshell7、xftp7等软件，根据账号密码和ip地址等信息正确远程登录服务器2.学习了解什么是linux系统及它的用处2.1 Linux系统下所有皆由“文件夹组成 用户分为管理员和一般用户，一般用户能到的最高级目录为宿主目录，放在home目录下3.学习了解Linux系统中最常见的几个基础命令图片4.实践操作图片
20410编辑于 2024-03-06生信学习笔记
生信学习之第五天R语言实操1.R语言基本数据类型重点掌握向量和数据框，明确元素、向量、标量的定义元素：数字或者字符串（chr）标量：一个元素组成的变量向量：多个元素组成的变量图片2.提取元素2.1向量x
21810编辑于 2024-03-09生信学习笔记
生信学习第三天1 生信软件的安装图片2 具体安装步骤2.1 百度搜索清华镜像下的安装链接=》进入：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda 复制代码后回车，注意理解代码意思conda list#开始使用condaconda install fastqc -yfastqc --help#确认是否安装成功3 实践操作图片4后续计划4.1 选修内容学习 4.2 linux系统详细视频学习
25710编辑于 2024-03-07生信学习笔记
DAY1--生信学习前准备1学习方式，使用电脑进行学习，与小伙伴交流讨论，共同进步2解决问题，利用搜索引擎学会搜索，推荐虫快搜部落，去解决学习过程中的问题3提高效率的软件，浏览器推荐如chrome，电脑文件搜索 ，Windows用everything，Mac自带搜索；快捷截图软件snipaste或者电脑版微信；思维导图记录，推荐xmind，便于后期整理回顾学习4学习Markdown语法做笔记4.1展示代码a=14.2
28010编辑于 2024-03-05第一天生信学习-生信星球学习小组
一、学习小组正确打开方式 1.如何开启高效学习 每日学习完成后，与小伙伴一起学习讨论，并在腾讯云记录学习笔记。 2.如何解决学习中遇到的问题 （1）搜索引擎 首选-谷歌，其次-必应，另外推荐一个大神级的搜索引擎：虫部落快搜。 （2）专业教程（推荐） 搜狗微信、搜狗知乎、github 直接去搜网站名字，就能搜到 （3）正确的提问 礼貌提问，描述问题需要用截图（快捷截图软件用微信截图或snipaste） 学习小组课程范围内的问题课在微信群里问 ，学习小组范围外的问题邮件提问。 (4)电脑版微信功能使用 截图功能，文件传输助手。 2.学习流程 （1）思维导图 幕布：兼具大纲与思维导图两种模式。 xmind：仅有思维导图一种模式，简单易上手。
31310编辑于 2024-02-20生信星球--生信学习DAY2：适应Linux
权限控制多用户的权限控制命令行模式linux的操作靠命令行来实现目录结构文件系统呈树状，宿主目录放在home目录下2.为什么学生信要用linux？ /testbio09@ecm-cefa:~/lidahuang$ lsblkNAME MAJ:MIN RM SIZE RO TYPE MOUNTPOINTsr0 11:0 1 378K
46100编辑于 2024-01-19生信星球——生信入门DAY6:学习R包
（library() : library(package)将加载名为package的命名空间，并添加到包的搜索列表中。加载前对搜索列表进行检查并更新，如果package不存在则报错，如果之前已加载package，则不会重复加载。如没有参数package即library()，则列出lib.loc指定的库中的所有可用包。library(help=package)将返回package的基本信息。
54610编辑于 2024-01-23- 来自专栏生信学习小组
生信学习day3
anaconda是总管，职务比conda低，但干的活不少，也是个有内涵的家伙miniconda是区域经理，说白了就是干事的，而且比较专一，主要负责生信领域二、如何下载软件1.创建biosoft（mkdir 从某链接下载软件：wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh生信星球 然后出现这个界面：3.下载完成后，运行 ：bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh,然后开始安装过程4.激活：source ~/.bashrc（注意空格）生信星球：激活不成功就将 add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/conda config --set show_channel_urls yes生信星球三
35310编辑于 2024-01-18 - 来自专栏数据处理小技能
生信技能树 R习题 11-20
11 使用R语言获取人类所有基因的名字，ID，symbol以及别名倒是没想到18年的时候还要纠结基因名转换的问题不过这个内容现在已经被生信马拉松最新分享的代码替代了12 R语言读书笔记以及为什么发读书笔记 芯片的探针ID找到基因名-基于R语言-一文就够这一篇分享了芯片的注释包，不过现在有小洁老师的tinyarray了，也不用这么麻烦17 R语言练习题10道，有答案代码，还有视频很基本的一些题目，真正的入门R语言生信分析题目 ，值得做18 使用methods函数来查看R语言里面的对象的操作方式介绍了一个methods函数，不过好像现在没有什么实际用处19 生信人应该这样学R语言系列视频学习心得笔记分享12年底分析的R语言生信马拉松笔记 ，对所有内容提了一个详细的大纲最后还有一些基因在TCGA数据库表达情况和生存分析的代码分享２０ 生信工程师全套教学视频之R语言专辑纪念版习题链接初级http://www.bio-info-trainee.com http://www.bio-info-trainee.com/3750.html高级http://www.bio-info-trainee.com/3415.html非常入门的题目，高级版也是入门版生信技能树
26510编辑于 2024-06-13 第4天生信学习笔记-微信公众号生信星球
今天的学习内容： 1.安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面） 2.粗略了解R语言是什么，干什么的，认识Rstudio的工作界面 3.学会外观设置和基本操作 4.完成第一个R做的图 如果已经安装或者基础较好 ，可以看下R for Data Science的第一章，系统学习作图。 share_source=copy_web&vd_source=ba670d5a7ca081b044384f15866b88ef 注意：只看R和Rstudio的下载部分，剩下的非学习范围（不需要装R包）
57310编辑于 2024-02-25第6天生信学习笔记-微信公众号生信星球
R包是多个函数的集合，R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。
41010编辑于 2024-02-25第5天生信学习笔记-微信公众号生信星球
提取某两列作散点图：plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)学习一下脚本的使用和保存：将上面的代码复制到一个新的R脚本中。
48310编辑于 2024-02-24- 来自专栏生信学习小组
生信学习day2
图片——来源：生信星球2.为什么学生信要用linux？（1）生物软件基于linux，系统开源、免费，不需要图形界面，有效节约资源。（2）命令行模式可以批量、高效地处理文件，满足数据分析的要求。 同时安装Xftp如何登录生信星球https://www.jianshu.com/p/8a340b103a411.ip地址。ip是代表服务器的一个“编号”。2.用户名。bio开头的那个3.密码。
33510编辑于 2024-01-17 - 来自专栏生信宝典
生信分析案例 Python简明教程 | 视频11
开源生信 Python教程 生信专用简明 Python 文字和视频教程 源码在：https://github.com/Tong-Chen/Bioinfo_course_python 一些练习题 给定
26140编辑于 2023-08-30 生信技能树 Day11 Linux1
引用自生信技能树
39610编辑于 2024-04-24- 来自专栏小张的学习笔记
生信技能树学习笔记1
x1 = read.csv("C:/Users/win10/Desktop/x.csv")
70320编辑于 2023-05-10 Day1 学习生信准备
Day1 学习生信准备1. 搜索引擎推荐1.1 浏览器搜索引擎：谷歌，必应，虫部落快搜1.2 专业教程搜索：搜狗微信、搜狗知乎、github2. 学习软件推荐2.1 浏览器：chrome，可以安装一些插件2.2 电脑文件搜索：Everything2.3 截图软件：snipaste，微信3. 学习方式：做思维导读，推荐使用幕布，xmind4. 学习markdown语法做笔记常见格式如下：1.展示代码a = 1 注意 ：这里要设置代码格式，否则会报错。 我们的学习小组教程是非开放的，你的笔记应当是经过你自己消化和整理的，禁止直接复制、抄袭发布。
36120编辑于 2024-03-04
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