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Cyanine 染料 | MedChemExpress
CY 染料的分类CY 染料分为非磺化花菁和磺化花菁。两者的光谱特性基本相同，在 DNA 和蛋白质的标记中，它们是可互换的，两种均可用于标记生物分子。 为减少空间位阻影响，CY 染料常做各种修饰，具体如下：1) Succinimidyl ester (SE) 修饰：该类型 CY 染料可与蛋白的氨基末端或伯胺反应，从而实现包括多肽、抗体等的蛋白标记。 CY 花菁类染料优点1) 光谱窄，信号强；2) 花菁类染料的摩尔吸光系数高于其他荧光染料；3) 磺化花菁类染料易溶于水，对组织细胞毒性小，适用于动物和细胞实验；4) 荧光波段在近红外区段的组织透过性更好 Cy5659/670Cy5 是明亮的红色荧光染料，用于标记肽，蛋白质，寡核苷酸的氨基基团的反应染料。 Cy7-SE720/790CY7-SE (Sulfo-Cyanine7 Succinimidyl Ester) 是一种近红外荧光标记试剂，常用于小动物体内成像，也用来标记核酸，蛋白，多肽，纳米粒，多聚物等
30720编辑于 2023-01-10 - 来自专栏技术文章
选对染料少走弯路，Elabscience 流式死活染色试剂获全球科研认可
排除死细胞的关键是使用死活细胞鉴定染料。目前主要的死活鉴定染料分为核酸染料和胺基染料，它们的原理不同，适用场景各异。1. 核酸染料（适用于未固定样本）该方法的原理基于活细胞膜的完整性：活细胞因膜结构保持完整，具有选择透过性，使得PI、7-AAD、DAPI这类核染料无法进入细胞内部，因此不会显现荧光；而死细胞由于膜已破损，染料可进入细胞内并与核酸结合 使用时，在完成流式抗体染色后，于上机前加入核酸染料并进行短暂孵育。 胺基染料（适用于需固定的实验）该方法的原理是通过染料与蛋白质伯氨基的共价结合实现的：活细胞因仅与细胞膜表面蛋白结合，荧光信号较弱；而死细胞由于细胞膜破损，染料可结合胞内大量蛋白，因此荧光信号较强。 4. 多色流式实验：建议进行死活染色。这是降低背景、提高数据质量的关键步骤，需注意染料通道与抗体panel的兼容性。是不是没想到，小小的死细胞，竟有这么大的破坏力？
12100编辑于 2025-12-31 - 来自专栏Y大宽
4️⃣ 核酸序列特征分析(2):CpG岛预测
CpG岛是200bp或更长的DNA序列，GC含量较高，一般富集在人类基因组组启动子区和起始外显子去，在这个区段容易出现DNA甲基化，从而对基因表达进行调控。 推荐工具CpGPlot
1.9K30发布于 2019-01-28 - 来自专栏Y大宽
4️⃣ 核酸序列特征分析(8):重复序列的查找
基因组序列主要构成成分是基因序列，重复序列和基因间序列。 基因组注释包括基因组结构注释和基因组功能注释 结构注释的核心是基因识别，为了提高基因识别效率需要首先寻找并标记去除 重复的和低复杂性的序列。
3.7K30发布于 2019-02-26 - 来自专栏Y大宽
4️⃣ 核酸序列特征分析(1):开放阅读框识别
序列比对和序列特征分析总目录 阅读框Open Reading Frame，ORF ORF指的是DNA上的序列，从5'端翻译起始密码子ATG到终止密码子(TAA,TAG,TGA)的蛋白质编码序列。 对于任意给定的一段DNA，有两个问题需要考虑， 一是DNA双链中的哪条是编码链 二是编码区究竟从第一个碱基开始进行编码 所以每条链都有潜在的3种ORF，而对于双链DNA来说就有6种可能的ORF。也就是说先从给定的DNA单链为模版，分别从5'-3'方向第123个碱基开始翻译，再以互补链为模版，分别从3'-5
3.3K30发布于 2019-01-28 - 来自专栏生信宝典
一文读懂：PCR，qPCR，Real-time PCR，RT-PCR和RT-qPCR
在经历一次变性→退火→延伸的流程之后，原本只有1条的DNA双链变成了2条；2次之后是4条；以此类推，经过变性、退火和延伸重复若干个循环后，就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。 （2）实时荧光定量PCR 实时荧光定量PCR（Real-time PCR，Quantitative Real-time PCR，qPCR），即第二代PCR技术，是指在整个扩增的过程中，引入了荧光染料或者荧光基团 ■ 一种是用荧光染料，主要为SYBRGreenⅠ染料，该染料能与DNA双链结合，结合之后会显示荧光信号，而在没有结合的时候几乎检测不到荧光信号，随着拷贝数的增加，荧光信号增强。 基于泊松分布原理，数字PCR技术核酸样品分配到大量独立、平行的微反应单元中，使每个反应室中平均只有一个拷贝或者没有目标DNA分子，然后加入荧光信号进行扩增，从而实现靶标核酸分子的绝对计数，提高检测灵敏度和准确度 由于这种检测方式具有比传统荧光定量 PCR 更加出色的灵敏度和精确性，数字 PCR迅速得到广泛的关注，尤其在痕量核酸样本检测、复杂背景下稀有突变检测、核酸拷贝数变异和基因表达量微小差异鉴定方面表现出的优势已被普遍认可
6.8K22编辑于 2024-01-23 - 来自专栏生命科学
核酸提取干货 - MedChemExpress
如果要对核酸的结构和功能进行研究，首先就要对核酸进行提取和纯化。核酸提取是个啥？字面意思，就是把核酸从样本中提取出来呗！那一般常见的提取方法有哪些呢？ 提取步骤核酸提取主要包括细胞裂解、核酸吸附、杂质漂洗和核酸洗脱四步。那具体到实验中，我们该选择哪种提取方法呢？这就要看个人的实验设计方案及实验组的经费情况啦！ 自配试剂的优缺点是显而易见的，若后续实验对核酸要求不高 (如常规的 DNA 提取，后续用做普通 PCR 扩增)，这种提取方法也可选择。但如果对核酸的质量要求比较高 (如定量或文库构建等。 MCE 新推出三款核酸提取纯化试剂盒，均利用硅胶膜离心柱对核酸进行特异性吸附，改良的裂解液可以促进细胞充分裂解、蛋白变性、核酸释放；改良的吸附缓冲液能有效地促进核酸结合到硅胶膜上；最后经过洗脱即可获得高纯度核酸 我不仅包含 蛋白酶 K，更有核酸助沉剂助力，提取的核酸那可不团团来嘛！纯化的病毒 DNA/RNA 可用于 PCR、RT-PCR、qPCR 等实验。
83723编辑于 2022-12-27 - 来自专栏简说基因
从零开始学PCR技术（五）：试验污染
(4) 标本核酸模板在提取过程中，由于吸样枪污染导致标本间污染。 (5) 有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散，导致彼此间的污染。 2. 试剂污染 PCR 试剂配制过程中，由于加样枪、容器、双蒸水及其它溶液被 PCR 核酸模板污染。 3. 4. 克隆质粒污染 (1) 某些用克隆质粒做阳性对照的检验室，这个问题比较常见。 还有另一种形式的内标，使用人工合成的假病毒，在核酸提取前在每一份样品中加入等量的内标，这样就可以监控样品的提取到扩增的过程。但是由于是人工添加到样品中，仍然不能监控胞内细菌病毒的释放情况。 4. (3) 荧光染料对照 最常使用的是 ROX 染料，由于荧光定量 PCR 的荧光信号在每个样品孔会有微小的差异所以使用特定的 ROX 荧光染料，系统可以根据 ROX 荧光染料的信号值来校准每孔的荧光信号。
1.5K10发布于 2020-12-03 - 来自专栏生信技能树
问了一下chatGPT实验室常见的生物化学试剂哪些对人体有害
三氯乙酸缓冲液 Tris缓冲液 试剂盐： 氯化钠（盐） 氯化钾 磷酸二氢钠 硫酸铵 氨水 蛋白质分析试剂： 苯甲醛 吡啶 酚 布拉德福试剂（Bradford reagent） BCA试剂（蛋白质定量） 核酸分析试剂 ： 乙酸 氯仿 硝酸 DNA染料（例如，乙溴蓝、SYBR Green） 酶和底物： 脱氧核糖核酸酶（DNA酶） 核糖核酸酶（RNA酶） 蛋白酶 底物（例如，底物用于酶活性测定） 抗体和标记物： 抗体（多抗 、单抗） 荧光标记物（例如，荧光染料、荧光标记的抗体） 酶标记物（例如，辣根过氧化物酶，碱性磷酸酶） 培养基和培养试剂： LB培养基 DMEM培养基 細胞凍存液（DMSO） 分离试剂： 溴化乙锭 异硫氰酸盐 乙二胺四乙酸（EDTA） 二硫代硫酸（DTT） 巯基乙醇（β-ME） 其他： 乙醇 甘油 硝酸银 聚丙烯酰胺凝胶（SDS-PAGE凝胶） 这些试剂在实验室中用于各种生物化学和分子生物学实验，包括蛋白质分析、核酸分析
67040编辑于 2023-11-08 链霉亲和素-生物素系统在免疫沉淀中的应用 - MedChemExpress
RNA 亲和分离(RNA affinity isolation)，进一步证实了 SQSTM1 mRNA (已生物素化处理) 与YTHDC1 蛋白相互作用 (图 4)。 下述为 2 种方法举例：1）解离生物素化核酸：为了从链霉亲和素磁珠上分离生物素化核酸，在 pH 8.2 的 95% 甲酰胺+ 10 mM EDTA 中孵育磁珠，65°C 孵育 5 分钟或 90°C 孵育 使用磁力架将磁珠吸到试管壁上，将含有生物素化核酸的上清液从试管中取出。2）解离生物素化蛋白质：对于生物素化蛋白质，则可在 0.1% SDS 或 SDS-PAGE 缓冲液中煮沸磁珠 3 分钟。 链霉亲和素可以与多种荧光染料/报告标签结合，同时生物素标记抗体、酶的标记率高且不影响蛋白的活性，因此链霉亲和素-生物素系统可用于几乎所有的免疫测定实验。 除 Vari Fluor 488-Streptavidin 外，MCE 还可以提供多种 Vari Fluor 染料标记的链霉亲和素。
1.9K00编辑于 2024-01-18- 来自专栏AI掘金志
核酸采样机器人来了，我们能实现「核酸自由」吗？
坐标深圳，本月已完成18次核酸检测。 作者 | 路遥 编辑 | 余快 疫情几年来，保住绿码，成了中国人尤其是深圳人的头等大事。 见面寒暄更多不是问“你吃了吗？”，而是“你做核酸了吗？” 自主扫描粤核酸码后，机器会自动匹配试管条形码，采样前，将自助核酸采样机提供的一次性无菌封装咬口器插入机器卡槽，然后张嘴对准咬口器，剩下的交给机器人即可。 从流程上看，自助核酸采样与由医护人员进行的核酸采样别无二致：采集信息、进行采样。 不可忽视的问题 作为新兴市场，核酸采样机器人行业还处于发展初期，诸多问题需要解决。 第一个问题是，核酸采样机器人真的提高采样效率了吗？ 此外，核酸机器人离大规模商业化落地有多远？ 由于缺乏国家层面的统一标准，越来越多的企业入局，核酸采样机器人产品也五花八门。
52120编辑于 2022-11-08 - 来自专栏亨利笔记
在香港做核酸指南
题图摄于香港弥敦道 从外地进入香港的朋友，基本上都要在香港做核酸。如果要从香港入境中国内地，需提供纸质的核酸检测结果。本文说说做核酸的流程和注意事项。 入境香港的旅客，无论从哪个国家来，根据防疫的规定，抵港第2天需接受核酸检测（注：入境当天算第0天）。如果离港前往内地，还需要做两次核酸。 抵港第2天的核酸检测，可以去社区中心免费做。 因为香港本地人基本不需要做核酸，提前1-2天预约即可。 香港社区流动核酸检测点（原来是篮球场） 到了检测现场会再收一条短信确认手机的正确性。 比如，若航班是周五下午4点起飞，则需要在周三下午4点后做核酸检测，这样周四获得纸版报告，周五能够乘机。 社区出具的纸质核酸检测报告，供出行使用 另一次核酸检测需要在航班预定起飞时间前8小时内，在机场现场做免费强制快速核酸检测，2-3小时出结果（电子版），需要从电子邮件或手机短信中获得报告链接，然后下载电子报告
3.6K30编辑于 2023-04-04 - 来自专栏生命科学
SYBR Green qPCR Master Mix 试剂盒 | MedChemExpress
产品介绍Real-time Quantitative PCR Detecting System，简称qPCR，即实时荧光定量核酸扩增检测系统 ，也叫实时定量基因扩增荧光检测系统，是目前较为先进的核酸分子诊断技术，被美国FDA承认并推崇。 本产品预先混有 Taq DNA Polymerase、PCR Buffer、dNTPs、SYBR Green I 荧光染料、稳定剂和镁离子等通用组分，只需加入模板、引物、双蒸馏水便可进行Real Time
80210编辑于 2023-01-13 - 来自专栏生命科学
亲脂性细胞膜染料： DiO, Dil, DiR, Did - MedChemExpress
常见 Di 染料常见的 Di 染料包括 DiO、DiI、DiD、DiR，在被激发后形成不同颜色的荧光 (如图 1)。 d）400 g，4℃ 离心 3-4 分钟，弃去上清。再次加入 PBS 洗涤细胞 2-3 次，以充分去除未进入细胞内的DiO。f）用无血清培养基或 PBS 重悬细胞后，在荧光显微镜或流式细胞仪下检测。 (但相较其他三种染料，DiO 染料荧光强度较弱，对于某些固定的组织切片染色效果略差)。 如图 4 所示，Dil 染料标记外泌体，然后与目标细胞共培养。 Dil 染料购自 MCE■ DiDDiD 为一种红色荧光染料，激发/发射波长为 646/663 nM，DiD 荧光信号高、不易淬灭、自身荧光干扰低，不仅用于细胞/组织染色，小动物活体成像中是最常用的。
1.9K20编辑于 2023-01-09 - 来自专栏冰河技术
核酸系统崩了，谁之过？
” 相信很多小伙伴都知道了，当前成都疫情非常严峻，就在成都人民排起长队等待核酸检测时，结果核酸检测系统崩了，没错，就是崩了！ 本来我是想保持沉默的，某软作为此次核酸系统的承建商，不仅没有出来向广大的成都人民表示歉意，反而一再强调此次0级事故与软件无关，还一再强调自己的系统多么多么“牛逼”！！ 某软作为核酸系统的承建商，出现问题后，抓紧排查和修复问题本来就是应该做的事情，事后发文不仅没有表达对成都人民的歉意，还一再甩锅是网络问题，强调与核酸系统软件无关，更多的是强调自己的系统多么多么的“牛逼” 不说别的，首先向成都人民表达了歉意，后续更多的是客观、合理的解释了此次核酸系统出现故障的原因以及目前的解决方案，也直言不讳的说明了后续存在不确定性的因素，和后续的处理措施。
46230编辑于 2022-12-01 - 来自专栏Y大宽
4️⃣ 核酸序列特征分析(6):密码子使用模式的分析
Initial Menu Option (1) Load sequence file ( ) (3) Change defaults (4) or (H)elp -> 用法和别的不太一样，属于命令行的交互版 具体来讲： 输入1，载入要分析的序列文件，这里我载入官方网站的示例数据 中间的选项可以自行设置，只需要输入相应的序号即可 比如第4个选项 (CAI) ( 2) Frequency of OPtimal codons (Fop) ( 3) Codon bias index (CBI) ( 4) 0.3169 0.263 0.052 0.456 53.19 0.430 0.397 684 712 -0.481742 0.117978 KAR4_ 0.3291 0.227 -0.046 0.410 61.00 0.400 0.417 100 107 -0.404673 0.074766 YCE4_
1.9K20发布于 2019-02-26 - 来自专栏蛋蛋编程手记
做核酸地图遇到的困难
通过政务网站能拿到核酸检测点的信息，但是这个信息目前还只是位置名称，我最终需要的是这个点位的经纬度信息。 这里我是通过腾讯云地图的api来做的转换。
45310编辑于 2022-12-12 - 来自专栏Y大宽
4️⃣ 核酸序列特征分析(3):启动子区域预测和转录终止信号预测
启动子Promoter是位于基因5'端上游的DNA序列，调控基因表达。作用方式是通过与转录因子结合。关于启动子更详细的简文请看查找一个基因的启动子序列
1.9K50发布于 2019-01-28 - 来自专栏Y大宽
4️⃣ 核酸（蛋白）序列特征分析(5):序列motif的查找和可视化工具
模体Motif，指DNA或蛋白质序列中局部的保守区域，或者是一组序列中共有的一小段序列模式。这些motif很可能具有分子功能，结构性质或家族成员相关的任何序列模式。
2.9K40发布于 2019-02-26 - 来自专栏Y大宽
4️⃣ 核酸序列特征分析(7):限制性内切酶位点分析
序列中被识别的位点多数有回文对称结构，长度一般4~8个碱基，常见为6个。切割位点在DNA两条链相对陈的位置。
1.7K30发布于 2019-02-26
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