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文献分享-----10X Visium HD & Stereo-seq图像分割（nature文献）
作者，Evil Genius今日我们分享文献，先看看正文部分，代码后续更新补充大家看到没，这些核心的算法都有中国人的参与。知识积累空间转录组学的一个开放性问题是单细胞水平上的信息推断。
42510编辑于 2024-12-12- 来自专栏人人都是数据分析师
因果推断文献解析|A Survey on Causal Inference(5)
接下来我们继续启航，一起来解析接下来的基于潜在结果框架下的因果推断方法，那么经过前两个方法的学习，我们已经对基于潜在结果框架下的因果推断有了较深的认识，接下来的介绍其他方法会更快速一些，不会像上面那么细致的解析 首先附上上一篇链接： 因果推断文献解析|A Survey on Causal Inference(4) 论文原文点击文末【阅读原文】即可查看。 二正文解析 3.3 匹配方法 书接上文，缺失的反事实结果和混杂造成的偏差是策略效果评估的主要挑战。匹配方法则是在减少选择偏差的基础上，提供了一种估计反事实结果的方法。 在原参考文献[77]中，提出了平衡的非线性表示(BNR)来将相关变量投影到平衡的低维空间。 在这里，我们还想介绍在原参考文献[56]中提出的另一种称为粗化精确匹配(CEM)的匹配方法。
1.2K10发布于 2021-05-13 - 来自专栏人人都是数据分析师
因果推断文献解析|A Survey on Causal Inference(4)
都影响着该方法的准确性，接下来我们换个角度，一起来解析接下来的基于潜在结果框架下的因果推断方法，首先附上上一篇链接： 因果推断文献解析|A Survey on Causal Inference(3) 二正文解析 3.2 分层方法 分层方法(Stratification)亦称为子群分类或者分块方法，是一种常见的混杂调整方法。 为了减少方差，在原参考文献[55]中，首先根据倾向分数划分子块，然后使用各子块处理效果的方差的倒数对子块进行一下加权。这种方法虽然减少了等频法的方差，但不可避免地增加了估计偏差。 为了解决这个问题，原参考文献[40]根据处理后变量的潜在值来构建子群(作者写成了处理前变量，ZZ怀疑是笔误，主观修改成了处理后变量)。
1.1K10发布于 2021-05-13 - 来自专栏人人都是数据分析师
因果推断文献解析|A Survey on Causal Inference(3)
下面我们书接上文，进入到解决因果推断问题具体的方法的解析，首先附一下上篇内容：因果推断文献解析|A Survey on Causal Inference(2)，论文原文点击文末阅读原文即可查看。 作者介绍了大概思路，具体操作需要感兴趣的小伙伴参阅原文参考文献。 直接看到这个公式不可能不懵逼啊，这跨度也太大了，ZZ给大家解析一下哈： 首先我们回忆一下IPW中逆倾向得分权重的构造方式，也就是公式(10)： ? 我们将公式(10)化简合并得到下面的公式： 然后考虑 情况： 然后考虑 情况： 再结合加权的ATE公式 ，将上述 的两种形式带入 ，可以得到： 在对比给出的公式(16)，就是将加权的 最后感慨一下，解析公式背后的含义是真的技术活，哈哈哈哈！
2.2K20发布于 2021-05-13 - 来自专栏人人都是数据分析师
因果推断文献解析|A Survey on Causal Inference(1)
2正文解析 摘要 首先文章说明了因果推断的重要性，ZZ不再赘述。 对于结构因果模型，建议参考文献[91]或书[90]（祥见原文文献）。 在这篇总结的最后，作者还将简要讨论这两个因果框架之间的关系和区别。 与上述总结文献相比，本文主要关注潜在结果框架的理论背景、统计领域和机器学习领域的代表性方法以及该框架与机器学习领域如何相互增强。 不知道大家看完什么感受，但是ZZ读到这里，感觉真的是找对了文献，这就是我想要的知识啊！ 对于后面的主体内容，ZZ将逐渐奉上，希望感兴趣的小伙伴点个赞，关注ZZ。 其实摘要和引言没什么好解析的，主要是翻译，但是后面的因果推断模型和模型构建背后的思维才是精华，希望大家不要错过精彩解析！
1.1K10发布于 2021-05-13 - 来自专栏人人都是数据分析师
因果推断文献解析|A Survey on Causal Inference(2)
下面我们继续解析论文，探索作者给我们描绘的因果世界，首先附一下上篇内容： 因果推断文献解析|A Survey on Causal Inference(1) 论文原文点击文末【阅读原文】即可查看。 二正文解析 2. 因果推断基础 本章节，作者将介绍因果推断的一些基础概念和符号表示，包括任务描述，数学符号表示，前提假设，面临的挑战和一般的解决办法，最后会给出一个启发性的例子，该例子贯穿全文。 公式看着很多，很长，但是小伙伴们不要被劝退，我们来解析一下： 公式(7)中我们可以发现，虽然 、、、 都有，但是核心只有 ITE 一个指标，其他指标都是由 ITE 转化出来，所以我们一起来推导一下公式( 有了上面ZZ的过度，就比较容易理解原文作者所说，衡量 时，在三个前提都满足的情况下，再利用上面ZZ解析说的估计思路时，直接用试验组的效果均值减对照组的效果均值就得到了 的估计值： ?
1.2K20发布于 2021-05-13 - 来自专栏人人都是数据分析师
因果推断文献解析|A Survey on Causal Inference(6)
本文我们来学习基于树的方法；首先附上上一篇链接： 因果推断文献解析|A Survey on Causal Inference(5) 论文原文点击文末【阅读原文】即可查看。 二正文解析 3.4 基于树的方法 基于决策树学习的方法也是一种流行的因果推断方法，这是一种预测模型方法。 其实之前ZZ有对决策树算啊做过详细的解析，感兴趣的小伙伴可以暂时移步： 如果目标变量是离散变量，那么称为分类树，使用误分类成本来评估预测错误。 为了评估因果效应，原参考文献[9]提供了一种基于CART的数据驱动方法，该方法将数据划分为策略效果不同的子群。 这里的相关控制变量含义比较模糊，感兴趣的可以回到原参考文献[48]进行了解。
1.9K51发布于 2021-05-13 - 来自专栏育种数据分析之放飞自我
P-rep designs 文献解析及实现方法
增广试验中，每12个plot为一个block，里面含有10 品种+2对照。试验设计方案里面，白色的是测试品种，褐色的为对照。 P-rep试验方案 ?
89150发布于 2019-06-13 - 来自专栏作图丫
高分文献解析-肿瘤免疫基因构建生存模型
最近几年，肿瘤免疫变成科研的热点，紧跟科研热点，今天介绍一篇5.5分的免疫基因构建生存预后模型的文章。研究思路非常的清晰，先差异分析，再筛选免疫相关的基因，构建生存预后模型，之后结合转录因子，免疫浸润做一些相关分析。
42410编辑于 2022-03-29 - 来自专栏全栈程序员必看
LaTeX 参考文献_论文参考文献外文文献格式
这篇好棒，但是代码写在什么位置看下一篇(26条消息) Latex中如何制作参考文献_bluenight专栏-CSDN博客_latex中参考文献 https://blog.csdn.net/chl033 /article/details/5927207 这篇有代码位置 (26条消息) Latex引用bib文件步骤_一个人漫步走-CSDN博客 【Latex】如何同时引用多篇参考文献_一千零一夜的博客-CSDN 博客_latex怎么连续引用多个文献这篇也可以，写了几个细节：1.cite包一定要导入 2. 写了里面的cite（好几篇都提到cite，），目前所有参考文献最下面（多余的不知哪来的怎么删）[1,2]变成了[2,1]不知为什么。 这篇没用到里面的内容，不知道为什么要写在这(26条消息) latex参考文献格式与宏包应用_weixin_34107955的博客-CSDN博客 版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点仅代表作者本人
1.4K20编辑于 2022-10-01 - 来自专栏生命科学
高分文献：解析长寿与抗衰老背后的机制 - MedChemExpress
在动物中也可使用辐照[10]、抗生素 (如曲美替尼[10])、D-半乳糖[11]等。 其他检测方法还包括表型的观察[10]、转录组或代谢组测序[8]。也许有一天科学家能够克服衰老的问题，能更大限度地延长寿命，人类能够老而不衰，健康变老。 MCE 的所有产品仅用作科学研究或药证申报，我们不为任何个人用途提供产品和服务参考文献1. Mueller AL, McNamara MS, Sinclair DA. Aging (Albany NY). 2020 May 29;12(10):9959-9981. 2. Ageing Res Rev. 2020 Sep;62:101094. 10. Yu, Y., et al.
73210编辑于 2022-12-27 - 来自专栏育种数据分析之放飞自我
ASReml文献解析|如何分析猪繁殖性状遗传参数估计
ASREML 遗传参数评估软件 飞哥推荐： asreml软件功能非常强大，使用简单，遗传评估和基因组选择的利器，5月份有个遗传评估和基因组选择的培训班（见文末）， 文献解析 如何分析猪繁殖性状遗传参数估计 处理多环境试验（MET）和元分析（meta-analysis） ※ 处理规则和不规则的空间分析数据 ※ 计算遗传力、重复力、遗传相关、表型相关等遗传参数 ※ 处理基因组数据，估计GBLUP 今天小编带领大家一起解析一篇文献 解析分为四大部分： 一、文章摘要； 二、分析文章思路； 三、文章结果解读； 四、如何通过分析文章后分析自己的数据？ 关键词 LBN与TNB、NBA和NBH遗传正相关 可以联合育种，多个场次 二、分析思路解析 2.1 数据介绍 数据介绍 本研究中使用的数据来自位于中国西南部的同一公司的11个种猪场，那里饲养着加拿大种系
66510编辑于 2024-05-11 - 来自专栏ops技术分享
Nginx结构原理全解析（10）
4 reload 流程 1）向master进程发送HUP信号（reload命令） 2）master进程校验配置语法是否正确 3）master进行打开新的监听端口 4）master进程用新配置启动新的worker子进程 5）master进程向老worker子进程发送QUIT信号 6）老worker进程关闭监听句柄，处理完当前连接后结束进程 image.png
30030发布于 2021-05-11 - 来自专栏大数据成神之路
经典SQL面试10题解析
一般这种题建中间表会解得清晰些 三、SQL真题 第一题 order订单表，字段为：goods_id， amount ； pv 浏览表，字段为：goods_id，uid； goods按照总销售金额排序，分成top10 ,top10~top20,其他三组 求每组商品的浏览用户数（同组内同一用户只能算一次） create table if not exists test.nil_goods_category as select goods_id ,case when nn<= 10 then 'top10' when nn<= 20 then 'top10~top20' else 'other' end where userid = 1900000169 ) b on a.userid = b.userid and a.nn = b.nn-1 ) aa where session_diff >10 = b.d10 then 1 else 0 end as d10_jp ,case when a.d20 = b.d20 then 1 else 0 end as d20_jp ,case when
3.8K32编辑于 2022-04-13 - 来自专栏技术杂货店
java集合【10】——— LinkedList源码解析
常用List方法解析 4.1 查找相关 4.1.1 getFirst() 获取第一个元素： public E getFirst() { // 保存第一个元素为f，注意是final LLSpliterator<E> implements Spliterator<E> { // 分割长度增加单位 static final int BATCH_UNIT = 1 << 10
55800发布于 2020-12-05 - 来自专栏锦小年的博客
Cifar-10数据集解析
cifar-10 数据集是机器学习入门第二个使用到的数据集合（第一个当然是MNIST），下面介绍一下如何解析。 1. cifar-10 简介 该数据集共有60000张彩色图像，图像大小是3通道的32*32，分为10个类，每类6000张图。 测试批的数据里，取自10类中的每一类，每一类随机取1000张。抽剩下的就随机排列组成了训练批。注意一个训练批中的各类图像并不一定数量相同，总的来看训练批，每一类都有5000张图。 cifar-10-binary.tar.gz 2. 数据解析，Python为例 cifar-10 数据以字典的形式存储，key为：dict_keys([b’batch_label’, b’labels’, b’data’, b’filenames’])，
2K30发布于 2019-05-28 - 来自专栏Lauren的FPGA
深度解析ug1292（10）
此外，对于不是由FD驱动的扇出大于10K的net，这部分也会有所显示。 ? 图片来源：page 10, ug1292 03 report_failpast使用方法 report_failpast除了基本的使用方法（不添加任何选项）之外，还提供了其他的选项。
1.3K30发布于 2019-10-30 - 来自专栏生信小驿站
文献翻译
NADH脱氢酶的亚基 NDUFAF5，p = 1.0×10−4; NDUFS3，p = 8.8×10−5），细胞色素C还原酶（UQCR10，p = 2.6×10−4; UQCR11，p = 7.7×10 −4）和氧化酶（COX10，p = 4.3×10−5；COX4I1，p = 1.7×10−4; COX7B，p = 3.1×10−4; COX7C，p = 6.1×10−4; COX5B，p = 1.1 ×10−3）和ATP合酶（ATP5G3，p = 1.1×10−6; ATPAF1，p = 3.6×10−5; ATP5G1，p = 8.0×10−5; ATP5C1，p = 2.0×10−4; COX10 在丙酮酸脱氢酶复合物中（PDC），蛋白质A1，B和X（p = 4.1×10-6; 4.2×10−5;1.3×10−3）显示随着年龄的增长表达减少。 5，pT2D = 8.5×10−5），和GADD45A（页面= 5.4×10−4，pT2D = 1.1×10−4）（表6）。
1.6K10发布于 2020-04-09 - 来自专栏生信技能树
BRCA分型之PAM50（逆向收费读文献2019-10）
栏目起源 2年前，考虑到科研路的艰难，我组建了文献阅读小组，广邀粉丝参与，从自身做起，开始学习及分享！ 感兴趣可以点击下面的链接跳转去了解详情： 逆向收费读文献社群 （2018-01-07） 逆向收费读文献社群 （2018-06-09） 逆向收费读文献社群（第二年通知）（2019-01-26） 大概有50 基因检测和MammaPrint 70基因检测，当然其他科研工作着的尝试也值得回顾： three variants of the Single Sample Predictor (SSP) (SSP2003 [10 目前看来，最出名的分类就是PAM50，其文章是：J Clin Oncol. 2009 Mar 10; 27(8): 1160–1167. 在5年和10年远处复发风险基础上，根据基因表达与临床结果的相关性，将患者分为预后良好组及预后不良组。 已有多项研究证实了MammaPrint 70基因检测对早期乳腺癌患者预后的预测作用。
2.5K40发布于 2019-06-19 - 来自专栏全栈程序员必看
latex 引用文献_latex引用多个参考文献
LaTeX插入参考文献，简单高效 Latex参考文献的引用 Latex中用Bibtex来引用文献 Latex能改变单独一篇参考文献字体的颜色吗？ （通过bib文件将单独一条参考文献高亮，xys亲测可用） 一、使用thebibliography标签 \begin{ thebibliography 二、使用bibtex引用数据库 Step1:创建BibTex文件 （1）新建一个.txt文件；(假设为ref.txt) （2）打开Google学术，搜索你想要引用问文献； 例如文献《Captcha: （3）重复以上动作，直至将所有参考文献的上述代码都复制到了.txt文件中，最终生成的.txt文件如下所示： （4）将.txt文件重命名为.bib文件即可。 (xys在使用mdpi模板过程中，并没有采用这个步骤，也是可以的) Step2:添加引用配置 在Latex文档里面添加BibTex库的引用，要在哪里显示参考文献，就在哪里添加如下内容 （一般引用文献都在文章末尾
4.3K10编辑于 2022-09-30
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